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鸡COL14A1基因的生物信息学分析及组织表达谱研究
被引量:
1
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作者
马岩超
张露洁
+7 位作者
蔡春霞
李建增
韩露
吉进卿
张彦华
田亚东
韩瑞丽
王永才
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第21期64-68,138,共6页
为了分析肉鸡肢体内外翻畸形(valgus-varus deformity,VVD)致病候选基因COL14A1的生物信息学功能和组织表达谱,试验以6只35日龄的哈伯德肉鸡作为试验对象(正常组3只,VVD组3只),采用在线软件分析COL14A1基因核苷酸序列同源性、蛋白质基...
为了分析肉鸡肢体内外翻畸形(valgus-varus deformity,VVD)致病候选基因COL14A1的生物信息学功能和组织表达谱,试验以6只35日龄的哈伯德肉鸡作为试验对象(正常组3只,VVD组3只),采用在线软件分析COL14A1基因核苷酸序列同源性、蛋白质基本理化性质和结构特征,利用实时荧光定量PCR法检测COL14A1基因在不同组织中的相对表达量,并绘制组织表达谱。结果表明:鸡COL14A1基因核苷酸序列和绿头鸭、日本鹌鹑的同源性最高;COL14A1蛋白理论等电点为5.25,不稳定指数为36.72,平均亲水性分值为-0.344分;COL14A1蛋白不存在跨膜结构,信号肽预测值为0.9862分,大于阈值0.5分;二级结构中的α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链占比分别为17.27%、4.56%、55.88%、22.30%,其中无规则卷曲和延伸链占比较多;三级结构中存在着大量的无规则卷曲和延伸链;COL14A1基因在腿肌组织中相对表达量最低,在软骨和法氏囊组织中的相对表达量较高,并且VVD组肉鸡法氏囊组织相对表达量极显著低于正常组(P<0.01)。说明COL14A1基因在法氏囊组织中的差异表达可能是导致肉鸡发生VVD的关键原因。
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关键词
鸡
肢体内翻外翻畸形
col14a1
基因
生物信息学分析
组织表达谱
原文传递
题名
鸡COL14A1基因的生物信息学分析及组织表达谱研究
被引量:
1
1
作者
马岩超
张露洁
蔡春霞
李建增
韩露
吉进卿
张彦华
田亚东
韩瑞丽
王永才
机构
河南农业大学动物科技学院
河南省畜牧总站
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022年第21期64-68,138,共6页
基金
河南省自然科学基金面上项目(222300420458)
河南省自然科学基金青年项目(202300410203)。
文摘
为了分析肉鸡肢体内外翻畸形(valgus-varus deformity,VVD)致病候选基因COL14A1的生物信息学功能和组织表达谱,试验以6只35日龄的哈伯德肉鸡作为试验对象(正常组3只,VVD组3只),采用在线软件分析COL14A1基因核苷酸序列同源性、蛋白质基本理化性质和结构特征,利用实时荧光定量PCR法检测COL14A1基因在不同组织中的相对表达量,并绘制组织表达谱。结果表明:鸡COL14A1基因核苷酸序列和绿头鸭、日本鹌鹑的同源性最高;COL14A1蛋白理论等电点为5.25,不稳定指数为36.72,平均亲水性分值为-0.344分;COL14A1蛋白不存在跨膜结构,信号肽预测值为0.9862分,大于阈值0.5分;二级结构中的α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和延伸链占比分别为17.27%、4.56%、55.88%、22.30%,其中无规则卷曲和延伸链占比较多;三级结构中存在着大量的无规则卷曲和延伸链;COL14A1基因在腿肌组织中相对表达量最低,在软骨和法氏囊组织中的相对表达量较高,并且VVD组肉鸡法氏囊组织相对表达量极显著低于正常组(P<0.01)。说明COL14A1基因在法氏囊组织中的差异表达可能是导致肉鸡发生VVD的关键原因。
关键词
鸡
肢体内翻外翻畸形
col14a1
基因
生物信息学分析
组织表达谱
Keywords
chickens
Valgus-varus deformity
col14a1 gene
bioinformatics analysis
tissue expression profile
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鸡COL14A1基因的生物信息学分析及组织表达谱研究
马岩超
张露洁
蔡春霞
李建增
韩露
吉进卿
张彦华
田亚东
韩瑞丽
王永才
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2022
1
原文传递
已选择
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条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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