基于生物信息学鉴定CCNB2为肾嫌色细胞癌进展的关键基因

本研究旨在通过生物信息学方法筛选与肾嫌色细胞癌(Chromophobe renal cell carcinoma, chrcc)相关的生物标志物,作为预测chrcc预后的关键基因。GSE15641数据集从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中获取,共鉴定出1153个差异表达基因(DEGs)。随后,检测差异表达基因进行基因本体(GO)注释和京都基因基因组百科全书(KEGG)途径富集分析。此外,利用Cytoscape软件构建蛋白–蛋白相互作用(PPI)网络并可视化鉴定关键基因,包括KRAS、EGFR、EHHADH和CCNB2,根据Kaplan-Meier (K-M)生存分析,CCNB2是唯一重要的核心基因。根据我们的研究结果,CCNB2在The Cancer Genome Atlas(TCGA)-chrcc患者中的表达明显高于正常样本,并且CCNB2在癌症组织中的高表达与不良的临床病理因素有关。CCNB2高表达组与低表达组相比,总生存期(OS)和无进展间期(PFI)明显较差。同时,免疫浸润分析显示CCNB2表达与chrcc患者Th2细胞富集水平呈正相关,CCNB2表达与细胞毒性细胞和DC细胞呈负相关。最后,根据包括CCNB2基因在内的基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)富集结果,肝癌(HCC)亚类与乳腺癌(BC)的分类存在显著差异。在目前的工作中,CCNB2可以被认为是chrcc的预测性分子标记物和潜在的治疗靶点。

CCNB2、Sox11及miR-21在子宫内膜癌中的表达及临床意义

目的:探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)、SRY-盒转录因子11(Sox11)及miR-21在子宫内膜癌中的表达及临床意义。方法:选择2015年1月至2017年12月诊治的子宫内膜癌患者(EMC组)及子宫内膜良性疾病患者(CON组)为研究对象,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CCNB2、Sox11及miR-21表达。采用蛋白质印迹法(Western blot)检测CCNB2、Sox11蛋白表达。比较不同临床病理因素中CCNB2、Sox11及miR-21表达的差异。采用ROC曲线分析血清CCNB2、Sox11及miR-21预测子宫内膜癌患者死亡效能。Logistic回归分析子宫内膜癌预后不良的危险因素。Kaplan-Meier法分析CCNB2、Sox11和miR-21表达与生存期的关系。结果:EMC组患者肿瘤组织中CCNB2、Sox11及miR-21相对表达量及CCNB2、Sox11蛋白表达均显著高于癌旁组织及CON组(均P<0.05)。Ishikawa、ECC-1、Hec50co和RL95-2子宫内膜癌细胞中CCNB2、Sox11及miR-21相对表达量及CCNB2、Sox11蛋白表达量均显著高于正常人子宫内膜上皮细胞HEMEC(均P<0.05)。EMC组患者肿瘤组织中CCNB2、Sox11及miR-21表达在分化程度、组织学分级、肌层浸润深度、淋巴结转移及FIGO分期中的差异有统计学意义(均P<0.05)。CCNB2、Sox11及miR-21表达预测子宫内膜癌患者死亡截断值分别为1.2、0.8、1.5,敏感度分别为0.771、0.827、0.833,特异性分别为0.785、0.762、0.701。低分化、组织学分级G3、肌层浸润深度>1/2、有淋巴结转移、III期、CCNB2相对表达量≥1.2、Sox11相对表达量≥0.8、miR-21相对表达量≥1.5为子宫内膜癌患者死亡的危险因素(P<0.05)。CCNB2表达≥1.2且Sox11表达≥0.8且miR-21表达≥1.5子宫内膜癌患者中位生存期显著低于CCNB2表达<1.2或Sox11表达<0.8或miR-21表达<1.5患者[中位生存期(27.2±6.4)月比(32.5±6.8)月,Logrank=9.821,P<0.05]。结论:子宫内膜癌患者CCNB2、Sox11及miR-21表达显著升高,与分化程度、组织学分级、肌层浸润深度、淋巴结转移及FIGO分期、生存期及死亡风险密切相关,可作为子宫内膜癌病情及预后评估的标志物。

山羊CCNB2和ALDH1L2基因多态性与产羔性能的关联分析

有报道显示,CCNB2与ALDH1L2基因与动物繁殖存在一定的联系,但关于他们在山羊繁殖中的作用还未清晰,为了改进山羊育种,提供有用的遗传标记,首先对3种山羊品种(济宁青山羊,辽宁绒山羊,云上黑山羊)768只母羊CCNB2基因和ALDH1L2基因的8个候选位点进行基因分型,之后再进行群体遗传和关联分析。结果表明,8个候选位点均存在多态性,CCNB2基因中除g.51957276C>T位点在济宁青山羊和辽宁绒山羊中为低度多态性(PIC<0.25)外,其余位点均处于中度多态性(0.25<PIC<0.5);ALDH1L2基因除g.67261430C>G位点在云上黑山羊和济宁青山羊群体中为中度多态性(0.25<PIC<0.5)外,其余位点均为低度多态性(PIC<0.25)。卡方检验结果表明,ALDH1L2基因大部分位点在3个群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),CCNB2基因g.51957276T>C位点在云上黑山羊和济宁青山羊群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),其余位点均处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。在云上黑山羊中ALDH1L2基因g.67260707A>T位点TT型个体的产羔数显著高于AA型个体,在窝重上则没有显著性。综上所述,ALDH1L2基因的g.67260707A>T位点的突变可作为云上黑山羊产羔数选择的潜在分子标记。

转录因子MKL1通过激活CCNB2转录促进肺癌转移

目的 :在人肺腺癌细胞中,研究转录因子MKL1是否参与了肺肿瘤细胞的迁移和侵袭过程,并且调控的信号通路是否涉及细胞周期蛋白2(CCNB2)活性的改变。方法:在肺癌细胞中感染MKL1病毒构建稳定细胞系,分析抑制MKL1表达对肿瘤细胞生长及迁移能力的影响;Real-time PCR(RT-PCR)法检测内源MKL1缺失对CCNB2 m RNA水平的影响;荧光素酶报告基因法分析干扰内源MKL1对CCNB2启动子表达的作用。结果:软琼脂种植实验显示当MKL1表达被抑制后,形成的集落明显减少,表明MKL1能够促进肿瘤恶化。通过绘制生长曲线发现感染组MKL1表达被抑制后,细胞增殖能力下降。荧光素酶报告基因实验显示MKL1的小RNA干扰转染细胞后,CCNB2启动子的表达显著降低,抑制率达70%。RT-PCR实验显示MKL1干扰后CCNB2的m RNA水平明显降低。以上差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 :稳定敲除MKL1的肺癌细胞系出现生长减慢、侵袭能力降低等特性。MKL1干扰后CCNB2的转录活性和m RNA水平都显著降低。本研究为早期肺癌的诊断和治疗提供了依据。

CCNB2在结直肠癌组织中的表达及其临床意义

目的统计结直肠癌中CCNB2的表达情况,分析结直肠癌中CCNB2阳性表达的临床意义。方法随机选取2010年6月-2013年11月份我院在手术治疗中留取的结直肠癌病标本57例和癌旁正常组织标本49例,用免疫组化法检测CCNB2蛋白表达,用实时定量PCR法检测CCNB2 m RNA表达。结果 CCNB2蛋白阳性表达主要在细胞质,偶见于细胞核。结直肠癌组织中CCNB2 m RNA相对表达量（36.52±8.82）和CCNB2蛋白阳性表达率（86.21%）均显著高于癌旁正常组织,P〈0.05,差异具有显著性。结论 CCNB2在结直肠癌组织呈高表达,有望作为诊断和预后的参考指标。

太行鸡CCNB2基因剪接异构体的克隆鉴定及其在卵泡发育中的表达模式分析

【目的】试验旨在克隆鸡细胞周期素B2(cyclin B2,CCNB2)基因不同剪接异构体,并对其进行生物信息学和组织表达分析。【方法】采用反转录PCR技术对太行鸡CCNB2基因不同剪接异构体进行扩增和克隆,采用生物信息学软件对CCNB2基因不同剪接异构体的部分核苷酸序列进行比对,比较不同物种CCNB2不同剪接异构体的氨基酸序列相似性并构建系统进化树,对其进行亚细胞定位及二级结构预测。利用实时荧光定量PCR技术分析CCNB2基因不同剪接异构体在太行鸡卵巢和不同发育时期卵泡中的相对表达量。【结果】太行鸡CCNB2基因存在3种剪接异构体,即CCNB2-AS1、CCNB2-AS2和CCNB2-AS3,分别编码390、383和401个氨基酸。太行鸡CCNB2-AS1、CCNB2-AS2和CCNB2-AS33个剪接体之间的氨基酸序列相似性均为97.00%,这3个剪接体均与原鸡的相似性最高,分别为99.71%、99.71%和100%。3个剪接异构体在进化上与原鸡亲缘关系最近,其次为雉鸡。亚细胞定位结果表明,3个剪接异构体均主要定位于细胞质;蛋白质二级结构分析显示,3种剪接异构体均以α-螺旋为主;CCNB2-AS1、CCNB2-AS2和CCNB2-AS3在太行鸡不同发育时期卵泡中的相对表达量存在差异,并且不同剪接异构体在同一时期卵泡中的表达趋势也存在差异,其中CCNB2-AS1在等级前卵泡中高表达;而CCNB2-AS2在大白卵泡中表达量显著高于其他时期(P<0.05),且在其他时期均以较低水平表达;CCNB2-AS3的表达则与CCNB2-AS1呈现相反的表达趋势,在等级卵泡中高表达。【结论】本研究成功鉴定到太行鸡CCNB2基因的3种剪接异构体,其在各时期卵泡中均有表达,但在等级前卵泡中的表达趋势存在差异。

CCNB2过表达对非小细胞肺癌不良预后的预测效果研究

目的探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达及对预后的影响。方法实时荧光定量聚合酶链反应和免疫组织化学法测定CCNB2 mRNA和蛋白在NSCLC肿瘤组织及临近非肿瘤组织中的表达水平,分析其与患者临床病理特征的关系。结果肿瘤组织中CCNB2 mRNA和蛋白表达量高于非肿瘤组织(P<0.05),且其表达水平与肿瘤分化等级、直径、淋巴结转移、远处转移及临床分期呈正相关(P<0.05),同时CCNB2高表达是患者生存率预后不良的危险因素。结论肿瘤组织中CCNB2高表达与NSCLC不良预后密切相关。

CCNB2在肾透明细胞癌中的表达意义与功能网络关系分析

分析细胞周期蛋白B2(CCNB2)在肾透明细胞癌中的表达及与临床预后的关系,建立CCNB2共表达网络并探讨其潜在的作用机制。采用GEPIA和UALCAN数据库分析CCNB2在肾透明细胞癌临床样本中的表达情况,获得CCNB2与肾透明细胞癌的病理分期及预后的关系,同时检测肾透明细胞癌及癌旁临床组织中目的mRNA的表达;通过cBioportal和String数据库分析CCNB2在肾透明细胞癌的功能作用,建立CCNB2共表达网络;DVIAD和KEGG数据库在线分析共表达网络功能及富集的信号通路。结果表明:CCNB2在肾透明细胞癌组织中高表达,并且与肾透明细胞癌的病理分期及预后呈现正相关性。从cBioportal数据库获得肾透明细胞癌患者数据,挖掘得到CCNB2表达关系密切的83个基因,建立CCNB2功能网络。进一步采用DVIAD和KEGG数据库在线分析发现富集的基因主要参与细胞周期、卵母细胞减数分裂和卵细胞成熟通路等信号通路,共表达基因功能显示为微管结合、微管运动活性和微管蛋白结合等。因此,CCNB2在肾透明细胞癌组织中显著高表达,并与患者预后、临床病理分期呈正相关,这些预示着CCNB2不仅能够作为肾透明细胞癌诊断、病理分期和预后的重要分子标志物,还是肾透明细胞癌潜在的治疗靶标。

CCNB2在结直肠癌中的表达及临床意义

目的:探讨细胞周期蛋白B2(Cyclin B2,CCNB2)在结直肠癌组织中的表达及其临床意义。方法:选择45对结直肠癌组织及癌旁正常结直肠组织样本,分别采用实时定量PCR(qRT-PCR)方法和免疫组织化学技术检测CCNB2的mRNA和蛋白表达,并进一步分析CCNB2的表达与结直肠癌临床病理特征之间的关系。结果:结直肠癌组织中CCNB2 mRNA的表达显著高于癌旁正常结直肠组织,差异有统计学意义(P<0.001),且CCNB2的mRNA表达与结直肠癌的肿瘤大小、浸润深度及TNM分期显著相关(P<0.05),与年龄、性别、肿瘤位置、分化程度、脉管神经浸润、淋巴结转移和远处转移均无关(P>0.05)。45例结直肠癌标本中39例表达(+^+++),6例表达(-)。CCNB2蛋白主要表达于结直肠癌细胞质中,少量见于细胞核。结直肠癌组织中CCNB2蛋白的阳性表达率为86.7%,显著高于癌旁正常结直肠组织,并与患者的性别、年龄、分化程度和肿瘤转移均无显著相关性(P>0.05),但与肿瘤分期、浸润程度均显著相关(P<0.05)。结论:CCNB2在结直肠癌中呈异常高表达,且与结直肠癌的发生发展相关,有望作为结直肠癌的诊断和预后预测参考指标。

CCNB2作为潜在生物标志物在肾透明细胞癌组织中的表达及临床意义

目的检测细胞周期蛋白B2(CCNB2)在人肾透明细胞癌组织中的表达情况,分析其临床意义。方法采用生物信息学的方法分析CCNB2在肾透明细胞癌组织及正常组织中的mRNA水平,并分析其表达与肾透明细胞癌患者的生存率间的关系。回顾性分析98例接受手术治疗的肾透明细胞癌患者临床病理资料。采用免疫组化法检测肾透明细胞癌组织和癌旁正常组织中的CCNB2蛋白表达水平,分析其与肾透明细胞癌患者临床病理特征的关系。结果生物信息学分析结果显示,CCNB2的mRNA在肾透明细胞癌组织中显著高表达,并与患者总生存率和无病生存率显著相关。免疫组化结果表明,CCNB2在肾透明细胞癌组织中高表达,而在癌旁正常组织中低表达或无表达。CCNB2在肾透明细胞癌组织中的高表达与肿瘤分期和肿瘤大小相关(均P<0.05),而与年龄、性别、肿瘤分级无关(均P>0.05)。结论CCNB2在肾透明细胞癌发生和发展中发挥重要作用,其有望成为肾透明细胞癌重要的治疗靶点和预后标志物。

细胞周期蛋白B2在恶性肿瘤中的研究进展

细胞周期蛋白B2(CCNB2)是一种在细胞分裂周期G2/M期转变中起关键调控作用的蛋白质。CCNB2在多种恶性肿瘤组织中的表达水平异常,并参与到肿瘤的生长、凋亡、和转移等过程;研究发现,作为一种分子标记物,CCNB2在提高恶性肿瘤的诊断效率及改善患者预后方面具有巨大的潜在价值。本文综合近年来国内外的研究,将其在恶性肿瘤中的研究进展作出综述。

脑胶质瘤组织中细胞周期蛋白B2的表达变化及其与患者临床病理特征、预后的关系

目的观察细胞周期蛋白B2(CCNB2)在脑胶质瘤组织中的表达变化,并探讨其与患者临床病理特征及预后的关系。方法选择首次接受外科手术的脑胶质瘤患者65例作为观察组,同期因颅脑外伤行颅内减压手术的患者30例作为对照组。观察组术中收集其脑胶质瘤组织,对照组术中收集其切除的脑组织,采用免疫组化法检测脑组织CCNB2表达。术后随访记录观察组生存时间,分析CCNB2表达与观察组临床病理特征及生存时间的关系。结果观察组脑胶质瘤组织CCNB2阳性表达率为50.8%(33/65),对照组为16.7%(5/30),两组比较P<0.01。观察组脑胶质瘤组织CCNB2阳性表达与患者WHO分级、p53基因型、Ki-67表达均有关(P均<0.05),与患者性别、年龄、肿瘤位置、KPS评分、肿瘤直径均无关(P均>0.05)。观察组脑胶质瘤组织CCNB2阳性表达患者生存时间为(44.0±5.7)月,阴性表达患者为(81.0±6.4)月,两者比较P<0.01。结论脑胶质瘤组织中CCNB2蛋白表达升高,CCNB2蛋白表达升高可能参与了脑胶质瘤的发生与发展,并提示患者预后不良。