T细胞CD4^(+)/CD8^(+)比值及CD4、CD8编码基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的关联研究

目的分析T细胞CD4^(+)/CD8^(+)比值及CD4、CD8编码基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)的关联。方法检测119例SLE患者及117例健康人T细胞亚群水平及CD4、CD8A、CD8B基因14个标签SNP位点基因型,比较组间T细胞亚群及各基因型、等位基因的分布差异,计算比值比(OR)及其95%可信区间(CI)。结果SLE组CD4^(+)T细胞低于对照组(P>0.05),CD8^(+)T细胞高于对照组(P<0.01),CD4^(+)/CD8^(+)比值低于对照组(P<0.01)。携带CD4 rs1055141C>T/CT基因型(OR:2.280,95%CI:1.261~4.123,P<0.01)及T等位基因(OR:2.210,95%CI:1.293~3.778,P<0.01)、CD8B rs13400210C>T/TT基因型(OR:8.661,95%CI:1.066~70.378,P<0.05)及T等位基因(OR:8.389,95%CI:1.041~67.613,P<0.05)、CD8B rs4832054A>G/AG基因型(OR:2.046,95%CI:1.055~3.967,P<0.05)的个体更易患SLE。结论低T细胞CD4^(+)/CD8^(+)比值是SLE诊断的稳定指标。CD4 rs1055141C>T、CD8B rs13400210C>T和CD8B rs4832054A>G与SLE发病有关联,rs1055141 CT、rs13400210 TT、rs4832054 AG基因型和rs1055141、rs13400210 T等位基因是SLE发病的危险因子。

猪CD8B基因编码区克隆和序列分析

本研究旨在克隆猪CD8B基因的编码区及检测其碱基变异,并利用生物信息学对CD8B基因及其编码的蛋白质序列进行分析。提取大白猪脾脏总RNA后,用RT-PCR扩增CD8B基因。结果表明,扩增得到长785 bp猪CD8B基因序列,包含完整的630 bp编码区(共编码209个氨基酸),并检测到1个同义突变(c.204 A/G)。经预测,猪CD8β蛋白的分子式为C1053H1702N296O279S10,分子量为23293.51,理论等电点为10.24,不稳定系数为50.40,平均亲水性系数为-0.041;二级结构以无规卷曲、延伸链为主,含1个Ig V样结构域;存在1个长21个氨基酸残基的信号肽和1个跨膜区;含1个N-糖基化位点和4个O-糖基化位点。同源性分析表明,猪CD8β蛋白与8个哺乳动物(普通牛,水牛,山羊,绵羊,猫,狗,小鼠,大鼠)的相似性在49%以上。分子进化分析表明,猪CD8β蛋白与普通牛、水牛、山羊、绵羊的亲缘关系最近,其次是猫、狗,最远的是小鼠、大鼠。本试验为研究猪CD8B基因的结构和免疫功能提供基础资料。