CILP2在子宫内膜癌组织中的表达及临床意义

目的:利用在线生物信息学数据库,通过组织水平实验验证CILP2基因在子宫内膜癌中的表达和临床意义,并分析CILP2基因表达与患者预后、免疫浸润之间的关系。方法:通过TIMER数据库获得CILP2在泛癌中的表达情况并用DriverDBv3数据库验证,利用R软件对从TCGA数据库下载子宫内膜癌项目中得到的552例子宫内膜癌和35例正常子宫内膜组织的数据进行差异表达分析,Human Protein Atlas数据库分析子宫内膜癌中CILP2的阳性表达情况,R软件对TCGA数据库下载的子宫内膜癌项目数据进行临床相关性分析,进一步利用免疫组织化学方法检测子宫内膜癌组织芯片中CILP2的表达情况;cBioPortal数据库得到CILP2基因的突变情况,GEPIA、UALCAN、Linkedomics三个数据库对CILP2高、低表达组进行生存期的分析,R软件获得单因素和多因素Cox分析及诊断性ROC分析结果;利用STRING数据库构建与CILP2相互作用的蛋白网络,Linkedomics数据库获取CILP2共表达基因,R软件对共表达基因进行GO和KEGG分析并可视化,TISIDB数据库分析CILP2与肿瘤浸润免疫细胞和免疫调节因子之间的关系。结果:子宫内膜癌患者组织中CILP2基因的mRNA表达水平和蛋白水平均较正常组织显著升高。免疫组织学的实验结果证实了CILP2在子宫内膜癌中异常高表达。cBioPortal突变分析发现CILP2在变异组中高表达,且变异组子宫内膜癌患者的生存时间明显低于未变异组;GEPIA、UALCAN、Linkedomics的生存分析也发现CILP2高表达组子宫内膜癌患者的生存期明显短于低表达组,同时,单因素和多因素Cox分析结果得到CILP2的高表达与患者不良预后有关。STRING在线分析结果表明,与CILP2相互作用的蛋白质参与了包括调控转录、脂质代谢、泛素蛋白修饰、免疫细胞的分化等生物学过程。GO和KEGG富集分析显示,在子宫内膜癌组织中CILP2共表达的基因可能参与泛素蛋白转移酶活性的阳性调节、糖基化、蛋白代谢、胞吐囊泡、核糖核蛋白复合物结合等过程,并与糖基化、脂肪酸降解、细胞周期、胰岛素分泌等信号通路有关。TISIDB分析发现CILP2与激活的CD8^(+)T细胞及巨噬细胞等肿瘤浸润细胞呈负相关;而与CD40、CD80、IL6等部分免疫刺激因子呈正相关;同时,还发现CILP2与PVRL2、TGFB1等部分免疫抑制因子呈正相关;此外还显示CILP2还与HLA-DMA、HLA-DOB等MHC因子呈负相关。结论:基于生物信息学和组织水平的实验揭示,CILP2在子宫内膜癌组织中异常高表达,且其表达水平与子宫内膜癌患者的不良预后和免疫浸润密切相关。CILP2基因可能是评估患者预后的分子标志物及基因治疗靶点。

基于生物信息学分析CILP2基因在结直肠癌中表达及其与预后的相关性

目的:探究CILP2基因在结直肠癌中的表达,分析CILP2基因的表达与临床病理特征、预后的关系,探索CILP2基因在结直肠癌发生发展中的作用机制。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库官方网站上下载结直肠癌的RNA-seq数据及患者的临床病理信息,提取CILP2在结直肠癌组织和正常组织样本中的表达量数据,使用Mann-Whitney U检验分析两组之间的表达差异。根据CILP2在结直肠癌样本中表达水平的中位数,将结直肠癌患者划分为高、低表达两组,使用χ^(2)检验分析CILP2表达与患者临床病理特征的联系,利用Kaplan-Meier法分析CILP2表达与患者预后的相关性。使用单因素和多因素Cox回归分析CILP2表达与结直肠癌患者临床预后相关性。利用基因富集分析(GSEA)探索CILP2在结直肠癌中参与的信号途径。结果:结直肠癌样本中CILP2表达水平显著高于正常组织中CILP2的表达水平,差异具有统计学意义(P<0.05);CILP2的表达与患者的原发肿瘤分期(P=0.014)和淋巴结转移分期(P=0.016)显著相关。CILP2高表达组患者的总体生存率显著低于低表达组患者,且差异具有统计学意义(P=0.009)。多因素Cox回归分析显示,CILP2可以作为结直肠癌患者的独立预后因素(HR=1.288,95%CI:1.058~1.569,P=0.012)。GSEA富集分析结果提示,CILP2主要参与WNT信号通路、刺猬信号通路、肿瘤相关的通路等通路。结论:CILP2在结直肠癌中表达上调,参与多种癌症信号通路,可作为结直肠癌患者的独立预后因素,是结直肠癌新型分子标志物。