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分子动力学模拟中支持CIF蛋白质文件格式
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作者 王恒越 张志勇 《中国科学技术大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1-6,I0007,共7页
分子动力学(MD)模拟能够以非常精细的时间分辨率捕捉蛋白质的全原子动态行为,因此它已经成为蛋白质动力学研究的重要工具。当前有多种MD软件包被广泛使用。MD模拟需要从一个蛋白质初始结构开始,而初始结构一般来自蛋白质数据库(PDB)。直... 分子动力学(MD)模拟能够以非常精细的时间分辨率捕捉蛋白质的全原子动态行为,因此它已经成为蛋白质动力学研究的重要工具。当前有多种MD软件包被广泛使用。MD模拟需要从一个蛋白质初始结构开始,而初始结构一般来自蛋白质数据库(PDB)。直到2014年,PDB文件格式一直是蛋白质结构的标准格式。然而,PDB格式存在一些内在缺陷,例如以固定宽度存储结构信息,这对于超大型蛋白质复合物来说存在问题。因此,CIF文件格式被提出来替代PDB格式,前者的特点是具有出色的扩展性。据我们所知,目前主流的MD软件包只支持PDB格式,而不直接支持CIF格式。在本研究中,我们修改了一个MD软件包GROMACS的源代码,使其能够支持输入CIF格式的蛋白质结构文件,并生成拓扑文件。这项工作将简化大型蛋白质复合物MD模拟中的预处理过程。 展开更多
关键词 蛋白质数据库 PDB格式 cif格式 分子动力学模拟 GROMACS
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CIF到PG3600格式转换的算法研究 被引量:2
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作者 李金儒 陈宝钦 +1 位作者 赵珉 汤跃科 《微电子学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期207-209,共3页
提出了微光刻图形CIF数据格式到PG3600数据格式转换软件新的图形切割算法,该算法将L-EDIT输出的CIF格式中的四种图形当作任意多边形处理,然后把多边形切割成矩形。与其他算法相比较,该算法简单、切割理想、切割后的矩形数据量比其他算... 提出了微光刻图形CIF数据格式到PG3600数据格式转换软件新的图形切割算法,该算法将L-EDIT输出的CIF格式中的四种图形当作任意多边形处理,然后把多边形切割成矩形。与其他算法相比较,该算法简单、切割理想、切割后的矩形数据量比其他算法少很多。并以此算法为基础,编制能够运行于Windows操作系统且又能够挂靠在L-EDIT上的数据格式转换软件。 展开更多
关键词 cif格式 PG3600格式 图形切割 数据格式转换
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CIF格式转换为PG3600格式中任意多边形切割成矩形的算法研究(英文)
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作者 李金儒 陈宝钦 +1 位作者 刘明 赵珉 《电子器件》 CAS 2008年第2期385-388,共4页
为了编制能够运行于Windows操作系统且又能够挂靠在L-EDIT数据格式转换软件,文章提出了微光刻图形CIF数据格式转换为PG3600数据格式的新的图形切割算法——沿边切割法,重点讨论任意多边形切割成矩形的具体算法,并与其它几种常见的切割... 为了编制能够运行于Windows操作系统且又能够挂靠在L-EDIT数据格式转换软件,文章提出了微光刻图形CIF数据格式转换为PG3600数据格式的新的图形切割算法——沿边切割法,重点讨论任意多边形切割成矩形的具体算法,并与其它几种常见的切割算法进行比较,说明该算法对于不规则图形的切割具有明显的优越性,最后给出所编软件运行的实验结果。 展开更多
关键词 数据格式转换 任意多边形 切割法 cif 算法 WINDOWS操作系统 矩形 软件运行
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一种由CIF到PAL制的视频编码器
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作者 罗煜 李靖华 余松煜 《数据采集与处理》 CSCD 1997年第1期61-64,共4页
提出了一种从CIF恢复到全电视信号的方法,这种方法使用了乒乓结构和查表形式,在这种结构的基础上可以扩展出画中画和汉字叠加等功能。同时还可以在信道发生误码时对错误帧进行掩盖.本文还对其中—些可以采用多种方法实现的部分作了... 提出了一种从CIF恢复到全电视信号的方法,这种方法使用了乒乓结构和查表形式,在这种结构的基础上可以扩展出画中画和汉字叠加等功能。同时还可以在信道发生误码时对错误帧进行掩盖.本文还对其中—些可以采用多种方法实现的部分作了实验和比较.对于QCIF,MPEG-1的SIF以及MPEG-2中的多种格式只需作很少的改动就能适用.因此可以广泛地应用于数字电视会议、数字监视和数字视盘等系统中.本文所描述的方法已用于实际的多个系统,具有很强的稳定住和可靠性。 展开更多
关键词 视频编码器 cif PAL制 电视信号
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CIF数字视频的实现
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作者 陈洁 朱秀昌 《电视技术》 北大核心 1998年第3期6-8,共3页
对会议电视系统中包括A/D变换、亮色分离及格式转换在内的CIF数字视频电路的实现提出一种改进的实现方案。该方案经调试取得成功,不仅大大缩小了原来系统的体积,且工作可靠,性能稳定。
关键词 数字视频 PAL编解码 cif格式 在线可编程
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CIF格式文件展开处理程序
6
作者 陈宏 《半导体光电》 CAS CSCD 北大核心 1993年第1期100-103,共4页
阐述对 CIF 格式文件进行展开处理在制版工作中的必要性;剖析了 CIF格式;介绍了展开处理程序的主要思想和结构。
关键词 cif格式 制版 集成电路 处理程序
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一种微电路封装中锡膏印刷钢网开口处理方法 被引量:1
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作者 张颖 李华伟 沈小刚 《微电子学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期846-849,共4页
针对微电路封装中的锡膏印刷钢网开口,提出了一种新的处理方法。通过自编程序,直接对CIF格式的印刷钢网数据进行焊盘自动识别和焊盘形状的自动处理。利用公开软件,实现CIF数据与其他钢网数据之间的互相转换。该方法具有处理速度快、精... 针对微电路封装中的锡膏印刷钢网开口,提出了一种新的处理方法。通过自编程序,直接对CIF格式的印刷钢网数据进行焊盘自动识别和焊盘形状的自动处理。利用公开软件,实现CIF数据与其他钢网数据之间的互相转换。该方法具有处理速度快、精度高、易于实现等特点,适用于处理各种EDA软件导出的锡膏印刷钢网开口数据。 展开更多
关键词 印刷钢网开口 自动处理 cif数据
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对称相位函数掩模化的研究
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作者 白临波 杜春雷 李展 《光子学报》 EI CAS CSCD 2000年第3期255-259,共5页
本文对各种连续对称相位函数及其特性进行了分析 ,讨论了相位函数的 2 π调制、2 N 和 N - 1法量化等问题及数据处理过程 ,提出二元衍射元件 CIF( Caltech IntermediateForm)格式掩模数据的生成方法 ,并建立了实用软件 。
关键词 相位函数 掩模化 激光直写 衍射光学元件
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集成电路版图数据处理中的预处理方法
9
作者 来新泉 刘文广 +2 位作者 贾新章 李伯成 李玉山 《微电子学与计算机》 CSCD 北大核心 1996年第4期48-50,共3页
本文介绍IC版图数据提取器中预处理模块的设计方法与特点。
关键词 集成电路 预处理 数据处理 集成电路版图
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统一高清晰度电视(HDTV)标准基本参数的必要性和前景 被引量:1
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作者 康诵诗 李鹤芩 《电视技术》 北大核心 1993年第6期2-5,共4页
本文阐述了统一高清晰度电视(HDTV)标准的必要性和国际上为此作出的努力,对有争议的参数作了分析。
关键词 高清晰度电视 共图像格式 数据速率
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