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题名猪嵴病毒441株3D基因的克隆及序列分析
被引量:2
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作者
王恩丽
兰喜
刘伟
杨彬
柳纪省
马小军
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机构
甘肃农业大学动物医学院
中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室草食动物疫病重点开放实验室
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期148-152,共5页
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文摘
根据GenBank中登录的猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)核苷酸序列设计引物,利用RT-PCR技术及3'RACE法扩增猪嵴病毒441株(swKoV CH441株)3D基因。成功扩增了swKoV CH441株的3D基因,3'非编码区(3'untranslated region,3'UTR)及Poly(A),扩增的基因片段长度分别为1 064、1 046和592 bp,包括3A、3B、3C、3D基因序列,3'UTR序列和一个至少含有29个Poly(A)的尾巴。序列分析结果表明,swKoV CH441株3D基因全长1 407 bp,编码468个氨基酸,分子质量约为53 369.29 D,理论等电点为6.12;3'UTR位于终止密码子TGA之后,长166 bp;swKoV CH441株与其他猪嵴病毒3D基因核苷酸序列相似性在92.2%-93.4%,氨基酸一致性为97.9%-99.4%。遗传进化分析表明,swKoV CH441株与国内株亲缘关系较近,与匈牙利株亲缘关系较远。
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关键词
swKoV
ch441株
RT-PCR
3’RACE
3D
基因序列分析
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Keywords
swKoV ch441 RT-PCR 3'RACE 3D gene Sequence analysis
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分类号
S852.65
[农业科学—基础兽医学]
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