利用DNA池对3个山羊品种CXCL10基因多态性的研究

为了研究3个山羊品种(黔北麻羊、内蒙古绒山羊、关东奶山羊)CXCL10基因多态性,试验采用构建DNA池并直接对其测序的方法进行分析。结果表明:快速筛查到2个与繁殖性能相关的单核苷酸多态性(T-131-C,G-661-A)。进一步利用测序图中的SNP等位基因峰高的比值估算各山羊品种等位基因的频率。

趋化因子CXCL5基因多态性与2型糖尿病胰岛素抵抗相关性研究

目的研究2型糖尿病患者趋化因子CXCL 5基因启动子-156位点G/C多态性分布,探讨该基因多态性与胰岛素抵抗的关系。方法采用多聚酶链式反应限制性片段长度多态性技术检测210例2型糖尿病患者及171例非糖尿病对照者趋化因子CXCL5基因启动子-156位点G/C多态性。测量身高、体重、并计算体重指数(BMI)、检测血脂、放射免疫分析法测空腹胰岛素,计算胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)。结果 2型糖尿病组空腹血糖、甘油三酯、总胆固醇、低密度脂蛋白、HOMA-IR高于对照组(P<0.001),2型糖尿病组高密度脂蛋白低于对照组(P<0.05)。2型糖尿病组中携带C基因型(G/C+C/C)的患者与携带G/G基因型的患者年龄、性别、甘油三酯、高密度脂蛋白差异无统计学意义(P>0.05)。携带C基因型(G/C+C/C)的患者空腹血糖、空腹胰岛素、总胆固醇、低密度脂蛋白、HOMA-IR、BMI均高于携带G/G基因型的患者(P<0.05)。结论CXCL5基因启动子-156位点G/C多态性与2型糖尿病发病无关,2型糖尿病患者CXCL5变异基因携带者有较高的HOMA-IR与BMI,表明CXCL5基因突变可能与胰岛素抵抗有关。

CXCL12基因rs2839688位点多态性与冠心病的关系

目的探讨CXCL12基因rs2839688位点多态性与冠心病的关系。方法选择冠心病患者545例,经冠状动脉造影证实一支或多支血管狭窄50%以上者279例(观察组),冠状动脉造影正常且无其他粥样硬化证据者266例(对照组)。两组各随机抽取20例,采用ELISA法检测血浆CXLC12;采集所有研究对象静脉血,采用直接测序法检测CXCL12基因rs2839688位点基因型及等位基因分布频率,并分析其多态性与血浆CXLC12水平的关系。结果观察组血浆CXCL12水平低于对照组(P<0.01)。两组CXCL12基因rs2839688位点共检测出GG、GC、CC三种基因型,观察组三种基因型频率分别为66.8%、28.7%、2.5%,对照组分别为69.5%、28.9%、1.5%,两组比较P均>0.05;观察组、对照组C等位基因分布频率分别为16.8%、16.0%,G等位基因分别为83.2%、84.0%,两组比较P均>0.05。两组基因型及等位基因频率符合Hardy-Weinberg平衡定律。两组各基因型者血浆CXCL12水平比较P均>0.05。结论 CXCL12可能与冠心病的发生有关,但其rs2839688位点多态性与冠心病的发病可能无关。

广西扶绥县壮族人群CXCL12基因多态性与肝癌家系遗传易感性的关系

目的探讨CXCL12基因rs3780891多态性与广西扶绥县壮族人群肝细胞癌(HCC)遗传易感性的关系。方法采用对照研究方法,选择广西扶绥县壮族人群肝癌家系组79例(肝癌患者20例,直系亲属59例),正常对照家系组40例,运用质谱方法检测CXCL12基因rs3780891位点基因型分布频率;应用非条件logistic回归分析不同基因型与HCC发病风险的关系。结果 CXCL12基因rs3780891位点存在AA、GA、GG 3种基因型。正常对照组与肝癌家系肝癌组患者的CXCL12基因rs3780891位点GA基因型分布频率比较,差异无统计学意义(P>0.05);肝癌家系中直系亲属组与肝癌组GA基因型的分布频率比较,差异也无统计学意义(P>0.05)。结论 CXCL12基因rs3780891位点多态性与广西扶绥县肝癌家族聚集的遗传易感性无关联。

CXCL2基因在LPS诱导的支气管上皮细胞炎症反应中的作用

目的:探讨CXCL2基因对脂多糖(LPS)诱导的人支气管上皮细胞(16HBE)炎症反应的影响及机制。方法:体外培养16HBE细胞,采用50μg/ml的LPS干预16HBE细胞,构建LPS诱导的16HBE细胞炎症反应模型,实验分为未处理对照组(Control组)、LPS模型组(LPS组)、转染siRNA NC+LPS处理组(si-NC+LPS组)和转染CXCL2 siRNA+LPS处理组(si-CXCL2+LPS组)。分别采用qPCR和Western blot分析CXCL2 mRNA和蛋白的表达情况,MTT法检测16HBE细胞增殖活力,ELISA检测TNF-α、IL-6和IL-1β含量,流式细胞术检测16HBE细胞凋亡率,Western blot检测JAK2和STAT3的磷酸化水平。结果:与Control组相比,LPS组16HBE细胞中CXCL2 mRNA和蛋白的表达明显上调,细胞增殖活力明显降低,TNF-α、IL-6和IL-1β含量明显增多,细胞凋亡率明显升高,JAK2和STAT3磷酸化水平明显升高,差异有统计学意义(P<0.05);与LPS组相比,si-CXCL2+LPS组16HBE细胞中CXCL2 mRNA、CXCL2蛋白、TNF-α、IL-6和IL-1β的含量、JAK2和STAT3的磷酸化水平以及细胞凋亡率均明显降低,细胞增殖活力明显升高,差异有统计学意义(P<0.05);LPS组与si-NC+LPS组间以上各指标差异无统计学意义(P>0.05)。结论:沉默CXCL2基因能够减轻LPS诱导的支气管上皮细胞炎症反应,其作用机制可能与抑制JAK2/STAT3信号通路激活有关。

miR-23b通过靶基因Cxcl12调控肾性高血压

目的:研究微小RNA-23b(miR-23b)是否通过靶基因Cxcl12调控肾性高血压。方法:通过miR-23b基因敲除(miR-23b KO)小鼠,运用RT-qPCR、ELISA、HE染色、PAS染色、免疫组化、彩色多普勒血流成像(CDFI)、肾皮质磁共振成像(MRI)等方法,观察分析miR-23b对肾脏的影响,通过RNA测序(RNA-Seq)技术分析miR-23b靶基因的变化,萤光素酶报告基因实验测定靶基因。结果:从临床中发现肾病综合征患者miR-23b表达水平降低(P<0.01),为了探讨miR-23b与肾病综合征的相关性,对miR-23b KO小鼠的研究发现,miR-23b基因敲除后,小鼠出现尿微量白蛋白显著升高(P<0.05)。通过CDFI和肾皮质MRI测得miR-23b基因敲除后小鼠肾脏血管阻力指数显著升高(P<0.01),肾皮质变薄(P<0.05)。通过ELISA确定miR-23 KO小鼠血清中肾素和血管紧张素蛋白表达显著增高(P<0.05)。对miR-23b KO小鼠肾脏组织的RNA-Seq发现,肾脏总体变化基因与TargetScan数据库中的miR-23b靶基因有交集,GO Term分析发现这些交集的基因主要富集于血流。RT-qPCR结果显示,与健康人群相比,肾病综合征患者Cxcl12基因表达水平显著升高(P<0.01),同时miR-23b KO小鼠Cxcl12基因表达水平也较WT小鼠显著升高(P<0.05)。体外萤光素酶报告基因实验表明,miR-23b过表达可以显著抑制Cxcl12萤光素酶活性(P<0.01),从而确定miR-23b通过调控靶基因Cxcl12发挥其生物学功能。结论:miR-23b可通过靶基因Cxcl12参与肾性高血压的发生与发展。本研究发现miR-23b在肾性高血压中的重要作用,miR-23b可能成为肾性高血压的一种崭新、有效的治疗靶点。

藏猪和大约克夏猪CXCL10基因多态性及表达差异分析

为探讨CXCL10基因在藏猪和大约克夏猪中的差异表达和多态性分析,本研究采用一代测序(Sanger测序)法对藏猪和大约克夏猪CXCL10基因起始密码子上游3 kb区域进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)筛选并进行基因分型;采用RT-qPCR检测CXCL10基因在180日龄藏猪和大约克夏猪背最长肌、腿肌、肝脏组织中的mRNA水平表达情况。结果显示:在CXCL10基因起始密码子上游3 kb区域,存在T-832G、A-808G和T-694C这3个品种间极显著差异的SNPs位点,且均符合哈迪-温伯格定律;转录因子预测结果显示,这些SNPs位点的突变导致了ARGFX、ARID3A/B的结合位点消失;CXCL10基因在藏猪背最长肌、腿肌和肝脏组织中的表达量均极显著高于大约克夏猪。由此推测,CXCL10基因可能参与肌肉生长发育的负向调控。本研究结果为进一步研究藏猪生长发育机制奠定了基础。

特应性皮炎免疫浸润相关miR-155靶基因的筛选及验证

目的筛选与特应性皮炎(AD)免疫浸润相关的miR-155靶基因,并进行细胞实验验证。方法从GEO数据库获取AD基因表达谱数据集GSE121212和GSE157194,筛选出AD皮损区差异表达基因,并进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析,构建蛋白互作网络(PPI)。基于CIBERSORT算法,分析AD患者免疫细胞浸润情况。利用miRNet网站预测miR-155靶基因,并筛选与AD免疫浸润相关的miR-155靶基因。将人永生化角质形成细胞株HaCaT细胞分为control组和TI组,TI组细胞加入TNF-α和IFN-γ构建炎症模型,control组常规培养,采用qRT-PCR法检测TI组、control组细胞中miR-155。取TI组HaCaT细胞分成TI+miR-155 mimics组、TI+mimics NC组,TI+miR-155 mimics组转染miR-155过表达质粒miR-155 mimics,TI+mimics NC组转染过表达对照质粒mimics NC,采用qRT-PCR法检测TI+miR-155 mimics组、TI+mimics NC组细胞中CXCL1、CXCL8 mRNA。结果筛选得到519个AD皮损区差异表达基因。GO功能富集分析结果显示,差异表达基因主要参与免疫系统过程、免疫反应、对外部刺激的反应、防御反应、免疫系统的调节等生物过程,KEGG通路富集分析结果显示,通路主要富集在细胞因子—细胞因子受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路、IL-17信号通路等炎症相关信号通路。成功构建出由67个节点、146条边组成的PPI网络图。树突状细胞、M2巨噬细胞和肥大细胞在表皮免疫微环境中占比最高,免疫浸润最明显。与AD免疫浸润相关性比较高的miR-155靶基因为CXCL1、CXCL8。TI组细胞中miR-155相对表达量高于control组(P<0.05),TI+miR-155 mimics组细胞中CXCL1、CXCL8 mRNA相对表达量高于TI+mimics NC组(P均<0.05)。结论筛选获得的与AD免疫浸润相关的miR-155靶基因是CXCL1、CXCL8基因。高表达miR-155可提高炎症时HaCaT细胞中CXCL1、CXCL8基因的表达水平。

CXCL14基因甲基化是食管癌的潜在诊断标志物

目的探讨趋化因子配体CXCL14(C-X-C motif chemokine ligand 14)基因启动子区在食管癌中的甲基化情况及其表达调控机制。方法应用半定量RT-PCR和甲基化特异性PCR技术对7株食管癌细胞系(KYSE30、KYSE140、KYSE150、KYSE180、KYSE410、KYSE450、KYSE510)和85例食管癌组织进行分析。结果 CXCL14在食管癌细胞中的表达受基因启动子区甲基化调控,CXCL14在KYSE140、KYSE180、KYSE450、KYSE510中表达减少,启动子区呈现部分甲基化状态;在KYSE30、KYSE150和KYSE410中表达缺失,启动子区呈现完全甲基化状态。去甲基化药物5-aza-dc处理后,表达减少的细胞其表达增加,缺失表达的细胞系恢复其表达。CXCL14基因在原发食管癌中的甲基化率为71.8%(61/85),甲基化与肿瘤大小相关(P<0.05)。结论 CXCL14基因甲基化是食管癌诊断的潜在标志物。

年轻女性乳腺癌潜在核心基因的生物信息学分析

目的利用生物信息学方法对年轻女性乳腺癌肿瘤组织及正常乳腺组织的差异表达基因进行筛选及分析,初步探索其相关分子机制。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)下载年轻女性乳腺癌(≤35岁)相关转录组数据,其中包括29例乳腺肿瘤组织样本和3例正常乳腺组织样本。利用R语言Limma程序包筛选差异表达基因,进一步通过蛋白质相互作用数据库(STRING)构建差异表达基因编码蛋白质相互作用网络,着重对表达上调的核心基因进行生物学功能及信号通路分析。结果共筛选出720个差异表达基因,其中上调基因173个,下调基因547个。通过蛋白质相互作用分析得到的核心基因包括NCAPG、NCAPH、MELK、PBK、CDCA5、CDCA8、CCNB2、CCNA2、SPC25、SKA1、NPY1R、CXCL9、CXCL10、GALR2、CCR8、CXCL2、CXCL3、CXCL5、PPBP、CCL16。其中NCAPG、NCAPH、MELK、PBK、CDCA5、CDCA8、CCNB2、CCNA2、SPC25、SKA1、NPY1R、CXCL9、CXCL10、GALR2、CCR8在年轻女性乳腺癌中表达上调,同时发现CXCL2、CXCL3、CXCL5、PPBP、CCL16在癌组织中表达下调且既往研究报道较少。对上调核心基因进行GO分析显示:有丝分裂、细胞增殖正向调控和免疫应答等生物学过程与其相关性较大,同时上调核心基因与趋化因子信号通路以及神经活性配体-受体相互作用等KEGG信号通路关系密切。结论本研究筛选出与年轻女性乳腺癌显著相关的20个潜在核心基因,上调的核心基因与趋化因子信号通路有关。

CXCL16缺失缓解STZ诱导的糖尿病小鼠的肾脏病变

目的:探索CXCL16基因缺失对链脲佐菌素(STZ)引发的糖尿病小鼠肾脏病变的影响。方法:选取8周龄雄性C57BL/6J CXCL16基因缺失(C16 KO)小鼠,以及相同年龄及背景的野生型(WT)小鼠,采用STZ诱导的方式,建立糖尿病小鼠模型,观察CXCL16基因缺失对糖尿病肾病发生发展的影响。结果:在糖尿病病变方面,与STZ处理的WT小鼠相比,STZ诱导C16 KO糖尿病小鼠的空腹血糖显著降低,并且其葡萄糖耐受能力得到显著改善。在糖尿病引发的肾脏病变方面,STZ处理后,C16 KO糖尿病小鼠的尿蛋白量显著低于WT糖尿病小鼠,此外,C16 KO糖尿病小鼠的肾小球损伤也明显低于WT糖尿病小鼠。与此同时,与WT糖尿病小鼠相比,C16 KO糖尿病小鼠肾脏组织活性氧簇(ROS)、丙二醛(MDA)、氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)水平及凝集素样氧化低密度脂蛋白受体1(Lox-1)的m RNA表达水平均显著下调。此外,在STZ处理后,C16 KO糖尿病小鼠肾组织中的巨噬细胞移动抑制因子(MIF)、炎症因子TNF-α和IL-6以及黏附因子ICAM-1和CXCL1的m RNA表达水平均显著低于WT糖尿病小鼠。结论:CXCL16基因缺失能显著抑制STZ诱导的糖尿病小鼠肾脏病变。

沉默CXCL2基因对LTA诱导的炎性MAC-T细胞的作用

CXCL2基因可影响多种疾病并介导炎症和自身免疫的发生,但其在奶牛乳房炎中的作用鲜有报道。为初步揭示CXCL2基因在奶牛乳房炎中发挥的作用,本试验通过转染siRNA特异性序列构建CXCL2基因沉默模型,采用LTA刺激牛乳腺上皮细胞(MAC-T)构建奶牛乳房炎细胞模型,并通过CCK-8法检测CXCL2基因沉默对MAC-T细胞活力的影响;EdU染色法检测CXCL2基因沉默对MAC-T细胞增殖水平的影响;流式细胞术检测CXCL2基因沉默对MAC-T细胞凋亡水平的影响。结果显示,CXCL2基因沉默可使炎性MAC-T细胞活力和增殖能力增加,细胞凋亡数减少。CXCL2基因沉默可通过提高细胞活力、促进细胞增殖和抑制细胞凋亡来减轻LTA诱导的MAC-T细胞的炎症反应,但具体的分子机制仍有待进一步研究。

CXCL12及其受体CXCR4在喉鳞癌中的表达及其临床意义

目的探讨CXCL12以及CXCR4基因在喉鳞状细胞癌中的表达及其临床意义。方法取39例喉鳞癌及28例正常喉组织,应用半定量的RT-PCR方法检测CXCL12以及CXCR4基因mRNA的表达。结果正常喉黏膜CXCL12基因mRNA表达量为(1.22±0.41),在有淋巴结转移(N1,N2),晚期分级(T3,T4)的喉癌组织中CXCL12表达量升高,其mRNA值分别为(1.63±0.47)和(1.57±0.61),与正常喉黏膜组织相比差异有统计学意义(P<0.05)。正常喉黏膜组织的CXCR4基因mRNA表达量为(0.98±1.02),CXCR4基因mR-NA在喉癌中表达与淋巴结转移、T分级及病理分化无关,与正常喉黏膜组织mRNA表达相比,其差异没有统计学意义(P>0.05)。结论与CXCR4基因比较,CXCL12基因表达与喉癌发展关系更为密切,CXCL12基因mRNA表达升高可能与喉鳞状细胞癌的淋巴结转移及演进有关。

小鼠组织中Cxcl15 mRNA表达及其在肺组织中的的定位特征

目的观察Cxc l15(chemok ine,C-X-C motif,ligand 15)基因在小鼠体内的表达分布规律。方法采用North-ern,将小鼠Cxc l15基因与小鼠8种主要组织来源的Poly A+RNA印迹膜进行杂交,观察该基因在小鼠各种组织中的分布规律;采用原位杂交,观察该基因在小鼠肺组织中的分布规律。结果Cxc l15基因主要在小鼠肺组织支气管上皮细胞胞浆中表达,并可能存在不同亚型。结论Cxc l15基因的表达存在组织特异性。

CXCL5在肾透明细胞癌中的表达及其诊断预后价值

目的分析CXCL5基因在肾透明细胞癌中的表达水平、诊断及预后价值,探讨CXCL5在肾透明细胞癌中的调控网络。方法通过TCGA数据库收集肾透明细胞癌基因测序数据和临床数据,分析CXCL5表达差异以及与临床特征的相关性。通过Oncomine数据库验证表达差异,ROC曲线分析CXCL5的诊断价值,COX回归进行预后相关分析,GSEA分析探究CXCL5的调控网络。结果CXCL5基因在肾透明细胞癌中高表达,且其高表达与性别、病理分级、T分期以及N分期有相关性;ROC曲线下面积为0.722;CXCL5高表达患者的总生存期更短(P<0.05)。COX回归分析显示年龄、病理分级、M分期、CXCL5表达量是影响肾透明细胞癌预后的独立危险因素(P<0.05)。GSEA分析发现CXCL5基因可能参与DNA复制、自噬通路、PPAR信号通路等来调控肾透明细胞癌。结论CXCL5在肾透明细胞癌中高水平表达,并且可作为一个潜在的独立标志物用于肾透明细胞癌的诊断和预后。

稽留流产患者组织病理学及CXCL9表达水平变化的研究

目的分析稽留流产患者绒毛组织病理及基因表达变化,探讨稽留流产的机制。方法选取安徽医科大学第一附属医院2020年12月—2023年2月人工流产患者参加研究,其中研究组稽留流产35例,对照组35例。通过HE染色和透射电镜观察绒毛组织的病理变化;RNA测序并通过qRT-PCR验证测序结果及CXCL9基因表达变化。结果研究组HE染色合体滋养细胞减少,炎细胞浸润;透视电镜结果显示,细胞滋养层内质网扩张,合胞滋养层线粒体数量减少;Hofbauer细胞增多。RNA测序分析得到上调最显著的基因包括KRT34(FDR=0.008)、MRGPGR(FDR=0.048)、CUZD1(FDR=0.002)、CXCL9(FDR<0.001)、CD72(FDR=0.043)、FGF14(FDR=0.042)、TMEM176A(FDR<0.001)、GAPT(FDR=0.026)。qRT-PCR表明KRT34、MRGPGR、CUZD1、CXCL9、CD72、FGF14、TMEM176A、GAPT基因表达均上调(P<0.05),而研究组CXCL9 mRNA表达(28.66±0.38)和对照组(27.46±0.75)差异有统计学意义(P<0.001)。结论炎性细胞浸润及CXCL9表达上调可能在稽留流产发展中起重要作用。

卵巢肿瘤组织CXCL1基因表达与临床病理的相关性探讨

目的：探讨趋化因子联接因子1（CXCL1）基因mRNA在卵巢肿瘤组织中的表达及其与临床病理的相关性。方法：Trizol一步法提取卵巢肿瘤患者卵巢组织总RNA,实时荧光定量PCR技术对80例卵巢恶性肿瘤、40例卵巢良性病变及20例正常卵巢组织中CXCL1基因表达进行定量分析,并分析其与临床病理的相关性。结果：CXCL1 mRNA在卵巢肿瘤组织中表达量比在卵巢良性病变组织中明显升高,P=0.000;卵巢恶性肿瘤晚期（Ⅲ~Ⅳ期）患者组织CXCL1表达量显著高于早期（Ⅰ~Ⅱ期）患者,P=0.005。但Kaplan-Meier生存曲线显示,肿瘤组织中CXCL1基因表达与其预后无关。Cox比例风险模型分析未显示CXCL1表达量是独立判断卵巢恶性肿瘤患者预后的因素。结论：卵巢癌患者肿瘤组织CXCL1 mRNA高表达可能与恶性肿瘤的发生、发展有关。

创伤反应差异与Cxcl15基因关系的初步探讨

目的观察Cxcl15基因(chemokine,C-X-Cmotif,ligand15)在两系创伤反应明显差异小鼠生理状态下及伤后表达的差异,初步探讨创伤反应差异与Cxcl15基因的关系。方法采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)技术,对两系小鼠Cxcl15基因在生理状态下的表达进行定量;采用Northern的实验方法,对两系小鼠伤后Cxcl15基因的表达变化进行定量。结果在生理状态下,Cxcl15基因在C57BL/6小鼠中的表达量较在BALB/C小鼠中的表达量低,差异有统计学意义(P<0.01);伤后1h和伤后6h,两系小鼠间比较,Cxcl15基因的表达量差异有统计学意义(P<0.05);伤后24h,Cxcl15基因的表达量基本恢复正常;BALB/C小鼠中Cxcl15基因在伤后6h内持续升高,而C57BL/6小鼠中Cxcl15基因的表达在伤后1h有一下降过程,然后再上升;伤后Cxcl15基因的表达高峰可能在伤后6h或前后的时相点;在不同的时相点,BALB/C小鼠中Cxcl15基因的表达均较C57BL/6小鼠的高。结论Cxcl15基因的差异表达可能在创伤反应差异现象中发挥重要作用。

白花蛇舌草对巨噬细胞Cxcl1基因表达的影响及机制的初步研究

目的通过研究白花蛇舌草对巨噬细胞细胞因子表达的影响及Toll样受体4(TLR-4)炎性信号转导通路的影响,探索白花蛇舌草的免疫调节作用,为新药研发提供实验和理论基础。方法用白花蛇舌草水提液作用小鼠腹腔巨噬细胞,RT-PCR法检测3种常见细胞因子白细胞介素6(IL-6)、单核细胞趋化因子1(MCP-1)、Cxcl1的表达。然后用Autodock软件分析白花蛇舌草主要成分与TLR-4的相互作用,得出白花蛇舌草的主要活性物质对于TLR介导的信号通路的作用机理,从而得出白花蛇舌草对巨噬细胞炎症因子释放以及吞噬功能的影响。结果白花蛇舌草能上调Cxcl1基因的表达,其主要成分豆甾醇-β-D-葡萄糖苷、反式4-甲基肉桂醇、车叶草苷酸可以与TLR-4受体结合。结论白花蛇舌草可以激活TLR-4信号通路,从而影响Cxcl1的表达及巨噬细胞功能,因此推测白花蛇舌草有调控免疫的作用。

CXCL8和MSMO1基因在宫颈鳞癌预后评价中的临床价值

目的:探讨C-X-C基序趋化因子配体8(C-X-C motif chemokine ligand 8,CXCL8)和甲基固醇单加氧酶1(methylsterol monooxygenase 1,MSMO1)基因与宫颈鳞癌患者临床预后的相关性。方法:在高通量基因表达(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载宫颈鳞癌数据集GSE7803和GSE9750,利用GEO2R和R语言软件筛选差异表达基因,并通过DAVID、STRING、GEPIA和HPA数据库分析和筛选与宫颈鳞癌相关的关键基因(Hub基因)。利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)宫颈鳞癌临床数据进行单因素和多因素COX回归模型分析,并构建随机森林模型分析CXCL8和MSMO1表达与宫颈鳞癌患者预后的相关性。采用实时荧光定量PCR法检测CXCL8沉默和MSMO1 mRNA在宫颈鳞癌Siha细胞中的表达水平,并用CCK-8法检测沉默MSMO1基因表达对Siha细胞增殖能力的影响。结果:通过GEO2R筛选出245个表达上调的基因和334个表达下调的基因。基因本体论(gene ontology,GO)富集分析显示,上述差异基因主要与细胞复制、分裂和增殖等有关联。京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析显示,这些差异基因主要富集在肿瘤和细胞周期等通路中。对10个Hub基因进行生存分析,发现其中CXCL8和MSMO1在宫颈鳞癌中高表达与患者预后不良相关(P均<0.05)。单因素和多因素COX回归模型显示,CXCL8和MSMO1表达水平与宫颈鳞癌患者总生存率(overall survival,OS)相关[风险比(hazard ratio,HR)=1.00,95%可信区间(confidence interval,CI)为1.00~1.01,P=0.018;HR=1.03,95%CI为1.10~1.05,P=0.002]。随机森林模型显示,在生存组和死亡组中,患者的预测评分存在明显差异(P<0.05)。训练组模型的绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under the curve,AUC)=1.00,实验组的AUC值=0.71,说明模型预测能力较好,可以在一定程度上预测患者的生存和死亡状态。宫颈鳞癌Siha细胞中CXCL8和MSMO1 mRNA表达水平明显高于正常HUVE-12细胞(P均<0.05)。沉默MSMO1表达后Siha细胞增殖的能力被明显抑制(P<0.05)。结论:CXCL8和MSMO1在宫颈鳞癌中高表达与患者的预后差密切相关,可能是宫颈鳞癌的潜在预后生物标志物。