HIV-1CRF07_BC重组毒株的起源和分子流行病学研究进展

CRF07 BC是中国特有的艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)重组毒株,首先在四川和新疆静脉吸毒人群中检出,并成为中国静脉吸毒人群中主要的流行毒株。从发现至今,CRF07 BC在中国流行时间超过十年,其流行呈逐步扩大的态势。对CRF07 BC的现场流行病学和分子流行病学研究也逾十年,积累了大量的现场流行病学数据和实验室数据。特别是2006年在中国台湾静脉吸毒人群中爆发了CRF07 BC流行,CRF07 BC的起源和传播路线等成了众所关注的焦点。该文对CRF07 BC的起源、分子流行病学研究等方面进行综述,希望对该毒株的预防控制、流行趋势和起源推测以及传播路线确立等研究提供依据。

HIV-1 C亚型、CRF07_BC和CRF08_BC重组毒株的起源和分子流行病学研究进展

过去二十多年里,HIV-1 C亚型仍然是目前全球HIV-1最广泛流行的毒株。C亚型毒株传入我国后虽然没有引起广泛的流行,但B/C重组毒株CRF07_BC和CRF08_BC在中国的流行趋势呈逐步扩大化,感染人群呈多样化,流行形式趋于复杂化。本文结合HIV-1 C亚型、CRF07_BC和CRF08_BC分子流行病学研究的文献,对这三种毒株的起源、传播和流行病学研究等方面进行了综述,阐明流行特征,供从事艾滋病防治的科研人员、实验室工作者以及医护人员学习与参考,同时为我国HIV-1的精准防控提供科学依据。

福州MSM人群中HIV-1病毒株基因进化分析

目的分析福州地区男同性恋患者中HIV-1病毒CRF_07BC亚型的分子特征和全基因结构。方法采用分层随机抽样法取2011年1月-2016年12月95份福州地区经免疫印迹法确诊的同性恋人群中新近感染的血清标本,用RT-PCR法对env基因进行扩增,通过MEGA软件对env基因序列进化分析,结果表明46份env基因阳性,其中CRF_07BC亚型18株。采用Sanger测序法对CRF07_BC亚型的HIV病毒株(BC.FJFZ.2016.MSM6)进行全基因测序分析。结果福州地区CRF07_BC与云南、河南和江西地区的HIV毒株有较高同源性,序列相似度为95.1%~98.3%。全基因测序结果病毒株(BC.FJFZ.2016.MSM6)是由B亚型和C亚型的重组株,与CRF07_BC标准株(97CN54)的重组位点基本一致。结论HIV-1病毒CRF07_BC亚型已在福州男同人群中传播,导致福州地区MSM中HIV-1流行的新型重组株的流行出现。应加强对男同人群中的CRF07_BC亚型HIV-1病毒的监测与控制。

HIV-1 CRF07_BC gp41重组抗原在不同体系表达效率的比较

目的获得HIV-1 CRF07_BC株gp41重组抗原表达效率最佳的体系。方法采用基因工程技术将gp41重组蛋白基因分别构建到pThioHis A,pThioHis A-1(不含标签),PBV220,PGEX-6p-1原核表达载体。转化大肠杆菌BL21和Rosetta两种宿主菌,通过IPTG诱导表达并经WB鉴定。结果 4种原核表达质粒构建完成,蛋白成功表达。PGEX-6p-1表达量明显高于pThioHis A载体;而无标签载体组中,PBV220表达量优于pThioHis A-1。BL21和Rosetta宿主菌对表达体系无影响。结论 HIV-1 CRF07_BC株gp41重组抗原在大肠杆菌中以包涵体形式存在,构建在PGEX-6p-1和PBV220载体上gp41重组蛋白表达效率较高,为gp41疫苗的研究和血清学检测提供充足的抗原。

江门市两条新型HIV-1 CRF55_01B/CRF07_BC重组体的基因组特征分析

不同亚型和循环重组亚型(Circulating recombinant forms,CRFs)在同一人群中的传播往往导致独特重组型(Unique recombinant forms,URFs)的出现。在本研究中,我们发现了两条新的HIV-1 CRF55_01B/CRF07_BC第二代重组体(Second-generation recombinant forms,SGRs),它们分别来自江门市的同性恋和异性恋群体。系统进化分析表明,JM.pj44和JM.pj64的近全长基因组(Near full-length genomes,NFLGs)均以CRF55_01B为骨架,插入了CRF07_BC的基因片段,但断点位置不同。将本研究发现的两种新的NFLGs与其他研究中发现的CRF55_01B/CRF07_BC SGRs进行比较,目前未发现有相同的CRF55_01B/CRF07_BC重组体。

HIV-1 CRF55_01B毒株流行特征的研究进展

CRF55_01B是我国报道的HIV-1主要流行毒株之一,具有较为独特的流行病学和基因进化特征。近几年HIV-1分子流行病学监测发现CRF55_01B已经成为我国第五个主要流行HIV-1毒株。本研究从他的发现起源、流行情况、致病性和耐药性及参与的重组等方面进行综述,并讨论了与其流行密切相关的社会和生物学因素。

HIV-1 gp41蛋白的主要特性及B/T细胞表位预测

目的采用生物信息学方法分析HIV-1 gp41跨膜糖蛋白的基因序列及其编码蛋白的结构特征,并预测可能的B/T细胞表位,为艾滋病疫苗及多肽药物开发提供理论依据。方法从NCBI GenBank数据库获取gp41基因及其编码蛋白序列,综合运用ExPASy ProtParam tool、SOPMA、TMpred、Motifscan、ABCpred、Bepipred、CTLPred和IEDB等在线软件分别预测其低级结构、跨膜区、翻译后修饰位点、B/T细胞表位。结果 HIV-1 gp41基因ORF长度为666 bp,编码222个氨基酸。该gp41蛋白共3 627个原子,相对分子质量为25.642 5×10~3,分子式为C_(1164)H_(1815)N_(317)O_(325)S_6。理论等电点为8.60,是稳定的疏水性蛋白。gp41蛋白具有无规则卷曲55个,占24.77%;13个翻译后修饰位点,存在N-糖基化、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化、N-酰胺化、蛋白激酶C磷酸化等修饰。gp41蛋白N-末端存在跨膜螺旋区,分别位于第2-20,80-97和171-192位氨基酸处,这3个螺旋区的总评分为4 614。预测gp41蛋白含有23个B细胞抗原表位,优势表位依次是87-102、93-108、113-128、78-93、151-166等;含有NKTYKEIWD、VERYLRDQR和EPDRPERIE 3个优势CTL细胞表位,分别位于第103-111、70-78、213-221位氨基酸处。结论预测gp41蛋白的B/T细胞表位进行预测,可为艾滋病疫苗及多肽药物的开发提供了理论依据。