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启动子CpGs位点甲基化所致BRCA1基因转录抑制作用的位点特异性 被引量:4
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作者 朱益民 来茂德 《实用肿瘤杂志》 CAS 北大核心 2003年第6期444-447,共4页
目的 研究 BRCA1基因 Cp G岛内各个 Cp Gs位点甲基化与转录水平的关系 ,探讨甲基化所致转录抑制作用的特异性 Cp G位点 ,以阐明 DNA甲基化的作用方式。方法 以 Rice等研究数据为材料 ,用方差分析和多因素线性回归模型等方法进行统计... 目的 研究 BRCA1基因 Cp G岛内各个 Cp Gs位点甲基化与转录水平的关系 ,探讨甲基化所致转录抑制作用的特异性 Cp G位点 ,以阐明 DNA甲基化的作用方式。方法 以 Rice等研究数据为材料 ,用方差分析和多因素线性回归模型等方法进行统计再分析。结果  BRCA1基因 Cp G岛 +8~ +44、- 189~ - 19、- 379~ - 2 5 8、- 37~ - 19和 - 80~ - 19区段内 Cp Gs的甲基化与基因转录抑制有关 ,这些区段内 Cp Gs位点的甲基化数目越多 ,基因转录水平越低。多因素线性回归模型分析表明 ,- 80~ - 19区段的甲基化与转录抑制关系密切。并以 - 2 9Cp G位点甲基化引起的转录抑制作用最强。结论  Cp G岛甲基化引起的转录抑制与 Cp Gs位点有关 ,具有位点的特异性。 展开更多
关键词 启动子 cpgs位点 甲基化 BRCA1基因转录 抑制作用 位点特异性
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构成CPGs的非线性振荡器模型的介绍 被引量:5
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作者 王斐斐 张奇志 周亚丽 《北京机械工业学院学报》 2007年第4期31-36,共6页
基于中枢神经模式产生器(Central Pattern Generators,CPGs)的双足机器人中最基本的单元之一的非线性振荡器的几种数学模型,给出了利用Matsuoka振荡器设计5连杆步行机器人CPGs网络控制器的方法。仿真结果表明构成CPGs的各种非线性振荡... 基于中枢神经模式产生器(Central Pattern Generators,CPGs)的双足机器人中最基本的单元之一的非线性振荡器的几种数学模型,给出了利用Matsuoka振荡器设计5连杆步行机器人CPGs网络控制器的方法。仿真结果表明构成CPGs的各种非线性振荡器的数学模型均能产生频率与振幅可调的周期信号,所设计的CPGs网络控制器的输出信号稳定、可靠。 展开更多
关键词 非线性振荡器 cpgs 双足机器人 HOPF RAYLEIGH Matsuoka
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中国石油产业全球战略研究—CPGS模型构建
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作者 张汉昌 《物流技术》 北大核心 2012年第3期67-71,75,共6页
指出中国的石油跨国企业加快了进入国际市场步伐,但现有研究对于这个重要产业的全球化战略研究却相对不足,并以CGMS模型为基础,融入石油产业特性后构建了中国的石油产业全球化战略的理论模型CPGS,拓展了全球化理论在行业的应用。
关键词 石油业 全球化战略 绩效 cpgs模型
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C57小鼠胸腺和睾丸中mPer1基因启动子区CpGs甲基化分析
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作者 李宁 刘姝 +1 位作者 蔡彦宁 陈彪 《首都师范大学学报(自然科学版)》 2009年第3期33-37,共5页
利用实时定量PCR方法检测胸腺和睾丸组织中mPer1基因表达时相特点,采用亚硫氢酸修饰法对两种组织两个时间点该基因2个启动子区域5个E-box CpGs甲基化情况进行研究.结果显示:C57 BL/6J小鼠胸腺和睾丸组织中mPer1基因表达没有显著波动性,m... 利用实时定量PCR方法检测胸腺和睾丸组织中mPer1基因表达时相特点,采用亚硫氢酸修饰法对两种组织两个时间点该基因2个启动子区域5个E-box CpGs甲基化情况进行研究.结果显示:C57 BL/6J小鼠胸腺和睾丸组织中mPer1基因表达没有显著波动性,mPer1基因启动子区CpGs呈低甲基化状态(<10%).两种组织中E3和E4甲基化频率存在显著差异(P<0.01).在睾丸中,不同时间点E3和E4甲基化频率有显著变化(P<0.01).说明在睾丸中,mPer1启动子E-box3的甲基化状态能够随时间波动.但在胸腺和睾丸中,甲基化并不是mPer1基因调节的主要方式. 展开更多
关键词 roper1基因 启动子 CPG岛 甲基化 实时定量PCR
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人类胎盘基因CpG岛甲基化水平与自然流产的相关性
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作者 李慧 胡春霞 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第10期91-95,共5页
目的探讨人类胎盘基因CpG岛甲基化水平与孕妇自然流产的相关性。方法选取接受常规产前检查的孕妇55例为研究对象,其中25例自然流产(流产组),30例正常分娩(对照组)。收集入组孕妇的临床资料及人类胎盘组织样本。比较2组临床一般资料。分... 目的探讨人类胎盘基因CpG岛甲基化水平与孕妇自然流产的相关性。方法选取接受常规产前检查的孕妇55例为研究对象,其中25例自然流产(流产组),30例正常分娩(对照组)。收集入组孕妇的临床资料及人类胎盘组织样本。比较2组临床一般资料。分析相关胎盘基因的甲基化水平对孕妇自然流产结局的预测价值。采用Logistic回归分析法分析孕妇自然流产的影响因素。结果2组在孕妇年龄、流产儿/新生儿出生体质量、孕妇妊娠天数和流产儿/新生儿性别方面比较,差异有统计学意义(P<0.05)。MECP2-1、MECP2-4、HSD11B2、MECP2-3和MECP2-2基因甲基化与自然流产相关。流产组的MECP2-1、MECP2-4、HSD11B2和MECP2-3基因甲基化率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。MECP2-1、MECP2-4、HSD11B2、MECP2-3和MECP2-2的曲线下面积(AUC)分别为0.773、0.737、0.700、0.663和0.627。Logistic回归分析结果显示,MECP2-1是孕妇发生流产的独立影响因素(P<0.05)。结论MECP2-1、MECP2-4、HSD11B2、MECP2-3和MECP2-2基因甲基化水平和孕妇的自然流产结局有关。MECP2-1基因是自然流产发生的独立影响因素。 展开更多
关键词 胎盘 甲基化 自然流产 MECP2基因 影响因素 CPG岛
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尾鳍驱动仿生机器鱼的CPG控制
6
作者 王洋 陈坤 袁亮 《机械设计与制造》 北大核心 2024年第1期231-235,241,共6页
随着人们对海洋资源关注度的增加,对仿生机器鱼的游动性能提出更高要求,为了使机器鱼游动更贴近真实鱼的游动效果,根据Light Hill的大摆幅细长体理论的鱼体波曲线对水下仿生机器鱼的游动模式进行了研究,并采用HOPF神经元振荡器模型建立... 随着人们对海洋资源关注度的增加,对仿生机器鱼的游动性能提出更高要求,为了使机器鱼游动更贴近真实鱼的游动效果,根据Light Hill的大摆幅细长体理论的鱼体波曲线对水下仿生机器鱼的游动模式进行了研究,并采用HOPF神经元振荡器模型建立非线性振荡器模型,运用最近相邻耦合关系构建了CPG控制网络拓扑图,建立了CPG控制模型,通过调节CPG控制参数实现了机器鱼多运动模态的控制与切换。针对鲹科仿生机器鱼的游动方式进行SolidWorks三维建模,在ADAMS中进行运动仿真,并搭建实体样机。实验结果表明,采用基于HOPF的链式耦合中枢模式发生器对舵机的驱动进行控制,机器鱼尾鳍的摆动具有很好的运动柔顺性,易于实现运动模态平滑切换,游动更加灵活。这为机器鱼在海洋执行更复杂任务的研究打下了坚实基础。 展开更多
关键词 多关节机器鱼 CPG HOPF振荡器 游动方式 多模态游动 虚拟样机
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MeCP2在胶质瘤中的表达水平与患者显微手术预后的关系
7
作者 黄冠又 张欣 +3 位作者 杜永贵 甘鸿川 宋莱荣 吴震 《解放军医学院学报》 CAS 2024年第2期130-135,共6页
背景甲基化CpG结合蛋白2(methyl-CpG-binding protein 2,MeCP2)在基因转录调控中发挥重要作用,研究表明MeCP2可能是胶质瘤治疗的一个新靶点,但其在胶质瘤中的表达与患者预后的关系尚不清楚。目的探讨MeCP2在胶质瘤中的表达与患者手术后... 背景甲基化CpG结合蛋白2(methyl-CpG-binding protein 2,MeCP2)在基因转录调控中发挥重要作用,研究表明MeCP2可能是胶质瘤治疗的一个新靶点,但其在胶质瘤中的表达与患者预后的关系尚不清楚。目的探讨MeCP2在胶质瘤中的表达与患者手术后临床预后的关系。方法选择2016年1月—2018年10月在贵阳市第二人民医院神经外科手术治疗的临床病理资料完整的96例胶质瘤患者,应用免疫组织化学方法检测肿瘤组织和正常脑组织中MeCP2的表达,随访患者生存情况。采用Kaplan-Meier法进行生存分析;采用Cox单因素和多因素风险回归模型分析MeCP2表达水平及相关临床病理因素与患者生存预后的关系。结果96例患者获得随访,其中男51例,女45例,年龄7~79岁,平均年龄(44.9±18.3)岁。免疫组化结果显示胶质瘤组织中MeCP2阳性表达率高于正常脑组织(75.0%vs 30.0%,P<0.05)。MeCP2表达的阳性率在WHOⅠ~Ⅳ级胶质瘤组织中分别为20.0%、66.7%、75.0%、90.6%(1/5、18/27、24/32、29/32),在高级别胶质瘤(WHOⅢ、Ⅳ级)中的阳性表达率高于低级别胶质瘤(WHOⅠ、Ⅱ级),差异有统计学意义(P<0.05)。70例出现肿瘤复发,59例死亡,中位无进展生存期(progression-free survival,PFS)和总生存期(overall survival,OS)分别为(10.7±1.7)个月和(24.1±2.9)个月。Kaplan-Meier生存分析显示,胶质瘤患者中MeCP2高表达组的中位PFS和OS显著低于低表达组[PFS:(15.6±1.8)个月vs(28.0±2.6)个月,P=0.026;OS:(16.1±2.0)个月vs(28.3±5.8)个月,P=0.022]。Cox回归分析显示,MeCP2高表达(HR:1.705,95%CI:1.019~2.854)、肿瘤病变多发(HR:2.727,95%CI:1.453~5.120)、单纯采用手术治疗(HR:1.704,95%CI:1.015~2.861)、高病理级别(WHOⅢ、Ⅳ级)(HR:3.294,95%CI:2.317~4.683)是胶质瘤患者预后不良的独立危险因素。结论MeCP2在胶质瘤手术患者中表达水平上调,且高表达水平与胶质瘤患者术后不良预后相关。 展开更多
关键词 甲基化CpG结合蛋白 胶质瘤 显微手术 临床病理 预后
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CPGs control method using a new oscillator in robotic fish 被引量:4
8
作者 WANG Gang ZHANG DaiBing +3 位作者 LIN LongXin XIE HaiBin HU TianJiang SHEN LinCheng 《Science China(Technological Sciences)》 SCIE EI CAS 2010年第11期2914-2919,共6页
A new oscillator is presented in this paper based on our pervious oscillator (Zhang’s oscillator). Using this new oscillator, a bionic neural control system, the central pattern generators (CPGs) control system, is b... A new oscillator is presented in this paper based on our pervious oscillator (Zhang’s oscillator). Using this new oscillator, a bionic neural control system, the central pattern generators (CPGs) control system, is built. This control system has a two-level form. To validate the function of this new oscillator and the control system, simulations and experiments were both carried out, a simple robotic fish was built with three joints, and the results showed that the new oscillator can be used in startup and stop control mode, angle offset control mode and amplitude changing control mode. The new oscillator can be used in bionic CPGs control area with a simple form, and may be a new progress in bionic control. 展开更多
关键词 cpgs control OSCILLATOR robotic fish
原文传递
DNA methylation in poultry:a review
9
作者 Xing Ju Zhijun Wang +2 位作者 Danfeng Cai Semiu Folaniyi Bello Qinghua Nie 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2024年第2期509-518,共10页
As an important epigenetic modification,DNA methylation is involved in many biological processes such as animal cell differentiation,embryonic development,genomic imprinting and sex chromosome inactivation.As DNA meth... As an important epigenetic modification,DNA methylation is involved in many biological processes such as animal cell differentiation,embryonic development,genomic imprinting and sex chromosome inactivation.As DNA methylation sequencing becomes more sophisticated,it becomes possible to use it to solve more zoological problems.This paper reviews the characteristics of DNA methylation,with emphasis on the research and application of DNA methylation in poultry. 展开更多
关键词 CpG islands Differentially methylated genes Differentially methylated regions DNA methylation POULTRY
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配子及早期胚胎发育过程中的DNA甲基化动态改变
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作者 李明皓 潘洁雪 黄荷凤 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期6-9,共4页
近年来,随着对染色质DNA、组蛋白、RNA化学修饰了解的深入,表观遗传学在胚胎发育、疾病发生发展中的生物学作用被逐步揭示。其中,DNA甲基化作为一种重要的表观遗传学修饰,在基因表达调控与染色质结构调节中具有重要作用。在哺乳动物细胞... 近年来,随着对染色质DNA、组蛋白、RNA化学修饰了解的深入,表观遗传学在胚胎发育、疾病发生发展中的生物学作用被逐步揭示。其中,DNA甲基化作为一种重要的表观遗传学修饰,在基因表达调控与染色质结构调节中具有重要作用。在哺乳动物细胞中,胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷酸(CpG)中胞嘧啶第5位碳原子甲基化(5mC)占99%,是最主要的甲基化类型。因此,本文关于配子和胚胎发育过程中的甲基化变化讨论也以5mC为主。 展开更多
关键词 DNA甲基化 表观遗传学 早期胚胎发育 染色质结构 基因表达调控 碳原子 化学修饰 CPG
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MBD2对Th2/Th17细胞平衡的调控及其在哮喘中的作用研究
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作者 马乙云 郑亚妹 许玉妮 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期27-33,共7页
目的:探究甲基CpG结合区域蛋白2(MBD2)在哮喘中的作用及其对Th2/Th17分化的影响。方法:在条件性敲除CD4+T细胞中MBD2表达的小鼠构建以中性粒细胞浸润为主的哮喘模型,并将小鼠分为4组:WT生理盐水组(A组)、WT哮喘组(B组)、CD4CreMBD2fl/f... 目的:探究甲基CpG结合区域蛋白2(MBD2)在哮喘中的作用及其对Th2/Th17分化的影响。方法:在条件性敲除CD4+T细胞中MBD2表达的小鼠构建以中性粒细胞浸润为主的哮喘模型,并将小鼠分为4组:WT生理盐水组(A组)、WT哮喘组(B组)、CD4CreMBD2fl/fl生理盐水组(C组)、CD4CreMBD2fl/fl哮喘组(D组),每组10只。应用RT-PCR和Western blot实验检测MBD2在各组小鼠脾脏组织中的表达;使用乙酰胆碱(Mch)激发试验检测各组小鼠的气道高反应;收集小鼠肺泡灌洗液(BALF),使用血细胞计数法计算其中的细胞总数、嗜酸性粒细胞和中性粒细胞数量,ELISA法检测细胞因子IL-4与IL-17的表达,HE染色观察各组小鼠肺组织的病理学改变;免疫磁珠分选各组小鼠脾脏中的CD4+T细胞,流式细胞术、RT-PCR及ELISA分别检测Th2、Th17细胞比例及其相关细胞因子的表达水平;分离并培养小鼠na?ve CD4+T细胞,通过慢病毒载体以靶向沉默细胞中MBD2基因表达,流式细胞术检测其对na?ve CD4+T细胞Th2与Th17分化的影响。结果:与A、B组小鼠相比,C组与D组小鼠脾脏组织中MBD2的mRNA及蛋白表达均显著降低(P<0.01);A组与C组小鼠肺组织结构正常,而B组小鼠肺组织中支气管黏膜充血水肿,管腔狭窄,黏膜上皮细胞出现大量坏死脱落,大量炎症细胞浸润,D组介于A组与B组之间;与A组小鼠相比,B组与D组小鼠的气道反应性显著增高(P<0.05),且BALF中细胞总数和嗜酸性粒细胞、中性粒细胞、IL-4及IL-17均显著增加(P<0.05),C组中仅有嗜酸性粒细胞及IL-4明显增加(P<0.01);而与B组相比,D组小鼠中嗜酸性粒细胞及IL-4表达均明显增加(P<0.05)。在脾脏淋巴细胞中,B组与D组小鼠的Th2、Th17细胞比例、GATA3和RORγt mRNA及IL-4与IL-17表达水平均较A、C组小鼠显著增加(P<0.01),与B组相比,D组小鼠中以Th2细胞及相关细胞因子占主导地位(P<0.05);成功利用慢病毒载体沉默小鼠na?ve CD4+T细胞MBD2的表达,且沉默其表达后能显著促进Th2细胞的分化比例(P<0.05),而Th17细胞比例明显降低(P<0.05)。结论:敲除CD4+T细胞中MBD2基因表达可通过促进Th2细胞及IL-4细胞因子表达,而抑制Th17细胞及IL-17表达从而改善以中性粒细胞浸润为主的重症哮喘。 展开更多
关键词 哮喘 甲基CpG结合区域蛋白2 中性粒细胞 辅助性T细胞
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基于多层感知机的DNA甲基化年龄预测模型 被引量:2
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作者 宗西增 蔡蕊蕊 +2 位作者 田若婷 赵舜琳 张黎 《生物医学工程学进展》 CAS 2023年第1期34-41,共8页
衰老的过程中伴随着DNA甲基化的变化,DNA甲基化成为重要的衰老生物标志物之一。近年来,人们对衰老领域的研究越发火热,年龄预测有助于研究生物衰老问题,但预测精度还有待进一步提高。以往的研究大多基于线性回归模型,使用DNA甲基化数据... 衰老的过程中伴随着DNA甲基化的变化,DNA甲基化成为重要的衰老生物标志物之一。近年来,人们对衰老领域的研究越发火热,年龄预测有助于研究生物衰老问题,但预测精度还有待进一步提高。以往的研究大多基于线性回归模型,使用DNA甲基化数据中与年龄高度相关的CpG位点作为特征进行年龄预测。相比机器学习模型,使用深度学习模型对多特征任务包容性更强,能够选取更多的CpG位点作为特征。在Illumina 27K和Illumina 450K阵列的甲基化数据中,选择共同的21368个CpG位点的甲基化数据作为输入,使用多层感知机建立泛组织年龄预测方法MLPAge对年龄进行预测,将MLPAge与泛组织年龄预测方法行业中的标准Horvath 353 CpG时钟进行了比较。在来自8项研究的2310个样本的独立验证集中,其绝对中位数误差(MAD)为3.77年。研究发现,多层感知机能够更好地提取与年龄相关的特征,在年龄预测方面具有更高的准确度,为该领域提供了一种新的基于深度学习的方案。 展开更多
关键词 DNA甲基化 CpG位点 多层感知机 年龄预测
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基于CPG的六足机器人运动控制方法研究综述
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作者 刘天成 卢振利 +7 位作者 陈勇 单长考 刘燕 赵宇 PENCIC Marko CAVIC Maja ROUMIANA Ilieva MARJAN Mernik 《高技术通讯》 CAS 2023年第7期762-771,共10页
以六足机器人为研究对象,分析了中枢模式发生器(CPG)的国内外发展现状,揭示其主要是以振荡器作为控制器进行信号输出。针对如何搭建CPG模型,以Hopf振荡器为例进行模型搭建和改进,搭建六足机器人实验平台验证CPG模型控制六足机器人步态... 以六足机器人为研究对象,分析了中枢模式发生器(CPG)的国内外发展现状,揭示其主要是以振荡器作为控制器进行信号输出。针对如何搭建CPG模型,以Hopf振荡器为例进行模型搭建和改进,搭建六足机器人实验平台验证CPG模型控制六足机器人步态运动是可行的。最后对基于CPG的六足机器人发展进行了展望。 展开更多
关键词 中枢模式发生器(CPG) 六足机器人 步态运动
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启动子上的增强子和CpG岛在转基因沉默和位置效应中的作用
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作者 肖捷 纪华 +4 位作者 王宵 王静 刘凌云 李美荃 王斌 《新乡医学院学报》 CAS 2023年第9期801-809,共9页
目的探讨哺乳动物细胞表达载体启动子上增强子和CpG岛调控元件在转基因沉默和位置效应中的作用。方法应用带增强子的八聚体结合转录因子4(OCT4)基因启动子、带CpG岛的性别决定区Y框蛋白2(SOX2)基因启动子、带增强子和CpG岛的巨细胞病毒(... 目的探讨哺乳动物细胞表达载体启动子上增强子和CpG岛调控元件在转基因沉默和位置效应中的作用。方法应用带增强子的八聚体结合转录因子4(OCT4)基因启动子、带CpG岛的性别决定区Y框蛋白2(SOX2)基因启动子、带增强子和CpG岛的巨细胞病毒(CMV)基因启动子以及不含近端增强子和CpG岛的NANOG基因启动子构建哺乳动物细胞表达载体,并分别转染中国仓鼠卵巢细胞株CHO-K1细胞和人胚胎肾细胞(HEK293)。应用Image J软件中Mean算法计算OCT4、SOX2、CMV和NANOG基因启动子在CHO-K1细胞和HEK293细胞介导的增强绿色荧光蛋白(EGFP)表达的荧光强度,应用Image J软件中Mininum、Maxentropy、Mean 3种算法分别计算OCT4、SOX2、CMV和NANOG基因启动子4种载体稳定转染CHO-K1细胞后形成的多个单细胞克隆混合生长样品在同一个样本中最大荧光强度的细胞、大于平均荧光强度的所有细胞和最小荧光强度的所有细胞的EGFP平均荧光强度;应用有限稀释法从G418筛选后获得的稳定转染的多个单克隆混合的CHO-K1细胞中,分别筛选含EGFP的pE-C1、pE-Oct4、pE-Sox2、pE-Nanog质粒稳定转染CHO-K1细胞的单克隆细胞,每个质粒载体随机筛选3个单克隆细胞,应用Image J软件分析EGFP平均荧光强度;应用酶联免疫吸附法检测转染第20、30天CHO-K1细胞中EGFP蛋白表达水平,应用实时荧光定量聚合酶链式反应法检测转染第20、30天CHO-K1细胞中EGFP mRNA表达水平。结果SOX2基因启动子在CHO-K1细胞和HEK293细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度比较差异无统计学意义(t=0.770,P>0.05)。OCT4、CMV、NANOG基因启动子在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度显著高于HEK293细胞(t=7.000、11.100、4.900,P<0.05)。SOX2基因启动子于转染第20、30天在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白水平比较差异无统计学意义(t=0.330,P>0.05)。CMV基因启动子于转染第20天在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白水平显著低于转染第30天(t=3.770,P<0.05);OCT4基因启动子于转染第20、30天在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白水平比较差异无统计学意义(t=2.500,P>0.05);NANOG基因启动子于转染第20、30天在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白表达水平比较差异无统计学意义(t=0.014,P>0.05)。转染第20天与转染第30天SOX2、CMV、NANOG基因启动子在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度值比较差异均无统计学意义(t=0.130、0.830、0.210,P>0.05);转染第30天,OCT4基因启动子在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度值显著低于转染第20天(t=5.750,P<0.05)。SOX2、CMV、OCT4、NANOG基因启动子在CHO-K1细胞中介导表达的EGFP蛋白水平比较差异无统计学意义(F=4.070,P>0.05)。CMV、OCT4、NANOG基因启动子在CHO-K1细胞中介导的EGFP mRNA相对表达量显著高于SOX2基因启动子(t=5.440、5.000、5.740,P<0.05);CMV、OCT4基因启动子在CHO-K1细胞中介导的EGFP mRNA相对表达量显著高于NANOG基因启动子(t=3.220、4.270,P<0.05);CMV基因启动子在CHO-K1细胞中介导的EGFP mRNA相对表达量高于OCT4基因启动子,但差异无统计学意义(t=1.270,P>0.05)。SOX2基因启动子介导表达的EGFP在转录水平和转录后水平差异最大(t=16.900,P<0.05);NANOG基因启动子介导表达的EGFP在转录水平和转录后水平差异次之(t=14.930,P<0.05);OCT4和CMV基因启动子介导表达的EGFP在转录水平和转录后水平差异最小(t=2.060、0.430,P>0.05)。应用Mininum、Maxentropy、Mean 3种算法计算OCT4基因启动子在多克隆下介导表达的EGFP的荧光强度比较差异无统计学意义(F=3.720,P>0.05),SOX2、CMV和NANOG基因启动子在多克隆下介导EGFP表达的荧光强度比较差异均有统计学意义(F=516.400、428.500、28.120,P<0.05)。不同单克隆细胞中的差异分析显示,4种载体在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值的标准误差相比,从高到低依次为NANOG基因启动子在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值标准误差、SOX2基因启动子在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值标准误差、OCT4基因启动子在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值标准误差、CMV基因启动子在不同单克隆细胞中介导表达的EGFP荧光强度值标准误差,且OCT4基因启动子与SOX2、CMV基因启动子在单克隆细胞中介导表达的EGFP平均荧光强度比较差异有统计学意义(t=3.070、4.360,P<0.05)。结论带CpG岛的启动子能在转录后克服转基因沉默效应,带增强子的启动子具有克服位置效应的作用;二者的恰当组合可用于设计在哺乳动物细胞中高效稳定表达的启动子。 展开更多
关键词 增强子 CPG岛 转基因沉默 位置效应 哺乳动物细胞表达载体
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自制ISCOMATRIX与CpG联合的HCA587蛋白疫苗的制备及其免疫效应评估
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作者 谭媛芳 陈惠媛 +4 位作者 焦薇 范秋颖 邵国青 熊祺琰 陈娟娟 《南昌大学学报(医学版)》 2023年第5期1-7,F0003,共8页
目的确定自制免疫刺激复合物(ISCOMATRIX)作为HCA587蛋白疫苗佐剂的有效剂量,并探讨其与CpG联合作为HCA587蛋白疫苗佐剂的免疫效力和肿瘤治疗效果。方法应用透析法将Quil A、胆固醇和磷脂制备成ISCOMATRIX,经磷钨酸负染并采用透射电子... 目的确定自制免疫刺激复合物(ISCOMATRIX)作为HCA587蛋白疫苗佐剂的有效剂量,并探讨其与CpG联合作为HCA587蛋白疫苗佐剂的免疫效力和肿瘤治疗效果。方法应用透析法将Quil A、胆固醇和磷脂制备成ISCOMATRIX,经磷钨酸负染并采用透射电子显微镜观察自制ISCOMATRIX的结构。建立小鼠免疫模型,将联合CpG的HCA587蛋白疫苗与不同剂量的自制ISCOMATRIX佐剂混合,经尾根部皮下免疫小鼠;采用酶联免疫斑点试验(ELISpot)检测产生IFN-γ的脾细胞频数,采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测血清HCA587特异性抗体水平。在小鼠右侧胁腹部皮下接种B16-HCA587肿瘤细胞建立荷瘤小鼠模型,按照处理方式不同将小鼠分为HCA587蛋白疫苗治疗组(接种100μL包含CpG与最佳剂量的自制ISCOMATRIX的HCA587蛋白疫苗)与PBS对照组(注射100μL的无菌PBS),使用游标卡尺测量肿瘤大小。结果自制ISCOMATRIX佐剂呈典型的蜂窝状结构,直径20~30 nm,大小均一。12、36μg(QuilA浓度分别为0.012%、0.036%)的自制ISCOMATRIX组小鼠脾细胞分泌IFN-γ的频数与商品化ISCOMATRIX阳性对照组比较,差异无统计学意义(均P>0.05),且显著高于CpG+36μg ISCOM对照组与PBS组(均P<0.0001);5μg与18μg自制ISCOMATRIX组小鼠分泌IFN-γ的脾细胞频数,高于CpG+36μg ISCOM对照组与PBS组(均P<0.0001),但低于商品化ISCOM组(P=0.004)。12、18与36μg自制ISCOMATRIX组的血清HCA587抗体水平与商品化ISCOM阳性对照组比较,差异无统计学意义(均P>0.05);与PBS组相比,12μg自制ISCOMATRIX组1×10^(4)倍稀释血清的抗体滴度显著升高(P=0.0062)。与PBS对照组相比,HCA587蛋白疫苗治疗组肿瘤生长速度减缓,且第35天测量时肿瘤大小显著较小(P=0.0181)。结论以12μg自制ISCOMATRIX作为佐剂联合CpG制备的HCA587蛋白疫苗能诱导有效的免疫应答,并抑制荷瘤小鼠的肿瘤的生长,具有一定的肿瘤治疗作用。 展开更多
关键词 免疫刺激复合物(ISCOMATRIX) 自行制备 CPG HCA587蛋白疫苗 免疫效应
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RGD修饰的低分子量鱼精蛋白/CpG ODN复合物的制备及抗肿瘤活性
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作者 刘佳佳 苏秋东 +1 位作者 伊瑶 毕胜利 《医学研究杂志》 2023年第1期130-135,共6页
目的利用RGD修饰的低分子量鱼精蛋白(low molecular weight protamine,LMWP)包裹CpG寡聚脱氧核苷酸(CpG oligodeoxynucleotide,CpG ODN)制备复合物,评价其对CpG ODN抗肿瘤活性的影响。方法基于静电引力将RGD-LMWP与CpG ODN以不同质量比... 目的利用RGD修饰的低分子量鱼精蛋白(low molecular weight protamine,LMWP)包裹CpG寡聚脱氧核苷酸(CpG oligodeoxynucleotide,CpG ODN)制备复合物,评价其对CpG ODN抗肿瘤活性的影响。方法基于静电引力将RGD-LMWP与CpG ODN以不同质量比共孵育制备复合物,并利用凝胶阻滞实验分析RGD-LMWP对CpG的缩合能力;使用zeta电位/粒度仪对RGD-LMWP/CpG复合物的粒径和zeta电位进行表征;采用体外细胞实验评价RGD-LMWP/CpG复合物对肿瘤细胞的摄取效率和细胞毒性。结果采用共孵育法成功制备了RGD-LMWP/CpG复合物。当RGD-LMWP与CpG的质量比为3∶1时,RGD-LMWP能完全压缩CpG。此时,复合物的平均粒径和zeta电位分别为119.7±1.2nm和47.9±0.5mV。体外细胞实验表明,与游离CpG比较,RGD-LMWP/CpG(3∶1)复合物能显著提高人子宫颈癌细胞株(HeLa)细胞对CpG的摄取效率,抑制HeLa细胞的增殖。结论RGD-LMWP与CpG结合形成的复合物可以有效地将CpG递送至肿瘤细胞内并诱导肿瘤细胞凋亡,是一种具有研究前景的抗肿瘤给药方案。 展开更多
关键词 低分子量鱼精蛋白 RGD CPG寡聚脱氧核苷酸 抗肿瘤活性
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G-CIMP表达在胶质瘤中的研究进展
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作者 齐泽迪 陈胜利 +2 位作者 屈一晨 张明达 胡昌晨 《中南医学科学杂志》 CAS 2023年第2期299-301,共3页
胶质瘤起源于神经胶质细胞,以发病率高和预后差为特点。胶质瘤CPG岛甲基化表型(G-CIMP)作为DNA甲基化的一种,是近年新发现的一种表观遗传学改变,与胶质瘤的分子特征及临床特点均有关。本文就G-CIMP的发现、分子学特征、临床意义及展望... 胶质瘤起源于神经胶质细胞,以发病率高和预后差为特点。胶质瘤CPG岛甲基化表型(G-CIMP)作为DNA甲基化的一种,是近年新发现的一种表观遗传学改变,与胶质瘤的分子特征及临床特点均有关。本文就G-CIMP的发现、分子学特征、临床意义及展望展开综述。 展开更多
关键词 CPG岛甲基化表型 DNA甲基化 胶质瘤
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脑卒中患者TOAST、OCSP分型与外周血DNA甲基转移酶及MeCp2蛋白水平的关系 被引量:1
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作者 张鹏 《检验医学与临床》 CAS 2023年第8期1160-1164,共5页
目的研究脑卒中患者治疗急性卒中实验(TOAST)、牛津郡社区卒中项目(OCSP)分型与外周血DNA甲基转移酶(Dnmt)1、Dnmt3a、Dnmt3b及甲基CpG结合蛋白(MeCp2)水平的关系。方法选取2017年2月至2020年5月该院收治的116例急性缺血性脑卒中患者作... 目的研究脑卒中患者治疗急性卒中实验(TOAST)、牛津郡社区卒中项目(OCSP)分型与外周血DNA甲基转移酶(Dnmt)1、Dnmt3a、Dnmt3b及甲基CpG结合蛋白(MeCp2)水平的关系。方法选取2017年2月至2020年5月该院收治的116例急性缺血性脑卒中患者作为观察组,另选取同期50例健康志愿者作为对照组,采集所有研究对象外周静脉血检测Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平,分析脑卒中患者外周血Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平与TOAST、OCSP分型及脑梗死面积的关系。结果观察组患者外周血Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平均明显高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。不同TOAST分型患者外周血Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平比较,差异均无统计学意义(P>0.05);而外周血Dnmt1水平比较,差异有统计学意义(P<0.05);其中大动脉粥样硬化型(LAA)组与不明原因型(SUE)组外周血Dnmt1水平均明显高于心源性栓塞型组、小动脉闭塞型组和其他明确病因型组,差异均有统计学意义(P<0.05);而LAA组与SUE组外周血Dnmt1水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。不同OCSP分型患者外周血Dnmt3b水平比较,差异无统计学意义(P>0.05);而外周血Dnmt1、Dnmt3a及MeCp2水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05);其中完全前循环梗死(TACI)组外周血Dnmt1、Dnmt3a及MeCp2水平与后循环梗死(POCI)组比较,差异均无统计学意义(P>0.05);TACI组和POCI组外周血Dnmt1、Dnmt3a及MeCp2水平均明显高于部分前循环梗死组和腔隙性梗死组,差异均有统计学意义(P<0.05)。不同梗死面积患者外周血Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。结论缺血性脑卒中患者发病24 h内外周血Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b及MeCp2水平均异常升高,其表达水平与患者TOAST分型有关,而与患者脑梗死面积无关。 展开更多
关键词 脑卒中 外周血DNA甲基转移酶 甲基CpG结合蛋白 治疗急性卒中实验分型 牛津郡社区卒中项目分型
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急性脑梗死患者静脉溶栓前后闭锁蛋白、甲基CpG结合蛋白2、钙调蛋白表达与功能结局的关系 被引量:1
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作者 何健萍 彭国斌 《医学理论与实践》 2023年第1期10-13,共4页
目的:分析急性脑梗死(ACI)患者静脉溶栓前后闭锁蛋白(Occludin)、甲基CpG结合蛋白2(MECP2)、钙调蛋白(CAM)表达与功能结局的关系。方法:选取2020年1月-2022年1月我院收治的ACI患者134例作为ACI组,同期进行健康体检的健康志愿者50例作为N... 目的:分析急性脑梗死(ACI)患者静脉溶栓前后闭锁蛋白(Occludin)、甲基CpG结合蛋白2(MECP2)、钙调蛋白(CAM)表达与功能结局的关系。方法:选取2020年1月-2022年1月我院收治的ACI患者134例作为ACI组,同期进行健康体检的健康志愿者50例作为NC组。使用酶标仪测定Occludin、MECP2、CAM水平,在ACI患者静脉溶栓后90d时,使用日常生活活动能力量表评价功能结局,根据ACI患者静脉溶栓后功能结局分为结局不良组、结局良好组两个亚组。分析ACI患者静脉溶栓前后Occludin、MECP2、CAM表达变化及与功能结局的关系。结果:ACI组Occludin水平低于NC组,MECP2、CAM水平高于NC组,差异具有统计学意义(P<0.05)。ACI患者溶栓后90d Occludin水平高于溶栓前,MECP2、CAM水平低于溶栓前,差异具有统计学意义(P<0.05)。结局不良组Occludin水平低于结局良好组,MECP2、CAM水平高于结局良好组,差异具有统计学意义(P<0.05)。由Pearson相关性分析发现,Occludin、MECP2、CAM与ACI患者静脉溶栓后功能结局相关(均P<0.05)。ROC曲线显示,相比于Occludin、MECP2、CAM单项预测,三项联合预测效能最佳,三项联合预测的AUC为0.912(95%CI=0.828~1.036),敏感度为89.00%,特异度为81.50%,P<0.001。结论:ACI患者Occludin水平降低,MECP2、CAM水平升高,静脉溶栓可改善Occludin、MECP2、CAM水平,而溶栓功能结局不良与Occludin、MECP2、CAM异常有关。 展开更多
关键词 急性脑梗死 闭锁蛋白 甲基CpG结合蛋白2 钙调蛋白 功能结局
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Reduced non-CpG methylation is a potential epigenetic target after spinal cord injury
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作者 Zhourui Wu Chen Li +3 位作者 Ran Zhu Yiqiu Cao Thomas C.Chen Liming Cheng 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2023年第11期2489-2496,共8页
DNA methylation is a critical epigenetic regulator in the occurrence and development of diseases and is closely related to various functional responses in relation to spinal cord injury.To investigate the role of DNA ... DNA methylation is a critical epigenetic regulator in the occurrence and development of diseases and is closely related to various functional responses in relation to spinal cord injury.To investigate the role of DNA methylation in spinal cord injury,we constructed a library with reduced-representation bisulfite sequencing data obtained at various time points(day 0-42)after spinal cord injury in mice.Global DNA methylation levels,specifically non-CpG(CHG and CHH)methylation levels,decreased modestly following spinal cord injury.Stages post-spinal cord injury were classified as early(day 0-3),intermediate(day7-14),and late(day 28-42)based on similarity and hie rarchical cluste ring of global DNA methylation patterns.The non-CpG methylation level,which included CHG and CHH methylation levels,was markedly reduced despite accounting for a minor proportion of total methylation abundance.At multiple genomic sites,including the 5’untranslated regions,promoter,exon,intron,and 3’untranslated regions,the non-CpG methylation level was markedly decreased following spinal cord injury,whereas the CpG methylation level remained unchanged at these locations.Approximately one-half of the differentially methylated regions were located in intergenic areas;the other differentially methylated regions in both CpG and non-CpG regions were cluste red in intron regions,where the DNA methylation level was highest.The function of genes associated with differentially methylated regions in promoter regions was also investigated.From Gene Ontology analysis results,DNA methylation was implicated in a number of essential functional responses to spinal cord injury,including neuronal synaptic connection creation and axon regeneration.Notably,neither CpG methylation nor non-CpG methylation was implicated in the functional response of glial or inflammatory cells.In summary,our work elucidated the dynamic pattern of DNA methylation in the spinal co rd following injury and identified reduced nonCpG methylation as an epigenetic target after spinal cord injury in mice. 展开更多
关键词 CpG methylation cytosine fraction differentially methylated regions DNA methylation DNA methyltransferases dynamic signatures Gene Ontology non-CpG methylation single-cell RNA-Seq spinal cord injury
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