CDKN2A/B基因多态性在颅内动脉瘤形成过程中的功能分析

目的研究CDKN2A/B相关基因位点突变与颅内动脉瘤形成的关系。方法病例组82例为安阳市人民医院神经外科在2017-2021年间收治的开颅夹闭颅内动脉瘤患者。对照组为该院同期收治的入院头CTA检查无颅内动脉瘤的头外伤患者,共114例。两组均使用SNP基因分型,对病例组不同基因型的动脉瘤壁组织内CDKN2A/B基因翻译、表达的产物进行对比分析。结果动脉瘤壁内表达CD⁃KN2A/B基因产物p15^(INK4b)/p16^(INK4a)蛋白,rs10757272位点等位基因T的频率高于对照组(P=0.029,OR=1.658,95%CI:1.051~2.614),rs10757272位点在T/T基因型动脉瘤瘤壁组织中p16^(INK4a)(P<0.001)/p15^(INK4b)(P=0.014)mRNA低水平转录,在T/T基因型中p15^(INK4b)蛋白为低水平表达(P=0.027),p16^(INK4a)蛋白的表达水平差异无统计学意义(P=0.089),但是有相似的低表达趋势。结论rs10757272位点的突变通过影响细胞周期抑制基因CDKN2A/B的表达,影响动脉瘤壁组织细胞的塑性,参与动脉瘤的形成过程。

2型糖尿病人群CDKN2A/B基因多态性与冠心病风险的相关性研究

目的观察T2DM人群细胞周期蛋白依赖激酶抑制基因2A/B(CDKN2A/B)基因多态性是否与冠心病风险相关,以早期筛查DM人群中冠心病的高危人群。方法对我院因胸痛症状行冠脉造影或冠脉CT检查的T2DM患者,根据冠脉造影或冠脉CT结果分为冠心病组及非冠心病组。冠心病组共220例,非冠心病组共89例。根据Hapmap数据库选取CDKN2A/B共7个单倍型标记的单核苷酸多态性(SNP):CDKN2A rs2811708(G>T)、rs3088440(A>G)和rs3731239(C>T),CDKN2B rs3217986(A>C)、rs1063192(C>T)、rs2285327(A>G)和rs3217992(A>G)。对所有个体进行PCR扩增并通过RFLP或基因测序方法读取个体的基因型。结果在T2DM人群中,冠心病组中CDKN2A rs2811708的次要等位基因T频率(26.4%)显著高于非冠心病组(17.4%)(P<0.05),基因型分布在两组间存在显著性差异(P<0.05),G/T基因型携带者较G/G基因型携带者发生冠心病的风险显著增加(P<0.05),在校正心血管其他风险因素(如性别、年龄、BMI、DM病程、高血压病病史、脂代谢异常病史、吸烟史)后,这种相关性仍然存在(P<0.01)。结论 T2DM人群中,CDKN2A/B基因单核苷酸多态性可能与冠心病的风险相关。

CDKN2B基因多态性与2型糖尿病人群心肌梗死发病风险的关系

目的:探讨细胞周期依赖性激酶抑制基因(CDKN2B)单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病(T2DM)人群心肌梗死发病风险的关系,以早期筛查T2DM病人中的心肌梗死高危人群。方法:选取山西医科大学第一医院收治的461例T2DM病人,其中114例合并心肌梗死病人作为观察组,347例T2DM不合并冠心病及其他心脏病的病人作为对照组,以CDKN2B基因rs3217992位点为遗传标记,检测研究对象的基因型,使用MassARRAY遗传分析系统进行SNP分型。采用多因素Logistic回归分析基因多态性与心肌梗死的关系。结果:观察组CDKN2B单核苷酸多态性rs3217992 A等位基因频率较对照组增高(χ^(2)=9.36,P=0.002);多因素Logistic回归分析显示,CDKN2B基因rs3217992位点AG/AA基因型是T2DM人群心肌梗死发病的独立危险因素。结论:CDKN2B基因多态性与糖尿病人群心肌梗死风险相关,rs3217992位点可作为T2DM人群心肌梗死风险预测的有效遗传因子。

芍药苷调节丝氨酸/苏氨酸激酶/鼠双微基因2/p53信号通路对弥漫大B细胞淋巴瘤细胞增殖、凋亡和细胞周期的影响实验研究

目的:探讨芍药苷(PAE)调节丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT)/鼠双微基因2(MDM2)/p53信号通路对弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)细胞增殖、凋亡和细胞周期的影响。方法:以OCI-LY3细胞为研究对象,分别设置PAE低浓度组(15μmol/L PAE)、PAE中浓度组(30μmol/L PAE)、PAE高浓度组(60μmol/L PAE)、PAE高浓度+SC79(AKT激活剂)组(60μmol/L PAE+8μg/ml SC79),同时以未经处理的细胞为对照组。48 h后,分析细胞增殖、克隆形成能力及细胞周期和凋亡变化,检测AKT/MDM2/p53信号通路相关蛋白的表达水平。结果:与对照组比较,PAE低浓度组、PAE中浓度组、PAE高浓度组细胞凋亡率、p53表达、G_(0)/G_(1)期增加,细胞克隆形成数和细胞增殖率,p-AKT/AKT和p-MDM2/MDM2表达水平,以及G_(2)/M、S期降低(均P<0.05)。与PAE高浓度组比较,PAE高浓度+SC79组细胞凋亡率、p53表达、G_(0)/G_(1)期降低,细胞克隆形成数和细胞增殖率,p-AKT/AKT和p-MDM2/MDM2表达水平,以及G_(2)/M、S期增加(均P<0.05)。结论:PAE通过抑制AKT/MDM2上调p53表达,抑制DLBCL细胞增殖、细胞周期进展,诱导其凋亡。

芝麻热胁迫响应基因SiHsfB-2b的克隆及表达特性分析

为探究B类热激转录因子(HSFs)在芝麻耐热性中的分子功能,基于前期转录组分析鉴定到的编码B类HSF家族蛋白HsfB2b的基因序列,以郑太芝3号耐热白芝麻品种为材料,采用同源克隆方法克隆了芝麻SiHsfB-2b基因,对其进行生物信息学分析,同时分析其在芝麻不同器官和热胁迫下的表达特性,并对其进行亚细胞定位。结果表明:SiHsfB-2b基因CDS序列全长为936 bp,编码311个氨基酸;系统进化树分析表明SiHsfB-2b与松蒿、独脚金和锈鳞木樨榄的同源蛋白关系较近,含保守DNA结合结构域;亚细胞定位于细胞核内;SiHsfB-2b基因启动子区域含有13类顺式作用元件,其中与胁迫响应和激素响应相关的各有3类。RT-qPCR分析结果显示,热胁迫可诱导SiHsfB-2b在芝麻根、茎和叶中上调表达,叶中相对表达量最高;在持续高温胁迫下,SiHsfB-2b在芝麻茎和叶中的表达量呈上升趋势,且在胁迫后期的叶中表现出显著上调,而根中的表达量呈现出先上升后下降趋势。综上推测,SiHsfB-2b基因可能通过介导胁迫和激素信号等通路积极响应热胁迫,这可为后期深入研究芝麻耐热性的分子机制奠定理论基础。

SH2B3基因在髓系肿瘤中的突变位点及频率分析

目的:分析SH2B接头蛋白3(SH2B3)基因在髓系肿瘤中的突变位点及频率。方法:回顾性分析2017年11月至2022年11月首都医科大学宣武医院血液内科髓系肿瘤相关基因靶向DNA测序结果,筛选出携带SH2B3基因突变的患者,收集患者人口学资料及临床资料,分析SH2B3基因突变类型、突变位点、发生频率、共突变基因以及与疾病间的关系。结果:测序结果来自1005例患者,有19例患者检测到SH2B3基因突变,其中错义突变18例(94.74%),无义突变1例(5.26%),10例患者同时伴发其他突变(52.63%),突变等位基因频率(VAF)分布于0.03-0.66;发生频率最高的突变为p.Ile568Thr(5/19,26.32%),平均VAF为0.49,涉及1例MDS/MPN-RS(伴SF3B1突变)、1例MDS-U(伴SF3B1突变)、1例再生障碍性贫血伴PNH克隆(伴PIGA和KMT2A突变)、2例MDS-MLD(其中1例伴SETBP1突变);其余突变包括2例p.Ala567Thr(10.53%),p.Arg566Trp、p.Glu533Lys、p.Met437Arg、p.Arg425Cys、p.Glu314Lys、p.Arg308*、p.Gln294Glu、p.Arg282Gln、p.Arg175Gln、p.Gly86Cys、p.His55Asn和p.Gln54Pro各1例。结论:SH2B3基因在髓系肿瘤中突变位点分布较广,重现性低,其中p.Ile568Thr突变发生率较高,常与其他疾病特征性突变共存。

恶性胸膜间皮瘤细胞培养条件及CDKN2B对癌细胞的作用

目的探讨不同培养条件(RPMI-1640、DMEM和DMEM/F12培养液)对人恶性胸膜间皮瘤(malignant pleural mesothelioma,MPM)组织中分离的MPM细胞传代的影响以及细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B(cyclin dependent kinase inhibitor 2B,CDKN2B)对MPM细胞增殖、侵袭和凋亡的作用。方法从MPM组织中分离细胞分别用RPMI-1640、DMEM和DMEM/F12培养液培养。CCK-8检测细胞增殖,细胞核及染色体利用瑞氏-吉姆萨染色观察,免疫荧光实验检测MPM标志物Calretinin、CD141、CK5、EMA和WT-1荧光强度。RT-qPCR和Western blot分别检测CDKN2B的mRNA和蛋白表达能力。Transwell检测细胞侵袭能力,流式细胞术检测细胞凋亡率。结果建立的MPM细胞在RPMI-1640、DMEM和DMEM/F12培养液中传至第10代仍具有较好的活力,且MPM标志物Calretinin、CD141、CK5、EMA和WT-1在细胞中均表达,MPM细胞在RPMI-1640培养液中活力较为稳定。CDKN2B在MPM细胞中低表达(P<0.05),过表达CDKN2B显著抑制MPM细胞的增殖(P<0.05)、侵袭(P<0.05)和上皮间质转化(P<0.01),促进细胞凋亡(P<0.01)。结论建立的MPM细胞可在RPMI-1640培养液中稳定传代,CDKN2B可作为MPM诊断和治疗的潜在靶标。

环状RNA ACAP2调节微小RNA-421与B细胞易位基因2轴对心肌梗死大鼠心肌损伤的影响

目的探讨环状RNA ACAP2(circACAP2)调节微小RNA(miR)-421/B细胞易位基因2(BTG2)轴对心肌梗死(MI)大鼠心肌损伤的影响。方法构建MI大鼠模型和H9c2细胞模型,将80只大鼠分为假手术组、MI组、小干扰RNA-阴性对照(si-NC)组、si-circACAP2组、pcDNA3.1组、pcDNA3.1-circACAP2组、pcDNA3.1-circACAP2+模拟物(mimic)NC组、pcDNA3.1-circACAP2+miR-421 mimic组,每组各10只。将缺氧H9c2细胞置于24孔板中,瞬时转染细胞,分为缺氧组、缺氧+si-NC组、缺氧+si-circACAP2组、缺氧+pcDNA3.1组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2+mimic NC组、缺氧+pcDNA3.1-circACAP2+miR-421 mimic组,另取正常培养的H9c2细胞作为对照组。检测大鼠左心室射血分数(LVEF)、左心室短轴缩短率(LVFS)、心肌梗死情况、心肌组织病理变化、circACAP2、miR-421、BTG2 mRNA表达情况、乳酸脱氢酶(LDH)、肌酸激酶同工酶(CK-MB)活性、H9c2细胞活力和凋亡、心肌组织BTG2蛋白表达、H9c2细胞BTG2蛋白表达。结果MI组circACAP2、BTG2 mRNA表达高于假手术组(1.84±0.21 vs 1.00±0.10,1.68±0.17 vs 1.00±0.10),miR-421表达低于假手术组(0.49±0.05 vs 1.00±0.11,P<0.05);与假手术组比较,MI组梗死面积、CK-MB、LDH活性升高,LVFS、LVEF降低(P<0.05)。与si-NC组比较,si-circACAP2组心肌损伤减轻,LVFS、LVEF升高,梗死面积、CK-MB、LDH活性降低(P<0.05);与缺氧+si-NC组比较,缺氧+si-circACAP2组细胞活力升高,凋亡率、CK-MB和LDH活性降低(P<0.05)。与pcDNA3.1组比较,pcDNA3.1-circACAP2组心肌损伤加重,LVFS、LVEF降低,梗死面积、CK-MB、LDH活性升高(P<0.05);与缺氧+pcDNA3.1组比较,缺氧+pcDNA3.1-circACAP2组细胞活力降低,凋亡率、CK-MB、LDH活性升高(P<0.05)。结论circACAP2在MI大鼠和H9c2细胞中表达上调,沉默circACAP2可能通过调节miR-421/BTG2轴改善心脏功能,减少心肌损伤,提高心肌细胞活力。

糖尿病肾病不同中医辨证分型患者中CDKN2A,CDKN2B,IGF2BP2和CDKAL1基因表达研究

目的:研究糖尿病肾病不同中医辨证分型的患者中CDKN2A,CDKN2B,IGF2BP2和CD-KAL1基因的表达量。方法:提取血液样本中的mRNA,并以此为模板进行反转录得到cDNA,以Real-Time PCR方法测定目的基因的表达量。结果:建立了这4个基因的定量方法,测定了50例正常人和53例糖尿病肾病患者中的基因表达量。结论:本研究在糖尿病肾病不同中医辨证分型的患者中测定了4个基因的表达量水平,对这些基因的表达量与糖尿病肾病中医辨证分型的关系进行了研究,为糖尿病肾病中医的临床诊断提供了量化指标,并同时指出基因研究对于中医中药的临床诊断和治疗具有深远的意义。

妊娠糖尿病患者血糖、血脂水平与CDKN2A/2B基因多态性的相关性

目的探讨妊娠糖尿病患者血糖、血脂水平与CDKN2A/2B基因多态性的相关性。方法选取2015年1月至2017年1月我院内分泌科、产科收治的妊娠期糖尿病患者120例(GDM组),同时选取同期在我院产科门诊检查糖耐量试验正常的孕妇120例作为对照。检测两组孕妇CDKN2A/2B基因多态性,并对妊娠期糖尿病患者血糖、血脂水平与CDKN2A/2B基因多态性的相关性进行分析。结果妊娠期糖尿病患者TT、TC基因型的总胆固醇(TC)、空腹血糖(FBG)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白(LDL)高于CC基因型,差异有统计学意义(P<0.05);TT、TC基因型的高密度脂蛋白(HDL)低于CC基因型,差异有统计学意义(P<0.05);两组孕妇CDKN2A/2B基因TT、TC、CC 3种基因型分布差异有统计学意义(P<0.05);GDM组危险等位基因T分布频率显著高于健康对照组(P <0.05)。结论 CDKN2A/2B基因可能是妊娠糖尿病的易感基因之一,TC、TG、LDL、HDL、FBG与CDKN2A/2B基因多态性具有相关性。

CDKN2B-AS1基因多态性与缺血性脑卒中的相关性研究

目的探讨血管阻塞性相关基因CDKN2B-AS1的rs4977574位点和缺血性脑卒中的相关性。方法选取2018年3月—2018年9月郑州市第一人民医院神经内科收治的212例病人,其中脑卒中病人118例(病例组),非脑卒中病人94例(对照组),测定两组血浆总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、三酰甘油(TG)、空腹血糖(FPG)及糖化血红蛋白(HbA1c)水平,并通过小测序法(SNaPshot技术)检测CDKN2B-AS1基因位点rs4977574多态性。评估rs4977574多态性与上述生物标志物的相关性。结果与对照组相比,病例组FPG、HbA1c水平明显升高(P<0.05),校正年龄、体质指数、相关病史及危险因素后,低HbA1c(HbA1c≤6.2%)可明显减弱脑卒中的发生风险[OR=0.295,95%CI(0.139,0.623)];空腹血糖正常(FPG<6.1mmol/L)明显减弱脑卒中的发生风险[OR=0.323,95%CI(0.129,0.809)];rs4977574基因型及等位基因频率在病例组和对照组中分布差异有统计学意义(P<0.05)。进一步分析发现,rs4977574多态性与高HbA1c相关;与AA基因型病人相比,(GG+GA)基因型病人中高FPG的发生率明显增加[OR=12.429,95%CI(5.358,28.831),P=0.000]。结论CDKN2B-AS1基因位点rs4977574基因型和糖代谢相关,并和脑卒中具有相关性。

CDKN2A和CDKN2B区域间的基因多态性与汉族人群颅内动脉瘤性别差异性的关联分析

目的 研究CDKN2A-CDKN2B区域的基因多态性与汉族人群颅内动脉瘤(intracranial aneurysm,IA)的相关性.方法 收集500例中国汉族IA病例作为研究对象,通过病例对照的关联分析方法 和分层分析方法 ,从遗传学角度探讨存在于IA患者的性别差异与上述基因多态性是否存在关联.结果 位于9p21.3的CDKN2A-CDKN2B区域4个与血管疾病相关的SNP位点(rs1333040、rs2891168、rs2383207和rs10757278)中,rs1333040与汉族人群IA发病密切相关,其风险性主要来源于T等位基因(χ2=6.278,P=0.012,OR=1.378,95%CI 1.072~1.771).应用Logistic回归校正性别、年龄及饮酒、吸烟等危险因素后,发现rs1333040位点的T/T基因型及T等位基因是IA的独立危险因素,其患病风险率增加至1.796倍.亚组分析显示rs2891168的A/A基因型与前循环分布区的IA密切相关(P=0.025).在按性别进行统计的亚组分析中,rs1333040 T/T基因型与汉族男、女IA发病均密切相关,但与女性IA的关联程度更高.结论 遗传因素和性别在IA的发生中具有一定的影响作用.

鼻咽癌组织中细胞周期相关基因CDKN2B/p15的表达及临床意义

目的探讨鼻咽癌(NPC)组织中CDKN2B/p15蛋白、mRNA的表达与肿瘤微血管密度及其临床病理特征的关系。方法90例鼻咽癌组织(病例组)、45例慢性鼻咽炎组织(对照组)中应用免疫组织化学技术检测p15蛋白表达,应用实时荧光定量RT-PCR检测p15mRNA的表达。结果p15蛋白阳性表达率鼻咽癌组织(病例组)(26.7%和35.0%)均低于于对照组(93.3%和93.2%),P均<0.01;p15的mRNA表达水平在肿瘤组中较正常组织明显降低(P<0.001);鼻咽癌组织中p15蛋白和mRNA阳性表达率Ⅲ-Ⅳ期(38.9%和44%)均低于Ⅰ-Ⅱ期(94.4%和79.2%),P均<0.05,颈部淋巴结转移者(70.4%和63%)均低于颈部淋巴结无转移者(88.9%和82.5%),P均<0.05;鼻咽癌组织中p15蛋白阳性表达组与阴性表达组MVD值无明显差异(P均>0.05)。结论p15在鼻咽癌组织中呈低表达,它与鼻咽癌病期进展和颈部淋巴结转移有一定关系,在鼻咽癌发生发展中可能起一定作用。p15可作为反映鼻咽癌生物学行为和估计患者预后的客观指标。

CYP2C19基因多态性、血清NT-proBNP水平与急性脑梗死静脉溶栓预后不良的关系

目的探讨CYP2C19基因多态性、血清N末端B型脑利钠肽前体(NT-proBNP)水平与急性脑梗死(ACI)患者静脉溶栓预后不良的关系。方法选择210例ACI患者,均行阿替普酶静脉溶栓治疗,治疗90 d后根据改良Rankin量表(mRS)评分将患者分为预后不良组(mRS评分≥3分)52例、预后良好组(mRS评分<3分)158例。治疗前采用实时荧光定量PCR法检测CYP2C19基因多态性,时间分辨荧光免疫层析法检测血清NT-proBNP。用Pearson或Spearman分析CYP2C19基因多态性、血清NT-proBNP水平与mRS评分的相关性;用多因素Logistic回归分析ACI患者静脉溶栓预后的影响因素;用受试者工作特征曲线分析CYP2C19基因多态性、血清NT-proBNP水平对ACI患者静脉溶栓预后不良的预测价值。结果预后不良组年龄、高血压比例、糖尿病比例、入院美国国立卫生研究所脑卒中(NIHSS)评分、空腹血糖水平高于预后良好组(P均<0.05)。预后不良组和预后良好组CYP2C19基因多态性比较差异有统计学意义(P<0.05),预后不良组血清NT-proBNP水平高于预后良好组(P<0.05)。ACI患者CYP2C19基因多态性(r_(s)=0.362)、血清NT-proBNP水平(r=0.426)与mRS评分均呈正相关(P均<0.05)。高NIHSS评分、CYP2C19基因慢代谢型、高血清NT-proBNP水平是ACI患者预后不良的危险因素(P均<0.05)。CYP2C19基因多态性、血清NT-proBNP水平单独及联合预测ACI患者静脉溶栓预后的曲线下面积分别为0.752、0.786、0.861,二者联合预测的曲线下面积高于单独预测(P均<0.05)。结论CYP2C19基因多态性和高水平NT-proBNP是ACI患者静脉溶栓预后不良的危险因素,二者联合对不良预后有较高的预测价值。

妊娠晚期感染B族链球菌孕妇早产的危险因素及其pbp2x基因突变分析

目的 分析某院感染B族链球菌(GBS)孕妇发生早产的危险因素及观察早产孕妇感染GBS的pbp2x基因突变情况。方法 选取2022年1月至2023年5月在该院分娩且感染GBS的孕妇199例,根据早产与否分为观察组(41例)和对照组(158例)。采用二分类logistic回归模型和受试者操作特征(ROC)曲线分析感染GBS的孕妇发生早产的危险因素;对早产孕妇的GBS样本进行pbp2x基因一代测序分析。结果 199例感染GBS孕妇中发生早产41例,发生率为20.6%。Logistic回归分析显示,年龄[比值比(OR)=1.151,P=0.004)]和口服葡萄糖耐量试验(OGTT)异常项数(OR=2.995,P<0.001)是感染GBS孕妇发生早产的独立危险因素。两危险因素联合预测早产的曲线下面积(AUC)为0.783,最佳敏感度为75.6%,特异度为69.0%,较单项危险因素预测价值高。pbp2x基因测序发现3个错义突变(1129G>A、1148T>G、1528A>G),未发现影响GBS对青霉素敏感性的基因突变。结论 年龄和OGTT异常项数是感染GBS孕妇发生早产的危险因素,两者联合预测的效能优于单项,早产孕妇感染的GBS中尚未发现影响青霉素敏感性的pbp2x基因突变。

CDKN2A/2B基因单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病的相关性

目的探讨细胞周期素依赖性蛋白激酶抑制因子2A/2B(CDKN2A/2B)基因单核苷酸多态性(SNP)与妊娠期糖尿病(GDM)发生风险的关系。方法选择459例GDM患者为病例组,571例正常妊娠者为对照组。通过相关数据库及文献筛选CDKN2A/2B基因的7个候选SNP位点,并对其进行基因分型。采用多因素Logistic回归模型评估候选SNP位点与GDM的相关性,采用多因子降维法评估候选SNP位点的单独或联合作用对妊娠期女性发生GDM的影响。结果多因素回归分析结果显示,与携带CDKN2A/2B基因rs10811661位点CC基因型的孕妇比较,携带TC或TT基因型的孕妇GDM患病风险升高(均P<0.05);在显性遗传模型下,与CC基因型携带者比较,携带TC/TT基因型的孕妇发生GDM的风险升高(P<0.05)。多因子降维分析结果显示,最优单位点模型为rs10811661位点(P<0.05);SNP-SNP联合作用与GDM发病存在关联,rs10811661-rs7036656-rs1063192-rs3217986位点的交互作用可增加GDM发病风险(P<0.05)。结论 CDKN2A/2B基因rs10811661位点多态性与GDM发生有关,SNP单独和联合作用均可影响妊娠期女性对GDM的易感性。

翘嘴鲌Runx2b基因的克隆与表达特征分析

为探究Runx2b基因在翘嘴鲌肌间刺骨化过程中的调控作用,基于转录组数据和PCR扩增技术克隆获得了翘嘴鲌Runx2b基因全长编码序列。通过茜素红整体骨骼染色对肌间刺(IBs)形成的不同阶段进行了分期,同时采用qRT-PCR技术检测了Runx2b基因的时空表达水平。结果显示,Runx2b基因开放阅读框为1 401 bp,编码466个氨基酸,预测分子量为50.676 ku,理论等电点为9.35;氨基酸序列多重比对显示,翘嘴鲌Runx2b氨基酸序列与近源物种的同源性高达95%以上,且都具有高度保守的Runt和RunxI结构域;系统进化树分析表明,翘嘴鲌与团头鲂的亲缘关系最为接近。茜素红染色结果显示,在肌间刺发育前,翘嘴鲌的主轴骨骼和附肢骨骼已经发育完全;其中,孵化后15 d,尾部肌隔中开始出现小肌间刺;孵化后30 d,翘嘴鲌幼体的肌间刺发育完全。组织表达结果显示,Runx2b基因在翘嘴鲌各组织中均有表达,鳃中的表达量最高,其次是肌肉。此外,Runx2b基因在翘嘴鲌幼体不同生长阶段的表达模式与肌间刺骨化发生的时序保持一致,提示该基因与肌间刺骨化的相关性。研究结果可以为后续无肌间刺翘嘴鲌新种质的创制和肌间刺形成的分子机制提供基础数据。

湖南一株猪非典型瘟病毒的鉴定及其NS5B和E2基因序列分析

随机挑选湖南某规模化猪场出现“抖抖病”的新生仔猪,采集血清样本,用可扩增猪非典型瘟病毒(APPV)的NS5B基因和E2基因引物进行RT-PCR鉴定,对PCR扩增产物测序。随后利用MegAlign软件分析NS5B和E2基因序列的同源性,预测E2蛋白部分结构,并使用MEGA 5.0,采用邻接法构建NS5B和E2基因的遗传进化树。结果表明,发病仔猪为猪非典型瘟病毒(APPV)感染阳性。鉴定毒株HN0626与GenBank中84株参考毒株NS5B和E2基因序列的同源性分别为81.68%~98.95%、81.14%~99.33%,通过预测E2蛋白部分结构,推导其潜在的B细胞抗原表位。系统发育分析显示,HN0626毒株属于基因1型,是全球猪群中的主要流行毒株,其E2、NS5B基因序列在GenBank中的登录号分别为OR936135、OR936136。

香苏杂交猪KAT2B基因多态性与其生长性状的关联分析

【目的】了解香苏杂交猪组蛋白乙酰转移酶P300/CBP结合因子(KAT2B)基因在组织中的表达量,筛选其单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并分析基因多态性与生长性状的关联性,为香苏杂交猪新品系培育提供参考依据。【方法】以香苏杂交猪为研究对象,采用实时荧光定量PCR检测KAT2B基因在3日龄和6月龄不同组织中的相对表达量,通过直接测序检测KAT2B基因的SNP位点,统计SNP位点等位基因频率、基因型频率、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、有效等位基因数(Ne)及平均多肽信息含量(PIC)等,以卡方(χ^(2))检验分析基因型是否处于Hardy-Weinberg平衡状态,分析不同基因型与香苏杂交猪生长性状的关联性。【结果】实时荧光定量PCR结果显示,KAT2B基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌6个组织中均有表达,与3日龄相比,6月龄KAT2B基因相对表达量在肝脏和脾脏组织中极显著升高(P<0.01,下同),在肺脏中极显著降低。KAT2B基因Exon-2、Exon-14和Exon-15区域均分别存在1个外显子突变,分别为g.36682G>A、g.104540G>T和g.106651A>G,3个SNPs位点PIC均处于中度多态性水平且Hardy-Weinberg平衡。g.36682G>A位点优势基因型为GA型,等位基因频率G>A;g.104540G>T位点优势基因型为GG型,等位基因频率G>T;g.106651A>G位点优势基因型为AA型,等位基因频率A>G。关联分析结果表明,g.36682G>A位点各基因型生长性状之间无显著差异(P>0.05),g.106651A>G位点AA基因型与AG基因型胸深存在显著差异(P<0.05)。【结论】香苏杂交猪KAT2B基因在各组织中均有表达且存在3个SNPs位点(g.36682G>A、g.104540G>T和g.106651A>G),KAT2B基因可作为与香苏杂交猪生长性状相关的候选基因。

绒毛组织Bcl-2、Bax、LC3、P62与稽留流产患者解脲支原体感染的关系

目的研究绒毛组织B淋巴细胞瘤-2基因(Bcl-2)、B淋巴细胞瘤-2相关X蛋白(Bax)、微管相关蛋白1轻链3(LC3)、P62对稽留流产患者解脲支原体感染的预测价值。方法本研究为队列研究。选取2022年1月至2023年6月榆林市第一医院收治的稽留流产患者156例作为稽留流产组,并选取同期在本院进行人工流产的患者170例作为人工流产组。人工流产组年龄、孕次、产次、既往流产次数、妊娠时间分别为(28.61±5.30)岁、(1.54±0.48)次、(0.97±0.24)次、(0.87±0.25)次、(53.72±4.49)d,稽留流产组分别为(29.18±5.57)岁、(1.49±0.43)次、(0.95±0.26)次、(0.91±0.32)次、(54.55±4.20)d。比较两组解脲支原体感染率及绒毛组织Bcl-2、Bax、LC3、P62表达情况。稽留流产患者根据是否发生解脲支原体感染再分为阴性组(96例)、阳性组(60例),比较两组绒毛组织Bcl-2、Bax、LC3、P62表达情况,采用受试者操作特征曲线(ROC)分析绒毛组织Bcl-2、Bax、LC3、P62表达对稽留流产患者解脲支原体感染的预测价值。采用独立样本t检验、χ^(2)检验进行统计学分析。结果稽留流产组解脲支原体阳性率高于人工流产组[38.46%(60/156)比12.94%(22/170)](P<0.05)。稽留流产组绒毛组织Bcl-2、P62表达水平低于人工流产组,Bax、LC3表达水平高于人工流产组(均P<0.05)。阳性组绒毛组织Bcl-2、P62表达水平低于阴性组,Bax、LC3表达水平高于阴性组(均P<0.05)。绒毛组织Bcl-2、Bax、LC3、P62联合预测稽留流产患者解脲支原体感染的曲线下面积(AUC)为0.852,高于四者单独检测(均P<0.05)。结论与人工流产患者相比,稽留流产患者解脲支原体感染发生率较高,且两组绒毛组织Bcl-2、Bax、LC3、P62表达存在明显差异。解脲支原体感染可引起绒毛组织Bcl-2、Bax、LC3、P62表达差异,且四者联合提高对稽留流产患者解脲支原体感染的预测价值。