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基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI的贵州东方蜜蜂群体遗传分析
1
作者
周文才
李应
+7 位作者
姚丹
万炜
詹洪平
黎华君
贺兴江
冉曜琦
于瀛龙
韦小平
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1819-1828,共10页
【目的】明确贵州省东方蜜蜂群体的遗传结构和遗传多样性,掌握其遗传现状,为贵州省东方蜜蜂的遗传资源评价及保护利用提供参考依据。【方法】基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段对贵州省内19个采样点的1282群东方蜜蜂进行遗传分析,计...
【目的】明确贵州省东方蜜蜂群体的遗传结构和遗传多样性,掌握其遗传现状,为贵州省东方蜜蜂的遗传资源评价及保护利用提供参考依据。【方法】基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段对贵州省内19个采样点的1282群东方蜜蜂进行遗传分析,计算单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异数(K)和核苷酸多样性(π)等遗传多样性指数,采用中性检验(Tajima's D和Fu's Fs)评估群体扩张情况,通过计算遗传分化系数(Fst)、构建系统发育进化树和分子方差分析评估其遗传分化,并开展环境因子相关分析以明确遗传分化的作用因子。【结果】贵州东方蜜蜂在线粒体tRNA^(leu)~COII片段上的Hd介于0.5421~0.9167,π介于0.00174~0.00527,K介于0.611~1.854,其中台江、雷山、麻江、罗甸、紫云、晴隆和威宁等7个采样点发生过群体扩张;在线粒体COI片段上的Hd介于0.5710~0.9109,π介于0.00109~0.00261,K介于0.874~2.084,其中松桃、江口、印江、台江、石阡、雷山、罗甸、紫云、黔西、晴隆和威宁等11个采样点发生过群体扩张。贵州东、西部东方蜜蜂群体间存在中度遗传分化(在tRNA^(leu)~COII片段上的Fst=0.04±0.02,在COI片段上的Fst=0.07±0.04),贵州西部东方蜜蜂群体内也存在中度遗传分化(在tRNA^(leu)~COII片段上的Fst=0.04±0.02,在COI片段上的Fst=0.07±0.03)。相关分析结果显示,贵州西部东方蜜蜂组群的遗传分化程度与海拔呈弱相关,但与温度、湿度等环境因子呈显著正相关。【结论】贵州省东方蜜蜂在线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段上的遗传多样性处于较高水平,主要归功于蜂群数量大和饲养方式较原始;贵州东方蜜蜂整体上呈现中度遗传分化,且西部东方蜜蜂组群内部的遗传分化程度较东部东方蜜蜂组群更高,主要与温度和湿度等环境因子密切相关,是其为适应所处环境而进化产生,而非海拔因素造成。
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关键词
东方蜜蜂
tRNA^(leu)~
coi
I
片段
coi片段
遗传多样性
遗传分化
环境因子
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职称材料
单只轮虫DNA提取及其细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基部分序列测定
被引量:
20
2
作者
董云伟
牛翠娟
+2 位作者
鲍蕾
李庆芬
黄晨西
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期81-83,共3页
通过调整试剂剂量及实验条件与步骤 ,利用WizardTM基因组DNA纯化试剂盒可以稳定、快捷地提取单只轮虫的DNA。以提取的DNA为模板 ,利用COⅠ通用引物 ,扩增并测定了萼花臂尾轮虫 (Brachionuscalyci florus)COⅠ部分基因的序列。与褶皱臂...
通过调整试剂剂量及实验条件与步骤 ,利用WizardTM基因组DNA纯化试剂盒可以稳定、快捷地提取单只轮虫的DNA。以提取的DNA为模板 ,利用COⅠ通用引物 ,扩增并测定了萼花臂尾轮虫 (Brachionuscalyci florus)COⅠ部分基因的序列。与褶皱臂尾轮虫 (B plicatilis)COⅠ基因序列比较结果表明 ,此片断确为轮虫COⅠ基因片断 。
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关键词
单只轮虫
DNA
提取
coi
基因
片段
细胞色素C
氧化酶
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职称材料
不同地区桔小实蝇遗传分化研究
3
作者
陈云芳
高渊
+3 位作者
庄鸣娟
胡斌华
葛华林
詹国辉
《西南林学院学报》
2010年第B06期4-7,共4页
利用线粒体COI基因片段分析3个省份,6个种群,总计66个桔小实蝇样品个体,共得到54种基因单倍型,所有种群共有181个多态位点。应用MEGA 3.1软件对试验所得的66条样品DNA片段进行聚类分析,结果发现:单倍型在系统树中的分布没有明显的地理...
利用线粒体COI基因片段分析3个省份,6个种群,总计66个桔小实蝇样品个体,共得到54种基因单倍型,所有种群共有181个多态位点。应用MEGA 3.1软件对试验所得的66条样品DNA片段进行聚类分析,结果发现:单倍型在系统树中的分布没有明显的地理分布族群,遗传分化程度较低。
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关键词
桔小实蝇
线粒体
coi
基因
片段
遗传分化
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职称材料
题名
基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI的贵州东方蜜蜂群体遗传分析
1
作者
周文才
李应
姚丹
万炜
詹洪平
黎华君
贺兴江
冉曜琦
于瀛龙
韦小平
机构
贵州省农业科学院现代农业发展研究所
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1819-1828,共10页
基金
贵州省科技计划项目(黔科合基础〔2019〕1453号)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-44-SYZ-22)
贵州省农业科学院科技项目(黔农科院青年科技基金〔2020〕08号,黔农科院种质资源〔2022〕16号)。
文摘
【目的】明确贵州省东方蜜蜂群体的遗传结构和遗传多样性,掌握其遗传现状,为贵州省东方蜜蜂的遗传资源评价及保护利用提供参考依据。【方法】基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段对贵州省内19个采样点的1282群东方蜜蜂进行遗传分析,计算单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异数(K)和核苷酸多样性(π)等遗传多样性指数,采用中性检验(Tajima's D和Fu's Fs)评估群体扩张情况,通过计算遗传分化系数(Fst)、构建系统发育进化树和分子方差分析评估其遗传分化,并开展环境因子相关分析以明确遗传分化的作用因子。【结果】贵州东方蜜蜂在线粒体tRNA^(leu)~COII片段上的Hd介于0.5421~0.9167,π介于0.00174~0.00527,K介于0.611~1.854,其中台江、雷山、麻江、罗甸、紫云、晴隆和威宁等7个采样点发生过群体扩张;在线粒体COI片段上的Hd介于0.5710~0.9109,π介于0.00109~0.00261,K介于0.874~2.084,其中松桃、江口、印江、台江、石阡、雷山、罗甸、紫云、黔西、晴隆和威宁等11个采样点发生过群体扩张。贵州东、西部东方蜜蜂群体间存在中度遗传分化(在tRNA^(leu)~COII片段上的Fst=0.04±0.02,在COI片段上的Fst=0.07±0.04),贵州西部东方蜜蜂群体内也存在中度遗传分化(在tRNA^(leu)~COII片段上的Fst=0.04±0.02,在COI片段上的Fst=0.07±0.03)。相关分析结果显示,贵州西部东方蜜蜂组群的遗传分化程度与海拔呈弱相关,但与温度、湿度等环境因子呈显著正相关。【结论】贵州省东方蜜蜂在线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段上的遗传多样性处于较高水平,主要归功于蜂群数量大和饲养方式较原始;贵州东方蜜蜂整体上呈现中度遗传分化,且西部东方蜜蜂组群内部的遗传分化程度较东部东方蜜蜂组群更高,主要与温度和湿度等环境因子密切相关,是其为适应所处环境而进化产生,而非海拔因素造成。
关键词
东方蜜蜂
tRNA^(leu)~
coi
I
片段
coi片段
遗传多样性
遗传分化
环境因子
Keywords
Apis cerana
tRNA^(leu)-
coi
I fragment
coi
fragment
genetic diversity
genetic differentiation
environmental factor
分类号
S891.8 [农业科学—特种经济动物饲养]
下载PDF
职称材料
题名
单只轮虫DNA提取及其细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基部分序列测定
被引量:
20
2
作者
董云伟
牛翠娟
鲍蕾
李庆芬
黄晨西
机构
北京师范大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室
出处
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期81-83,共3页
基金
国家重点基础研究发展规划项目 (G2 0 0 0 0 46 80 4)
文摘
通过调整试剂剂量及实验条件与步骤 ,利用WizardTM基因组DNA纯化试剂盒可以稳定、快捷地提取单只轮虫的DNA。以提取的DNA为模板 ,利用COⅠ通用引物 ,扩增并测定了萼花臂尾轮虫 (Brachionuscalyci florus)COⅠ部分基因的序列。与褶皱臂尾轮虫 (B plicatilis)COⅠ基因序列比较结果表明 ,此片断确为轮虫COⅠ基因片断 。
关键词
单只轮虫
DNA
提取
coi
基因
片段
细胞色素C
氧化酶
Keywords
Single rotifer
DNA extraction
COⅠ
分类号
Q936 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
不同地区桔小实蝇遗传分化研究
3
作者
陈云芳
高渊
庄鸣娟
胡斌华
葛华林
詹国辉
机构
苏州出入境检验检疫局
出处
《西南林学院学报》
2010年第B06期4-7,共4页
基金
江苏出入境检验检疫局科技项目(2008KJ36)资助
文摘
利用线粒体COI基因片段分析3个省份,6个种群,总计66个桔小实蝇样品个体,共得到54种基因单倍型,所有种群共有181个多态位点。应用MEGA 3.1软件对试验所得的66条样品DNA片段进行聚类分析,结果发现:单倍型在系统树中的分布没有明显的地理分布族群,遗传分化程度较低。
关键词
桔小实蝇
线粒体
coi
基因
片段
遗传分化
Keywords
Bactrocera dorsalis
mtDNA
coi
genetic differentiation
分类号
S436.67 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI的贵州东方蜜蜂群体遗传分析
周文才
李应
姚丹
万炜
詹洪平
黎华君
贺兴江
冉曜琦
于瀛龙
韦小平
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
单只轮虫DNA提取及其细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基部分序列测定
董云伟
牛翠娟
鲍蕾
李庆芬
黄晨西
《Zoological Research》
CAS
CSCD
北大核心
2002
20
下载PDF
职称材料
3
不同地区桔小实蝇遗传分化研究
陈云芳
高渊
庄鸣娟
胡斌华
葛华林
詹国辉
《西南林学院学报》
2010
0
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职称材料
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