秦川牛CDH11基因外显子多态性分析

牛CDH11基因位于第18号染色体,含有丰富的SNP突变。本实验以247头秦川牛为样本,研究位于第2外显子的一个SNP(g.32935629C>T)分布情况。根据NCBI给出的序列信息(NC_007316.6),设计引物,采用混合池DNA进行PCR扩增,并对PCR产物进行酶切,酶切结果进行分型。结果表明,该突变位点存在3种基因型,即TT、CC、TC。其中纯合子突变的基因型频率很低。研究发现中国秦川牛CDH11基因g.32935629C>T位点是低度多态(PIC<0.25),χ2检验显示,所检测的秦川牛品种处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。该实验结果可以为肉牛选育开发生长发育分子标记提供基础数据。