CDCA8对肝细胞癌患者预后的影响

目的:肝细胞癌预后相关的分子标志物对提高患者生存质量和改善疗效至关重要,本研究旨在探究细胞分裂周期相关基因8(cell division cycle associated 8,CDCA8)对肝细胞癌预后的影响及潜在分子机制。方法:432例肝细胞癌样本的转录组数据及对应患者的临床信息下载自肿瘤基因表达图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库。分析肿瘤组织和正常组织中CDCA8 mRNA差异;根据CDCA8 mRNA中位数将肝细胞癌患者分为高表达组和低表达组,绘制生存曲线。采用Kruskal检验分析CDCA8与肿瘤分期、分级和T分期的相关性。采用单因素和多因素Cox回归分析探究CDCA8能否作为肝细胞癌患者的独立预后因子。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探究CDCA8在肝细胞癌中的潜在作用机制。结果:CDCA8在肿瘤组织中的mRNA水平明显高于正常对照组织(P<0.001),CDCA8高表达患者的生存率明显低于低表达组(P<0.001)。随着肿瘤分期(P<0.001)、分级(P<0.001)和T分期(P<0.001)增加,肝细胞癌恶性程度增加,同时伴随CDCA8 mRNA水平增加。GSEA富集分析发现CDCA8高表达明显富集的通路包括细胞周期和有丝分裂。结论:CDCA8可作为肝细胞癌患者的预后分子标志物,深入研究后有望成为治疗的新靶点。

人类胚胎干细胞分化前后CDCA8基因启动子区甲基化状态的实验研究

目的:分析在人类胚胎干细胞分化过程中,CDCA8基因启动子区甲基化的状态。方法:生物信息学预测人类CDCA8基因上游2 kb区域的CpG岛。抽提未分化和自然分化的人类胚胎干细胞gDNA,应用重亚硫酸盐修饰和DNA序列分析方法检测CDCA8基因启动子区CpG岛甲基化情况。结果:未分化和自然分化的人类胚胎干细胞中,被检测的CDCA8基因启动子区CpG岛均未发现明显的甲基化修饰。结论:在人类胚胎干细胞分化前后,CDCA8基因启动子关键区域的甲基化状态未发生明显改变。

NTERA-2细胞中人类CDCA8基因的转录因子谱的芯片分析(英文)

为了研究细胞周期相关基因8(CDCA8)的转录调控机制,首先克隆了人类CDCA8基因5’端上游的1071 bp转录调控区。生物信息学预测发现,此区域存在一系列已知转录因子的可能结合位点。联合运用DNApull-down和转录因子芯片技术分析发现共有114种转录因子在人恶性多发性畸胎瘤细胞(NTERA-2)中与该区域结合,其中某些转录因子有预测的结合位点,其他没有预测结合位点的转录因子可能是以复合物的形式结合到CDCA8基因的转录调控区。

CDCA8基因表达与膀胱癌患者临床病理和预后的相关性

目的探讨膀胱癌患者CDCA8基因的表达情况和CDCA8基因与膀胱癌的临床病理相关性及预后相关性,预测CDCA8是如何推动膀胱癌发生、发展及其机制。方法从NCBI(National Center for Biotechnology Information)的GEO数据库中下载膀胱癌基因表达数据GSE13507,采用非配对t检验分析CDCA8在膀胱癌中的表达情况,χ2检验分析CDCA8表达与膀胱癌患者临床病理指标的相关性,Log-rank检验用于预后生存分析;利用基因富集分析(GSEA)方法,分析CDCA8高表达样本的富集基因及受CDCA8调控的相关基因。结果膀胱癌中CDCA8表达水平明显高于正常膀胱组(8.87±0.08 vs 7.47±0.07,P<0.0001);CDCA8的表达与膀胱癌患者的年龄(P=0.027)、性别(P=0.04)及膀胱癌的疾病进展(P=0.001)、T分期(P<0.0001)、N分期(P=0.013)、不同分级(P<0.0001)密切相关;CDCA8高表达组膀胱癌患者的肿瘤特异性生存期明显短于CDCA8低表达组(P<0.0001,HR=0.5177,95%CI:13.40~18.10),且CDCA8高表达组膀胱癌患者的总生存期亦短于CDCA8低表达组(P<0.0001,HR=0.09906,95%CI:5.971~16.38);CDCA8可能调控与精子形成、G2M检查点、E2F信号通路、未折叠蛋白反应、MYC信号通路、MTORC1信号通路、有丝分裂纺锤体形成、PI3K/AKT/m TOR通路、胆固醇平衡、糖酵解相关的基因集。结论 CDCA8在膀胱癌组织中显著高表达,且与膀胱癌的恶性程度和发生进展相关,高表达CDCA8的膀胱癌患者临床预后更差,可能作为潜在的判断膀胱癌患者疾病进展的标志物和治疗膀胱癌的靶标。

敲低CDCA8基因表达对膀胱癌5637细胞吡柔比星敏感性的影响

目的膀胱癌具有较高的耐药和复发率,研究其分子机制有助于解决临床耐药问题。文中旨在探索CDCA8在膀胱癌5637细胞中的表达与吡柔比星(THP)敏感性的相关性。方法收集2018年1月至2020年12月中南大学湘雅医学院附属海口医院膀胱癌组织患者的临床信息。从TCGA数据库中获取CDCA8的mRNA表达数据及患者化疗信息,同时进行免疫组化实验,分析CDCA8的表达与患者化疗敏感性的关系。针对CDCA8基因构建RNA干扰慢病毒,将膀胱癌5637细胞分为空白组(未作处理)、阴性对照组(转染不含CDCA8靶序列的慢病毒)和实验组(转染含CDCA8靶序列的慢病毒,敲低CDCA8),检测CDCA8基因及蛋白的表达;检测敲低CDCA8对膀胱癌细胞THP敏感性的影响;Celigo检测5637细胞吡柔比星IC50。结果膀胱癌化疗者CDCA8表达(10.369±1.131)较非化疗者(9.250±0.892)显著高表达(P=0.012)。qRT-PCT实验结果显示实验组CDCA8的mRNA表达量(0.069±0.004)较空白组(1.087±0.075)、阴性对照组(1.001±0.054)显著降低(P<0.001)。免疫印迹实验结果所示,实验组CDCA8蛋白表达量较空白组、阴性对照组明显降低(P=0.003)。实验组的IC50明显低于空白组、阴性对照组(P<0.05),细胞抑制率显著高于其他两组(P<0.05)。结论敲低CDCA8表达后增强了膀胱癌5637细胞对THP的敏感性,为后续研究膀胱癌THP耐药机制奠定了研究基础。

CDCA8通过调控增殖促进前列腺癌发生的作用机制研究

目的 探讨细胞分裂周期相关蛋白 8(CDCA8)在前列腺癌(PCa)中的表达及作用机制。方法 通过生物 信息学方法分析正常前列腺组织和 PCa组织中 CDCA8 mRNA水平差异。利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库中 RNA表达测序数据分析 CDCA8表达相关的 PCa患者无病生存期(DFS)。免疫组织化学方法检测根治性前列腺切除 术后 56例 PCa组织和癌旁组织中 CDCA8蛋白表达差异,并依据染色指数将 PCa患者分为 CDCA8蛋白高表达组(31 例)和低表达组(25例),分析患者临床特征与 CDCA8表达水平的相关性。利用 siRNA沉默 PCa细胞 CDCA8基因,实 时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)检测 CDCA8 mRNA的表达水平,细胞克隆形成实验检测 PCa细胞增殖能力,蛋白 免疫印迹法检测 CDCA8、Ki67、增殖细胞核抗原(PCNA)以及磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶 B(AKT)信号通路 蛋白表达的变化。结果 TCGA数据库中 PCa组织中 CDCA8 mRNA水平明显高于正常组织,CDCA8 mRNA高表达的 患者预后更差(P<0.01)。PCa组织 CDCA8的蛋白表达水平明显高于癌旁组织,且表达水平与患者总前列腺特异性 抗原(tPSA)、Gleason评分、T分期和术后切缘情况呈正相关(P<0.01)。CDCA8蛋白高表达组tPSA≥10 μg/L、T3期、术 后切缘阳性患者比例大于 CDCA8 蛋白低表达组(P<0.05)。沉默 CDCA8 基因后 PCa 细胞增殖能力减弱,Ki67、 PCNA、p-PI3K、p-AKT蛋白表达水平均下调(P<0.01)。结论 CDCA8通过调控增殖促进 PCa发生,其作用机制可 能与 PI3K/AKT信号通路有关。

差异表达基因CDCA8、CDC20与肾母细胞瘤患者预后及免疫细胞浸润的关系

目的探讨差异表达基因CDCA8及CDC20在肾母细胞瘤中的表达,以及与肾母细胞瘤患者预后及免疫细胞浸润的关系。方法登录并下载GEO数据库及Target数据库中与肾母细胞瘤相关的基因表达谱数据;利用R语言筛选出差异表达基因,筛选出与肾母细胞瘤预后有关的基因;利用R语言中的CIBERSORT计算方法计算出肾母细胞瘤中免疫细胞浸润的表达;利用SPSS分析肾母细胞瘤预后有关的基因与免疫细胞浸润的相关性。结果GEO表达谱数据GSE66405、GSE73209、GSE11151筛选出共同差异表达基因1260个,其中高表达398个,低表达862个;蛋白互作网络筛选出15个核心蛋白,包括CDK1、CCNA2、TOP2A、CCNB2、KIF11、BUB1、BUB1B、ASPM、NUSAP1、CDC20、CDCA8、KIF20A、DLGAP5、TPX2、CENPF,其中CDCA8及CDC20与肾母细胞瘤患者预后有关;T cells CD4 memory activated(P=0.026)、T cells follicular helper(P=0.031)、Macrophages M0(P=0.005)、Dendritic cells activated(P=0.025)的表达高于正常对照组,而Plasma cells(P=0.023)、T cells CD4 memory resting(P=0.002)、NK cells resting(P=0.045)、Monocytes(P=0.013)在肾母细胞瘤中低表达。相关性分析显示,CDCA8与6个免疫细胞浸润具有相关性,CDC20与5个免疫细胞浸润具有相关性。结论CDCA8及CDC20有可能成为肾母细胞瘤患者治疗的新潜在靶点。

细胞分裂周期相关基因8在人恶性肿瘤中的表达及临床意义

目的探讨细胞分裂周期相关基因8(CDCA8)在多种人恶性肿瘤中的表达及其与患者预后、肿瘤浸润免疫细胞的相关性。方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)、基因表达谱交互分析(GEPIA)、TIMER 2.0等数据库中获取数据,分析各种恶性肿瘤中CDCA8基因的表达水平,探讨CDCA8表达水平用于鉴别癌组织和正常组织的诊断价值,明确CDCA8表达水平与患者预后生存的关系,分析CDCA8表达与肿瘤浸润免疫细胞的相关性。结果与正常组织相比,在大多数人恶性肿瘤组织中CDCA8的表达显著上调(P<0.05)。综合受试者工作特征(SROC)曲线分析显示,CDCA8表达水平可用于癌组织和正常组织的鉴别。生存分析结果显示,高CDCA8组的恶性肿瘤患者具有更差的总生存期和无病生存期(Log-rank P<0.05)。基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示,CDCA8可能与细胞周期和有丝分裂有关(P<0.05)。在TCGA数据库恶性肿瘤中,CDCA8表达水平与CD4+Th2细胞浸润明显相关(P<0.05)。结论CDCA8有望成为人恶性肿瘤诊断和预后评估的生物标志物,为临床上恶性肿瘤的诊治提供新的理论依据。

KIF18B 在胃癌细胞增殖、 迁移中的作用及机制研究

目的探究驱动蛋白超家族18B(KIF18B)对胃癌细胞增殖、迁移的影响及潜在调控机制。方法采用qRT-PCR和Western印迹分析胃癌组织和细胞(MKN-28、AGS、HGC-27)中KIF18B的表达水平;通过CCK-8、克隆形成以及划痕实验检测胃癌细胞的增殖、迁移情况;Western印迹法检测迁移蛋白(E-cadherin、N-cadherin)和MMP-3的表达。结果KIF18B在胃癌组织和细胞中表达上调;干扰KIF18B显著抑制AGS细胞增殖、集落形成和细胞迁移,提高E-cadherin的蛋白表达,同时降低N-cadherin和MMP-3的蛋白表达;此外,干扰KIF18B能显著抑制CDCA8并促进p53的蛋白表达,过表达CDCA8能逆转KIF18B干扰对细胞增殖、迁移的影响。结论KIF18B通过调控CDCA8/p53信号通路影响胃癌细胞的增殖、迁移。