全外显子测序发现CREBBP基因突变影响卵巢癌的发生机制

目的利用全外显子测序寻找与卵巢癌发生发展相关的分子靶标,并进行体外细胞实验验证其可能影响卵巢癌发生的机制。方法本研究通过对8对浆液性卵巢癌组织进行全外显子测序,验证实验进一步对另外43个浆液性卵巢癌组织和156位正常女性的外周血标本进行目的基因测序。在体外实验中用Lipofectamine 3000做载体,将含CREBBP基因L1850fs和P1373S突变的质粒转染人浆液性卵巢癌细胞株A2780,以含CREBBP野生型的质粒和空载体为对照,采用Western blot法检测CREBBP的L1850fs和P1373S突变对环磷腺苷效应元件(CREB)的结合蛋白(CBP)蛋白表达的影响;CCK-8检查L1850fs和P1373S突变对细胞增殖的影响;Transwell小室试验检测L1850fs和P1373S突变对细胞迁移的影响;划痕试验检测L1850fs和P1373S突变对细胞侵袭的影响。结果通过全外显子测序发现了浆液性卵巢癌的2个高频突变位点——CREBBP的L1850fs(c.5548dupC)和P1373S(c.4117C>T)。L1850f是移码突变,P1373S是非同义序列。在51例浆液性卵巢癌病例中(全外显子测序8例,目的基因测序43例),CREBBP基因的突变率为41.2%,而正常女性外周血中突变率为21.8%,差异有统计学意义(χ^(2)=7.4,P=0.007)。Western blot结果显示,L1850fs突变能降低卵巢癌细胞中其相应CBP蛋白的表达,而P1373S突变对蛋白表达无影响。CCK-8分析表明,突变型CREBBP可促进卵巢癌细胞增殖。Transwell小室试验结果显示L1850fs和P1373S突变可促进卵巢癌细胞迁移。划痕试验分析表明,CREBBP基因突变可提高卵巢癌细胞侵袭能力。结论本实验通过全外显子测序发现了浆液性卵巢癌相关的两个点突变,CREBBP L1850fs和P1373S。进一步的细胞实验表明该突变可以通过影响CBP蛋白促进卵巢癌细胞增殖、侵袭、转移等,提示CREBBP L1850fs和P1373S可能成为卵巢癌诊断及治疗的新靶点。

CREBBP基因突变所致Rubinstein-Taybi综合征1例

Rubinstein-Taybi综合征(Rubinstein-Taybi syndrome,RSTS)又称宽拇指巨趾综合征(broad thumb-great toe syndrome)、巨指(趾)综合征(broad digits syndrome),是一类罕见的常染色体显性遗传病。患者的主要特征为颅面畸形、骨骼畸形、生长延迟和精神及运动发育迟缓。本例患儿具有典型的RSTS特殊面容及生长迟滞,合并不典型的腹股沟斜疝。二代测序技术基因结果显示:患儿的16号染色体CREBBP基因外显子上存在1个杂合突变位点c.4492C>T(p. Arg1498Ter),且为无义突变,使得肽链合成提前终止。受检者父母未发现上述变异,该变异可能为新生突变。本病目前尚无特异性治疗方法。

CREBBP基因突变所致鲁宾斯坦-泰比综合征1例报告

目的探讨鲁宾斯坦-泰比综合征(RSTS)的临床表现及遗传学特征。方法回顾分析1例经基因检测确诊为RSTS患儿的临床资料。结果男性患儿,5月余,具有眉毛粗密、高眉弓、眼裂向外下斜、内眦赘皮、眼睑下垂等特殊面容。全外显子基因测序显示CREBBP基因存在一个错义突变c.3609G>C(p.K1203N);Sanger测序未发现其父母携带上述突变,可能为新生突变。结论发现了CREBBP基因c.3609G>C(p.K1203N)突变位点,丰富了RSTS的基因突变谱。

虹鳟ep300/crebbp基因家族不同拷贝的功能分化

为研究虹鳟Oncorhynchus mykiss ep300/crebbp基因家族的拷贝数变异、功能分化及与低氧应答的关联,通过TBLASTN和BLASTP搜索及重构进化树,确定该家族的拷贝数及与其直系同源的斑马鱼Danio rerio基因,基于对原始转录组测序数据的统计获得这些拷贝的组织表达谱及共表达基因,并对共表达基因进行GO富集分析,最后通过CDD搜索、多重序列比对及三维结构建模比较这些拷贝所编码蛋白质的变异程度。结果表明:虹鳟的ep300/crebbp家族有8个成员(ep300aa~ep300bb,crebbpaa~crebbpbb),其均由全基因组重复事件所形成,对应于斑马鱼的4个成员,可分为4对ohnologs;不同的ohnolog对之间在组织表达谱、编码蛋白质的一级结构和三级结构存在较大差异,而同一对ohnologs内部的2个拷贝在这些方面差异较小;这8个成员拥有数量不等的独有共表达基因,这些共表达基因所富集的与结合、修饰、应对压力/刺激和耐低氧相关的GO条目的数量均存在较大差异;ep300ba和ep300bb属于一对ohnologs,但它们编码的蛋白质保守结构域中存在35处变异,数量远大于其他ohnolog对,且只有ep300bb的共表达基因能富集到与应对压力/刺激和耐低氧相关的GO条目。研究表明,相较于其他ep300/crebbp家族成员,虹鳟ep300bb的进化速度较快,且与耐低氧性能相关性更大,可作为虹鳟遗传改良的重要候选基因。

Menke-Hennekam综合征表型及基因型分析

目的探讨CREBBP基因变异所致Menke-Hennekam综合征(MKHK)的临床特征及基因变异特点。方法回顾性总结7例中国MKHK患儿临床特征及基因测序结果。结果7例患儿均有精神发育迟缓、语言及运动发育落后、身材矮小,特殊面容表现为上斜眼睑、内眦距宽、塌鼻梁、短鼻、长人中、招风耳、低耳位、小下颌,2例伴喂养问题,4例伴视力障碍,3例伴听力障碍,3例伴脑发育异常,2例合并手/脚部异常体征。7例患儿携带CREBBP基因的致病/可能致病变异,均位于外显子30和31,共6个不同变异,涉及2种类型基因变异(5个为错义变异、1个为不影响阅读框的插入缺失),全为新发,其中c.5218C>T、c.5225T>A(NM_004380.3)变异尚未有文献报道。结论MKHK是一种罕见的常染色体显性遗传病,大多由CREBBP基因第30或31位外显子杂合错义变异引起。文章报道了CREBBP基因的6个变异,进一步扩大了MKHK的基因变异谱。

1例Rubinstein-Taybi综合征临床病例报告并文献复习

目的探讨Rubinstein-Taybi综合征(RSTS)的遗传学特征。方法通过分析1例RSTS患儿的临床资料。结果女性患儿,2岁余,具有弓形眉、眼裂向外下斜、鹰钩鼻、双手拇指短扁宽、身高偏矮、智力发育落后等特点。全外显子基因测序显示CREBBP基因存在一杂合突变c.1824-1G>C(splicing),未发现其父母携带上述突变,为自发突变。结论发现了CREBBP基因c.1824-1G>C(splicing)新发突变,丰富了RSTS的基因突变谱。

一例鲁宾斯坦-泰比综合征患者的临床及基因分析并文献复习

鲁宾斯坦-泰比综合征(RSTS)是一种临床上罕见的常染色体显性遗传病,患者常表现出精神发育迟滞、宽拇指、钩形鼻等特征。RSTS可导致多器官发育不全,也可导致多系统(内分泌系统、消化系统、泌尿系统等)发育不全,甚至可累及皮肤(如毛母细胞瘤、多毛症等)。近年研究发现RSTS可增加患者患癌风险,但该病罕见,目前国内外相关报道较少,虽部分患者可通过临床特征及基因检测确诊,但仍有不少患者无法确诊,因此需进一步明确该病的病因和发病机制。本文报道了桂林医学院附属医院收治的1例疑似RSTS患者,通过对其进行临床特征分析和基因检测,发现患者有一个CREBBP基因突变:c.3832G>A(p.Glu1278Lys),未发现患者父母该基因突变,表明该基因突变为新发突变,患者诊断为RSTS明确。RSTS十分罕见,确诊困难,通过本例患者的报道,可以提供该病更多的临床特征,有助于对该病基因型-表型相关性的研究,能够给未来诊治RSTS提供更多参考。

1例Rubinstein-Taybi综合征的临床分析及文献复习

本文报道1例CREBBP基因变异导致Rubinstein-Taybi综合征的临床特征及CREBBP基因突变特点。患儿女,2岁,主要表现为精神运动发育迟缓,伴双手拇指及第一脚趾粗大。全外显子测序显示患儿CREBBP基因存在碱基缺失c.3469_3471del,p.val1157del(杂合),父母该位点为正常基因型,提示该变异可能为新生突变。临床上对于不明全因的全面性发育迟缓、神经系统疾病、肢体畸形,采用全外显子测序技术有助诊断,并可根据突变位点评估预后。

Rubinstein-Taybi综合征一例报告

目的探讨Rubinstein-Taybi综合征的临床症状、遗传特点及诊疗策略。方法对2020年3月郑州大学第五附属医院儿童康复科收治的1例临床表现符合Rubinstein-Taybi综合征诊断的患儿,分析其临床特征,同时采用二代测序技术进行CREBBP基因分析,并进行全面康复治疗。结果患儿存在身材矮小,小头畸形,发际线低,眼距宽,睑下垂,高眉弓,拇指和第一脚趾短而宽,且伴有智力低下及语言发育落后等症状;在患儿的16号染色体CREBBP基因上存在一个杂合突变位点c.4268dupC(插入突变),该突变在父母双方均未检出,考虑为Denovo突变;且系统康复治疗疗效一般。结论Rubinstein-Taybi综合征主要临床表现为智力低下、生长发育不足、特殊面容及宽大拇指足趾等;CREBBP基因上的c.4268dupC为引起该综合征的突变位点;康复治疗策略有待进一步研究。

产前诊断Rubinstein-Taybi综合征胎儿1例

目的探讨1例Rubinstein-Taybi综合征(RSTS)胎儿的临床特点及CREBBP基因的变异。方法选取2022年8月在郑州大学第三附属医院确诊的1例RSTS胎儿作为研究对象。收集胎儿的临床资料,对其羊水样本及父母的外周血样本进行家系全外显子测序(WES),对候选变异进行Sanger测序验证。结果产前超声检查发现胎儿足部畸形、小脑蚓部发育不全、脑发育不全、轴前多/并趾畸形。WES检测发现胎儿CREBBP基因(NM_004380.3)第28外显子存在c.4684G>T(p.E1562*)新发杂合变异,既往未见报道。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南判定为致病性(PVS1+PS2_Moderate+PM2_Supporting)。胎儿父母在遗传咨询后选择引产,但拒绝对胎儿进行尸检。结论CREBBP基因变异可能是本研究RSTS胎儿的遗传学病因。c.4684G>T(p.E1562*)变异的发现拓宽了CREBBP基因的变异谱,同时证实WES是产前诊断RSTS的有效方法。

1例Rubinstein-Taybi综合征的临床及CREBBP基因新突变分析

患儿女,3岁8个月,出生身长、体重正常。生后喂养困难。身高、体重及头围均低于第3百分位,伴智力障碍,面容特别,表现为拱形粗眉、眼裂下斜、宽鼻梁,但无喙状鼻尖、宽大的拇指及脚趾,基本符合Rubinstein-Taybi综合征(RSTS)的临床表现。基因测序发现患儿CREBBP基因c.3779+1G>T杂合剪接位点突变,其父母该位点无变异,患儿明确诊断为RSTS。c.3779+1G>T在人类基因突变数据库中未见报道,为新的致病性突变。确诊后主要针对患儿语言及运动发育落后进行康复训练。目前患儿门诊随访3个月,尚未评估康复治疗疗效。

两例Rubinstein-Taybi综合征患儿的临床及遗传学分析

目的 总结2例Rubinstein-Taybi综合征患儿的临床及遗传学特点.方法 采集患儿及家属外周血样,对全外显子组进行高通量测序,用Sanger测序法验证结果.结果 两例患儿均有特殊面容、拇指和大趾宽扁、体格及智力发育迟滞等特征.高通量测序发现例1携带CREBBP基因c.3779+1G>A杂合变异,例2携带CREBBP基因c.5052_c.5053insT杂合变异,按美国医学遗传学会指南评级两种变异均为有害.变异1为已知致病突变,变异2为新突变.结论 确诊了两例Rubinstein-Taybi综合征患儿,丰富了人类CREBBP基因突变数据库.