CCR2和CCR5基因多态性与结核性脓胸的关系

目的探讨CCR2基因-190 G/A和CCR5基因-59029 G/A单核苷酸多态性(SNP)与结核性脓胸的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对结核性脓胸患者300例和健康对照组300例进行CCR2基因-190 G/A和CCR5基因-59029 G/A SNPs检测。结果与CCR2基因-190 GG基因型相比,携带AG和AA基因型均可增加结核性脓胸发病风险(OR=2.254,95%CI 1.043~4.868;OR=8.728,95%CI 4.224~18.033)。进行分层分析发现,无卡介苗(BCG)接种史、体质量指数(BMI)<18.5 kg/m^2均增加结核性脓胸发病风险(OR=3.309,95%CI 2.108~4.382;OR=2.767,95%CI 1.918~3.993)。CCR5基因-59029 G/A各基因型未入选回归方程,无统计学意义(P>0.05)。结论CCR2基因-190 G/A SNP可能与结核性脓胸的发病风险有关;CCR5基因-59029 G/A SNP可能与结核性脓胸无关。

中国汉族人HIV-1辅助受体等相关基因CCR5、CCR2b、CXCR4和SDF1编码区SNP位点调查

目的调查中国汉族人群中HIV-1感染相关基因CCR5、CCR2b、CXCR4及SDF1编码区的基因多态性特点,为我国的艾滋病防治提供基础数据。方法 CCR5用2对引物进行PCR扩增,用PCR产物做模板直接测序。CCR2b编码区经PCR扩增后,用测序引物逐段分别测序。CXCR4(cDNA编号AF147204)编码区用2对引物进行PCR扩增,然后测序。SDF1编码区用4对引物进行PCR扩增,然后分别测序。样本总数为45例,测序结果用DNAstar综合分析,寻找和鉴定SNP位点。结果 CCR5基因编码区共发现6个SNP位点,4个引起氨基酸改变,1个单碱基缺失,引起移码突变和翻译提前终止。184A→G、503G→T、668G→A、999G→T等位基因频率分别为1.1％、21.1％、8.9％和10.0％。CCR2b编码区共发现8个SNP位点,6个错义突变,即43位G→C、190位G→A、260位C→A、302位C→A、315位G→C、433位G→A,突变频率分别为:30.0％、27.8％、32.2％、5.6％、10.0％和3.3％。CXCR4编码区共发现7个SNP位点,3个错义突变即38位C→T、90位A→T、712位A→C,1个终止突变:106位G→T,基因突变频率分别为:4.4％、4.4％、10.0％和3.3％。在SDF1编码区发现1个错义SNP位点:192位G→T,突变频率为8.9％;1例单碱基缺失:100位T缺失(100△T),引起34位氨基酸移码突变。结论中国汉族人HIV-1相关基因编码区有自己的多态性特点。4个HIV-1相关基因编码区共找到22个SNP位点,17个为首次报道;2个单碱基缺失均导致移码突变和翻译提前终止,1个已经报道。它们对HIV-1感染和艾滋病病程的影响值得进一步研究。

老年高血压患者CCR基因多态性研究

目的探索中国老年汉族人群中CCR5和CCR2基因多态性与原发性高血压的相关性。方法入选的高血压患者(n=187)和非高血压对照者(n=98)均为中国老年汉族人群,提取外周血基因组DNA。采用PCR法检测CCR5Δ32突变,PCR-测序法检测CCR2-64I基因型。结果所有被研究者中均未发现CCR5Δ32突变基因型。高血压组中CCR2-64I杂合子59例(31.55%),纯合子16例(8.56%),CCR2-64I等位基因频率为24.3%;非高血压对照组中CCR2-64I杂合子34例(34.69%),纯合子4例(4.08%),CCR2-64I等位基因频率为21.4%。等位基因多态性在该群体中呈Hardy-Weinberg平衡分布,两组等位基因频率及基因型比较有差别,但均无统计学意义(P>0.05)。结论该研究在中国老年汉族人群中未检出CCR5Δ32突变基因型,且未证实CCR2-64I基因位点与高血压相关。

基质衍生因子1等基因多态性在人群中的分布

目的 探讨SDF1-3’A、CCR2 -64I、-2 518MCP -1基因多态性在皖籍汉族人群中的分布。方法 运用PCR -RFLP方法确定SDF1-3 /A和 -2 518MCP -1基因多态性 ,运用ARMS方法确定CCR2 -64I基因多态性。结果 皖籍汉族人 -2 518MCP -1G等位基因突变频率为 64% ,高于西班牙人、美国黑人、高加索人 ,均有显著性差异(P <0 0 1)。CCR2 -64I等位基因突变频率为 2 5% ,高于美国黑人和高加索人 (P <0 0 1)。SDF1-3’A等位基因突变频率为 2 2 % ,高于美国黑人 ,但与国内其他地区均无显著性差异 (P <0 0 5)。结论 皖籍汉族人 -2 518MCP -1、CCR2 -64I。

CCR2和CCR5基因多态性与结核性脓胸的相关性研究

目的 探讨CCR2基因-190G/A和CCR5基因-59029G/A单核苷酸多态性（SNP）与结核性脓胸的相关性。方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对200例结核性脓胸患者和200例健康人进行-190G/A和-59029G/A SNPs检测,采用逐步logistic回归分析其与结核性脓胸的相关性。结果 与CCR2基因-190G/G基因型相比,携带A/G和A/A基因型均可增加结核性脓胸发病风险（OR=2.250,95%CI=1.046-4.842,P=0.037和OR=8.706,95%CI=4.232-17.909,P=0.000）。无卡介苗接种史亦增加结核性脓胸发病风险（OR=3.031,95%CI=2.109-4.356,P=0.000）。CCR5基因-59029G/A位点各基因型未进入回归方程,与结核性脓胸的发病风险无明显相关性。结论 CCR2基因-190G/A SNP与结核性脓胸有相关性,CCR5基因-59029G/A SNP可能与结核性脓胸无关。

CCR2基因rs1799864多态性与儿童噬血性淋巴组织细胞增生症的关联研究

目的探讨CCR2基因单核苷酸多态性（SNP）位点V64I（rs1799864）与儿童噬血性淋巴组织细胞增生症（HLH）发病的关联性。方法收集2007年1月至2013年12月确诊为HLH的86例患儿的临床资料,采用SNaPshot基因分型技术对HLH患儿和128例健康对照进行CCR2基因rs1799864位点分型,比较两组该SNP位点基因型和等位基因频率的差异;以及HLH患儿不同临床特征与rs1799864位点基因型分布的关系。结果与对照组相比,HLH组rs1799864位点的基因型和等位基因频率差异均无统计学意义（均P〉0.05）;就发病年龄是否〈1岁、治疗后1 d体温是否恢复正常及治疗后2~3周血小板是否恢复正常等不同临床特征的HLH患儿基因型分布进行比较后发现差异均具有统计学意义（均P〈0.05）。结论 CCR2基因rs1799864位点多态性与儿童HLH的发病无关,但其基因型不同可能与HLH患儿的临床表现及预后有关。

单核细胞趋化因子-1受体CCR2基因190A/G、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶p22phox亚基基因C242T多态性与吸烟的交互作用增加非酒精性脂肪性肝病的发病风险

目的探讨单核细胞趋化因子-1（MCP-1）受体CCR2基因190A/G、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸（NADPH）氧化酶p22phox亚基基因C242T多态性与吸烟的交互作用与非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的关系。方法采用病例-对照研究的方法,以600例NAFLD患者及600例健康对照者的外周血白细胞为样本,利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术分析了MCP-1受体CCR2基因190A/G和NADPH氧化酶p22phox亚基基因C242T多态性。结果 190A/G（GG）基因型和C242T（TT）基因型频率分布在病例组分别为50.17%、50.00%,在对照组分别为23.83%、24.17%,二者经χ^2检验差异有统计学意义（χ^2=88.8462,P=0.0031;χ^2=85.8100,P=0.0039）。190A/G（GG）基因型者患NAFLD的风险显著增加（OR=3.2171,95%CI 1.9351-5.2184）。C242T（TT）基因型者患NAFLD的风险也显著增加（OR=3.1379,95%CI 1.7973-5.2362）。基因突变的协同分析发现190A/G（GG）/C242T（TT）基因型者在NAFLD组和对照组中的分布频率分别为39.67%和13.00%,二者经χ2检验差异有统计学意义（χ^2=118.3021,P=0.0017）。190A/G（GG）/C242T（TT）基因型者患NAFLD的风险显著增加（OR=5.0211,95%CI 3.1853-7.7926）。病例组的吸烟率显著高于对照组（χ^2=92.2234,P=0.0025）,吸烟者患NAFLD的风险显著增加（OR=3.3032,95%CI 1.9147-5.7413）,吸烟与190A/G（GG）/C242T（TT）基因型均有交互作用（r=3.9983;r=3.8553）。结论 190A/G（GG）、C242T（TT）基因型和吸烟是NAFLD的易患因素,基因多态性与吸烟的交互作用增加了NAFLD的发病风险。

亚洲人群中SDF1-3’A和CCR2-64I基因的多态性与HIV-1感染相关性的Meta分析

目的探讨SDFl-3’A和CCR2-641基因的多态性与HIv-1感染之间的关联性。 方法检索国内外有关SDFl-3’A和CCR2-64I基因的多态性与HIV感染相关性的病例对照研究文献进行Meta分析。 结果符合CER2-64I入选条件的文献有13篇，20个研究，总共有5 578例样本，其中病例有2 898例，健康对照有2 680例，当CCR2-64I基因所入选的研究全部合并在一起时，在所有模型中没有发现其显著相关性（CY VS．CC：OR=0．97，95％a=0．85-1．09；CY＋YYUS．YY：OR=1．00，95％CI=0．89-1．13；YY＂US．CA2：OR=1．28，95％CI=0．97-1．69）。符合SDFl-3’A入选条件的文献13篇，19个研究，总共有4 854例，其中病例有2 281例，健康对照有2 573例，在整个和亚组分析中没有发现其显著相关性。而在印度人群发现高度的异质性。 结论亚洲人群CCR2-641两种抗性基因与HIV一1感染之间无相关性；中国人群SDFl-3’A与HIV-1感染之间无相关性；印度人群SDFl-3’A与HIV-1感染之间是否有相关性仍需作进一步的研究。

人类免疫缺陷病毒1感染相关的基因多态性在中国汉族人群中的分布

目的 调查中国汉族人群中人类免疫缺陷病毒 1(HIV 1)感染相关的CCR5△ 32、CCR2 6 4I和SDF1 3’A等位基因突变频率和多态性的特点。方法 以 12 5 1例汉族人群为研究对象 ,应用PCR、PCR/RFLP(聚合酶链反应 /限制性片段长度多态性分析 )和DNA直接测序等方法进行检测 ,并用统计学方法进行分析。结果 发现中国汉族人群中存在CCR5△ 32等位基因突变 (均为杂合子基因型 ) ,突变频率为 0 .0 0 119,和西欧及美国白人相比 ,中国人群中CCR5△ 32基因突变频率极低 ,而CCR2 6 4I和SDF1 3’A基因突变频率相对较高 ,分别为 0 .2 0 0 2 3和 0 .2 872 3。结论 中国汉族人群的CCR5△ 32、CCR2 6 4I和SDF1 3’A等位基因的突变和多态性特点 ,具有一定的代表性。由于CCR5△ 32突变率低 ,中国汉族人群对性接触传播的HIV 1病毒 (R5 )

烧伤后瘢痕组织内甲基化基因的加权基因共表达网络分析

目的采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)探讨烧伤后瘢痕组织内甲基化基因,发掘瘢痕形成过程中的分子标志物及治疗靶点。方法采用观察性研究方法。从美国国家生物技术信息中心基因表达综合数据库筛选出同一批次分别进行了mRNA测序和甲基化测序的GSE136906和GSE137134数据集(数据集的样本数均为6),并利用数据集GSE108110(样本数为9)纳入支持向量机及建模分析。采用“Limma”软件包对烧伤后瘢痕和正常组织之间的差异表达基因和差异甲基化基因进行鉴定。使用WGCNA筛选和瘢痕组织临床特征相关性强且基因数目多的模块。对模块内的基因进行功能富集分析并寻找模块内异常甲基化状态的基因,使用受试者操作特征(ROC)曲线判断异常甲基化基因对瘢痕的诊断效能,并使用支持向量机模型进行验证。结果共鉴定出10个共表达基因模块,棕色模块与烧伤后瘢痕组织形成相关性高且基因数目多。棕色模块内的基因主要富集在雄激素受体信号通路的调控、细胞因子-细胞因子受体相互作用、胰岛素分泌的正调节等方面。棕色模块内显示35个基因甲基化状态异常,ROC曲线(曲线下面积>0.9)与支持向量机模型(准确率为93.3%)表明基因CCR2、LMO7、STEAP4、NNAT和TCF7L2具有良好的瘢痕诊断效能。结论CCR2、LMO7、STEAP4、NNAT和TCF7L2可作为烧伤后瘢痕治疗的潜在靶点。