-
题名吲哚类CB2配体3D-QSAR模型的构建与比较
- 1
-
-
作者
沈家成
姜筝
孙盛鑫
周祖浩
陈佳吟
李姣姣
-
机构
江苏海洋大学药学院
贵州大学精细化工研究开发中心
-
出处
《广州化工》
CAS
2024年第23期109-113,共5页
-
基金
江苏海洋大学研究生科研与实践创新计划项目(KYCX2022-80)
2022年江苏海洋大学大学生创新训练项目(SY202211641640010)
2023年江苏海洋大学大学生创新训练项目(2023-474)。
-
文摘
大麻素2型受体可在多种病理情况下发挥作用,与各种神经退行性疾病、肾小管线粒体功能障碍和肾脏衰竭、抗炎镇痛、免疫调节、溃疡性结肠炎、缺血性卒中、骨质疏松、代谢障碍以及癌症等各类疾病的作用机制息息相关,显示出良好的治疗前景。为研究吲哚类CB2配体的3D-QSAR模型,选取22个吲哚类CB2配体,构建两个不同的训练集,使用3D-QSAR中CoMFA和CoMSIA方法构建四个可靠稳定且具有良好的预测能力的模型。其中3D-QSAR模型的结果为CoMFA 1(q^(2)=0.645,r^(2)=0.984)、CoMSIA 1(q^(2)=0.516,r^(2)=0.970)与CoMFA_(2)(q^(2)=0.619,r^(2)=0.975)、CoMSIA_(2)(q^(2)=0.674,r^(2)=0.974),进一步采用测试集以及Y-随机化试验进行外部验证,结果显示四个模型均满足相应的验证标准,表明模型具有良好的预测能力。并对等势图进行分析,为后续吲哚类CB2配体的设计提供一定的理论参考。
-
关键词
吲哚类cb2配体
3D-QSAR
模型验证
等势图
-
Keywords
indole cb2 ligand
3D-QSAR
model verification
equipotential map
-
分类号
O641
[理学—物理化学]
-
-
题名吲哚类CB2配体共同特征药效团的研究及其应用
被引量:1
- 2
-
-
作者
秦政
沈家成
李正夫
周祖浩
王晓斌
李姣姣
-
机构
江苏海洋大学药学院
江苏海洋大学计算机工程学院
贵州大学绿色农药与农业生物工程教育部重点实验室
-
出处
《化学研究与应用》
CAS
北大核心
2023年第5期1059-1068,共10页
-
基金
江苏省海洋资源开发研究院开放基金课题项目(JSIMR202102)资助
江苏海洋大学研究生科研与实践创新计划项目(KYCX2022-80)资助
江苏海洋大学大学生创新训练项目(SY202211641640010)资助。
-
文摘
CB2与神经退行性疾病、癌症等多种疾病紧密相关,是极具潜力的药物靶点。本文从已报道文献中选取8个具有高亲和力的吲哚类CB2配体为研究对象,采用共同特征药效团(HipHop)方法构建出10个CB2配体药效团模型,并通过测试集验证和ROC曲线验证两种方法对其进行筛选和验证,得到1个最佳药效团模型。最佳药效团模型含有1个芳环中心,3个疏水基团,1个氢键受体特征。随后采用逐级筛选策略,通过该模型对ZINC数据库进行筛选、分子对接、ADMET预测及配体蛋白相互作用分析,最终获得5个对CB2具有潜在活性的化合物,为筛选具有CB2活性的化合物提供理论基础。
-
关键词
cb2配体
共同特征
药效团
逐级筛选
-
Keywords
cb2 ligand
common feature
pharmacophore
stepwise screening
-
分类号
O641.4
[理学—物理化学]
-