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甲型流感病毒HA蛋白质序列的预测 被引量:1
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作者 张玲 高洁 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期828-831,共4页
基于CGR-游走模型和分数阶差分,用ARFIMA模型预测甲型流感病毒HA蛋白质序列。对所选取1943~2013年同源性相对较高的71条蛋白质序列,用ARFIMA(p,d,q)模型对前20个位置去拟合并且预测,除极个别外由预报区域图显示原始数据都在预报区域内... 基于CGR-游走模型和分数阶差分,用ARFIMA模型预测甲型流感病毒HA蛋白质序列。对所选取1943~2013年同源性相对较高的71条蛋白质序列,用ARFIMA(p,d,q)模型对前20个位置去拟合并且预测,除极个别外由预报区域图显示原始数据都在预报区域内,表明模型建立的比较合理,预报效果很好。这对流感病毒的研究和预测有着重要的意义。 展开更多
关键词 甲流 HA蛋白质序列 预测 cgr游走模型 ARFIMA(p d q)
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甲型H1N1流感病毒蛋白质序列的预测
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作者 张玲 高洁 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期10-13,共4页
目的:用长记忆模型预测未来年份的甲型H1N1流感病毒的蛋白质序列。方法:基于时间序列分析,首先建立CGR混沌游走序列,再进行模型拟合。对所选取的1943年~2012年同源性相对较高的70条流感病毒蛋白质序列,先混沌游走再用ARFIMA(p,d,q)模... 目的:用长记忆模型预测未来年份的甲型H1N1流感病毒的蛋白质序列。方法:基于时间序列分析,首先建立CGR混沌游走序列,再进行模型拟合。对所选取的1943年~2012年同源性相对较高的70条流感病毒蛋白质序列,先混沌游走再用ARFIMA(p,d,q)模型对其前10个位置去拟合并且预测。结果:几乎所有原始蛋白质序列的各个位置值都在预报区域内(除极个别之外),表明选择的模型比较科学。结论:可以用来预测未来年份的流感病毒蛋白质序列,对流感病毒的预测和预防有着重要的研究价值。 展开更多
关键词 甲流病毒 蛋白质序列 预测 cgr游走模型 ARFIMA(p d q)
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