产ESBLs大肠埃希菌CTX-M型耐药基因分析

目的了解某院CTX-M型超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)在大肠埃希菌中的检出率,并确定其基因型。方法对该院2005年1—12月临床送检标本中分离的197株大肠埃希菌进行ESBLs表型确证试验和接合试验;采用聚合酶链反应(PCR)检测CTX-M酶基因型,对PCR产物测序并确定其基因型。结果197株大肠埃希菌中有104株(52.79%)ESBLs表型检测阳性,其中91株符合供体菌标准,64株(70.33%)接合成功,接合子均确证产ESBLs。PCR扩增结果示104株产ESBLs大肠埃希菌中共有98株(94.23%)携带CTX-M型基因,其中38株(36.54%)检出blaCTX-M-1组基因,69株(66.35%)检出blaCTX-M-9组基因。64株接合子中共有51株(79.69%)携带CTX-M型基因,其中18株(28.13%)检出blaCTX-M-1组基因,35株(54.69%)检出blaCTX-M-9组基因。基因测序确定存在CTX-M-22、CTX-M-28、CTX-M-15、CTX-M-14、CTX-M-27五种基因亚型,以CTX-M-14为主。结论该院大肠埃希菌产ESBLs和耐药质粒水平传播情况严重,产ESBLs细菌基因型以CTX-M-9组的CTX-M-14亚型为主,同时存在CTX-M-22、CTX-M-28、CTX-M-15和CTX-M-27等多种亚型。

四川北部地区肠杆菌科细菌产ESBLs CTX-M亚型研究

目的了解川北地区临床分离的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌中产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)CTX-M型亚型的分布情况。方法选取CTX-M型的42株大肠埃希菌和14株肺炎克雷伯菌作为研究对象,对PCR扩增CTX-M耐药基因阳性者行DNA测序,测序结果在Genebank中进行比对。结果 42株大肠埃希菌中有30株出现CTX-M基因阳性条带,6株弱阳性;14株肺炎克雷伯菌,5株出现CTX-M阳性条带,2株弱阳性。ESBLs分子表型流行以CTX-M-14型为主,其次为CTX-M-3型,且发现1株OXY-2型;VITEK AES耐药表型判断的准确性达76.8%。结论川北地区ESBLs分子表型中CTX-M-14型流行情况严重,应进一步加强消毒隔离措施和流行菌株的控制。

青岛地区产ESBLs鸡源大肠杆菌耐药性调查与优势基因型分析

【目的】通过抗菌药物敏感性测定试验以及超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)表型和基因型检测试验,了解青岛地区肉鸡养殖场产ESBLs大肠杆菌菌株的分布情况及耐药特征,分析ESBLs流行基因型和基因亚型,为指导临床合理使用抗菌药物、有效控制产ESBLs菌株的感染和流行提供依据。【方法】采用微量肉汤稀释法对249株大肠杆菌菌株进行抗菌药物敏感性测定试验,采用CLSI推荐方法进行ESBLs表型检测和确证实验,采用PCR方法、序列测定以及生物学分析软件进行ESBLs耐药质粒的DNA扩展和基因型分析,利用SPSS19.0软件对产ESBLs菌株与非产ESBLs菌株的耐药情况进行差异显著性分析。【结果】83.13%(207/249)的鸡源大肠杆菌菌株产ESBLs;产ESBLs菌株对7种抗菌药的耐药率高于非产ESBLs菌株,其中对庆大霉素、大观霉素、氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、头孢噻呋等5种药物差异显著(P<0.05),而产ESBLs菌株对四环素和氟苯尼考2种抗菌药的耐药率显著低于非产ESBLs菌株;产ESBLs菌株多重耐药程度显著高于非产ESBLs菌株,其多重耐药率分别为99.03%和92.86%(P=0.035);CTX-M型、TEM型和OXA型ESBLs菌株的检出率分别为100.00%、99.52%和47.83%,未检测出SHV型ESBLs菌株;产酶菌株分属于10个基因亚型,TEM-1型、CTX-M-65型和CTX-M-55型、OXA-1型是优势基因亚型,并首次从健康家禽中检测到基因重组嵌合体CTX-M-123和CTX-M-64。【结论】产ESBLs鸡源大肠杆菌菌株在青岛地区广泛流行和传播;产ESBLs菌株耐药相对非产ESBLs菌株严重;相比国内其它地区,CTX-M型和TEM型同样成为青岛地区产ESBLs鸡源大肠杆菌菌株的流行基因型,但基因亚型存在差异,TEM-1型、CTX-M-65型和CTX-M-55型、OXA-1型分别是各基因型的优势基因亚型。

30株鸡大肠杆菌ESBLs基因型检测及耐药性分析

采用2倍稀释法检测30株鸡大肠杆菌对常见药物耐药性,用表型筛选和确证试验检测产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)情况,并分别用TEM、SHV和CTX-M等3种通用引物进行PCR扩增以确定其基因型。结果显示23株大肠杆菌为产ESBLs株,占76.7%。PCR扩增表明TEM、CTX-M、SHV阳性率分别为73.9%、43.5%和0%,有7株同时检测出TEM和CTX-M基因(占30.4%),3株未检测出TEM、CTX-M和SHV 3种基因(占13.0%)。药敏试验结果显示产ESBLs大肠杆菌对药物的多重耐药性明显比非产酶大肠杆菌严重,产酶菌对氨苄西林和头孢噻呋的耐药率最高,为95.7%,对氨基糖苷类、恩诺沙星和复方新诺明的耐药率均高于78%,氨苄西林和三代头孢与酶抑制剂联用或2种不同种类的药物联用均能明显增强抗菌活性。以上结果表明河南省76.7%的临床分离鸡大肠杆菌为产ESBLs株,其基因型主要是TEM和CTX-M,尚无SHV型,β-内酰胺类与酶抑制剂联用或不同种类药物联用是防治鸡产酶大肠杆菌感染的有效措施之一。

鸡源大肠杆菌ESBLs基因型检测及其耐药性分析

采用K-B法检测30株鸡源大肠杆菌对16种抗菌药物的耐药性,根据耐药表型和超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的基因型流行情况,指导临床合理用药。结果表明,24株大肠杆菌为产ESBLs株。扩增出了与预期片段大小相符的TEM型、SHV型、CTX-M型、OXA型基因。有5株同时检测出TEM和CTX-M基因。产酶大肠杆菌对氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、环丙沙星的耐药率100%。其多重耐药性明显比非产酶大肠杆菌严重。

鸡源大肠杆菌分离鉴定及ESBLs与AmpC酶基因型检测及耐药性分析

为了解山西省范围内鸡源产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)和头孢菌素酶(AmpC)大肠杆菌分离株的基因型及其耐药现状,本试验从呈现典型鸡大肠杆菌病临床症状的病料中分离、鉴定出68株符合鸡源大肠杆菌生物特性的流行菌株,采用K-B法与双纸片确认法对分离的68株大肠杆菌分别进行药敏试验和ESBLs、AmpC酶耐药表型的筛选;采用PCR方法检测了分离株中质粒介导的ESBLs、AmpC酶的基因型。结果显示,分离到的68株菌对22种抗菌药物均产生不同程度的耐药性,其中耐药谱达7耐以上的有66,占总分离菌株数的97.06%;呈ESBLs、AmpC酶阳性和两者均阳性的菌株数分别为57(83.82%)、19(27.94%)和16(23.53%)株;检测出ESBLs阳性菌株携带的耐药基因型包括bla TEM、bla OXA和bla CTX-M-1/9,AmpC酶阳性菌株耐药基因型为bla FOX型。研究结果表明,分离的68株鸡源大肠杆菌已对绝大多数种类抗菌药物产生耐药性,且产ESBLs和AmpC酶菌株已普遍流行。山西省鸡源大肠杆菌中流行的ESBLs基因型与国内其他地区相关报道大体一致,而检测到的bla FOX型AmpC酶基因在国内报道相对较少。

鸡、猪大肠杆菌ESBLs基因型检测及耐药性分析

为检测不同动物源大肠杆菌中超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的基因型,探究ESBLs对大肠杆菌耐药性的影响,指导兽医临床有效防治大肠杆菌病。采用NCCLS标准方法和双纸片协同法,对102株大肠杆菌菌株进行抗菌药物敏感性测定和和ESBLs检测,设计合成4对引物,用PCR方法进行了ESBLs耐药质粒的DNA扩增和基因型分析。结果表明:以产ESBLs细菌的耐药质粒为模板扩增出了与预期片段大小相符的TEM、CTX-M型ESBLs产物,但均未扩增出SHV、OVA型ESBLs产物。鸡源、猪源产ESBLs菌株检出率分别为81%、6%。CTX-M、TEM型为山东莱西地区动物源产ESBLs大肠杆菌菌株的流行基因型,且鸡源产ESBLs大肠杆菌菌株分布广泛,应加强当地产酶耐药菌的监测和研究,以有效防治此类细菌引发的疾病。

贵州部分地区猪源大肠杆菌耐药性分析及ESBLs基因型检测

为了解贵州地区规模养猪场大肠杆菌菌株耐药情况和ESBLs基因型的流行情况,试验采用CLSI推荐的方法对采自贵州省4个地区规模养猪场的164株大肠杆菌进行药物敏感性试验和产ESBLs菌的检测,并用PCR方法对TEM、SHV、OXA-1和CTX-M-1 4种常见ESBLs基因进行检测。结果显示,164株大肠杆菌对10种常用抗菌药物耐药率分别是头孢噻呋93.29%、氨苄西林87.19%、四环素86.59%、庆大霉素81.10%、链霉素53.66%、多黏菌素51.83%、环丙沙星53.05%、卡那霉素47.56%、金霉素34.76%和氟苯尼考21.95%,且大多为多重耐药,其中检测出ESBLs阳性菌株137株,阳性率为83.54%,各个地区的检出率不同;137株产ESBLs大肠杆菌中,TEM、SHV、OXA-1和CTX-M-1基因的检出率分别为90.51%、70.07%、51.82%和43.07%,且多为复合基因型耐药菌株,各地区的各种基因检出率不同。试验结果表明,贵州部分地区的猪源大肠杆菌耐药现象严重,ESBLs菌株的检出率很高,耐药基因的检出率也极高,且多为复合基因型耐药菌株,应加强当地产酶耐药菌的监测和研究,有效防制此类细菌引发的疾病。

合肥市产超广谱β-内酰胺酶菌株中OXA型ESBLs基因分布

目的了解合肥市部分医院临床分离产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌中OXA型ESBLs基因分布情况. 方法标本为安徽省细菌耐药性监控中心所留取1999年9月～2000年9月,合肥市4所医院临床分离的产ESBLs肺炎克雷伯菌和大肠埃希菌98株;采用聚合酶链反应(PCR)扩增产OXA型ESBLs菌株基因;按Sanger双脱氧末端终止法,用自动测序仪对其进行测序以鉴定基因型. 结果98株产ESBLs菌株中19株携带OXA型ESBLs基因,对其中3株的进行测序,结果分别与OXA-1、OXA-2和OXA-10基因相符. 结论合肥市部分医院产OXA型ESBLs大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌检出率较高.

1株鹑鸡肠球菌产ESBLs和AmpC酶的基因型鉴定

为检测1株临床分离的七彩鸟鹑鸡肠球菌的ESBLs和AmpC酶的基因型,探讨其耐药基因的进化机制;采用两倍稀释法测定此菌株对18种常用药物的敏感性,并用9对特异性引物进行PCR扩增、基因克隆及测序分析,确定鹑鸡肠球菌ESBLs和AmpC酶的基因型及基因亚型。结果表明,鹑鸡肠球菌为产ESBLs和AmpC酶菌,除对3代、4代头孢,碳青霉烯类和磷霉素体外敏感外,对其他常用药物均呈现耐药,具有多重耐药特性;该菌所产ES-BLs的TEM序列与AJ847364(TEM-116)序列相比发生了2处碱基突变,即512T→A和695A→C,引起了相应氨基酸的突变171Ile→Lys、232Lys→Thr,是一种新的TEM亚型,GenBank注册号DQ849329;AmpC酶与序列EF078894(ACT-like型)有97%的同源性,GenBank登录号是DQ849330。这表明该株鹑鸡肠球菌ESBLs为一种新TEM亚型,来源于同时分离的鹑鸡克雷伯菌TEM型的ESBLs;ACT型AmpC酶的存在可能与七彩鸟鹑鸡接触过β-内酰胺类药物有关。

鸡源大肠杆菌ESBLs基因型检测及耐药性分析研究

为调查哈尔滨市周边地区鸡源大肠杆菌中超光谱β-内酰胺酶(ESBLs)基因型的流行情况,探索携带ESBLs对鸡源大肠杆菌耐药性的影响,从哈尔滨市周边地区多个养殖场分离了137株鸡源大肠杆菌,用微量肉汤稀释法测定137株菌对18种抗菌药物的最小抑菌浓度,采用CLSI推荐的表型筛选和确证试验检测大肠杆菌携带ESBLs情况,用PCR方法检测ESBLs基因(blaTEM、blaSHV、blaCTX-M、blaOXA)的流行分布情况。结果显示:109株大肠杆菌为产ESBLs菌株,占79.6%;137株鸡源大肠杆菌对临床常用18种抗菌药物产生不同程度耐药,且产ESBLs大肠杆菌的耐药性比非产ESBLs大肠杆菌的耐药性严重;blaTEM、blaCTX-M基因阳性率分别为40.9%、71.5%,所有菌株均未扩增出blaSHV和blaOXA基因。提示,blaTEM和blaCTX-M基因为哈尔滨地区鸡源产ESBLs大肠杆菌的流行基因型,且鸡源产ESBLs大肠杆菌菌株分布广泛,应加强当地用药监管。

猪、鸡大肠杆菌ESBLs的基因型检测

【目的】检测致病性大肠埃希氏菌中超广谱β-内酰胺酶(Extendβ-lactamase,ESBLs)的基因型,指导兽医临床合理用药。【方法】对产生ESBL的5株致病性大肠埃希氏菌,设计并合成TEM-1和SHV-1两对引物,用PCR方法进行了ESBLs耐药质粒的DNA扩增、测序和基因型分析【结果】以产生ESBLs细菌的ESBLs耐药质粒为模板均扩增出了与预期片段大小相符的TEM型ESBL产物,但都没有扩出SHV型ESBL产物。【结论】结果提示国内畜禽产生ESBLs的致病性大肠埃希氏菌未通过质粒进行细菌间耐药基因的交换;ESBLs的产生与动物种属没有关系;为克服细菌的该类耐药性问题,应该进行头孢噻呋复方制剂的研究。

鸡志贺菌产ESBLs的基因型鉴定

目的检测鸡志贺菌所产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的基因型和基因亚型,分析其产酶耐药的分子机制。方法采用双纸片协同增效法对临床分离的鸡志贺菌进行了ESBLs检测,用试管二倍稀释法测定了其对常用抗菌药物的敏感性,并通过PCR扩增、基因克隆及测序分析,确定该菌所产ESBLs的基因亚型。结果鸡志贺菌为ESBLs产生菌,对三代头孢类药物严重耐药,具有多重耐药特性。该菌所产ESBLs的基因序列与U48775对比,同源性为99.2%,属于TEM型ESBLs;与同源性最高的AY903309(TEM-116)相比,同源性为99.8%,两处碱基发生变化,409位碱基T突变为C,没有引起氨基酸变化,为沉默突变,157位碱基A突变为G,引起53位丝氨酸变为甘氨酸且该突变是新的突变位点。结论该菌产ESBLs基因型为新的基因亚型,暂命名为TEM-1V,上传至GenBank获序列号DQ211973。

肺炎克雷伯氏菌K99-1029中的ESBLs基因型分析

目的 了解华山医院临床分离的肺炎克雷伯氏菌K99 10 2 9菌株产生的超广谱 β 内酰胺酶(ESBLs)的基因型。方法 编码框以外设计引物、PCR扩增K99 10 2 9转移接合子中的ESBLs全编码基因 ,克隆入pHSG398质粒、表达 ,并对PCR产物进行测序分析其基因型。结果 K99 10 2 9转移接合子所产生的三种酶编码基因序列分别与GenBank中TEM 1、SHV 12、CTX M 3编码基因序列的同源性为 10 0 % ;产SHV 12或CTX M 3克隆菌株对多数 β 内酰胺类抗生素耐药 ,SHV 12和CTX M 3对多数 β 内酰胺类抗生素具有水解作用 ,CTX M 3对头孢噻肟的水解能力明显强于头孢他啶 ;产TEM 1克隆菌株仅对青霉素类耐药 ,TEM 1对青霉素类有明显的水解作用。结论 临床分离的肺炎克雷伯氏菌K 99 10 2 9菌株同时产生TEM 1、SHV 12、CTX M 3型酶 ,可导致对大多数的 β 内酰胺类抗生素产生耐药性。

产ESBLs液化沙雷氏菌临床分离株的表型和基因型分析

目的探索液化沙雷氏菌临床分离株CR04对第三代头孢菌素耐药的分子机制。方法采用琼脂二倍稀释法对临床分离的液化沙雷氏菌CR04株进行MIC检测,提取耐药菌β-内酰胺酶,并测定其酶活性。双纸片法筛选及确证实验鉴别耐药菌的ESBLs表型,进行结合传递实验并提取耐药菌质粒,进一步根据常见的质粒介导的β-内酰胺酶基因序列设计两对寡核苷酸引物,以耐药质粒为模板进行PCR扩增,并对其扩增产物进行DNA序列测定和同源性分析。结果头孢他啶对液化沙雷氏菌CR04株的MIC为512μg/ml,其酶活性为837.9U,双纸片法筛选及确证实验证明为产ESBLs耐药菌,结合传递实验表明产酶基因能传递给受体菌,从耐药菌中提取出大小约为10kb的质粒,以质粒DNA为模板进行PCR扩增,对扩增产物DNA测序结果进行分析表明,其核苷酸序列与已知的β-内酰胺酶blaSHV-5、blaSHV-1、blaSHV-2、blaSHV-7、blaSHV-8、blaSHV-12、blaSHV-24、blaSHV-34基因高度同源,其所推导的氨基酸序列与已知的β-内酰胺酶blaSHV-5、blaSHV-1、blaSHV-2、blaSHV-7、blaSHV-8、blaSHV-12、blaSHV-24、blaSHV-34相比较至少有30个氨基酸残基的差异。结论对临床分离的第三代头孢菌素耐药性液化沙雷氏菌CR04株进行详细的表型和基因型分析。

河南省猪源大肠杆菌ESBLs基因型检测及耐药性分析

对河南省农业科学院畜牧兽医研究所传染病研究室2018年1—4月所分离的70株河南省猪源大肠杆菌,用双纸片法初步确证30株疑似ESBLs菌株,阳性率达42.8%。对30株疑似ESBLs菌株扩增其耐药基因,其阳性率分别为CTX-M53.3%,TEM66.7%,SHV 3.3%,未扩增出OXA,DHA基因。结果显示,河南省农业科学院畜牧兽医研究所传染病研究室所分离的河南省猪源ESBLs大肠杆菌耐药基因型以CTX-M和TEM型为主,且多为耐药菌株。

1997-2010年上海市猪源大肠杆菌耐药性和产ESBLs菌的基因型检测

[目的 ]了解1997—2010年上海市猪源大肠杆菌的耐药情况和产ESBLs大肠杆菌的基因型分布。[方法 ]采用K-B法对199株猪源大肠杆菌进行药敏试验,采用PCR方法对TEM、CTX-M、SHV和OXA等4种基因型进行检测。[结果 ]199株猪源大肠杆菌对20种抗菌药物均表现出不同程度的耐药性。耐药率最低的为大观霉素(7.04%),其次为头孢曲松(10.55%)、头孢哌酮(12.56%),最高的为林可霉素(100%),对阿莫西林和复方新诺明的耐药率分别高于80%和93.33%。5~15耐的菌株占88.94%。15种抗菌药物之间均存在不同程度交叉耐药性。共检出15株产ESBLs菌株(7.54%),其中2株TEM型,5株CTX-M型,7株同时携带TEM、CTX-M型。[结论 ]上海市猪源大肠杆菌分离株耐药谱广、耐药率高;对抗菌药物的交叉耐药现象严重,交叉耐药率有的相似,有的差异大。猪源大肠杆菌ESBLs基因型主要以TEM型和CTX-M型为主,尚无SHV型和OXA型。

鸡福氏志贺菌SHV-12型ESBLs基因的扩增、原核表达及酶特性研究

对5株鸡福氏志贺菌产SHV-12型ESBLs基因进行重组表达并优化表达条件,观察了表达蛋白的底物水解特性和抑制剂的抑酶特性。结果表明:构建的重组质粒经EcoRⅠ和XholⅠ双酶切后,可切下目的条带。重组质粒转化BL21后所表达的重组蛋白有超广谱β-内酰胺酶活性。SHV-12原核表达的最佳条件是IPTG浓度为0.5 mmol/L、温度37℃、诱导时间5 h;SHV-12型ESBLs亲和力最强的底物是头孢噻呋钠,Km值为1.29μmol,较难水解的底物是头孢曲松钠,Km值为24.13μmol;它唑巴坦、舒巴坦对头孢曲松钠的抑酶保护率分别为21.01%、25.51%,对头孢噻呋钠的抑酶保护率分别为34.99%、35.49%。

郑州地区ESBLs基因型分布研究

目的明确ESBLs在郑州地区的基因型分布。方法收集78株临床分离产ESBLs革兰阴性杆菌,混合后提取总质粒作为模版,用特异性引物进行PCR扩增。结果显示TEM、SHV、OXA1、OXA20、CTX-M1、CTX-M14和CTX-M25的泳道有阳性条带。结论郑州地区目前已有TEM、SHV、OXA和CTX-M四种亚型的ESBLs流行。

甘肃省天水地区产ESBLs大肠埃希菌致尿路感染的基因分型及耐药性分析

目的了解天水地区尿路感染患者产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌的基因型分布和耐药性特征,为尿路感染的用药选择和院感防控提供参考。方法收集该地区尿培养分离的2 126株大肠埃希菌,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF)进行鉴定,采用K-B法进行药物敏感试验,按照美国临床实验室标准化委员会(CLSI 2017)推荐的ESBLs纸片扩散法进行表型确证试验,1 003株产ESBLs的大肠埃希菌提取其耐药质粒,应用PCR法检测blaCTX-M,blaTEM,blaSHV及blaOXA耐药基因表型。结果①尿培养分离的2 126株大肠埃希菌中产ESBLs菌株1 003株,产酶率为47.2%,科室分布以泌尿外科最多,检出475株,占47.4%,其次是内分泌科,检出216株,占21.5%。②ESBLs大肠埃希菌对临床常用抗生素如青霉素类、1~3代头孢菌素、单环类、氟喹诺酮类和磺胺类的耐药率超过80%,较非产酶株耐药率高,差异均有统计学意义(P<0.01,P<0.05)。仅对碳青霉烯类、磷霉素和呋喃妥因耐药率<5%。③ESBLs大肠埃希菌耐药基因分子分型特征为:(1)blaCTX-M基因型624株占62.2%,blaTEM基因型287株占28.6%,blaSHV基因型51株占5.1%,blaOXA基因型30株占3.0%,阴性4株占0.4%,未见其它表型。其中blaCTX-M表型以blaCTX-M-14亚型为主,检出597株,占59.5%,其次为bla CTX-M-15亚型,检出21株,占2.1%,blaCTX-M-3亚型最少,检出6株占0.6%;(2)携带单一模式992株,占98.9%,同时携带两种不同耐药基因的复合模式7株,占0.7%,分别为:blaCTX-M-14+bla-TEM型4株,占0.4%,blaCTX-M-15+bla-TEM型2株,占0.2%,blaCTX-M-3+bla-TEM型1株,占0.1%。结论天水地区致尿路感染产ESBLs大肠埃希菌呈现多重耐药性,耐药基因以blaCTX-M-14亚型为主,其次为bla-TEM型;菌株以携带单一模式为主,可见同时携带两种耐药基因型的复合模式;建议临床应根据药敏试验结果选择用药,并加强院感监测与有效的隔离措施,防控耐药菌株在该地区的水平播散。