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利用真菌纤维素结合域(CBD)保守性序列进行草菇木聚糖酶cDNA的克隆 被引量:6
1
作者 丁少军 J.A.BUSWELL 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期408-412,共5页
Cellulose binding domains (CBDs) are present in the majority of fungal cellulases and hemicellulases. Based on the conserved region of CBDs, degenerate primers were designed and used to amplify the 5′ end cDNA fragme... Cellulose binding domains (CBDs) are present in the majority of fungal cellulases and hemicellulases. Based on the conserved region of CBDs, degenerate primers were designed and used to amplify the 5′ end cDNA fragment of xylanase from Volvariella volvacea by 5′ RACE. Gene specific primer was then designed based on extreme region of 5′ end cDNA fragment and used to amplify the full length cDNA of xylanase. The cDNA of xyn 1 was 1 287 bp in length, including 3′ and 5′ non coding region. The xyn 1 cDNA contained an ORF of 1101 bp encoding 367 amino acids, in which there was a putative signal peptide with 19 amino acids. Alignment of the deduced amino acid sequence of xyn 1 with other xylanases showed that the homology with family 10 xylanases from Agaricus bisporus xyl1,Aspergillus sojae xyn1, Aspergillus kawachii xynA, Fusarium oxysporum f.sp xyl3 was 64%,55%,52%,55%, respectively. 展开更多
关键词 Volvariella volvacea cellulose-binding domain(cbd) xylanase CDNA
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纤维糊精酶DM1与CBD的融合及融合酶性质分析 被引量:1
2
作者 庄永红 刘利 +2 位作者 段承杰 唐纪良 冯家勋 《广西农业生物科学》 CAS CSCD 2008年第4期365-371,共7页
纤维糊精酶(cellodextrinase)属纤维素酶类中的一类,可以从短链纤维素分子上水解糖苷键生成葡萄糖或纤维二糖。曾克隆了纤维糊精酶DM1的编码基因,该酶与生黄瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)的Cellodextrinase A的一致性为52%。通... 纤维糊精酶(cellodextrinase)属纤维素酶类中的一类,可以从短链纤维素分子上水解糖苷键生成葡萄糖或纤维二糖。曾克隆了纤维糊精酶DM1的编码基因,该酶与生黄瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)的Cellodextrinase A的一致性为52%。通过人工合成基因的方法合成了细菌来源的3个分别为家族_4_9(GenBank索引号为AAA73869)、家族Ⅲc(GenBank索引号为BABB33148)和家族10(GenBank索引号为CAA60493)的纤维素结合功能域(CBD)和连接桥(linker)的DNA序列。通过把编码纤维糊精酶DM1(GenBank索引号为ACA61162)的催化功能域(CD)的DNA序列与合成的CBD和连接桥的DNA序列进行融合,构建了3个融合酶,并分别在大肠杆菌BL21中得到过量表达。纤维素结合实验表明,3个纯化的融合酶对结晶纤维素(Avicel)和滤纸粉末均有结合能力,融合酶CBD_4_9-DM1、DM1-CBD10和DM1-CBDⅢc与结晶纤维素(Avicel)结合的蛋白质占总蛋白的比例分别为58.60%、51.16%和21.13%,与滤纸粉末结合的蛋白质占总蛋白的比例分别为65.59%、60.47%和22.54%,证实与原始酶相比3个融合酶的CBD均有纤维素结合的功能。酶学特性研究表明,融合酶的最适pH、最适温度、pH稳定性和温度稳定性等没有显著改变,均未检测到3个融合酶有新的活性,但它们对p-nitrophenylβ-D-cellobioside(pNPC)、p-nitrophenyl-β-D-glucopyranoside(pNPG)和lichenan等底物的比活力显著降低。3个融合酶CBD_4_9-DM1、DM1-CBD10和DM1-CBDⅢc对pNPC的比活力分别为原始酶DM1的26%、2%和2%,对lichenan的比活力分别为原始酶DM1的12%、8%和2%,几乎检测不到后两个融合酶对pNPG的酶活。 展开更多
关键词 纤维糊精酶 纤维素结合功能域 基因融合 DNA合成
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面向领域分析在软件构件化开发中的应用
3
作者 杨波 傅锦伟 娄七明 《红河学院学报》 2007年第2期43-45,49,共4页
软件构件技术是当前软件开发技术的主要动向之一.围绕面向特定领域软件构件的开发,将领域分析引入到软件构件化开发中,有助于产生具有较高的可复用性构件,并以贸易公司信息管理系统为案例,进一步深化对此方法的探讨.
关键词 软件构件 领域分析 cbd 软件复用
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基于UML的构件检索 被引量:1
4
作者 冯艳华 房鼎益 +1 位作者 陈晓江 刘炜 《计算机应用与软件》 CSCD 北大核心 2006年第8期48-49,73,共3页
基于构件的软件开发(CBD)是当前大型软件系统开发方法的主流,而CBD的基础是构件库及其检索方法。目前主要采用从领域模型中获得特定领域知识辅助用户进行构件检索,但缺乏较好的领域模型表示方法。本文对使用UML表示领域模型进行了研究,... 基于构件的软件开发(CBD)是当前大型软件系统开发方法的主流,而CBD的基础是构件库及其检索方法。目前主要采用从领域模型中获得特定领域知识辅助用户进行构件检索,但缺乏较好的领域模型表示方法。本文对使用UML表示领域模型进行了研究,提出了一个利用UML和领域词典中的领域知识辅助用户刻画领域、扩充和求精初始查询、形成用户的构件需求并指导构件库检索,通过行为相似性确定构件的构件检索方法。该方法增强了用户对领域知识的了解,在检索过程中充分考虑了与构件相关的领域知识、检索上下文以及用户的意图,可对结果集进行有效筛选评优,极大地提高了查全率、查准率及用户的满意度。为了验证该方法的可行性和有效性,设计并实现了一个高效的构件检索环境。 展开更多
关键词 cbd 构件检索 领域模型 复用构件库 UML
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内切纤维素酶在纤维素底物上的初始吸附动力学 被引量:1
5
作者 秦薇薇 付时雨 +2 位作者 刘浩 柴欣生 詹怀宇 《造纸科学与技术》 北大核心 2011年第3期66-70,59,共6页
应用双波长紫外分光光度法实时监测了两种内切纤维素酶(EGV和EGI)在α-纤维素上的初始吸附,并结合动力学方程探讨了可能的吸附机理。实验结果表明,带纤维素结合域(CBD)的内切纤维素酶在底物上的吸附非常迅速,仅需4min左右即可达到准稳态... 应用双波长紫外分光光度法实时监测了两种内切纤维素酶(EGV和EGI)在α-纤维素上的初始吸附,并结合动力学方程探讨了可能的吸附机理。实验结果表明,带纤维素结合域(CBD)的内切纤维素酶在底物上的吸附非常迅速,仅需4min左右即可达到准稳态,其吸附动力学曲线与准二阶动力学模型的预测值几乎完全一致。通过改变纤维素酶EGV的初始浓度得到的平衡吸附数据符合Langmuir等温吸附模型,表明该酶的初始吸附可能是单分子层化学吸附。内切纤维素酶EGI的吸附动力学较为复杂,约每7min即发生明显的脱附,然后重新吸附。内切纤维素酶的特异性吸附是由CBD决定的,缺少CBD的内切纤维素酶以缔合的形式沉积在纤维表面,其吸附动力学更多依赖于其胶体化学性质。 展开更多
关键词 内切纤维素酶 初始吸附 纤维素结合域 动力学模型 等温吸附
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微生物纤维素结合域的研究及在生物技术中的应用 被引量:1
6
作者 郑小玲 林陈水 《纤维素科学与技术》 CAS CSCD 2008年第2期66-72,共7页
概述了微生物纤维素结合域的来源、分类及作用机理,总结了近年来微生物纤维素结合域在亲和层析、细胞固定化、诊断学、蛋白质工程、靶向定位及体内细胞壁修饰等领域的应用状况。
关键词 纤维素结合域 生物应用 亲和层析
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嗜热真菌纤维素酶的CBD与海栖热袍菌的纤维素酶融合表达 被引量:5
7
作者 乐易林 邵蔚蓝 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期837-841,共5页
将嗜热真菌毛壳菌纤维素酶Cel7A的纤维素结合结构域编码区与极端嗜热厌氧菌海栖热袍菌的纤维素酶CelB基因进行融合,构建重组质粒pHsh-CBD-CelB,并在大肠杆菌中表达。对融合蛋白进行纯化,通过热处理和离子交换层析,纯化到的融合蛋白SDS-P... 将嗜热真菌毛壳菌纤维素酶Cel7A的纤维素结合结构域编码区与极端嗜热厌氧菌海栖热袍菌的纤维素酶CelB基因进行融合,构建重组质粒pHsh-CBD-CelB,并在大肠杆菌中表达。对融合蛋白进行纯化,通过热处理和离子交换层析,纯化到的融合蛋白SDS-PAGE电泳图谱显示为单一条带。对融合蛋白的特性研究,结果表明融合蛋白降解CMC的最适反应温度为90°C,结晶纤维素吸附实验表明该融合蛋白具有结合结晶纤维素的能力,并且融合蛋白降解CMC与结晶纤维素的能力得到提高。 展开更多
关键词 海栖热袍菌 嗜热毛壳菌 纤维素结合结构域(cbd) 融合蛋白
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抗猪流行性腹泻病毒纳米单链抗体CNC-CBD-scFv的制备及鉴定 被引量:3
8
作者 刘慧敏 李浩 +3 位作者 朱文娇 常琛 路万平 杨国庆 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1256-1260,1268,共6页
为防治猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV),本文制备纳米化抗PEDV单链抗体(singlechain fragment,scFv)并验证其生物学特性。通过PCR方法扩增含有纤维素结合结构域(cellulose binding domain,CBD)的单链抗体基因CB... 为防治猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV),本文制备纳米化抗PEDV单链抗体(singlechain fragment,scFv)并验证其生物学特性。通过PCR方法扩增含有纤维素结合结构域(cellulose binding domain,CBD)的单链抗体基因CBD-scFv,构建抗PEDV的原核重组表达载体pET19b-CBD-scFv,鉴定正确后进行蛋白表达与鉴定。经硫酸水解法制备纳米纤维素(cellulose nanocrystal,CNC)后,将纯化复性后的CBD-scFv蛋白与CNC孵育结合得到纳米抗体CNC-CBD-scFv,通过SDS-PAGE和透射电镜鉴定复合物的结合效果。SDS-PAGE与Westernblot结果表明抗体蛋白CBD-scFv正确表达;制备的纳米纤维素粒度均达到纳米材料级别;CNC与CBD-scFv结合后SDS-PAGE与透射电镜结果说明CNC与CBD-scFv在室温条件下可高效结合。本试验在高效表达合成复合纳米抗体材料的同时为PEDV的防治及应用奠定了一定的试验基础。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 纤维素结合结构域 cbd-scFv 纳米纤维素
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十字花科黑腐病菌纤维素酶主效基因XC0639 CBD结构域功能的分析
9
作者 高亚君 冯艳茹 +3 位作者 欧金清 林玲 杭小红 姜伯乐 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期139-142,共4页
十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris,Xcc)几乎能引起所有十字花科植物产生黑腐病[1]。该菌是研究植物与病原微生物互作的模式菌株之一[2]。植物病原菌在侵染宿主植物时需要先降解植物细胞的细胞壁,纤维素和半纤维... 十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris,Xcc)几乎能引起所有十字花科植物产生黑腐病[1]。该菌是研究植物与病原微生物互作的模式菌株之一[2]。植物病原菌在侵染宿主植物时需要先降解植物细胞的细胞壁,纤维素和半纤维素是细胞壁的主要成分。纤维素酶是降解纤维素生成葡萄糖的一类复合酶,主要由内切葡聚糖酶、外切葡聚糖酶以及β-葡萄糖苷酶3类酶组成,三者作用方式不同,但能协同催化水解纤维素[3]。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 XC0639基因 纤维素酶 cbd
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幽门螺杆菌黏附素BabA的致病性 被引量:2
10
作者 谷娅楠 季娜 +3 位作者 邓国英 刘欣 孙文长 杨淑凤 《生命的化学》 CAS CSCD 2019年第3期611-615,共5页
幽门螺杆菌在人群中感染非常普遍。全世界约有三分之二人口感染了幽门螺杆菌。长期慢性幽门螺杆菌感染能诱发炎症,如慢性胃炎和溃疡,甚至恶性肿瘤(如黏膜胃癌和相关淋巴组织淋巴瘤)。吸附在胃黏膜上是幽门螺旋杆菌定植宿主和诱发炎症的... 幽门螺杆菌在人群中感染非常普遍。全世界约有三分之二人口感染了幽门螺杆菌。长期慢性幽门螺杆菌感染能诱发炎症,如慢性胃炎和溃疡,甚至恶性肿瘤(如黏膜胃癌和相关淋巴组织淋巴瘤)。吸附在胃黏膜上是幽门螺旋杆菌定植宿主和诱发炎症的第一步,在此过程中,细菌很多外膜蛋白发挥了关键作用。本文将重点论述幽门螺杆菌外膜蛋白中的血型结合黏附素(blood-group-antigen-binding adhesin, BabA),并从宿主受体分子、黏附区域晶体结构和酸适应性等方面阐述其在幽门螺杆菌致病过程中的作用。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 血型结合黏附素 LEWIS B抗原 糖结合区域
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抗大豆胰蛋白酶抑制剂单链抗体表达与纯化方法优化
11
作者 刘玉婷 王琼 +4 位作者 谢亮 程小玲 彭静 屈品均 辛化伟 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期287-292,共6页
[目的]利用大肠杆菌毒素蛋白VTB的五聚体化结构域(VT1B)及梭菌纤维素酶的纤维素结合结构域(CBD),异源表达其与抗大豆胰蛋白酶抑制剂单链抗体(anti-BBI Sc Fv)的融合蛋白,对该单链抗体表达与纯化方法进行优化。[方法]构建CBD-VT1B-... [目的]利用大肠杆菌毒素蛋白VTB的五聚体化结构域(VT1B)及梭菌纤维素酶的纤维素结合结构域(CBD),异源表达其与抗大豆胰蛋白酶抑制剂单链抗体(anti-BBI Sc Fv)的融合蛋白,对该单链抗体表达与纯化方法进行优化。[方法]构建CBD-VT1B-anti-BBI Sc Fv融合蛋白大肠杆菌表达系统;应用Ni-NTA树脂与微晶纤维素两步亲和层析法提纯单链抗体融合蛋白。[结果]单链抗体融合蛋白在大肠杆菌中得到大量表达,通过两步纯化法获得了高纯度的融合蛋白,纯度比Ni-NTA树脂一步纯化法提高约12~34%;五聚体融合蛋白与纤维素的结合能力及蛋白纯化效率比单体蛋白提高约1倍。[结论]通过增加纤维素标签和五聚体化结构域,抗大豆胰蛋白酶抑制剂五聚体化单链抗体融合蛋白的纯化效果得到提高。 展开更多
关键词 抗大豆胰蛋白酶抑制剂单链抗体(anti-BBI ScFv) 五聚体化结构域(VT1B) 纤维素结合结构域(cbd)
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Using recombinant adhesive proteins as durable and green flame-retardant coatings 被引量:1
12
作者 Weng I.Leong Owen Lok In Lo +2 位作者 Fong Tin Cheng Wai Man Cheong Leo Chi U.Seak 《Synthetic and Systems Biotechnology》 SCIE 2021年第4期369-376,共8页
Current fire retardants are known to be toxic to humans and our environment.As environmental-friendly flame retardants(FRs),protein-based flame retardants have been studied extensively recently,even though they are no... Current fire retardants are known to be toxic to humans and our environment.As environmental-friendly flame retardants(FRs),protein-based flame retardants have been studied extensively recently,even though they are not durable.In this study,we designed,synthesized and tested a durable protein-based FR through the fusion of the adhesion domain from either mussel foot protein-5(mfp-5)or cellulose-binding domain(CBD)with flame retardant protein(SR protein and alpha casein).We first verified the expression of the recombinant proteins in Escherichia coli using Western blot.Then,we coated the fusion protein(carrying cell lysates)to cotton fabrics and wood and verified with Infrared(IR)spectroscopy.Using a vertical burning test and wood flammability test,we confirmed the flame retardancy of the materials after the protein coating.In the vertical burning test,the SR protein and alpha casein flame retardant proteins with the CBD adhesion domain showed a 50.0%and 43.3%increase in flame retardancy.The data is also consistent in the wood flame retardancy test.Confocal imaging experiments also suggested these new fire retardants can be preserved on the materials well even after washing.Overall,our results showed that flame-retardant proteins with adhesion domains are high potential candidates of green alternative flame retardants. 展开更多
关键词 Flame retardant protein Cellulose-binding domain(cbd) Mussel foot protein-5(mfp-5)
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