食源性大肠杆菌O157毒力、耐药性及CRISPR分型分析

为深入了解食品源大肠杆菌O157的生物学特点,本研究对2014-2015年分离的39株大肠杆菌O157进行了PCR鉴定,毒力基因和耐药性检测,并利用规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)分型技术对菌株的遗传特性进行了分析。结果表明,39株菌株中有8株鉴定为O157:H7,31株为O157;检测的11种毒力基因中,eae存在于所有菌株中,stx2存在于82.50%菌株中,stx1未检出,其他毒力岛基因esp A、etp D、tir、tox B、iha和kat P携带率分别为92.31%、94.87%、87.18%、79.49%、69.23%和46.15%。药敏试验结果表明,菌株对四环素、复方新诺明、链霉素、氯霉素和氨苄西林等抗生素高度耐药,超过30%菌株具有多重耐药性。CRISPR分型结果表明菌株具有较高的遗传多样性,39株菌株中有33株存在CRISPR1位点,8株E.coli O157:H7产生了相同的CRISPR spacer图谱,而26株E.coli O157产生了13种spacer图谱。本研究为食源性疾病的监测、疾病溯源和流行病学研究提供重要的基础数据。

基于CRISPR序列的肠道沙门氏菌分离株CSST分型

为验证一种新的CRISPR分型方法——CSST分型方法分型沙门氏菌的可行性,分别采用传统CRISPR与CSST两种分型方法,对20株临床肠道沙门氏菌分离株进行分型。结果显示:CSST分型方法同传统CRISPR分型方法分型沙门氏菌的结果完全一致,均将20株临床肠道沙门氏菌菌株分成了15种亚型,其中CR4/CT4和CR9/CT9为最优势CR/CT型,而其他CR/CT型均呈零星分布。结果表明,CSST分型方法可用于肠道沙门氏菌分型,且比传统CRISPR分型方法更简洁、方便。本研究为沙门氏菌的流行病学溯源提供了重要技术方法。