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CENPA表达与儿童神经母细胞瘤进展和化疗耐受的关系 被引量:3
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作者 杨业然 伏利兵 +7 位作者 王焕民 于永波 金雅琼 洪恩宇 任慧敏 张杰 倪鑫 郭永丽 《标记免疫分析与临床》 CAS 2020年第5期823-828,849,共7页
目的探讨CENPA在儿童神经母细胞瘤(neuroblastoma,NB)中的差异表达。研究CENPA的差异表达对NB增殖、转移、化疗耐药及预后的影响,为NB治疗及预后评价提供理论依据和线索。方法通过实时定量PCR(qRT-PCR)对CENPA在临床NB组织中的表达进行... 目的探讨CENPA在儿童神经母细胞瘤(neuroblastoma,NB)中的差异表达。研究CENPA的差异表达对NB增殖、转移、化疗耐药及预后的影响,为NB治疗及预后评价提供理论依据和线索。方法通过实时定量PCR(qRT-PCR)对CENPA在临床NB组织中的表达进行定量分析,并利用公共数据进行验证。在NB细胞系SH-SY5Y中敲低CENPA,通过实时细胞动力学分析仪测定、克隆形成实验和划痕实验,评估NB细胞增殖、转移和化疗耐药性的变化。并利用公共数据预测了CENPA对NB预后的影响。结果首先,高风险NB组织中CENPA的表达显着增加;其次,在SH-SY5Y细胞中敲低CENPA表达可以抑制NB细胞增殖和转移,并增加SH-SY5Y对阿霉素和顺铂的化疗敏感性;最后,通过分析公共数据发现,CENPA低表达组NB患儿的五年无事件生存率和五年总生存率均显著高于CENPA高表达组。结论CENPA高表达可以促进神经母细胞瘤的发展,增强NB化疗耐药性。因此,CENPA可能成为未来NB治疗和预后评价的潜在靶标。 展开更多
关键词 神经母细胞瘤 cenpa 肿瘤进展 化疗耐药 临床诊断
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CENPA基因在不同鸡种上的序列比较分析
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作者 郑圣晗 陈颖 +1 位作者 陈国宏 常国斌 《上海农业学报》 2019年第4期75-79,共5页
为找出不同鸡种CENPA基因序列上的差异,为鸡抗病育种研究提供基础材料,利用目标区域捕获测序技术对25个鸡种的CENPA基因进行序列测定.以NCBI网站上Gallus_gallus-5.0(GCF_000002 315.4)的CENPA基因序列为参照,利用MEGA 6.06软件对25个... 为找出不同鸡种CENPA基因序列上的差异,为鸡抗病育种研究提供基础材料,利用目标区域捕获测序技术对25个鸡种的CENPA基因进行序列测定.以NCBI网站上Gallus_gallus-5.0(GCF_000002 315.4)的CENPA基因序列为参照,利用MEGA 6.06软件对25个鸡种的基因序列进行比对分析,统计SNPs位点和InDel位点,并构建系统进化树.结果表明:CENPA的外显子没有丰富的多态性,CENPA内含子的丰富多态性主要体现在Intron4上.CENPA基因在Exon3具有保守性,在鸡的进化历史中稳定遗传.25个鸡种大致可被分为4大类,表明我国的地方鸡品种资源丰富,且之间的同源性较低,可为抗病育种的研究提供丰富的样本. 展开更多
关键词 cenpa基因 SNPS INDEL 进化树
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CENPA-driven STMN1 Transcription Inhibits Ferroptosis in Hepatocellular Carcinoma 被引量:1
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作者 Daomiao Liang Lanzhu Luo +2 位作者 Jiang Wang Tongyu Liu Chao Guo 《Journal of Clinical and Translational Hepatology》 SCIE 2023年第5期1118-1129,共12页
Background and Aims:The growing knowledge of ferroptosis has suggested the regulatory role of ferroptosis in hepatocellular carcinoma(HCC),but the pertinent molecular mechanisms remain unclear.Herein,this study invest... Background and Aims:The growing knowledge of ferroptosis has suggested the regulatory role of ferroptosis in hepatocellular carcinoma(HCC),but the pertinent molecular mechanisms remain unclear.Herein,this study investigated the mechanistic basis of ferroptosis-related genes(ferrGenes)in the growth of HCC.Methods:Differentially expressed human ferrGenes and tumor-related transcription factors(TFs)were obtained from the The Cancer Genome Atlas(TCGA)dataset and the GTEx dataset.Spearman method-based correlation analysis were conducted to construct TF-ferrGene coexpression regulatory network.Key genes associated with prognosis were singled out with Lasso regression and multivariate Cox analysis to construct the prognostic risk model.Then the accuracy and independent prognostic ability of the model were evaluated.Expression of CENPA and STMN1 was determined in clinical HCC tissues and HCC cells,and their binding was analyzed with dual-luciferase and chromatin immunoprecipitation(ChIP)assays.Furthermore,ectopic expression and knockdown assays were performed in HCC cells to assess the effect of CENPA and STMN1 on ferroptosis and malignant phenotypes.Results:The prognostic risk model constructed based on the eight TF-ferrGene regulatory network-related genes accurately predicted the prognosis of HCC patients.It was strongly related to the clinical characteristics of HCC patients.Moreover,CENPA/STMN1 might be a key TF-ferrGene regulatory network in ferroptosis of HCC.CENPA and STMN1 were overexpressed in HCC tissues and cells.Additionally,CENPA facilitated STMN1 transcription by binding to STMN1 promoter,thus facilitating the malignant phenotypes and suppressing the ferroptosis of HCC cells.Conclusions:Taken together,CENPA curbs the ferroptosis of HCC cells by upregulating STMN1 transcription,thereby promoting HCC growth. 展开更多
关键词 Ferroptosis Transcription factor Hepatocellular carcinoma Ferroptosis-related genes TF-ferrgene regulatory network Prognostic risk model cenpa STMN1
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c-myc与CENPA在结直肠癌表达的相关性及其临床病理学价值 被引量:3
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作者 陆伟杰 高小姣 +2 位作者 史春桃 韩玮 程杰 《重庆医学》 CAS 2022年第10期1731-1735,1740,共6页
目的研究c-myc与着丝粒蛋白A(CENPA)在结直肠癌中的表达相关性,分析其临床病理学价值。方法利用Oncomine、GEPIA数据库分析c-myc与CENPA在结直肠癌中的表达及相关性。收集江苏大学附属昆山医院86例结直肠癌组织标本,利用免疫组织化学技... 目的研究c-myc与着丝粒蛋白A(CENPA)在结直肠癌中的表达相关性,分析其临床病理学价值。方法利用Oncomine、GEPIA数据库分析c-myc与CENPA在结直肠癌中的表达及相关性。收集江苏大学附属昆山医院86例结直肠癌组织标本,利用免疫组织化学技术检测c-myc与CENPA在癌组织及癌旁组织中的表达,分析二者的相关性以及与临床病理学参数的关系。PROMO数据库预测可能作用于CENPA与c-myc启动子的转录因子。结果Oncomine与GEPIA数据库显示,c-myc与CENPA在结直肠癌组织中表达水平明显高于正常组织,且两者呈正相关。免疫组织化学结果显示,c-myc与CENPA在癌组织中均较癌旁正常组织高,且两者同样呈正相关。不仅如此,c-myc与淋巴结转移和TNM分期呈正相关,CENPA与病理分级呈正相关;c-myc与CENPA共阳性与更高的病理分级、淋巴结转移以及更晚的TNM分期密切相关。PROMO数据库可见,有AR、TCF-4、YY1等71个转录因子可能共同作用于CENPA与c-myc启动子。结论c-myc与CENPA在结直肠癌组织中表达均明显升高,且呈正相关;c-myc与淋巴结转移和TNM分期呈正相关,而CENPA仅与病理分级呈正相关;两者联合检测有利于更好的评估临床病理学参数。同时受AR、TCF-4、YY1等转录因子的调控作用,可能是两者呈正相关的重要因素。 展开更多
关键词 C-MYC cenpa 结直肠癌 临床病理学
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子宫肉瘤差异表达基因生物信息学分析
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作者 胡攀伟 杨红 +1 位作者 高扬 钱麟 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2022年第10期1866-1870,共5页
目的:筛选子宫肉瘤(uterine carcinosarcoma,UCS)进展相关的核心差异基因(differentially expressed genes,DEGs),探讨其生物学作用并筛选预后相关生物标志物。方法:从美国国立生物数据中心下的GEO数据库获取包含子宫肉瘤和正常组织的... 目的:筛选子宫肉瘤(uterine carcinosarcoma,UCS)进展相关的核心差异基因(differentially expressed genes,DEGs),探讨其生物学作用并筛选预后相关生物标志物。方法:从美国国立生物数据中心下的GEO数据库获取包含子宫肉瘤和正常组织的表达数据集GSE64763,使用Limma包筛选差异基因。对筛选得到的差异基因运用ClusterProfiler包进行GO和KEGG分析,并通过蛋白互作网络(protein protein interaction network,PPI)在线平台String和Cytoscape(3.7.2)软件对DEGs分析,筛选核心基因。再基于GEPIA(gene expression profiling interactive analysis)数据库,验证核心基因的表达与预后关系。结果:共筛选出861个DEGs,其中上调DEGs 426个,下调DEGs 435个。富集GO主要生物活性信号15条,主要包括染色质结合、DNA转录活性激活、细胞外基质组成等生物过程。富集KEGG信号15条,主要包括细胞循环通路、DNA复制通路、p53信号通路。成功筛选出核心基因网络,包含DEGs 10个,均为上调基因。通过GEPIA数据库验证后得到与UCS预后相关的差异基因CENPA。结论:UCS差异表达基因主要集中在染色体结合活性、DNA复制活性、细胞循环通路与p53信号通路等。CENPA基因可能为UCS早期诊断的生物标志物和治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 子宫肉瘤 差异表达基因 生物信息学分析 cenpa
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