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粘绿木霉Gv29-8碳水化合物酶类蛋白理化性质预测分析
被引量:
1
1
作者
祝友朋
韩长志
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2020年第4期74-79,共6页
粘绿木霉Gv29-8是已完成全基因组测序的重要生防拮抗菌之一,为对其碳水化合物酶类蛋白的理化性质进行预测分析,以粘绿木霉中185个CAZymes蛋白序列为研究对象,对其理化性质进行了预测分析。结果表明:近2/3的蛋白理论等电点(p I)小于6,属...
粘绿木霉Gv29-8是已完成全基因组测序的重要生防拮抗菌之一,为对其碳水化合物酶类蛋白的理化性质进行预测分析,以粘绿木霉中185个CAZymes蛋白序列为研究对象,对其理化性质进行了预测分析。结果表明:近2/3的蛋白理论等电点(p I)小于6,属于酸性蛋白,同时,通过随机数软件对上述蛋白进行10%随机抽样分析,发现不同理论等电点类别的CAZymes蛋白所具有的分子式、原子数量、半衰期、不稳定性系数、脂肪族氨基酸指数、总平均亲水性等性质不尽相同。其中,比例为26.67%的蛋白属于不稳定蛋白,比例为13.33%的蛋白属于亲水性蛋白。
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关键词
粘绿木霉Gv29-8
cazymes蛋白
理化性质
生物信息学分析
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职称材料
题名
粘绿木霉Gv29-8碳水化合物酶类蛋白理化性质预测分析
被引量:
1
1
作者
祝友朋
韩长志
机构
西南林业大学生物多样性保护学院
出处
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2020年第4期74-79,共6页
基金
云南省研发经费投入补助项目(2016YB462&2017YB236)资助
云南省应用基础研究计划项目(2018FG001-028)资助
+1 种基金
西南林业大学大学生创新创业项目(201825)资助
国家自然科学基金项目(31960314)资助。
文摘
粘绿木霉Gv29-8是已完成全基因组测序的重要生防拮抗菌之一,为对其碳水化合物酶类蛋白的理化性质进行预测分析,以粘绿木霉中185个CAZymes蛋白序列为研究对象,对其理化性质进行了预测分析。结果表明:近2/3的蛋白理论等电点(p I)小于6,属于酸性蛋白,同时,通过随机数软件对上述蛋白进行10%随机抽样分析,发现不同理论等电点类别的CAZymes蛋白所具有的分子式、原子数量、半衰期、不稳定性系数、脂肪族氨基酸指数、总平均亲水性等性质不尽相同。其中,比例为26.67%的蛋白属于不稳定蛋白,比例为13.33%的蛋白属于亲水性蛋白。
关键词
粘绿木霉Gv29-8
cazymes蛋白
理化性质
生物信息学分析
Keywords
Trichoderma virens GV29-8
cazymes
protein
physicochemical properties
bioinformatics analysis
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
粘绿木霉Gv29-8碳水化合物酶类蛋白理化性质预测分析
祝友朋
韩长志
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2020
1
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