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题名均衡数据法提高蛋白质二级结构预测
被引量:1
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作者
李伟
赵亚欧
陈月辉
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机构
济南大学信息科学与工程学院
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2009年第6期219-220,239,共3页
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基金
国家自然科学基金~~
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文摘
传统蛋白质二级结构预测,由于氨基酸序列中三种结构数量的差异,易造成不均衡训练,使得对三种结构的预测准确率差别较大。为改善这种缺陷,受装袋原理的启发,对传统方法进行改进,缩小训练时三种结构数量的差距。在实验中,采用数据集CB396,结果表明该方法能够显著提高对折叠的预测正确率,而且在总的预测正确率上达到77.3%,可以较好地进行蛋白质二级结构预测。
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关键词
PSSM矩阵
BP神经网络
cb396数据集
蛋白质二级结构
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Keywords
Position Special Scoring Matrix (PSSM)
BP neural network
cb396
protein secondary prediction
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分类号
TP181
[自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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