淀粉酶系中淀粉结合域的结构和功能的研究进展

很多淀粉酶中都具有淀粉结合区域(starch-bindingdomain,SBD),如!-淀粉酶、β-淀粉酶、麦芽糖四糖水解酶、麦芽五糖水解酶、麦芽糖!-淀粉酶、环化糊精葡萄糖转移酶(即CGT酶)等。SBD可以和生淀粉相结合,进而破坏结合表面的结构,起到加速淀粉水解的作用。在酶分子中,SBD具有非常特殊的结构,这种结构赋予了它特殊的功能。本文论述了SBD的结构;具有SBD的酶各个区域的特点;SBD的进化;以及近些年来科学工作者们对这个区域的研究进展。

α-淀粉酶AmyP中淀粉结合结构域的鉴定

【目的】检测具有生淀粉降解活性的新型α-淀粉酶AmyP是否具有淀粉结合结构域(SBD)。【方法】通过结构域预测和序列分析,推测AmyP的C端是一个SBD。将这段序列克隆、表达和重组蛋白纯化后,采用亲和电泳和生淀粉吸附两种方法对重组表达的蛋白进行研究。【结果】AmyP的C端序列是一个新型的SBD,根据序列特征可以将其划分在碳水化合物结合结构域(CBM)20家族。该SBD与生大米淀粉的吸附能力最强,生玉米淀粉次之,不能与生小麦淀粉、生马铃薯淀粉和生绿豆淀粉吸附。【结论】α-淀粉酶AmyP在蛋白C端具有一个SBD,有助于理解AmyP快速偏好性降解生淀粉的能力。