牛源CCL28基因克隆、生物学特性及mRNA表达分析

为了探究牛趋化因子CCL28基因编码蛋白的生物学特性及其mRNA在奶牛不同器官中的表达水平,试验采用PCR方法扩增并克隆奶牛CCL28基因CDS全长序列;通过生物信息学软件对其编码蛋白进行分析并构建系统进化树;应用实时荧光定量PCR方法检测CCL28基因mRNA在奶牛不同器官中的表达情况。结果表明:CCL28基因编码蛋白是一种结构较不稳定、带正电的亲水性蛋白,由129个氨基酸组成;牛CCL28基因核苷酸序列与绵羊的同源性较高,达到94.3%,与绵羊的遗传距离较近;CCL28蛋白的二级结构主要由无规则卷曲和α-螺旋构成,主要存在于细胞外,可能与CCR10、CCR3、ACKR2等蛋白存在互作关系;平均信号肽分值为0.901,没有跨膜结构域;CCL28基因mRNA在奶牛多个器官中均有表达,其中乳腺中的表达量极显著高于其他器官(P<0.01),肝脏和肾脏次之。说明CCL28基因可能在乳腺组织免疫过程中发挥调控作用。