基于网络药理学和生物信息学探讨满药复方木鸡颗粒治疗肝癌的分子机制

利用网络药理学和生物信息学方法揭示复方木鸡颗粒治疗肝癌的作用机制。通过TCMSP、Swiss Target Prediction数据库分别获取复方木鸡颗粒的活性成分以及相关靶点;在GEO数据库筛选肝癌的相关靶点;利用Venny 2.1在线平台获取药物与疾病的共同靶点;由Cytoscape 3.8.2绘制药物–成分–靶点–疾病网络;用STRING数据库构建PPI网络;通过DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;利用Kaplan Meier-Plotter数据库对关键基因的表达量及预后关联性进行分析;运用AutoDock软件对关键成分和靶点进行分子对接验证。复方木鸡颗粒中共获得37个活性成分,筛选出57个共有靶点,涉及生物过程98条、细胞成分17条、分子功能37条,介导15条信号通路。生存期分析结果显示,ESR1、CYP3A4、G6PD基因的表达量与肝癌患者的生存期具有相关性。分子对接表明筛选的6个活性成分与6个关键靶点蛋白之间具有较好的结合能力。复方木鸡颗粒中的大豆皂苷C、柚皮素、β-谷固醇、汉黄芩素等活性成分可以作用于ESR1、CYP3A4、G6PD等靶点,可能通过P53、戊糖磷酸途径、MAPK等信号通路发挥治疗肝癌的作用。

基于网络药理学方法及实验验证探讨复方金钱草颗粒对前列腺增生的防治作用及机制

目的基于网络药理学方法及实验验证探讨复方金钱草颗粒(JQC)对前列腺增生(BPH)的防治作用及机制。方法(1)通过TCMSP数据库检索广金钱草、车前草、光石韦、玉米须的活性成分,同时通过文献检索进行补充;利用PubChem、Swiss Target Prediction、CTD数据库筛选JQC活性成分作用靶点。通过GeneCards、CTD、DRUGBANK、DisGeNET数据库筛选BPH疾病相关靶点。对JQC活性成分作用靶点与BPH疾病相关靶点进行映射取交集,即得JQC治疗BPH的潜在作用靶点。利用STRING 11.5数据库对JQC治疗BPH的潜在作用靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析。利用Metascape平台对潜在作用靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。采用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-成分-靶点-通路”网络,预测JQC治疗BPH的关键活性成分及核心靶点。利用AutoDock Vina软件进行关键活性成分与核心靶点的分子对接验证。(2)将60只SD雄性大鼠随机分为空白组、模型组、前列舒通胶囊组(0.324 g·kg^(-1))及JQC高、中、低剂量组(3.24、1.62、0.81 g·kg^(-1)),每组10只。采用去势联合注射丙酸睾酮诱导建立BPH大鼠模型。灌胃给药,每天1次,连续给药30 d。摘取大鼠前列腺组织,称定质量并计算前列腺湿质量指数;采用ELISA法检测血清COX-2、VEGF、PGE2的含量;HE染色法观察大鼠前列腺组织的病理变化;Western Blot法检测前列腺组织中AKT1、p-AKT1、PI3K、p-PI3K、COX-2、VEGF蛋白表达水平。结果(1)共得到JQC活性成分作用靶点260个,疾病相关靶点1584个,JQC治疗BPH的潜在作用靶点(交集靶点)125个。PPI网络分析发现AKT1、TNF、TP53、IL1β、EGFR、CASP3、PTGS2等靶点可能是JQC治疗BPH的重要靶点。JQC治疗BPH的潜在作用靶点主要与IL-17、HIF-1、TNF及PI3K-Akt通路相关。得到关键活性成分为木犀草素、芹菜素、车前子苷、芒果苷、夏佛塔苷、异牡荆苷,核心靶点为PTGS2、AR、CASP3、IL6、PTGS1、AKT1等。共有24对“关键活性成分-核心靶点”的分子结合能均≤-6 kcal·mol^(-1);PTGS2蛋白受体与木犀草素、芹菜素等配体结合活性最好;AKT1与车前子苷、芒果苷、木犀草素、芹菜素、夏佛塔苷、异牡荆苷等均具有较好的亲和力。(2)与模型组比较,JQC高、中剂量组大鼠的前列腺湿质量与湿质量指数均明显降低(P<0.05,P<0.01);大鼠前列腺腺体基底细胞肥大有明显缓解,腺腔大小相对规则,上皮细胞增生情况均有所改善;血清COX-2、VEGF、PGE2水平明显降低(P<0.05,P<0.01);前列腺组织中的p-AKT1、p-PI3K、PI3K、COX-2、VEGF蛋白表达明显下调(P<0.05,P<0.01)。结论JQC对BPH具有明显防治作用,其机制可能是通过车前子苷、芒果苷、木犀草素等活性成分来调控PI3K/Akt信号通路,抑制COX-2的表达,减少PGE2释放,进而导致VEGF表达下调,抑制前列腺细胞增殖。

清气凉营颗粒抗流感病毒药效学研究和分子机制分析

目的探讨清气凉营颗粒抗流感病毒药效学研究和分子机制分析。方法体内实验验证清气凉营颗粒抗甲型流感药效,同时利用活性成分筛选、靶点预测技术,结合生物信息学手段,确定清气凉营颗粒治疗流感的特异性靶点,并进行信号通路富集分析,探讨其治疗流感的分子机制。结果体内实验显示清气凉营颗粒具有抗甲型流感的作用,而其抗流感的分子机制主要参与了Wnt信号通路,调控细菌侵袭性上皮细胞信号通路,同时也影响了致病性大肠杆菌感染信号通路、军团杆菌病信号通路和甲型流感信号等通路。结论清气凉营颗粒主要从抑制细菌感染、抗病毒感染和抑制病毒复制3个方面抑制流感。

基于网络药理学和分子对接分析补肾活血颗粒治疗帕金森病分子机制

目的以网络药理学为主要研究手段,并结合分子对接技术,分析补肾活血颗粒治疗帕金森病的分子机制。方法使用TCMSP查找补肾活血颗粒活性成分,进行ADME筛选,将得到的活性成分及作用靶点与PD作用靶点相结合,得到疾病-药物共同作用靶点;使用STRING11.0对获得的疾病-药物作用靶点构建PPI网络。利用Metascape平台,对疾病-药物靶点功能与通路的富集分析,继而使用Cytoscape 3.7.1构建补肾活血颗粒-PD靶点-作用通路网络图;借助于AUTODOCK和PYMOL软件进行分子对接和可视化操作。结果补肾活血颗粒治疗PD的核心活性成分是槲皮素、木犀草素、山柰酚、丹参酮等;主要靶点有PTGS2、PTGS1、SCN5A、ADRB2和CHRM1等;主要信号通路有PI3K/AKT、Toll样受体信号等,其功能主要为调节细胞凋亡和神经炎症反应。结论本研究初步揭示了补肾活血颗粒多层次、多环节治疗PD的作用机制。

复方土茯苓颗粒对大鼠滑膜细胞炎症因子及mi-RNA的影响

【目的】观察复方土茯苓颗粒含药血清对大鼠滑膜细胞痛风模型的影响以及与白细胞介素-1β/白细胞介素-6(IL-1β/IL-6)、小片段RNA miR-146a的关系。【方法】从SD大鼠身上摘取膝关节滑膜组织进行原代培养并传代,将滑膜细胞分成空白对照组,空白血清组,模型组,中药血清低、中、高剂量组6组;分别制备复方土茯苓颗粒中药血清和尿酸盐晶体混悬液,并进行细胞活性试验后,按组进行相应的干预,然后收集细胞培养液采用酶联免疫吸附反应(ELISA)法检测IL-1β/IL-6水平;提取滑膜细胞总RNA并进行逆转录—聚合酶链反应(RT-PCR)检测miR-146a表达,并分析它们的关系。【结果】模型组滑膜细胞培养液中IL-1β/IL-6的含量显著升高(P<0.05),滑膜细胞miR-146a表达显著下调(P<0.05);中药血清各剂量组IL-1β/IL-6的含量显著降低(P<0.05),miR-146a则显著上调(P<0.05);IL-1β/IL-6与miR-146a表达呈反比关系。【结论】复方土茯苓颗粒含药血清可能是通过上调大鼠滑膜细胞miR-146a的表达,抑制IL-1β/IL-6,从而缓解炎症反应。

复方海带胶囊对实验性脑缺血保护作用的研究

【目的】观察复方海带胶囊(主要由海带、黄芪、川芎等中药组成)对实验性脑缺血的保护作用。【方法】取NIH小鼠40只,随机分为模型组、复方海带胶囊组(剂量为0.38 g.kg-1.d-1)、复方丹参滴丸组(剂量为0.12 g.kg-1.d-1)和尼莫地平组(0.018 g.kg-1.d-1),采用结扎右侧颈总动脉及迷走神经法复制小鼠脑缺血模型,观察复方海带胶囊对模型小鼠脑卒中指数的影响;取SD大鼠70只,随机分为假手术组、模型组、复方海带胶囊低、中、高剂量组(剂量分别为0.095、0.190、0.380 g.kg-1)、复方丹参滴丸组(剂量为0.086 g.kg-1)和尼莫地平组(剂量为0.013 g.kg-1),采用线栓法复制大鼠大脑中动脉栓塞模型(MCAO),观察复方海带胶囊对模型大鼠神经功能和脑组织含水量的影响。【结果】复方海带胶囊能显著性降低脑缺血模型小鼠的脑卒中指数,降低MCAO模型大鼠的神经功能评分和脑组织含水量(P<0.05或P<0.01)。【结论】复方海带胶囊治疗脑缺血的机制可能与其改善脑缺血及神经症状,减轻脑水肿的作用有关。

复方固环止血冲剂药效学研究

固环止血冲剂不同剂量,对大鼠正常子宫平滑肌收缩有明显抑制作用,并可对抗由催产素引起的子宫平滑肌强烈收缩。对动物子宫内异物多种炎症模型有明显的抗炎作用,该方尚有缩短出血和至凝血时间的作用。提示该方具有对育龄妇女上避孕环后的止血、止痛、抗炎等功效。

复方参芪颗粒对小鼠免疫功能及应激反应的影响

目的:探讨复方参芪颗粒提高免疫功能及抗应激能力的药理作用。方法:复方参芪颗粒高、中、低剂量组分别连续给健康昆明种小鼠灌胃,同时腹腔注射环磷酰胺造成免疫抑制模型小鼠,并设阳性对照组及正常对照组。小鼠于末次给药后30min处理,检查免疫指标及抗应激能力。结果:复方参芪颗粒对正常小鼠和免疫抑制小鼠免疫功能有一定的增强作用。对正常小鼠和免疫抑制小鼠耐高温、耐低温和抗疲劳等抗应激能力也有一定的增强作用。结论:复方参芪颗粒具有良好的提高免疫功能和抗应激能力的作用。

复方川贝颗粒含药血清对豚鼠离体气管平滑肌收缩功能影响随机平行对照研究

[目的]观察复方川贝颗粒含药血清对豚鼠离体气管平滑肌收缩功能影响。[方法]使用随机平行对照方法,将清洁级豚鼠12只按随机数字表法随机分为6组,用于制作含药血清:模型组,复方川贝颗粒低、中、高剂量组,二陈丸组,氨茶碱组,2只/组,雌雄各半。其余10只准备取气管制作气管螺旋条的豚鼠,根据抽签结果决定先后顺序。制作新鲜的豚鼠离体气管螺旋条,将其放入克氏液中,使用磷酸组胺(His)引发豚鼠气管螺旋条收缩。观测加入复方川贝颗粒含药血清后1,3,5min的解痉百分率。[结果]复方川贝颗粒含药血清中剂量组解痉率与模型组比较均有明显上升(P<0.05),复方川贝颗粒含药血清对His引起的气管平滑肌收缩反应具有拮抗作用,药物与标本接触5min后作用较好。[结论]复方川贝颗粒含药血清对His引起的气管平滑肌收缩反应具有一定拮抗作用。

基于网络药理学探讨复方鲜石斛颗粒防治酒精性肝病的作用机制及实验验证

目的结合网络药理学方法和实验验证探讨复方鲜石斛颗粒防治酒精性肝病(ALD)的作用靶点及潜在机制。方法借助TCMSP、ETCM、BATMAN-TCM数据库及文献报道检索复方鲜石斛颗粒的化学成分,利用Swiss ADME数据库筛选优效目标化合物,并通过Swiss Target Prediction数据库对活性成分靶点进行预测。通过GeneCards、OMIM、DrugBank、DisGeNET数据库获取ALD相关疾病靶点,采用String数据库和Cytoscape软件构建靶点相互作用网络图(PPI)及“中药-活性成分-靶点-疾病”网络图,将预测的潜在作用靶点通过DAVID数据库进行GO/KEGG功能富集分析预测作用机制。构建酒精性肝损伤小鼠模型,通过病理染色、ELISA检测、qPCR及Western blot来验证网络药理学富集分析结果。结果通过数据库及文献报道共筛选获得73个关键活性成分,与ALD交集靶点有720个,根据P<0.05,FDR<0.05的GO注释分析得到789个BP信息,93个CC信息,204个MF信息,194个KEGG信号通路,主要涉及代谢过程、PI3K/Akt信号通路、MAPK信号通路、cAMP信号通路、钙信号通路等。体内实验表明,与对照组相比,模型组小鼠肝细胞索排列紊乱,肝小叶界限不清,肝细胞出现明显炎性细胞浸润和脂肪空泡,血清中ALT、AST活力,肝组织TG、TCHO含量及IL-1β、CXCL10、Srebp-1c的基因表达水平显著升高,CPT1基因表达水平显著降低,炎症通路蛋白p-AKT、p-mTOR、p-p65蛋白表达水平升高。复方鲜石斛颗粒治疗后,小鼠肝细胞炎性细胞浸润和脂肪空泡数量减少,肝脏恢复正常细胞结构,血清中ALT、AST活力,肝组织TG、TCHO含量及IL-1β、CXCL10、Srebp-1c的基因表达水平显著降低,CPT1基因表达水平显著升高,同时p-AKT、p-mTOR、p-p65蛋白表达水平也显著降低。结论复方鲜石斛颗粒能有效改善酒精性肝损伤小鼠的肝脏炎症和脂质代谢,并可能通过调节PI3K/Akt信号通路抑制组织炎症。该研究初步揭示了复方鲜石斛颗粒防治ALD的作用机制,为临床用药和后续研究提供参考依据。

基于网络药理学及分子对接技术探究复方雷公藤逐痛颗粒干预类风湿关节炎的作用机制

目的运用网络药理学及分子对接技术探究复方雷公藤逐痛颗粒(CTWPGs)干预类风湿关节炎(RA)的分子作用机制。方法通过检索相关文献,并运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药百科全书数据库(ETCM)、分子机制生物信息学分析工具(BATMAN)等获取CTWPGs的主要活性成分和作用靶点,利用在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、药物银行(Drug Bank)、基因卡(Gene Cards)、治疗靶点数据库(TTD)等获取RA相关靶点;药物与疾病靶点映射后获取交集靶点,以String数据库对交集靶点构建蛋白互相作用网络,并分析、筛选核心靶点;通过注释、可视化、集成发现数据库(DAVID)对核心靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析,以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,采用Cytoscape3.6.0构建CTWPGs“活性成分-靶点-信号通路”的可视化网络。结果通过筛选获得CTWPGs干预RA的作用成分共47种,得到作用于RA的核心靶点34个。GO功能富集分析共得到357个条目(P<0.05),其中生物过程条目299个,细胞组成条目21个,分子功能条目37个;KEGG通路分析富集得到107条信号通路(P<0.05),主要包括肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、Toll样受体信号通路和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等。最终“活性成分-靶点-信号通路”蛋白互作网络分析结果显示,CTWPGs活性成分中发挥干预RA作用的关键成分为槲皮素、木犀草素、雷公藤甲素等;关键靶点为环加氧酶2(PTGS2)、肉瘤病毒17癌基因同源物(JUN)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、网状内皮增生症病毒癌基因同源物A(RELA)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、TNF等。分子对接结果显示,木犀草素与MAPK3、PTGS2,雷公藤甲素与MAPK3、TNF,山柰酚与MAPK14,银杏内酯A30与MAPK3、TNF、AKT1、PTGS2,黄芩素与MAPK3之间具有较好的对接活性。结论基于网络药理学研究表明,CTWPGs可以通过多成分、多靶点、多通路发挥对RA的干预作用,具有一定的临床应用价值。

祖卡木颗粒活性成分作用机制的网络药理学研究

目的通过网络药理学研究复方祖卡木颗粒活性成分,作用靶点及其作用机制。方法已报道的文献及数据库中收集祖卡木颗粒活性成分,并预测和筛选活性成分的作用靶点,对靶点进行蛋白相互作用分析、功能富集分析以及通路分析,构建"成分-靶点""靶点-通路"和"通路-疾病"网络结构来研究祖卡木颗粒对疾病的作用机制。结果筛选出了祖卡木颗粒的13个活性成分,经过成分-靶点-通路网络分析,发现13个活性成分通过38条主要信号通路作用于44个核心靶点,而作用于中枢神经系统疾病、哮喘、流感和头疼等。

基于网络药理学与分子对接探究中兽药复方乳康颗粒治疗奶牛乳房炎的作用机制

【目的】探究中兽药复方乳康颗粒(RKG)治疗奶牛乳房炎的作用机制。【方法】通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、中医药百科全书(ETCM)平台获取中兽药复方乳康颗粒中黄芪、王不留行、益母草的有效成分及靶点,利用Cytoscape v 3.7.2构建中兽药复方乳康颗粒中药-成分-靶点网络图,从NCBI、OMIM、GeneCards、MalaCards平台获取奶牛乳房炎靶点,使用Cytoscape v 3.7.2中的Bisogenet插件对中兽药复方乳康颗粒成分靶点及奶牛乳房炎的靶点进行综合分析,构建蛋白互作(PPI)网络图,并使用DAVID进行GO功能和KEGG通路富集分析,探讨其治疗奶牛乳房炎的作用机制。采用分子对接对网络药理学预测结果进行初步验证。【结果】通过网络药理学筛选出槲皮素、山奈酚、异鼠李素等23个中兽药复方乳康颗粒相关的活性成分,文献检索得到奶牛乳房炎相关靶点有肿瘤坏死因子(TNF)、Toll样受体4(TLR4)、白细胞介素17A(IL17A)等49个,通过Bisogenet插件对其进行PPI分析后得到中兽药复方乳康颗粒作用于奶牛乳房炎的关键靶点77个,涉及到靶点肿瘤蛋白P53(TP53)、核因子κB P65(RELA)及乳腺癌1号基因(BRCA1)等。GO功能富集分析结果表明,生物过程富集在DNA修复、蛋白质泛素化等;主要通过泛素蛋白连接酶结合、ATP结合等分子功能发挥作用;细胞组分条目涉及胞浆、细胞质和细胞核等。KEGG通路富集分析结果表明,中兽药复方乳康颗粒主要调节丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)、PI3K-Akt等信号通路。分子对接结果表明,槲皮素、山奈酚、异鼠李素与BRCA1、RELA和TP53之间均形成了氢键,且结合能<-3 kJ/mol,其中RELA与上述成分亲和力最强。【结论】网络药理学分析表明,中兽药复方乳康颗粒主要通过槲皮素、山奈酚、异鼠李素等有效成分作用于TP53、MAPK、BRCA1、RELA等靶点,调节MAPK、PI3K-Akt等信号通路,从而达到治疗奶牛乳房炎的作用。

基于网络药理学的复方杜仲健骨颗粒作用机制解析研究

目的基于网络药理学结合体外实验探讨复方杜仲健骨颗粒的整体作用机制。方法通过TCMSP、TCMD数据库获得复方杜仲健骨颗粒的化学成分;基于TCMSP数据库收集复方杜仲健骨颗粒潜在作用靶标;将靶标导入STRING数据库中获得蛋白互作关系并运用Cytoscape的影响构建蛋白互作网络;使用DAVID软件进行GO富集分析和KEGG富集分析;基于Cytoscape软件的网络拓扑算法筛选关键作用靶标,运用Cytoscape软件绘制“关键靶标-信号通路-生命过程-药理作用”网络;体外实验检测复方杜仲健骨颗粒对产生炎症的RAW 264.7细胞的一氧化氮(NO)水平的影响;RT-qPCR法测定复方杜仲健骨颗粒对RAW的影响264.7细胞中关键靶标mRNA表达量的影响。结果检索获得复方杜仲健骨颗粒的化学成分1522个,潜在靶标279个;筛选获得复方杜仲健骨颗粒关键作用靶标20个、生物过程487条、信号通路133条。体外实验结果显示,复方杜仲健骨颗粒能够降低脂多糖诱导的炎症RAW 264.7细胞的NO水平(P<0.001),具有抗炎作用。此外,复方杜仲健骨颗粒可抑制TNF、STAT3、MAPK1 mRNA的表达(P<0.05,P<0.01或P<0.001)。结论复方杜仲健骨颗粒可能通过作用于TNF、STAT3、MAPK1等关键靶标,调节炎症,软骨细胞增殖、分化、凋亡以及代谢等相关通路,发挥抗炎,调控细胞增殖、分化、凋亡、血管生成等药理作用,进而发挥整体疗效。

满药复方木鸡颗粒研究新进展

复方木鸡颗粒是满族药,能抑制甲胎蛋白升高,在肝炎、肝硬化、肝癌治疗中被广泛应用。关于复方木鸡颗粒治疗肝病的作用机制,一直是专家学者们热议的焦点。本文综述了复方木鸡颗粒近年来药理研究新成果,揭示了其抗肝病,尤其是抗肿瘤的原理;同时还综述了临床应用中所取得的最新进展,对探索民族医药现代化进程具有重要意义。

基于网络药理学探讨隔山消积颗粒治疗功能性消化不良的物质基础及作用机制

目的探讨苗药复方隔山消积颗粒治疗功能性消化不良(FD)的物质基础及作用机制。方法通过文献检索隔山消积颗粒的化学成分,采用ADMETlab 2.0软件筛选活性成分;运用SwissTargetPrediction数据库预测其作用靶标,并与GenCLip3数据库和GeneCards数据库获得的FD相关靶标叠合,获取治疗FD的靶标。构建药味-活性成分-靶标相互作用网络,筛选关键活性成分和靶标。采用String数据库获得靶标-靶标相互作用网络,运用David数据库对靶标进行GO聚类分析和KEGG通路富集分析。采用分子对接技术考察活性成分与靶标间的结合亲和力和作用模式。结果筛选105个苗药复方隔山消积颗粒活性成分,作用于293个FD相关靶标。药味-活性成分-靶标相互作用网络分析筛选出度值大于中介值(12.3645)的关键活性成分70个和关键靶标61个。GO聚类分析显示,关键作用靶标主要参与信号转导、凋亡过程的负调控、蛋白质结合、ATP结合等生物过程;KEGG通路富集分析结果显示,上述靶标主要通过调控逆行内源性大麻素信号、胆碱能突触、花生四烯酸代谢和TRP通道的炎性介质调节等通路。分子对接结果表明,隔山消积颗粒活性成分与FD关键靶标有较强亲和力。结论苗药复方隔山消积颗粒的潜在活性成分为告达亭、芫花素、开德苷元、罗索他明、汉黄芩素和加加米宁等,通过调控胃肠动力障碍、脑-肠轴功能紊乱和精神心理因素等相关通路治疗FD。

基于网络药理学和细胞实验探究复方散热颗粒治疗流行性感冒的作用机制

目的 采用网络药理学及体外细胞实验探究预测复方散热颗粒治疗流行性感冒的作用机制。方法 通过TCMSP、PubChem、Swiss Target Prediction等平台以及相关文献获取复方散热颗粒活性成分及对应靶点。基于DrugBank、OMIM、GeneCards数据库获取流行性感冒相关靶点。利用Venny 2.1.0绘制复方成分靶点和流感靶点的韦恩图,采用STRING数据库构建蛋白相互作用网络,利用Cytoscape 3.9.0软件构建复方药材-化学成分-靶点网络,通过R语言对复方-疾病共同靶点进行GO及KEGG富集分析,采用AutoDock对关键成分与核心靶点进行分子对接。通过酶联免疫吸附测定(ELISA)和蛋白免疫印迹(WB)检测流感病毒感染MDCK细胞炎性因子水平及PI3K/AKT通路相关蛋白的表达。结果 经筛选得到活性成分224个,包括槲皮素、山柰酚、木犀草素等;其作用于流感治疗的靶点共145个,包括STAT3、CASP3等。GO和KEGG富集分析显示,复方散热颗粒主要通过甲型流感通路、Toll样受体信号通路等发挥治疗流感的作用。分子对接结果显示其主要化学成分与核心靶点具有良好的结合能力。复方散热颗粒能够降低流感病毒感染细胞炎性因子的释放以及p-PI3K、p-AKT1、MMP9蛋白的表达水平。结论 复方散热颗粒可通过多成分、多靶点发挥治疗流感的作用,而PI3K/AKT信号通路是其发挥作用的主要机制。

基于网络药理学与分子对接技术探讨复方仙草颗粒治疗足细胞损伤的作用机制

目的通过网络药理学结合分子对接的方式,分析复方仙草颗粒治疗足细胞损伤的可能作用机制。方法在中药系统药理学数据库与分析平台筛选复方仙草颗粒组方中各味中药的有效活性成分及对应作用靶点。在GeneCards®、OMIM®、PHARMGKB数据库检索足细胞损伤相关靶点。对有效活性成分的作用靶点及足细胞损伤的相关靶点取交集以获得交集靶点。针对有效活性成分与交集靶点,利用Cytoscape 3.9.1软件制作成分-靶点网络并获得关键有效活性成分。通过STRING数据库及Cytoscape 3.9.1软件构建交集靶点的蛋白-蛋白互相作用网络,再利用Cytoscape 3.9.1软件的CytoNCA插件筛选核心靶点。通过R 4.0.5软件对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析,通过Metascape数据库对交集靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。应用SYBYL-X软件2.0的Surflex模块对关键有效活性成分和与足细胞损伤关联最大的核心靶点进行分子对接。结果共收集到133种有效活性成分、234个有效活性成分的作用靶点、1733个足细胞损伤相关靶点,取交集后获得102个交集靶点。最终筛选得到3个关键有效活性成分(槲皮素、山柰酚、柚皮素)及17个核心靶点,其中表皮生长因子受体(EGFR)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、信号转导及转录激活子3(STAT3)、血管内皮生长因子(VEGF)A、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)是与足细胞损伤关联最大的核心靶点。GO功能富集分析提示交集靶点主要涉及氧化应激等生物过程,囊泡等细胞组分,以及酶结合、抗氧化活性等分子功能;KEGG通路富集分析提示交集靶点涉及的主要信号通路包括糖尿病并发症中的终末期糖基化终产物(AGE)-AGE受体信号通路、核因子κB信号通路、VEGF信号通路、叉头框O蛋白信号通路、AMP依赖的蛋白激酶信号通路、坏死性凋亡等。EGFR、MMP9、PTGS2与槲皮素、山柰酚之间,以及EGFR、MMP9与柚皮素之间均有一定的结合活性。结论复方仙草颗粒治疗足细胞损伤具有多成分、多靶点、多通路协同作用的特点,复方仙草颗粒的多个有效活性成分可能通过EGFR、MMP9、PTGS2、STAT3、VEGFA等主要靶点作用于多个信号通路,来发挥抗氧化应激、抗炎及抗细胞凋亡等作用,从而减轻足细胞损伤。

基于超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱和网络药理学探讨通脉颗粒治疗脑卒中的作用机制

目的基于超高效液相色谱串联四极杆飞行时间质谱(UHPLC-QTOF-MS)和网络药理学方法,探讨通脉颗粒治疗脑卒中的作用机制。方法采用UHPLC-QTOF-MS技术鉴定通脉颗粒的化学成分;通过TCMSP、TTD和PubMed等数据库检索通脉颗粒活性成分作用靶点和脑卒中相关靶点;采用STRING数据库构建关键靶点的蛋白互作网络;采用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果从通脉颗粒中鉴定出丹酚酸B、葛根素和藁本内酯等96个化学成分,筛选到38个活性成分和作用于脑卒中靶点55个,核心靶点包括前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、核因子κB(NFκB)和核因子红细胞系2相关因子2(NRF2)等,关键通路主要涉及缺氧诱导因子1(HIF-1)、肿瘤坏死因子(TNF)和磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)等。结论通脉颗粒中丹酚酸B、葛根素和藁本内酯等主要活性成分,通过作用于PTGS2、NFκB和NRF2等靶点,调控HIF-1、TNF和PI3K-Akt等信号通路发挥抗脑卒中的作用。

基于网络药理学和分子对接研究十味益脾颗粒的作用机制

为了挖掘十味益脾颗粒中治疗脾虚食滞症的主要药效成分及其作用机制,通过相关文献以及中药系统药理学数据库与分析平台获取十味益脾颗粒中10味药材所含的主要化学成分并构建化学成分库,通过多个数据库构建相关靶点库;运用Genecards数据库、OMIM数据库、TTD数据库搜索积食、健脾有关的疾病靶点;通过化学成分-潜在靶点网络筛选关键成分和关键靶点,构建中药-关键成分-关键靶点-疾病网络筛选核心成分和核心靶点;使用SwissADME数据库对核心成分进行分析;采用CB-Dock网站进行分子对接。结果表明,槲皮素、茯苓酸A、茯苓酸C、β-谷甾醇是十味益脾颗粒中的核心成分,CA2、PTGS1、PTGS2是十味益脾颗粒作用的核心靶点。分子对接结果显示核心成分与核心靶点的亲和作用较好。该研究为深入诠释十味益脾颗粒的作用机制和临床应用提供了理论基础和数据支撑。