长江三角洲白山羊优质笔料毛关键基因CMTM3启动子区甲基化分析

为进一步明确趋化素样因子3(CMTM3)基因在优质笔料毛性状形成过程中的调控作用,以长江三角洲白山羊为研究对象,采用亚硫酸氢盐处理后测序法,研究关键基因CMTM3在优质笔料毛羊群体中的表达水平,分析CMTM3基因甲基化状况与优质笔料毛性状之间的相关性。结果表明:CMTM3基因在优质笔料毛羊群体中的表达量极显著低于非优质笔料毛羊群体,而优质笔料毛羊群体的甲基化水平则高于非优质笔料毛羊群体,优质笔料毛羊群体的甲基化水平为84.7%~87.4%,非优质笔料毛羊群体为80.0%~81.6%;CMTM3基因的甲基化水平与其表达量呈负相关,相关性达显著或极显著水平。这一研究提示CMTM3基因参与了优质笔料毛性状的形成过程。

CMTM3在胃癌中的表达及其生物学功能研究

背景胃癌(gastric cancer,GC)是消化系统常见的恶性肿瘤之一,预后较差.晚期患者5年生存率低,同时大部分患者发现时已发展为远处转移的晚期或局部晚期,丧失了手术机会.然而,GC发生发展及侵袭转移的确切分子机制仍不完全明晰.目的在本研究中,我们采用生物信息分析结合细胞实验方法探讨CMTM3基因在GC中的表达、生物学功能及其潜在的分子调控机制.方法首先在GEO和TCGA数据库中分析CMTM3基因的差异表达情况,并比较CMTM3基因高低表达与GC患者预后的关系.在正常胃上皮细胞(GES-1)和多个GC细胞系(HGC-27,BGC-823和MKN45)中比较CMTM3基因的表达情况.在MKN45细胞中转染外源性小干扰RNA(sh-CMTM3-1)下调细胞中CMTM3基因表达后,采用MTT实验和划痕实验,评价下调前后细胞增殖和迁移能力有无改变.GEO数据库中筛选GC组织vs胃正常组织中差异表达的microRNA谱,并根据microRNA在线预测软件Targetscan预测CMCT3上游靶基因miR-125b-5P.选取我院收治的15例GC患者,采用q-PCR方法检测癌组织和癌旁组织中CMTM3和miR-125b-5P表达水平.双荧光素酶报告实验验证miR-125b-5P与CMTM3靶向调控关系.转染外源性miR-125b-5P-mimic,评价MKN45细胞增殖和迁移能力的变化.结果在GC患者,癌组织中的CMTM3基因mRNA表达水平明显高于癌旁正常胃组织(P<0.05).CMTM3基因高表达GC患者总生存(overall survival,OS)和无疾病进展生存(disease free survival,DFS)均低于低表达患者.外源性小干扰RNA(sh-CMTM3-1)可显著下调MKN45 GC细胞中CMTM3基因表达(P<0.05).sh-CMTM3-1下调MKN45 GC细胞中CMTM3基因表达后,细胞的迁移能力明显减低(P<0.05).MTT实验显示,sh-CMTM3-1下调CMTM3表达后,MKN45 GC细胞增殖能力明显下降(P<0.05).筛选出CMTM3上游靶基因miR-125b-5P.miR-125b-5P在正常胃黏膜细胞系中表达水平明显高于GC细胞系(P<0.05),GC患者癌组织中miR-125b-5P表达水平明显低于癌旁正常组织(P<0.05).CMTM3基因在GC组织中的表达水平明显高于癌旁组织(P<0.05).GC组织中CMTM3与miR-125b-5P表达呈负相关(rPearson=-0.58,P<0.05).MKN45细胞中,miR-125b-5P可显著下调CMTM3基因表达(P<0.05).双荧光素酶报告实验显示miR-125b-5P基因与CMTM3基因3’UTR靶向结合.转染miR-125b-5Pmimic下调CMTM3表达后GC MKN45细胞增殖能力和迁移能力明显减低(P<0.05).结论miR-125b-5P靶向调控CMTM3基因表达影响GC增殖和迁移能力,并有望成为GC预后的分子标志物和潜在治疗靶点.

Livin CMTM3与胃癌的相关性研究

目的探讨Livin、CMTM3基因与胃癌的关系。方法选择35例胃癌患者作为观察组,另选28例胃炎患者作为对照组。采用PCR方法检测两组Livin、CMTM3基因的表达情况,分析胃癌组织中Livin、CMTM3表达与临床表现之间的关系。结果 Livin基因:观察组的阳性率为51.4%(18/35),对照组为14.3%(4/28),二者比较有统计学意义(χ~2=7.79,P<0.01);CMTM3基因:观察组阳性率为25.7%(9/35),对照组为78.6%(22/28),观察组基因表达低于对照组(χ~2=15.34,P<0.01)。观察组Livin、CMTM3基因表达在组织分化程度方面均有显著差异(P<0.05);CMTM3在淋巴转移方面有显著差异(P<0.05)。结论 Livin、CMTM3基因在胃癌组织中呈异常表达,可能参与了胃癌的发生发展进程。