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芹菜素和山萘酚对细胞色素CYP 1A2抑制机理研究
1
作者
刘明
何琳
+2 位作者
徐峻
黄民
罗海彬
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期69-72,共4页
目的:我们先前的体外肝微粒体抑制活性实验,已证实芹菜素和山萘酚对细胞色素CYP 1A2有较强的抑制作用。然而,其抑制机理仍然未知。分子模拟方法能更好了解这2个天然产物对1A2的抑制机理。方法:采用分子对接、分子动力学模拟及结合自由...
目的:我们先前的体外肝微粒体抑制活性实验,已证实芹菜素和山萘酚对细胞色素CYP 1A2有较强的抑制作用。然而,其抑制机理仍然未知。分子模拟方法能更好了解这2个天然产物对1A2的抑制机理。方法:采用分子对接、分子动力学模拟及结合自由能计算的方法,研究它们对1A2的抑制作用。结果:芹菜素和山萘酚对1A2的预测结合自由能分别是-18.01和-16.40 kcal/mol,这与实验抑制活性结果一致。在1A2结合口袋中,残基呈平面性排列,与平面芹菜素和山萘酚存在紧密的范德华和疏水相互作用,因而小分子有较强的抑制作用。此外,活性位点残基也与小分子发生氢键和盐桥等相互作用,使小分子在结合口袋中的位置得到固定。
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关键词
细胞色素
1
a2
芹菜素
山萘酚
抑制机理
动力学模拟
原文传递
题名
芹菜素和山萘酚对细胞色素CYP 1A2抑制机理研究
1
作者
刘明
何琳
徐峻
黄民
罗海彬
机构
中山大学药学院
出处
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期69-72,共4页
基金
"重大新药创制"科技重大专项(No.2009ZX09304-003)资助项目
文摘
目的:我们先前的体外肝微粒体抑制活性实验,已证实芹菜素和山萘酚对细胞色素CYP 1A2有较强的抑制作用。然而,其抑制机理仍然未知。分子模拟方法能更好了解这2个天然产物对1A2的抑制机理。方法:采用分子对接、分子动力学模拟及结合自由能计算的方法,研究它们对1A2的抑制作用。结果:芹菜素和山萘酚对1A2的预测结合自由能分别是-18.01和-16.40 kcal/mol,这与实验抑制活性结果一致。在1A2结合口袋中,残基呈平面性排列,与平面芹菜素和山萘酚存在紧密的范德华和疏水相互作用,因而小分子有较强的抑制作用。此外,活性位点残基也与小分子发生氢键和盐桥等相互作用,使小分子在结合口袋中的位置得到固定。
关键词
细胞色素
1
a2
芹菜素
山萘酚
抑制机理
动力学模拟
Keywords
cyp 1 a2
,
inhibitory mechanism
,
apigenin
,
daempfero
,
simulations
分类号
O658 [理学—分析化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芹菜素和山萘酚对细胞色素CYP 1A2抑制机理研究
刘明
何琳
徐峻
黄民
罗海彬
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2011
0
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