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检测血浆中p16及CDO1基因甲基化在胶质瘤诊断中的价值 被引量:6
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作者 李显雄 徐培坤 +3 位作者 李式浩 胡光东 邓鹏程 杨成子 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2017年第4期593-596,共4页
采用甲基化特异PCR(MSP)法分别检测49例胶质瘤患者组织及其对应的术前血浆,10例颅脑外伤患者挫伤的脑组织及其对应的术前血浆和16例健康体检者血浆中p16及半胱氨酸双加氧酶1(CDO1)基因的甲基化状态,以探讨血浆中检测p16及CDO1基因甲基... 采用甲基化特异PCR(MSP)法分别检测49例胶质瘤患者组织及其对应的术前血浆,10例颅脑外伤患者挫伤的脑组织及其对应的术前血浆和16例健康体检者血浆中p16及半胱氨酸双加氧酶1(CDO1)基因的甲基化状态,以探讨血浆中检测p16及CDO1基因甲基化在胶质瘤临床诊断中的价值。胶质瘤组织中p16及CDO1基因甲基化率分别为53.1%(26/49)、42.9%(21/49),对应的血浆甲基化率为39.0%(19/49)、34.7%(17/49)。在肿瘤组织和血浆中p16及CDO1至少一个[p16和(或)CDO1]基因甲基化的频率为75.5%(37/49)和67.3%(33/49)。血浆中p16及CDO1基因(甲基化)联合检测胶质瘤的灵敏度为67.3%,较单基因检测的灵敏度明显提高。单因素分析显示术前患者血浆中p16和(或)CDO1基因的甲基化与年龄、性别、肿瘤分级无关。对一些肿瘤特异基因的甲基化状态进行联合检测可提高胶质瘤在血清学诊断水平上的灵敏度,为胶质瘤的筛查及早期诊断提供新的临床诊断思路。 展开更多
关键词 DNA甲基化 胶质瘤 早期诊断 P16基因 cdo1基因
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大白猪CDO 1基因克隆、生物信息学分析及组织表达定位
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作者 刘红润 朱思燃 +8 位作者 奉玲丽 张坤 颜港 王钰滨 张帅 江山 许迪 兰干球 梁晶 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1352-1363,共12页
【目的】克隆大白猪半胱氨酸双加氧酶1(cysteine dioxygenase type 1,CDO1)基因并进行生物信息学分析,检测CDO 1基因在大白猪不同组织中的表达情况,并定位CDO1在乳腺中的位置,为进一步探究CDO 1基因在乳腺发育过程中的调控作用提供依据... 【目的】克隆大白猪半胱氨酸双加氧酶1(cysteine dioxygenase type 1,CDO1)基因并进行生物信息学分析,检测CDO 1基因在大白猪不同组织中的表达情况,并定位CDO1在乳腺中的位置,为进一步探究CDO 1基因在乳腺发育过程中的调控作用提供依据。【方法】通过PCR扩增大白猪CDO 1基因CDS全长序列,将CDO 1基因序列与pMD18-T载体连接后转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,挑取单个阳性菌扩增培养,菌液通过PCR鉴定后测序,对测序结果进行不同物种间序列相似性比对及系统进化树构建;利用在线预测软件对CDO1蛋白进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR检测CDO 1基因在大白猪不同组织中的表达水平;利用免疫组化方法检测CDO1蛋白在母猪乳腺中的定位。【结果】大白猪CDO 1基因CDS区序列全长603 bp,编码200个氨基酸,家猪与大白猪CDO 1基因核苷酸序列相似性最高。系统进化树结果显示,大白猪与家猪先聚为一类,且与猕猴亲缘关系较近。CDO1蛋白的分子质量为23.018 ku,等电点为5.98,不稳定系数为33.58(<40),为稳定亲水性蛋白,定位在胞浆内,存在糖基化和磷酸化位点,CDO1蛋白二级结构和三级结构模型预测结果一致。组织表达分析结果显示,CDO 1基因在大白猪肝脏中表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05),在乳腺、背最长肌和心脏中表达次之,显著高于除肝脏外的其余组织(P<0.05),在十二指肠中表达量最低。免疫组化结果显示,CDO1定位在母猪乳腺终端芽(TEB)体细胞、上皮细胞和脂肪细胞中。【结论】大白猪CDO 1基因CDS区全长603 bp,编码200个氨基酸,在心脏、肝脏、乳腺中高表达;CDO1蛋白为稳定亲水性蛋白,在母猪乳腺TEB体细胞、上皮细胞和脂肪细胞中富集。研究结果为进一步探究CDO1蛋白调控母猪乳腺发育和影响母猪泌乳功能提供参考。 展开更多
关键词 大白猪 cdo 1基因 克隆 表达 定位
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