克罗恩病CNTNAP3基因拷贝数变异及其意义

背景:DNA拷贝数变异是人类疾病的重要致病因素,可能参与了炎症性肠病(IBD)的发病机制和病理过程。目的:探讨CNTNAP3基因在克罗恩病(CD)中的拷贝数变异情况及其意义。方法:纳入2009年7月—2010年12月上海交通大学医学院附属仁济医院收治的活动期CD患者101例,同期80例健康体检者作为正常对照。采集CD患者外周血或肠黏膜标本,以比较基因组杂交芯片(a CGH,n=8)和荧光定量PCR(n=93)筛选、验证CNTNAP3基因拷贝数变异,ELISA法(n=55)检测CNTNAP3编码蛋白表达。结果:a CGH检测显示初发CD患者染色体9p13区域(含CNTNAP3基因)存在大片段拷贝数扩增;荧光定量PCR验证并确认CD组外周血CNTNAP3基因拷贝数显著高于正常对照组,非激素治疗组差异更为明显(208 616.4±126 984.7和233 453.3±113 520.8对161 750.2±53 940.3,P<0.05和P<0.01)。在各项CD临床参数中,仅吸烟史与CNTNAP3基因拷贝数扩增显著相关(P<0.05),但拷贝数明显扩增者的血浆CNTNAP3水平与正常对照组无明显差异(P>0.05),与简化CD内镜评分无相关性(P>0.05)。结论:CNTNAP3基因拷贝数扩增可能参与了中国CD人群的发病,激素治疗和吸烟可能是影响该基因拷贝数变异的因素;血浆CNTNAP3水平不能用于区分CD患者与健康人。本研究结论有待进一步验证。

CNTNAP3B基因单核苷酸多态性与199例食管鳞癌患者生存关联分析

目的为了提高食管鳞癌患者的生存期,探讨CNTNAP3B基因单核苷酸多态性(SNP)与食管鳞癌患者生存期(OS)的关联。方法选择高发地区医院的199位食管鳞癌患者的癌组织为研究对象,使用bcftools软件识别SNP,并利用ANNOVAR软件对多态性位点进行功能注释。采用液相色谱—质谱技术对199例食管鳞癌的癌组织样本进行分析,并采用SPSS 21.0分析SNP rs3739620位点基因型与食管鳞癌患者OS的关系。结果单个SNP位点分析时,发现C/T基因型比C/C基因型生存率高,T/T基因型比C/T基因型生存率高。统计学分析显示SNP不同基因型的食管鳞癌患者的生存有显著差异(P<0.02)。CNTNAP3B基因rs3739620位点基因型影响MRPL18蛋白表达,以T/T基因型蛋白表达量最低,C/C基因型蛋白表达量最高,差异有统计学意义(P<0.001,bate为-0.32)。结论CNTNAP3B基因rs3739620位点T/T基因型生存期最好,可能与通过CNTNAP3B基因影响MRPL18蛋白表达有关,对食管鳞癌患者预后生存具有一定的临床指导意义。