猪GHR基因两个SNPs位点多态性与生长性状的关联分析

【目的】探讨猪GHR基因两个SNPs位点多态性与其生长性状的相关性,为保护广西巴马小型猪的遗传资源及推进猪分子标记辅助育种技术的发展奠定基础。【方法】采用PCR-RFLP和错配PCR-RFLP(CRS-PCR-RFLP)检测巴马小型猪×长白猪杂交F2代(简称巴×长F2代)资源家系中猪GHR基因G1248A和A1801G两个SNPs位点的多态性,并对其相关生长性状进行关联分析。【结果】猪GHR基因G1248A和A1801G两个SNPs位点在巴×长F2代资源家系中均表现出AA、AG和GG 3种基因型。G1248A位点对巴×长F2代生长性状的影响表现为:除2月龄GG基因型个体的胸围尺寸显著大于AA、AG基因型个体(P<0.05,下同),4月龄GG基因型个体的体重显著高于AA、AG基因型个体外,其他月龄的相关生长性状在不同基因型个体间差异均不显著(P>0.05,下同)。A1801G位点对巴×长F2代生长性状的影响表现为:除1和6月龄GG基因型个体的体高显著低于AA、AG基因型个体,3和6月龄GG基因型个体的胸围尺寸显著大于AA、AG基因型个体外,其他月龄的相关生长性状在不同基因型个体间差异也不显著。【结论】猪GHR基因G1248A位点的G等位基因对个体体重、胸围有正选择作用,而A1801G位点的G等位基因对个体体高有负选择作用,对个体胸围有正选择作用,均可作为猪分子标记辅助育种的遗传选择标记。

6个绵羊群体MC4R基因CRS-PCR多态性及其与湖羊、东湖杂交羊生长性状的关联分析

为了探讨黑素皮质素受体4(melanoeortin receptor-4,MC4R)基因在绵羊中的多态性以及多态位点对绵羊生长性状的影响,对湖羊MC4R基因进行扩增,测序后发现9个碱基置换,选择MC4R基因548位点处C/T的单碱基突变,建立CRSPCR-RFLP分析方法,并对6个绵羊群体(湖羊、东弗里生羊×湖羊(东湖杂交羊)、中国美利奴、Romney、中国美利奴×Romney和阿勒泰)共518个个体进行检测分析。结果表明:在阿勒泰、Romney、中国美利奴×Romney群体中仅检测到CC 1种基因型,在东湖杂交羊和中国美利奴的群体中检测到CC和CT 2种基因型,而在湖羊群体中检测到CC(0.865)、CT(0.126)和TT(0.009)3种基因型。湖羊群体CT基因型2月龄体质量显著高于TT基因型(P<0.05),4月龄体长显著高于CC型(P<0.05)和TT型(P<0.01);东湖杂交羊群体中CT基因型的4月龄体高显著高于CC基因型(P<0.05)。本研究初步表明6个绵羊群体中MC4R基因的CT基因型具有生长优势。

猪APOBEC3F基因外显子6单核苷酸多态性及其与PRRSV易感性的关联分析

载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3F(APOBEC3F)是有效阻止内源性与外源性反转录病毒复制的新型宿主细胞因子。本文对猪APOBEC3F基因外显子6序列进行扩增和测序,筛选多态性位点,并分析其与PRRSV易感性的相关性。测序发现外显子6存在3个单碱基突变(g.337 T/G、g.341 G/A和g.343 T/C)。针对g.341 G/A建立CRS-PCR-RFLP方法,检测9个猪群193个样本,发现仅在姜曲海猪和梅山猪中有GG(0.79/0.80)和GA(0.21/0.20)基因型,其他7个猪群体只检测到GG基因型。GG基因型猪肺泡巨噬细胞中PRRSV拷贝数在接毒后18h显著高于GA基因型个体(P<0.05)。表明APOBEC3F基因外显子6与猪种PRRSV抗性相关,外显子6的341位点A等位基因更有利于抵抗PRRSV的感染,这为进一步探讨APOBEC3F基因作为猪种PRRSV抗性辅助选育标记提供了试验依据。