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基于生物信息学分析CENPE在肺腺癌中的表达及临床意义
1
作者
李群荣
胡艳
+3 位作者
曹娟
王大伟
范浩
胡旭钢
《浙江临床医学》
2021年第9期1240-1244,共5页
目的探讨着丝粒蛋白E(CENPE)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过TCGA和GEO数据库获得CENPE在肺腺癌中的表达数据及相关临床特征参数,比较CENPE在肺腺癌组织和正常组织中的表达差异;分析CENPE表达与肺腺癌患者临床特征、驱动基因突变...
目的探讨着丝粒蛋白E(CENPE)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过TCGA和GEO数据库获得CENPE在肺腺癌中的表达数据及相关临床特征参数,比较CENPE在肺腺癌组织和正常组织中的表达差异;分析CENPE表达与肺腺癌患者临床特征、驱动基因突变、免疫治疗靶点及预后的关系;通过构建列线图模型进一步探讨联合CENPE及相关临床参数在预后监测中的作用;采用基因富集分析(GSEA)探讨CENPE相关的信号通路。最后,在TIMER数据库中观察CENPE在泛肿瘤组织中的表达与临床意义。结果在TCGA、GSE31210、GSE10072、GSE32863、GSE40791和GSE75037等数据库中,CENPE表达水平在肺腺癌组织中高于正常组织(均P<0.001)。HPA数据库的免疫组化结果提示,CENPE蛋白在肺腺癌组织中呈高表达。CENPE的表达与年龄、性别、吸烟史、T分期、N分期、TNM分期、EGFR/KRAS突变状态及PD-L1的表达等密切相关(均P<0.05)。CENPE高表达组患者总体生存率低于低表达组(P<0.05),且可以作为肺腺癌患者的独立预后因子。基于T分期、N分期及CENPE表达的列线图模型,能更准确地预测肺腺癌患者的预后。GSEA结果提示,CENPE高表达患者在有丝分裂纺锤体、mTOR信号通路、G2M检查点、Myc信号通路、E2F靶点、未折叠蛋白反应及DNA损伤修复等信号通路集中。在TIMER数据库中观察到,CENPE在泛肿瘤组织中高表达,并与患者的恶性生物学表型相关。结论CENPE在肺腺癌患者中呈高表达,与患者的恶性表型及不良预后相关,可作为治疗筛选及预后监测的潜在生物标志物。
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关键词
肺腺癌
cenpe预后
驱动基因突变
免疫治疗靶点
数据挖掘
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题名
基于生物信息学分析CENPE在肺腺癌中的表达及临床意义
1
作者
李群荣
胡艳
曹娟
王大伟
范浩
胡旭钢
机构
中国人民解放军联勤保障部队第
出处
《浙江临床医学》
2021年第9期1240-1244,共5页
基金
浙江省医药卫生科技计划项目(2019326546,2021424096)。
文摘
目的探讨着丝粒蛋白E(CENPE)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过TCGA和GEO数据库获得CENPE在肺腺癌中的表达数据及相关临床特征参数,比较CENPE在肺腺癌组织和正常组织中的表达差异;分析CENPE表达与肺腺癌患者临床特征、驱动基因突变、免疫治疗靶点及预后的关系;通过构建列线图模型进一步探讨联合CENPE及相关临床参数在预后监测中的作用;采用基因富集分析(GSEA)探讨CENPE相关的信号通路。最后,在TIMER数据库中观察CENPE在泛肿瘤组织中的表达与临床意义。结果在TCGA、GSE31210、GSE10072、GSE32863、GSE40791和GSE75037等数据库中,CENPE表达水平在肺腺癌组织中高于正常组织(均P<0.001)。HPA数据库的免疫组化结果提示,CENPE蛋白在肺腺癌组织中呈高表达。CENPE的表达与年龄、性别、吸烟史、T分期、N分期、TNM分期、EGFR/KRAS突变状态及PD-L1的表达等密切相关(均P<0.05)。CENPE高表达组患者总体生存率低于低表达组(P<0.05),且可以作为肺腺癌患者的独立预后因子。基于T分期、N分期及CENPE表达的列线图模型,能更准确地预测肺腺癌患者的预后。GSEA结果提示,CENPE高表达患者在有丝分裂纺锤体、mTOR信号通路、G2M检查点、Myc信号通路、E2F靶点、未折叠蛋白反应及DNA损伤修复等信号通路集中。在TIMER数据库中观察到,CENPE在泛肿瘤组织中高表达,并与患者的恶性生物学表型相关。结论CENPE在肺腺癌患者中呈高表达,与患者的恶性表型及不良预后相关,可作为治疗筛选及预后监测的潜在生物标志物。
关键词
肺腺癌
cenpe预后
驱动基因突变
免疫治疗靶点
数据挖掘
Keywords
Lung adenocarcinoma
cenpe
Prognosis
Driver—gene mutation
Immunotherapy target
Data mining
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析CENPE在肺腺癌中的表达及临床意义
李群荣
胡艳
曹娟
王大伟
范浩
胡旭钢
《浙江临床医学》
2021
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