抗体CDR-H3区段的免疫信息学分析

抗原结合部位亲和力是其组成氨基酸理化特性、结构特征的集中体现。CDR-H3位于抗体的抗原结合部位中心,构象多变。本研究从人抗体CDR-H3的氨基酸分布序列信息入手,同时选取12个FDA已批准上市的治疗性抗体药物来分析抗体CDR-H3区段的结构特点。结果显示人H3区段最高分布频率长度为12,出现概率最高的氨基酸为Tyr,Tyr、Trp、Ser、Thr、Gly 5种氨基酸有助于抗原结合部位构象的形成;所选取的抗体药物CDRH3区段的长度n∈[7,14],Base区域构象均隶属于K构型,β-发夹结构氢键分布变化各异,其中芳香族氨基酸侧链和带电氨基酸分布对抗原结合具有重要促进作用。

牛抗体中超长CDR H3结构的研究进展

牛体内具有超长CDR H3结构的抗体占总抗体的10%,长度约为70个氨基酸,包含特殊的β-带状柄结构和富含二硫键的旋钮结构,其形成与IGHV1-7区域的短核苷酸复制及IGHD8-2基因有关。牛超长CDR H3结构的抗原结合活性高且具有多样性,其中旋钮结构与抗体结合活性有关,抗体结构、二硫键位置和数量、半胱氨酸数量、体细胞突变等与超长CDR H3结构多样性有关。牛独特的超长CDR H3结构为其免疫应答、免疫治疗和新型疫苗制备等方面提供了新的研究思路。笔者概述了牛超长CDR H3结构的形成机制、特性、抗原结合特性,并总结了其应用前景,以期为新型抗体的研发和应用提供参考。