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2017-2019年济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行病学和基因组学分析
1
作者
王珊
杜照中
+5 位作者
尹强
韩淑琪
赵剑
江亚娟
王胜男
温红玲
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期879-886,共8页
目的了解济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行情况及其基因组特征。方法采集2017-2019年流行前期、流行期、流行后期不同年龄组健康人群的咽拭子标本,进行菌株分离培养、生化试验、血清凝集试验,分离到的菌株进行基因测序,利用PubMLST数据...
目的了解济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行情况及其基因组特征。方法采集2017-2019年流行前期、流行期、流行后期不同年龄组健康人群的咽拭子标本,进行菌株分离培养、生化试验、血清凝集试验,分离到的菌株进行基因测序,利用PubMLST数据库进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、疫苗抗原分析,利用IQ-TREE和Splits Tree构建系统发育树。结果2017-2019年共检测1086份健康人群咽拭子标本,分离出21株脑膜炎奈瑟菌,健康人群平均带菌率为1.93%。其中流行前期带菌率为0.93%,流行期带菌率为2.30%,流行后期带菌率为1.83%。17~19岁人群带菌率较高,3~5岁儿童及≥20岁成人中未检出阳性菌株。检出的21株菌株中,B群15株,C群1株,不可分群5株。通过基因组分析,主要的ST型为ST-12301和ST-14655,ST-17464、ST-17465、ST-17466、ST-17467和ST-17468为本研究新发现的ST型。进行基因测序的19株菌株中,有8株属于4821克隆群,其余菌株不属于确定的克隆群,有3株血清型为不可分群的菌株但其基因型为B型。结论济宁市2017-2019年健康人群中脑膜炎奈瑟菌血清群以B群为主。本研究新发现5种MLST序列型,提示近几年菌株基因组存在微进化。MLST序列型的变迁有可能导致流行模式发生改变,有必要开展持续监测。17~20岁人群带菌率高,应密切关注菌株在人群中的扩散传播,以防引起流脑病例。
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关键词
脑膜炎奈瑟菌
健康人群
血清群
核心基因组多位点序列分型
系统发育树
4821克隆群
下载PDF
职称材料
中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征
被引量:
2
2
作者
赵盼
朱兵清
+4 位作者
张艾煜
徐丽
高源
余建兴
邵祝军
《疾病监测》
CAS
2020年第6期508-512,共5页
目的了解中国脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)高致病性ST-4821克隆群(CC4821)荚膜基因簇分布特征,为流行性脑脊髓膜炎的传播扩散机制研究提供依据。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等软件分析41株Nm全基因组序列,分析...
目的了解中国脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)高致病性ST-4821克隆群(CC4821)荚膜基因簇分布特征,为流行性脑脊髓膜炎的传播扩散机制研究提供依据。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等软件分析41株Nm全基因组序列,分析荚膜基因簇序列差异性、序列重组和基因排布等特征。结果荚膜基因簇ACE区差异较大,重组现象多集中在AC区。D和D′区有明显差异序列,表明这2个区并非精准复制。荚膜基因簇存在基因反转现象。结论Nm高致病性CC4821荚膜基因簇呈现多态性、重组和基因反转等多种荚膜调节机制,可能有助于该克隆群菌株的传播扩散。
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关键词
脑膜炎奈瑟菌
cc4821
荚膜基因簇
分布特征
原文传递
题名
2017-2019年济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行病学和基因组学分析
1
作者
王珊
杜照中
尹强
韩淑琪
赵剑
江亚娟
王胜男
温红玲
机构
山东大学公共卫生学院
济宁市疾病预防控制中心
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期879-886,共8页
文摘
目的了解济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行情况及其基因组特征。方法采集2017-2019年流行前期、流行期、流行后期不同年龄组健康人群的咽拭子标本,进行菌株分离培养、生化试验、血清凝集试验,分离到的菌株进行基因测序,利用PubMLST数据库进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)、疫苗抗原分析,利用IQ-TREE和Splits Tree构建系统发育树。结果2017-2019年共检测1086份健康人群咽拭子标本,分离出21株脑膜炎奈瑟菌,健康人群平均带菌率为1.93%。其中流行前期带菌率为0.93%,流行期带菌率为2.30%,流行后期带菌率为1.83%。17~19岁人群带菌率较高,3~5岁儿童及≥20岁成人中未检出阳性菌株。检出的21株菌株中,B群15株,C群1株,不可分群5株。通过基因组分析,主要的ST型为ST-12301和ST-14655,ST-17464、ST-17465、ST-17466、ST-17467和ST-17468为本研究新发现的ST型。进行基因测序的19株菌株中,有8株属于4821克隆群,其余菌株不属于确定的克隆群,有3株血清型为不可分群的菌株但其基因型为B型。结论济宁市2017-2019年健康人群中脑膜炎奈瑟菌血清群以B群为主。本研究新发现5种MLST序列型,提示近几年菌株基因组存在微进化。MLST序列型的变迁有可能导致流行模式发生改变,有必要开展持续监测。17~20岁人群带菌率高,应密切关注菌株在人群中的扩散传播,以防引起流脑病例。
关键词
脑膜炎奈瑟菌
健康人群
血清群
核心基因组多位点序列分型
系统发育树
4821克隆群
Keywords
Neisseria meningitidis
healthy population
serogroup
cgMLST
phylogenetic tree
cc4821
分类号
R378.15 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征
被引量:
2
2
作者
赵盼
朱兵清
张艾煜
徐丽
高源
余建兴
邵祝军
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
出处
《疾病监测》
CAS
2020年第6期508-512,共5页
基金
国家科技重大专项(No.2018ZX10101002–001)
国家自然科学基金(No.81602903)。
文摘
目的了解中国脑膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis,Nm)高致病性ST-4821克隆群(CC4821)荚膜基因簇分布特征,为流行性脑脊髓膜炎的传播扩散机制研究提供依据。方法使用Artemis、MEGA 6、SimPlot和RDP等软件分析41株Nm全基因组序列,分析荚膜基因簇序列差异性、序列重组和基因排布等特征。结果荚膜基因簇ACE区差异较大,重组现象多集中在AC区。D和D′区有明显差异序列,表明这2个区并非精准复制。荚膜基因簇存在基因反转现象。结论Nm高致病性CC4821荚膜基因簇呈现多态性、重组和基因反转等多种荚膜调节机制,可能有助于该克隆群菌株的传播扩散。
关键词
脑膜炎奈瑟菌
cc4821
荚膜基因簇
分布特征
Keywords
Neisseria meningitidis
Clonal complex 4821
Capsular locus
Distribution characteristic
分类号
R378.1 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2017-2019年济宁市健康人群脑膜炎奈瑟菌流行病学和基因组学分析
王珊
杜照中
尹强
韩淑琪
赵剑
江亚娟
王胜男
温红玲
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
中国脑膜炎奈瑟菌ST-4821克隆群荚膜基因簇分布特征
赵盼
朱兵清
张艾煜
徐丽
高源
余建兴
邵祝军
《疾病监测》
CAS
2020
2
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