Climp63缺失对内质网关键蛋白表达的影响

在真核细胞中,内质网是一种非常重要的细胞器,是细胞内蛋白质与脂质合成的场所.从形态上划分,内质网可分为连续的管状结构以及片状结构.片状内质网通常被核糖体附着,主要负责蛋白质的合成.Climp63(63-kDa cytoskeleton-linking membrane protein)是定位于片状内质网上的单次跨膜蛋白,对片状内质网的塑形有重要作用,它的缺失会导致片状内质网腔隙变窄.利用敲除Climp63的哺乳动物细胞来探究Climp63缺失对内质网关键蛋白表达的影响.通过免疫印迹发现,Climp63的缺失并不影响内质网中多种关键蛋白的表达,这为Climp63以及片状内质网功能的进一步研究提供了重要信息.

基于大量ChIP数据集的果蝇顺式调控模块的从头预测

通过整合果蝇已有的ChIP数据集,采用模体发现算法FisherNet及高性能并行的模体聚类算法CLIMP对果蝇的顺式调控模块进行从头预测.与已知的顺式调控模块进行比对分析,结果表明该方法预测结果覆盖了数据集中已知顺式调控模块的82.93%,证明该方法具有一定的普适性.与较新的DePCRM算法进行比较,结果表明本算法在从头预测顺式调控模块上速度更快、精度更高.