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近江牡蛎C型凝集素CRD结构域PAMPs结合谱及抑菌活性
1
作者
王翠丽
《安徽农业科学》
CAS
2022年第16期68-72,共5页
[目的]揭示C型凝集素(CTL)在近江牡蛎固有免疫防御机制中的重要作用。[方法]采用基因克隆、蛋白表达等技术进行试验。[结果]克隆获得1种近江牡蛎CTL基因,其CDS区1350 bp,编码449个氨基酸,含1个CRD结构域,Ca^(2+)结合位点2关键氨基酸基序...
[目的]揭示C型凝集素(CTL)在近江牡蛎固有免疫防御机制中的重要作用。[方法]采用基因克隆、蛋白表达等技术进行试验。[结果]克隆获得1种近江牡蛎CTL基因,其CDS区1350 bp,编码449个氨基酸,含1个CRD结构域,Ca^(2+)结合位点2关键氨基酸基序为QPS/WHD;CTL mRNA相对表达呈组织差异分布,肝胰腺、外套膜、血细胞表达量较高,其次为鳃、肌肉柱、卵巢,唇瓣表达量最少;CTL的CRD结构域体外重组蛋白具有LPS、PGN和glucan 3种PAMPs结合活性,能结合、抑制和杀死革兰氏阳性菌中的金黄色葡萄球菌、革兰氏阴性菌中的大肠杆菌和鳗弧菌,能结合、抑制但不能杀死毕赤酵母和耶罗维亚酵母。[结论]近江牡蛎CTL的CRD结构域具有较广泛的PAMPs结合谱和抑菌活性,在其固有免疫防御机制中可发挥识别、结合、抑制和杀死多种有害菌的重要作用。
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关键词
近江牡蛎
C型凝集素
crd结构域
PAMPs结合谱
抑菌活性
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职称材料
用SDSL-EPR技术测量LSECtin-CRD与甘露糖结合过程中的位点运动性变化
2
作者
马蕾
董国福
+6 位作者
丛建波
杨俊涛
邹洁芮
郭俊旺
张成岗
王长振
吴可
《生物技术通讯》
CAS
2016年第3期381-385,共5页
目的:应用定点自旋标记-电子顺磁共振(SDSL-EPR)技术检测肝脏及淋巴结窦内皮细胞C型凝集素(LSECtin)的糖基识别结构域CRD上不同位点氨基酸的运动特性及其与甘露糖结合过程中的构象变化。方法:通过SOE-PCR方法对LSECtin-CRD引入半胱氨酸...
目的:应用定点自旋标记-电子顺磁共振(SDSL-EPR)技术检测肝脏及淋巴结窦内皮细胞C型凝集素(LSECtin)的糖基识别结构域CRD上不同位点氨基酸的运动特性及其与甘露糖结合过程中的构象变化。方法:通过SOE-PCR方法对LSECtin-CRD引入半胱氨酸点突变,构建p ET28b-Tat-LSECtin-CRD载体,可溶性表达LSECtin-CRD突变体蛋白;对突变位点进行自旋标记;EPR检测标记后样品的EPR波谱;用SS-FDDM软件对EPR波谱进行模拟和解析,获得旋转相关时间τc,研究其构象特点及变化。结果:在CRD的Ca^(2+)结合位点和配体结合功能区构建了5个突变体蛋白;LSECtin-CRD与Ca^(2+)和甘露糖结合后,4个位点的τc值明显升高,表明CRD结构域整体运动性降低;5个突变位点运动性差异较大,其中A258位点运动性变化最大,可能是参与糖基结合的关键位点。结论:SDSL-EPR技术能够有效研究LSECtin-CRD参与糖基结合过程中的构象运动性,研究结果证明了LSECtin-CRD在与糖基结合后整体运动性受限。
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关键词
定点自旋标记-电子顺磁共振技术(SDSL-EPR)
肝脏及淋巴结窦内皮细胞C型凝集素(LSECtin)
糖基识别
结构域
(
crd
)
运动性
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职称材料
半乳糖凝集素糖结合的新模式:一个糖结合域的双重配体结合(英文)
被引量:
1
3
作者
卞乘凤
张英
+1 位作者
李德峰
王大成
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期810-815,共6页
半乳糖凝集素家族通过糖识别结构域(CRD)可以专一性识别和结合含β-半乳糖的多糖配体来发挥其生物学功能.到目前发现的CRD对β-半乳糖的识别模式是非常保守的,在结构已知的半乳糖凝集素结构中,一个CRD只能结合一个多糖配体分子.最近,通...
半乳糖凝集素家族通过糖识别结构域(CRD)可以专一性识别和结合含β-半乳糖的多糖配体来发挥其生物学功能.到目前发现的CRD对β-半乳糖的识别模式是非常保守的,在结构已知的半乳糖凝集素结构中,一个CRD只能结合一个多糖配体分子.最近,通过对人源半乳糖凝聚素-3 CRD与对硝基TF二糖(TFN)复合物的晶体结构解析首次发现,一个CRD可以同时结合2个TFN分子.与这2个TFN分子有双向结合的残基突变体E165A结构分析显示,一个残基的突变引起的结构上的微小变化会使结合位点2丧失结合糖底物的能力,而位点1的配体结合却不受影响.这表明,结合位点1对糖底物保守的识别和结合是基本的、主要的,而结合位点2对于糖有条件的结合,是额外的、次要的.序列比对和立体化学分析显示,参与新位点2结合的关键残基在其他半乳糖凝集素分子中都是保守的,而它们参与糖配体结合并不常见,表明它们作用的发挥是有条件的.可能在复杂寡聚结构的情况下,如有多重分支结构,双重结合位点将有利于对这类配体分子的辨识和结合,已有一系列研究报道,具有分支结构的寡糖与半乳糖分子的亲和势明显高于单价糖配体,与上述分析相一致.对这类双重位点糖结合的可能生物学意义进行了讨论.
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关键词
半乳糖凝集素家族
糖识别
结构域
(
crd
)
β-半乳糖
对硝基TF二糖(TFN)
双重结合模式
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职称材料
题名
近江牡蛎C型凝集素CRD结构域PAMPs结合谱及抑菌活性
1
作者
王翠丽
机构
南宁师范大学地理与海洋研究院
北部湾环境演变与资源利用教育部重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
2022年第16期68-72,共5页
基金
广西自然科学基金青年基金项目(2018GXNSFBA281137)
广西自然科学基金面上基金项目(2020GXNSFAA159088)。
文摘
[目的]揭示C型凝集素(CTL)在近江牡蛎固有免疫防御机制中的重要作用。[方法]采用基因克隆、蛋白表达等技术进行试验。[结果]克隆获得1种近江牡蛎CTL基因,其CDS区1350 bp,编码449个氨基酸,含1个CRD结构域,Ca^(2+)结合位点2关键氨基酸基序为QPS/WHD;CTL mRNA相对表达呈组织差异分布,肝胰腺、外套膜、血细胞表达量较高,其次为鳃、肌肉柱、卵巢,唇瓣表达量最少;CTL的CRD结构域体外重组蛋白具有LPS、PGN和glucan 3种PAMPs结合活性,能结合、抑制和杀死革兰氏阳性菌中的金黄色葡萄球菌、革兰氏阴性菌中的大肠杆菌和鳗弧菌,能结合、抑制但不能杀死毕赤酵母和耶罗维亚酵母。[结论]近江牡蛎CTL的CRD结构域具有较广泛的PAMPs结合谱和抑菌活性,在其固有免疫防御机制中可发挥识别、结合、抑制和杀死多种有害菌的重要作用。
关键词
近江牡蛎
C型凝集素
crd结构域
PAMPs结合谱
抑菌活性
Keywords
Crassostrea rivularis
C-type lectin
crd
domain
PAMPs binding spectrum
Bacteriostatic activity
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
用SDSL-EPR技术测量LSECtin-CRD与甘露糖结合过程中的位点运动性变化
2
作者
马蕾
董国福
丛建波
杨俊涛
邹洁芮
郭俊旺
张成岗
王长振
吴可
机构
军事医学科学院放射与辐射医学研究所
出处
《生物技术通讯》
CAS
2016年第3期381-385,共5页
基金
国家自然科学基金(31170714
30970693)
北京市自然科学基金(7132134)
文摘
目的:应用定点自旋标记-电子顺磁共振(SDSL-EPR)技术检测肝脏及淋巴结窦内皮细胞C型凝集素(LSECtin)的糖基识别结构域CRD上不同位点氨基酸的运动特性及其与甘露糖结合过程中的构象变化。方法:通过SOE-PCR方法对LSECtin-CRD引入半胱氨酸点突变,构建p ET28b-Tat-LSECtin-CRD载体,可溶性表达LSECtin-CRD突变体蛋白;对突变位点进行自旋标记;EPR检测标记后样品的EPR波谱;用SS-FDDM软件对EPR波谱进行模拟和解析,获得旋转相关时间τc,研究其构象特点及变化。结果:在CRD的Ca^(2+)结合位点和配体结合功能区构建了5个突变体蛋白;LSECtin-CRD与Ca^(2+)和甘露糖结合后,4个位点的τc值明显升高,表明CRD结构域整体运动性降低;5个突变位点运动性差异较大,其中A258位点运动性变化最大,可能是参与糖基结合的关键位点。结论:SDSL-EPR技术能够有效研究LSECtin-CRD参与糖基结合过程中的构象运动性,研究结果证明了LSECtin-CRD在与糖基结合后整体运动性受限。
关键词
定点自旋标记-电子顺磁共振技术(SDSL-EPR)
肝脏及淋巴结窦内皮细胞C型凝集素(LSECtin)
糖基识别
结构域
(
crd
)
运动性
Keywords
site directed spin labeling electron paramagnetic resonance(SDSL-EPR)
liver and lymph node sinusoidal endothelial cell C-type lectin(LSECtin)
carbohydrate recognition domain(
crd
)
mobility
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
半乳糖凝集素糖结合的新模式:一个糖结合域的双重配体结合(英文)
被引量:
1
3
作者
卞乘凤
张英
李德峰
王大成
机构
中国科学院生物物理研究所
中国科学院研究生院
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期810-815,共6页
基金
supported by grants from National Basic Research Program of China(30800170)
The Special Project on Drug Discovery from The Ministry of Public Health of China(2009ZX09103-676)~~
文摘
半乳糖凝集素家族通过糖识别结构域(CRD)可以专一性识别和结合含β-半乳糖的多糖配体来发挥其生物学功能.到目前发现的CRD对β-半乳糖的识别模式是非常保守的,在结构已知的半乳糖凝集素结构中,一个CRD只能结合一个多糖配体分子.最近,通过对人源半乳糖凝聚素-3 CRD与对硝基TF二糖(TFN)复合物的晶体结构解析首次发现,一个CRD可以同时结合2个TFN分子.与这2个TFN分子有双向结合的残基突变体E165A结构分析显示,一个残基的突变引起的结构上的微小变化会使结合位点2丧失结合糖底物的能力,而位点1的配体结合却不受影响.这表明,结合位点1对糖底物保守的识别和结合是基本的、主要的,而结合位点2对于糖有条件的结合,是额外的、次要的.序列比对和立体化学分析显示,参与新位点2结合的关键残基在其他半乳糖凝集素分子中都是保守的,而它们参与糖配体结合并不常见,表明它们作用的发挥是有条件的.可能在复杂寡聚结构的情况下,如有多重分支结构,双重结合位点将有利于对这类配体分子的辨识和结合,已有一系列研究报道,具有分支结构的寡糖与半乳糖分子的亲和势明显高于单价糖配体,与上述分析相一致.对这类双重位点糖结合的可能生物学意义进行了讨论.
关键词
半乳糖凝集素家族
糖识别
结构域
(
crd
)
β-半乳糖
对硝基TF二糖(TFN)
双重结合模式
Keywords
galectins, β-galactosides, carbohydrate recognition domain (
crd
), glycan TFN, doublet binding pattern
分类号
Q5 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
近江牡蛎C型凝集素CRD结构域PAMPs结合谱及抑菌活性
王翠丽
《安徽农业科学》
CAS
2022
0
下载PDF
职称材料
2
用SDSL-EPR技术测量LSECtin-CRD与甘露糖结合过程中的位点运动性变化
马蕾
董国福
丛建波
杨俊涛
邹洁芮
郭俊旺
张成岗
王长振
吴可
《生物技术通讯》
CAS
2016
0
下载PDF
职称材料
3
半乳糖凝集素糖结合的新模式:一个糖结合域的双重配体结合(英文)
卞乘凤
张英
李德峰
王大成
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
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职称材料
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