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基于线粒体COI基因5′端区段粉螨DNA条形码研究
被引量:
2
1
作者
张兰香
詹雨娟
+4 位作者
李梦珠
王严
李心玫
褚凌渺
孙恩涛
《皖南医学院学报》
CAS
2021年第1期9-12,共4页
目的:基于线粒体COI基因5′端区段对常见储藏物粉螨进行分子鉴定,为粉螨鉴定方法的探讨提供依据。方法:采集储藏物样本,分离粉螨,形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA、PCR扩增、克隆测序,所获序列在Blast中进行同源性比对。结合GenBank...
目的:基于线粒体COI基因5′端区段对常见储藏物粉螨进行分子鉴定,为粉螨鉴定方法的探讨提供依据。方法:采集储藏物样本,分离粉螨,形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA、PCR扩增、克隆测序,所获序列在Blast中进行同源性比对。结合GenBank已知粉螨COI基因序列,用ClustalX 1.83软件进行多序列比对,基于MEGA X软件进行序列分析并计算遗传距离,构建Maximum Likelihood系统发育树。结果:经形态学鉴定出7种粉螨,其中腐食酪螨Tyrophagus putrescentiae、范张食酪螨T.fanetzhangorum、粉尘螨Dermatophagoides farinae、棕脊足螨Gohieria fusca和害嗜鳞螨Lepidoglyphus destructor分子鉴定与形态学鉴定相一致,拱殖嗜渣螨Chortoglyphus arcuatus和纳氏皱皮螨Suidasia nesbitti分子鉴定与形态学鉴定并非一致,共检测到261个变异位点,400个保守位点,247个简约信息位点。种内遗传距离为0.00~0.01,种间遗传距离为0.171~0.262。构建ML系统进化树显示,7种粉螨均独立聚为一支,且支持率均达100%,与形态学鉴定一致。结论:线粒体COI基因5′端区段可用于7种常见储藏物粉螨的物种鉴定,为构建DNA条形码数据库提供基础资料。
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关键词
线粒体COI基因
5
′端区段
粉螨
DNA条形码
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职称材料
成色剂COY—5中主要杂质的分析研究
2
作者
孙红艳
田文德
《辽宁化工》
CAS
1997年第1期53-56,共4页
应用高效液相色谱、薄层色谱、质谱及核磁共振谱等仪器分析手段,提出了成色剂COY—5中主要杂质的分子结构,指出了该杂质的产生原因和机理。
关键词
成色剂
杂质
分子结构
感光材料
黄成色剂
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职称材料
检疫性有害生物枣咔实蝇的快速分子鉴定
被引量:
1
3
作者
陈光辉
李焱
+1 位作者
张小菊
胡红英
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2021年第1期46-54,共9页
枣咔实蝇Carpomya vesuviana Costa是枣树果实的一种重要检疫性害虫,其寄主枣树在我国种植广泛,该虫一旦传入和扩散,将对我国新疆红枣产业造成严重危害。本研究以枣咔实蝇蛹和成虫为对象,通过提取枣咔实蝇蛹和成虫样品的基因组DNA,借助...
枣咔实蝇Carpomya vesuviana Costa是枣树果实的一种重要检疫性害虫,其寄主枣树在我国种植广泛,该虫一旦传入和扩散,将对我国新疆红枣产业造成严重危害。本研究以枣咔实蝇蛹和成虫为对象,通过提取枣咔实蝇蛹和成虫样品的基因组DNA,借助生物信息学分析软件挖掘枣咔实蝇ITS2、16S rRNA、CYT-B-D、CYT-B-C、COI-5'、COI-3'、COII等分子鉴定靶点序列并设计扩增引物,以建立枣咔实蝇的快速分子鉴定技术。PCR扩增、测序和序列相似性结果显示,从枣咔实蝇蛹和成虫中获得的16条序列(含14条新序列),分析表明其中CYT-B、COI、COII可作为枣咔实蝇分子鉴定序列。该技术可应用于枣咔实蝇的识别鉴定、实时监测、早期防治等项工作。
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关键词
枣咔实蝇
DNA条形码
鉴定
ITS2
16S
rRNA
CYT-B-D
CYT-B-C
coi-5'
coi-
3
'
COII
下载PDF
职称材料
题名
基于线粒体COI基因5′端区段粉螨DNA条形码研究
被引量:
2
1
作者
张兰香
詹雨娟
李梦珠
王严
李心玫
褚凌渺
孙恩涛
机构
皖南医学院卫生检验与检疫学教研室
出处
《皖南医学院学报》
CAS
2021年第1期9-12,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31870352)
皖南医学院青年卓越人才资助项目(Wyqnyx201902)
安徽省大学生创新创业教育训练计划项目(S201910368114)。
文摘
目的:基于线粒体COI基因5′端区段对常见储藏物粉螨进行分子鉴定,为粉螨鉴定方法的探讨提供依据。方法:采集储藏物样本,分离粉螨,形态学鉴定后,提取单个螨基因组DNA、PCR扩增、克隆测序,所获序列在Blast中进行同源性比对。结合GenBank已知粉螨COI基因序列,用ClustalX 1.83软件进行多序列比对,基于MEGA X软件进行序列分析并计算遗传距离,构建Maximum Likelihood系统发育树。结果:经形态学鉴定出7种粉螨,其中腐食酪螨Tyrophagus putrescentiae、范张食酪螨T.fanetzhangorum、粉尘螨Dermatophagoides farinae、棕脊足螨Gohieria fusca和害嗜鳞螨Lepidoglyphus destructor分子鉴定与形态学鉴定相一致,拱殖嗜渣螨Chortoglyphus arcuatus和纳氏皱皮螨Suidasia nesbitti分子鉴定与形态学鉴定并非一致,共检测到261个变异位点,400个保守位点,247个简约信息位点。种内遗传距离为0.00~0.01,种间遗传距离为0.171~0.262。构建ML系统进化树显示,7种粉螨均独立聚为一支,且支持率均达100%,与形态学鉴定一致。结论:线粒体COI基因5′端区段可用于7种常见储藏物粉螨的物种鉴定,为构建DNA条形码数据库提供基础资料。
关键词
线粒体COI基因
5
′端区段
粉螨
DNA条形码
Keywords
mitochondrial COI gene
5
′-terminal segment
acaroid mites
DNA barcode
分类号
R384.4 [医药卫生—医学寄生虫学]
Q963 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
成色剂COY—5中主要杂质的分析研究
2
作者
孙红艳
田文德
机构
化工部感光材料技术开发中心
沈阳药科大学
出处
《辽宁化工》
CAS
1997年第1期53-56,共4页
文摘
应用高效液相色谱、薄层色谱、质谱及核磁共振谱等仪器分析手段,提出了成色剂COY—5中主要杂质的分子结构,指出了该杂质的产生原因和机理。
关键词
成色剂
杂质
分子结构
感光材料
黄成色剂
Keywords
coupler COY
5
, organic impurity molecular structure, mechnism
分类号
TQ572.291 [化学工程—精细化工]
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职称材料
题名
检疫性有害生物枣咔实蝇的快速分子鉴定
被引量:
1
3
作者
陈光辉
李焱
张小菊
胡红英
机构
喀什大学生命与地理科学学院
新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室
新疆大学生命科学与技术学院
喀什海关技术中心
乌鲁木齐海关技术中心
出处
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2021年第1期46-54,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31672338)。
文摘
枣咔实蝇Carpomya vesuviana Costa是枣树果实的一种重要检疫性害虫,其寄主枣树在我国种植广泛,该虫一旦传入和扩散,将对我国新疆红枣产业造成严重危害。本研究以枣咔实蝇蛹和成虫为对象,通过提取枣咔实蝇蛹和成虫样品的基因组DNA,借助生物信息学分析软件挖掘枣咔实蝇ITS2、16S rRNA、CYT-B-D、CYT-B-C、COI-5'、COI-3'、COII等分子鉴定靶点序列并设计扩增引物,以建立枣咔实蝇的快速分子鉴定技术。PCR扩增、测序和序列相似性结果显示,从枣咔实蝇蛹和成虫中获得的16条序列(含14条新序列),分析表明其中CYT-B、COI、COII可作为枣咔实蝇分子鉴定序列。该技术可应用于枣咔实蝇的识别鉴定、实时监测、早期防治等项工作。
关键词
枣咔实蝇
DNA条形码
鉴定
ITS2
16S
rRNA
CYT-B-D
CYT-B-C
coi-5'
coi-
3
'
COII
Keywords
Carpomya vesuviana
DNA barcode
Identification
ITS2
16S rRNA
CYT-B
coi-5'
coi-
3
'
COII
分类号
S41-30 [农业科学—植物保护]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体COI基因5′端区段粉螨DNA条形码研究
张兰香
詹雨娟
李梦珠
王严
李心玫
褚凌渺
孙恩涛
《皖南医学院学报》
CAS
2021
2
下载PDF
职称材料
2
成色剂COY—5中主要杂质的分析研究
孙红艳
田文德
《辽宁化工》
CAS
1997
0
下载PDF
职称材料
3
检疫性有害生物枣咔实蝇的快速分子鉴定
陈光辉
李焱
张小菊
胡红英
《寄生虫与医学昆虫学报》
CAS
2021
1
下载PDF
职称材料
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