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陆地棉CC-NBS-LRR基因的克隆及特征分析 被引量:7
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作者 张保龙 杨郁文 +6 位作者 倪万潮 佘建明 沈新莲 何晓兰 张香桂 徐英俊 姚姝 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2006年第4期351-355,共5页
根据抗病基因核苷酸结合位点(Nuc leotide b ind ing site,NBS)设计简并性引物,从陆地棉cDNA中进行RT-PCR扩增。获得含NBS保守域的EST,进一步用RACE技术和TAIL PCR技术获得其中1个EST的全长基因序列,并获得GHNBS基因的5′调控序列。此... 根据抗病基因核苷酸结合位点(Nuc leotide b ind ing site,NBS)设计简并性引物,从陆地棉cDNA中进行RT-PCR扩增。获得含NBS保守域的EST,进一步用RACE技术和TAIL PCR技术获得其中1个EST的全长基因序列,并获得GHNBS基因的5′调控序列。此基因被命名为GHNBS。该基因的编码区长2 583 bp,编码861个氨基酸,GHNBS编码的氨基酸序列与拟南芥R基因具有28%的同源性。GHNBS与拟南芥的其他几个NBS-LRR基因比较发现,它们在保守区外的相似性相当低。Southern杂交和网上数据库搜索分析都表明GHNBS是1个寡拷贝基因。通过半定量RT-PCR分析发现GHNBS在棉花的蕾、花瓣、韧皮部、根及叶中均有表达且在根、叶中表达量比其它部位强,在木质部基本不表达。 展开更多
关键词 陆地棉 cc—nbs—lrr基因 GHnbs 基因表达
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Structural and Functional Insights into an Arabidopsis NBS-LRR Receptor in Nicotiana benthamiana
2
作者 Jianzhong Huang Xiuying Guan +3 位作者 Xiaoju Zhong Peng Jia Hongbin Zhang Honglei Ruan 《American Journal of Molecular Biology》 CAS 2024年第2期84-96,共13页
Nucleotide-binding site leucine-rich repeat receptors (NBS-LRR/NLRs) are crucial intracellular immune proteins in plants. Previous article reported a novel NLR protein SUT1 (SUPPRESSORS OF TOPP4-1, 1), which is involv... Nucleotide-binding site leucine-rich repeat receptors (NBS-LRR/NLRs) are crucial intracellular immune proteins in plants. Previous article reported a novel NLR protein SUT1 (SUPPRESSORS OF TOPP4-1, 1), which is involved in autoimmunity initiated by type one protein phosphatase 4 mutation (topp4-1) in Arabidopsis, however, its role in planta is still unclear. This study employed Nicotiana benthamiana, a model platform, to conduct an overall structural and functional analysis of SUT1 protein. The transient expression results revealed that SUT1 is a typical CNL (CC-NBS-LRR) receptor, both fluorescence data and biochemical results showed the protein is mainly anchored on the plasma membrane due to its N-terminal acylation site. Further truncation experiments announced that its CC (coiled-coil) domain possessed cell-death-inducing activity. The outcomes of point mutations analysis revealed that not only the CC domain, but also the full-length SUT1 protein, whose function and subcellular localization are influenced by highly conserved hydrophobic residues. These research outcomes provided favorable clues for elucidating the activation mechanism of SUT1. 展开更多
关键词 cc-nbs-lrr Hypersensitive Response Nicotiana benthamiana Plasma Membrane Localization
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‘大白谷’CC-NBS-LRR蛋白编码基因抗干尖线虫侵染时空表达研究 被引量:5
3
作者 陈俏丽 王峰 +7 位作者 李丹蕾 孔畅仪 牛春阳 张瑞芝 王博文 刘爽 史欣悦 张荣 《中国农学通报》 2015年第21期279-283,共5页
为深入探究‘大白谷’(Oryza sativa L.ssp.Indica)感病的分子机理,以及抗病基因在发病过程中所起的作用,克隆了‘大白谷’CC-NBS-LRR蛋白编码基因Os11g RGA8,对Os11g RGA8基因进行了生物信息学分析,并对其在水稻抗干尖线虫侵染过程中... 为深入探究‘大白谷’(Oryza sativa L.ssp.Indica)感病的分子机理,以及抗病基因在发病过程中所起的作用,克隆了‘大白谷’CC-NBS-LRR蛋白编码基因Os11g RGA8,对Os11g RGA8基因进行了生物信息学分析,并对其在水稻抗干尖线虫侵染过程中的功能进行了研究。Os11g RGA8基因位于11号染色体,其编码蛋白含有733个氨基酸,等电点为5.99,相对分子质量为84355.07。序列分析表明该氨基酸序列含有RX-CC、AAA_22、NBS和LRR_4这4个结构域,Os11g RGA8基因编码抗病蛋白属于CC-NBSLRR抗病蛋白家族。Q-PCR结果显示,接种水稻干尖线虫SAMN02420038的籼型常规稻‘大白谷’,与CK组‘大白谷’相比,Os11g RGA8基因表达量表现为上调,且24 h内上调增幅较缓,48 h时上调增幅突然上涨,72 h时上调增幅又出现下降,表明该基因参与‘大白谷’天然免疫反应过程,在水稻干尖线虫侵染过程中起到一定抗性作用。 展开更多
关键词 cc-nbs-lrr 大白谷 水稻干尖线虫 Q-PCR R基因
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青花菜CC-NBS-LRR抗病基因BoCNL1的克隆与分析
4
作者 黄笑梅 金建峰 +4 位作者 张雪 朱思眉 朱柯柯 赵罗鹏 蒋明 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期259-263,共5页
根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849... 根据已知序列设计PCR引物,从青花菜中克隆1个NBS-LRR(核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复)抗病基因BoCNL1;在生物信息学分析的基础上,利用RT-PCR研究该基因在不同器官中的表达模式。测序结果表明,BoCNL1基因的编码区全长为2 550 bp,编码849个氨基酸;编码蛋白具CC(卷曲螺旋)、NBS和LRR结构域;进化分析结果表明,BoCNL1与不结球白菜的关系最近,在进化树上处于同一分支,与醉蝶花的关系最远;RT-PCR结果表明,BoCNL1在根、花茎、叶、花蕾、开放的花和嫩角果中均有表达,但表达量低。 展开更多
关键词 青花菜 抗病基因 cc-nbs-lrr 基因克隆
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黄瓜CC-NBS-LRR家族基因鉴定及在霜霉病和白粉病胁迫下的表达分析
5
作者 康忱 赵雪芳 +3 位作者 李亚栋 田哲娟 王鹏 吴志明 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第19期3751-3766,共16页
【目的】对黄瓜全基因组的CC-NBS-LRR(CNL)基因家族进行生物信息学和表达模式分析,为深入研究CNL基因家族在黄瓜生长、发育和病害胁迫响应中的功能提供参考。【方法】以拟南芥CNL为参考序列,利用本地Perl语言和Pfam等软件检索黄瓜‘993... 【目的】对黄瓜全基因组的CC-NBS-LRR(CNL)基因家族进行生物信息学和表达模式分析,为深入研究CNL基因家族在黄瓜生长、发育和病害胁迫响应中的功能提供参考。【方法】以拟南芥CNL为参考序列,利用本地Perl语言和Pfam等软件检索黄瓜‘9930’基因组并确定黄瓜CNL基因家族成员。通过ExPASy、GSDS2.0、MEGA、MEME、Tbtools、Mev等工具对黄瓜CNL家族基因进行生物信息学分析。根据转录组数据库、霜霉病菌(Pseudoperonospora cubensis)、白粉病菌(Podosphaera xanthii)接种处理和实时荧光定量PCR技术分析该类基因的表达模式。【结果】从黄瓜全基因组中鉴定得到17个CsCNL,这些基因分布在除1号染色体外的6条染色体上,其编码蛋白与其他植物CNL结构相似,均含有CC、NBS和LRR保守结构域,蛋白质大小介于197—1148 aa,分子量在22.6—131.3 kD,等电点在5.71—8.38。共线性分析表明其中不存在片段重复和串联重复基因,多物种系统进化关系表明,CsCNL基因家族成员在葫芦科植物之间具有较高的结构和功能相似性。CsCNL启动子中存在多种与抗病相关的顺式作用元件。CsCNL表达具有组织特异性。在接种霜霉病菌2 d和5 d后,Csa3G815400、Csa3G822360和Csa7G420890在抗性品种中均显著上调表达,Csa4G015850在抗性品种中下调表达,在敏感品种中显著性表现不一;在接种白粉病菌2 d和5 d后,Csa2G008000和Csa3G684170在敏感品种中显著上调表达,在抗性品种中显著下调表达;Csa4G016360、Csa7G420890和Csa7G425940在抗性品种中显著上调表达,在敏感品种中表达量无变化或显著下调。【结论】CsCNL家族成员具有组织表达特异性并且多数基因能够响应霜霉病菌和白粉病菌的胁迫。推测Csa3G815400、Csa3G822360和Csa7G420890表达量增加,Csa4G015850表达量减少可诱发抗病黄瓜品种的霜霉病抗病反应;Csa4G016360、Csa7G420890和Csa7G425940表达量增加,Csa2G008000和Csa3G684170表达量减少可诱发抗病黄瓜品种的白粉病抗病反应;而Csa7G420890表达量的增加能同时诱发抗病黄瓜品种的霜霉病和白粉病的抗病反应。 展开更多
关键词 黄瓜 cc-nbs-lrr(CNL) 霜霉病 白粉病 基因表达
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草莓NBS-LRR家族基因FaNBS1的克隆与表达分析 被引量:12
6
作者 刘建成 段可 +3 位作者 李静 叶正文 苏建宇 高清华 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1025-1031,共7页
利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异... 利用同源克隆结合RACE技术从久香草莓茎尖cDNA中分离到一个抗病相关TIR-NBS-LRR类基因FaNBS1(GenBank登录号:HQ845018),解析了该基因及其编码蛋白的组织结构和同源特征;并采用半定量RT-PCR技术分析了该基因在不同组织中的表达差异和外源植物生长物质处理下的表达变化。该基因在基因组上长为2434bp,由3个外显子组成的转录本包含长1893bp的读码框。所编码蛋白含630个氨基酸残基,在15~146是保守的TIR结构域,191~492是NB-ARC结构域。FaNBS1与大豆TIR-NBS-LRR抗性蛋白ADF78118的全序列一致性为50.20%,在NB-ARC保守结构域的一致性为52.06%。半定量RT-PCR分析显示,FaNBS1在检测的所有组织中都表汰佃存摹套分年组织中表达水平最高,日存叶中的表达水平明显受到外源水杨酸和脱落酸处理的影响. 展开更多
关键词 草莓 nbs—lrr基因 同源克隆 基因结构 进化树 RT—PCR
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拟南芥基因组NBS-LRR类基因家族的生物信息学分析 被引量:9
7
作者 王岩 李兆阳 +5 位作者 唐心龙 卢姗 许鹏 张静 方奎 席景会 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第15期40-45,共6页
【研究目的】对拟南芥(Arabidopsis thaliana)中含有核苷酸结合位点(Nucleotide binding site,NBS)和富含亮氨酸的重复序列(Leucine-richrepeat,LRR)类基因进行了分析。【方法】利用TAIR、Pfam网站,数据库和Chromosome Map Tool、MEGA3.... 【研究目的】对拟南芥(Arabidopsis thaliana)中含有核苷酸结合位点(Nucleotide binding site,NBS)和富含亮氨酸的重复序列(Leucine-richrepeat,LRR)类基因进行了分析。【方法】利用TAIR、Pfam网站,数据库和Chromosome Map Tool、MEGA3.0、ClustalX软件,分析确定NBS-LRR基因及其类型、染色体物理分布、系统发育学关系。【结果】在拟南芥全基因组中共有204个NBS-LRR类基因,大多位于1号和5号染色体上,其中71.6%的NBS-LRR类基因分布在基因簇内。对NBS-LRR类基因家族进行了氨基酸多序列比对和系统进化树分析,NBS-LRR类基因家族可分为四个亚家族。另外,NBS-LRR基因在进化过程中存在较多的复制现象。 展开更多
关键词 拟南芥 生物信息学 基因家族 nbs—lrr
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小麦NBS-LRR类抗病基因同源序列的分离与鉴定 被引量:14
8
作者 黄萱 徐子勤 +1 位作者 陈立余 王健 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2006年第2期91-96,共6页
根据已知植物抗病基因的保守区域设计引物,从抗锈病小麦品种西农88基因组DNA扩增出3条与植物抗病基因同源的序列,分别为WRGA1、WRGA2和WRGA14。这三条同源片段均含有典型的NBS-LRR类抗病基因所拥有的保守性结构域Kinase-2a、Kinase-3a... 根据已知植物抗病基因的保守区域设计引物,从抗锈病小麦品种西农88基因组DNA扩增出3条与植物抗病基因同源的序列,分别为WRGA1、WRGA2和WRGA14。这三条同源片段均含有典型的NBS-LRR类抗病基因所拥有的保守性结构域Kinase-2a、Kinase-3a和疏水结构域(HD).它们与部分已知NBS-LRR类抗病基因的氨基酸序列同源性为46.0%-9.9%,三个片段间在氨基酸水平上的同源性为80.7%-56.8%。Northern杂交表明WRGA1在小麦中受水杨酸正调控,属诱导型表达。 展开更多
关键词 小麦 nbs—lrr 同源克隆技术 抗病基因同源序列 水杨酸
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水稻中富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点(LRR-NBS)基因家族的生物信息学分析 被引量:7
9
作者 孙学辉 路铁刚 +1 位作者 贾士荣 黄大昉 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期1-7,共7页
采用HMM(HiddenMarkovModel) ,对源于日本晴的粳稻 (国际水稻测序计划 ,IRGSP)基因组和 9311的籼稻基因组 (北京华大 ,BGI)的蛋白质数据库进行了搜索 ,分别获得了 32 5和 344个富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点 (leucinerichrepeat... 采用HMM(HiddenMarkovModel) ,对源于日本晴的粳稻 (国际水稻测序计划 ,IRGSP)基因组和 9311的籼稻基因组 (北京华大 ,BGI)的蛋白质数据库进行了搜索 ,分别获得了 32 5和 344个富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点 (leucinerichrepeat-nucleotidebindingsite ,LRR -NBS)类的抗病基因的蛋白序列 ,并得到了与这些蛋白相应的cDNA序列。对粳稻蛋白功能结构域的分析表明 ,多个蛋白具有与植物防卫反应相关的结构域 ,还发现多个蛋白中存在着与转座 /反转座酶或蛋白所具有的结构域。对 2套数据同源性分析表明 ,粳稻中 4 8个基因在籼稻中可以确定存在orthologs基因 ,且几乎所有的粳稻基因在籼稻中都存在高度同源的对应基因。对这些蛋白的表达情况进行了EST库搜索 ,确定粳稻和籼稻中分别有 95和 79个蛋白表达。对粳稻和籼稻的所有LRR NBS类蛋白的NBS结构域氨基酸序列进行了多序列比对和系统进化分析 ,在粳稻中可以确定为 2 6 3个簇 ,这些簇大多只含 1个基因 ,是一个冗余度不高的基因家族。且除了个别族外 。 展开更多
关键词 水稻 亮氨酸 重复序列 核苷酸 结合位点 lrr—nbs 基因家族 生物信息学分析
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香蕉NBS-LRR类抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:9
10
作者 袁克华 冯仁军 +1 位作者 程萍 张银东 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第5期271-274,共4页
根据已知植物抗病基因的保守区域设计引物,从香蕉基因组DNA扩增出一条与植物抗病基因同源的序列,命名为BRGAl,该同源片段含有典型的NBS—LRR类抗病基因所拥有的保守性结构p-loop、Kinase-2a、Killase-3a和疏水结构域HD,它与部分已知... 根据已知植物抗病基因的保守区域设计引物,从香蕉基因组DNA扩增出一条与植物抗病基因同源的序列,命名为BRGAl,该同源片段含有典型的NBS—LRR类抗病基因所拥有的保守性结构p-loop、Kinase-2a、Killase-3a和疏水结构域HD,它与部分已知NBS-LRR类抗病基因的氨基酸序列同源性为23.8%-42.7%。Northern杂交表明BRGA1在香蕉中受水杨酸调控,属诱导型表达。 展开更多
关键词 香蕉nbs—lrr 同源克隆技术 抗病基因同源序列 水杨酸
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香蕉NBS-LRR抗病基因类似序列的克隆和分析(英文) 被引量:3
11
作者 莫庭辉 黄俊生 +2 位作者 杜中军 徐立 陈业渊 《热带作物学报》 CSCD 2006年第3期46-50,共5页
根据大多数抗病基因的核苷酸结合区(NBS)和富含亮氨酸重复序列(LRR)保守区的氨基酸序列设计PCR简并引物,利用快速而又可行的简并PCR技术获得NBS-LRR类抗病基因类似序列。笔者利用该技术从香蕉cDNA中获得了一个NBS-LRR类抗病基因类似序列... 根据大多数抗病基因的核苷酸结合区(NBS)和富含亮氨酸重复序列(LRR)保守区的氨基酸序列设计PCR简并引物,利用快速而又可行的简并PCR技术获得NBS-LRR类抗病基因类似序列。笔者利用该技术从香蕉cDNA中获得了一个NBS-LRR类抗病基因类似序列,命名为B-NB(SAY739270)。结构域分析发现,B-NBS含有NBS蛋白所具有的P-Loop、Kinase-2、Kinase-3a和下游疏水GLPLAL结构域(HD,GLPLAL)4个保守基序。聚类分析发现,B-NBS与已报道的6个植物抗病基因的NBS基序的遗传距离在21.7之内。因此,B-NBS是一个香蕉NBS-LRR类抗病基因类似序列。本研究将为香蕉抗病基因克隆和抗病机理研究提供新的抗病候选基因资源。 展开更多
关键词 香蕉 抗病基因 类似序列 nbs—lrr
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小麦NBS-LRR类抗病基因同源cDNA序列的克隆与表达分析 被引量:8
12
作者 任晓娣 刘彦慧 +4 位作者 李建嫄 张娜 彭巧慧 杨文香 刘大群 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期69-74,79,共7页
为获得小麦抗叶锈病相关基因,以小麦近等基因系TcLr19所构建的非亲和cDNA文库中获得的EST序列(Contig 914)为靶序列,用RT-PCR方法和cDNA末端快速扩增技术,分离克隆到片段为3 042bp的全长cDNA序列。序列分析表明该序列符合典型单子叶植物... 为获得小麦抗叶锈病相关基因,以小麦近等基因系TcLr19所构建的非亲和cDNA文库中获得的EST序列(Contig 914)为靶序列,用RT-PCR方法和cDNA末端快速扩增技术,分离克隆到片段为3 042bp的全长cDNA序列。序列分析表明该序列符合典型单子叶植物的CC-NBS-LRR结构模式,命名为TaNLR。该基因包含一个完整的2 739bp的开放阅读框(ORF),具有连续的Poly A尾和典型的加尾信号AATTAA。ProtParam程序预测表明该基因编码912个氨基酸。发育树分析显示该氨基酸序列与大麦的NBS-LRR类抗病基因蛋白同源性最高达89%。荧光定量PCR分析表明,在小麦与叶锈菌互作中,TaNLR基因受叶锈菌诱导下调表达。本研究在TcLr19小麦中成功获得了抗病同源基因,这为明确NBS-LRR在小麦抗叶锈病中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦 核苷酸结合位点(nbs) 富含亮氨酸重复(lrr) 抗病基因同源序列(RGAs) cDNA末端快速扩增技术(RACE) 实时定量PCR(real-time PCR)
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芝麻NBS-LRR类抗病基因同源序列的分离与分析 被引量:2
13
作者 高树广 刘红彦 +2 位作者 王俊美 倪云霞 田保明 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第9期81-85,共5页
分离和分析芝麻抗、感茎点枯病材料的抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),可以为芝麻抗茎点枯病相关基因的克隆奠定基础。根据已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守结构域,合成了1对简并引物和2对特异引物,对6个抗茎点枯病芝... 分离和分析芝麻抗、感茎点枯病材料的抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),可以为芝麻抗茎点枯病相关基因的克隆奠定基础。根据已知植物抗病基因的NBS-LRR类保守结构域,合成了1对简并引物和2对特异引物,对6个抗茎点枯病芝麻品种中的抗病基因进行扩增,结果得到11条抗病基因同源序列。BLAST X分析发现,获得的11条RGAs与已知的RGAs有较高的相似性,氨基酸相似性为42%~57%。聚类分析将其分成5个亚类,均属于non-TIR-NBS-LRR类抗病基因。其氨基酸序列都不同程度地含有NBS保守区的典型特征基序,其中P-loop-GLPL区域氨基酸序列与已知抗病基因对应区域的相似性为18.2%~49.7%。 展开更多
关键词 芝麻 茎点枯病 nbs—lrr 抗病基因同源序列
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巴西橡胶NBS-LRR抗病基因类似物多样性分析 被引量:1
14
作者 游启孙 莫廷辉 +3 位作者 曾丽星 张影波 解辉 欧阳超 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期371-376,共6页
【目的】克隆巴西橡胶抗病基因同源序列,为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础。【方法】根据已知抗病基因(Resistance gene, R gene)编码的蛋白质NBS-LRR保守结构设计一对简并引物 P1/P2,采集经水杨酸(SA)处理0、12、24、48 h的... 【目的】克隆巴西橡胶抗病基因同源序列,为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础。【方法】根据已知抗病基因(Resistance gene, R gene)编码的蛋白质NBS-LRR保守结构设计一对简并引物 P1/P2,采集经水杨酸(SA)处理0、12、24、48 h的巴西橡胶叶片,进行cDNA同源序列克隆。【结果】序列分析结果表明,克隆获得的RGAs经系统进化分析分为TIR-NBS-LRR和non-TIR-NBS-LRR 两种类型和9个基因家族;多重比较发现,克隆获得的RGAs具有典型的NBS类抗病基因保守结构域,在与已知植物NBS类序列相似性比较中,与I2c-2基因相似性最高,为46.2%,而巴西橡胶NBS类RGAs之间氨基酸相似性为22.1%~100.0%。进一步研究发现,核苷酸非同义替换和同义替换的比率小于1,有低水平的重组,表明点突变逐步积累是导致纯化选择的主要力量。【结论】通过SA诱导作用和NBS类抗病基因结合得到的巴西橡胶NBS类RGAs具有广泛的遗传多样性,并与已知抗病基因氨基酸序列具高度相似性,这些RGAs候补序列可能与某抗病基因有密切联系。 展开更多
关键词 巴西橡胶 水杨酸 nbs—lrr 抗病基因同源序列(RGAs) 核苷酸结合位点(nbs)
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Characterization of an Organ Specific and Pathogen Responsive CC-NBS-LRR Gene from Cotton(Gossypium hirsutum L.) 被引量:3
15
作者 ZHANG Bao-long,NI Wan-chao,YANG Yu-wen,SHEN Xin-lian(Institute of Agro-biotechnology,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Zhongling Street 50,Nanjing 210014,China) 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2008年第S1期74-,共1页
Cotton diseases represent a major challenge to cotton growth.Cloning of a cotton pathogen response gene and promoter is of great importance to improve disease resistance.In this study,a
关键词 lrr nbs Characterization of an Organ Specific and Pathogen Responsive cc-nbs-lrr Gene from Cotton cc
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植物TIR-NB-LRR类型抗病基因各结构域的研究进展 被引量:11
16
作者 尹玲 方辉 +2 位作者 黄羽 卢江 曲俊杰 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期186-190,共5页
植物抗病反应是一个多基因调控的复杂过程,在这个过程中R基因发挥了非常重要的作用。根据其氨基酸基序组成以及跨膜结构域的不同,R基因可以分为多种类型,其中NBS-LRR类型是植物基因组中最大的基因家族之一。TIR-NB-LRR类型的抗病基因又... 植物抗病反应是一个多基因调控的复杂过程,在这个过程中R基因发挥了非常重要的作用。根据其氨基酸基序组成以及跨膜结构域的不同,R基因可以分为多种类型,其中NBS-LRR类型是植物基因组中最大的基因家族之一。TIR-NB-LRR类型的抗病基因又是NB-LRR类型中的一大类,也是目前抗病基因研究的热点。该文总结了TIR-NB-LRR类型抗病基因各个结构域的功能和相关的研究进展。相关研究表明,TIR结构域主要通过自身或异源的二聚体化介导抗性信号的转导,但也有部分研究表明,该结构域可能参与病原菌的特异性识别。NBS结构域常被认为具有"分子开关"的功能,它可以通过结合ADP或ATP来调节植物抗病蛋白的构象变化,从而调节下游抗病信号的传导。LRR结构域在植物与病原菌互作的过程中可以通过与病原菌的无毒蛋白直接或间接互作来特异识别病原菌。也有研究发现,LRR结构域具有调节信号传导的功能。这些信息将为研究植物抗病机理提供理论依据,也为将来通过基因编辑技术对作物进行定向抗病育种提供思路。 展开更多
关键词 抗病基因 TIR结构域 nbs结构域 lrr结构域
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巴西橡胶NBS类抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:4
17
作者 张影波 庞玉新 +3 位作者 莫廷辉 董美超 解辉 蔡秀清 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第24期11453-11455,共3页
[目的]探讨巴西橡胶NBS类抗病基因同源序列的克隆与序列分析。[方法]以高抗炭疽病的巴西橡胶无性系R042为材料,根据抗病基因Prf、L6、N等的P-loop和GLPL保守结构域设计简并引物,从R042扩增具有抗病基因同源序列的片段,对分离获得的抗病... [目的]探讨巴西橡胶NBS类抗病基因同源序列的克隆与序列分析。[方法]以高抗炭疽病的巴西橡胶无性系R042为材料,根据抗病基因Prf、L6、N等的P-loop和GLPL保守结构域设计简并引物,从R042扩增具有抗病基因同源序列的片段,对分离获得的抗病基因同源序列进行Blastn、氨基酸同源性分析、序列比较和系统进化分析。[结果]从巴西橡胶高抗炭疽病无性系R042基因组DNA中分离获得1个NBS类抗病基因同源序列,经Blastn比对后发现,该抗病基因同源序列与毛果杨中的一个CC-NBS-LRR抗病蛋白的mRNA的序列同源性为66%,Blastn的E值为2e-24,推测氨基酸序列与已知抗病基因的相似性在26.9%~43.2%。[结论]序列比对与系统进化分析表明,该抗病基因同源序列具有NBS类抗病基因的所有保守序列,且与Xa1的亲缘关系最近。 展开更多
关键词 巴西橡胶 核苷酸结合位点(nbs) 亮氨酸重复(lrr) 抗病基因同源序列(RGA)
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番茄SlNBRP1基因的克隆及抗病性的研究 被引量:1
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作者 黄曼 于淑坤 +2 位作者 张琳 刘永胜 苗敏 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第8期1131-1135,共5页
作物病害是农业生产的主要限制因子之一,利用植物抗病基因(R基因)培育抗性品种是防治植物病害最环保、有效、直接的手段。植物体内绝大多数R基因编码含有卷曲螺旋结构、核苷酸结合位点和富含亮氨酸重复序列(coiled-coil nucleotide-bind... 作物病害是农业生产的主要限制因子之一,利用植物抗病基因(R基因)培育抗性品种是防治植物病害最环保、有效、直接的手段。植物体内绝大多数R基因编码含有卷曲螺旋结构、核苷酸结合位点和富含亮氨酸重复序列(coiled-coil nucleotide-binding site and leucine-rich-repeat,CC-NBS-LRR)结构域的蛋白质。文章通过酵母双杂筛选鉴定得SlNBRP1基因,利用植物基因工程技术,构建植物过表达载体pBI121-35S::SlNBRP1;通过农杆菌介导法,将SlNBRP1基因导入野生型番茄基因组中,得到转基因植株。通过生物信息学分析SlNBRP1蛋白序列,发现含有高度保守的CC结构域和NBS结构域。采用Real-time聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)分析转基因植株中SlNBRP1 mRNA的表达情况,结果显示SlNBRP1的表达量显著下调,表现出共抑制(co-suppression,CoR),即基因间相互作用引起的失活现象。番茄病原菌丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae pv.Tomato DC3000,Pst DC3000)侵染野生型和共抑制转基因植株发现,共抑制转基因植株抗病性下降且叶片菌量增加,表明SlNBRP1基因正调控植物对病原菌的免疫反应。该文为遗传育种改良作物抗病性增加了新的分子靶标。 展开更多
关键词 番茄 cc-nbs-lrr结构域 共抑制 Pst DC3000 抗病性
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马铃薯抗晚疫病种质资源中抗病基因的筛选 被引量:1
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作者 李晓川 王朝海 +9 位作者 周平 马维 陈军 陆燚 吴显 王宗明 吴瑞 宋治豪 马杰 付毅 《贵州农业科学》 CAS 2023年第2期1-7,共7页
【目的】筛选晚疫病抗病种质资源的晚疫病抗病基因,为马铃薯晚疫病抗性种质创新与利用提供依据。【方法】利用转录组测序技术分析马铃薯抗感晚疫病材料(广谱晚疫病抗性材料野生种Solanum demissum品系cs47)和易感材料(卡它丁、大西洋、... 【目的】筛选晚疫病抗病种质资源的晚疫病抗病基因,为马铃薯晚疫病抗性种质创新与利用提供依据。【方法】利用转录组测序技术分析马铃薯抗感晚疫病材料(广谱晚疫病抗性材料野生种Solanum demissum品系cs47)和易感材料(卡它丁、大西洋、底西瑞)间差异表达基因,利用GO数据库预测差异表达基因的功能,Clustal Omega程序比对氨基酸序列,MEGA6绘制氨基酸序列进化树。【结果】利用马铃薯抗病种质资源cs47筛选得到PGSC0003DMP400045185、PGSC0003DMP400015105和PGSC0003DMP400015107共3个潜在的晚疫病抗性基因,与3个易感晚疫病品种比分别有6 084~6 547个和6 264~6 316个基因表达水平显著上升和显著下降。在显著差异表达水平的基因中,3个cc-NBS-LRR类基因和已克隆的晚疫病抗性基因拥有类似的蛋白结构域。【结论】广谱晚疫病抗性材料野生种S.demissum品系cs47含有PGSC0003DMP400045185、PGSC0003DMP400015105和PGSC0003DMP400015107共3个潜在的晚疫病抗性基因,转录组测序技术有助于分离晚疫病抗病基因。 展开更多
关键词 马铃薯 晚疫病 抗病基因 转录组测序 cc-nbs-lrr基因
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辣椒抗病基因同源序列的克隆与分析 被引量:18
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作者 张丽英 陈儒钢 +4 位作者 张俊红 欧阳波 肖景华 李汉霞 叶志彪 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期169-175,共7页
【目的】利用同源序列法分离辣椒抗病基因同源序列。【方法】根据已知植物抗病基因的NBS-LRR保守结构域设计简并引物,以辣椒品系PR205基因组DNA为模板对抗病基因同源序列进行扩增。【结果】获得了25个抗病基因同源序列(resistance gene ... 【目的】利用同源序列法分离辣椒抗病基因同源序列。【方法】根据已知植物抗病基因的NBS-LRR保守结构域设计简并引物,以辣椒品系PR205基因组DNA为模板对抗病基因同源序列进行扩增。【结果】获得了25个抗病基因同源序列(resistance gene analogs,RGAs),聚类分析将其分为7个不同的类别。由其核酸序列推导的氨基酸序列与Mi-1.2、prf、Hero、I2C-1、RPM1基因相应区域的同源性为27.4%~98.2%。其中RGA-p20与Mi-1.2基因的核苷酸和氨基酸序列相似性均达到99%,确认RGA-p20为抗根结线虫基因的一部分,即辣椒中也含有与Mi基因同源的根结线虫抗性基因。【结论】本研究在辣椒品系PR205中获得了抗病基因同源序列,为辣椒抗病基因的克隆奠定了基础。 展开更多
关键词 辣椒 抗病基因同源序列 抗病基因 nbs—lrr
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