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棉铃虫细胞色素P450CYP6B6基因启动子的活性分析 被引量:1
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作者 李芬 马纪 刘小宁 《新疆大学学报(自然科学版)》 CAS 2012年第1期13-18,共6页
在昆虫细胞色素P450s超家族中,CYP6家族基因与杀虫剂抗性关系最为密切,其中CYP6B家族基因的表达在植物次生物质的代谢调节中发挥重要作用.为研究CYP6B6基因的表达调节机制,本文采用PCR的方法从棉铃虫中肠DNA序列中扩增了CYP6B6基因转录... 在昆虫细胞色素P450s超家族中,CYP6家族基因与杀虫剂抗性关系最为密切,其中CYP6B家族基因的表达在植物次生物质的代谢调节中发挥重要作用.为研究CYP6B6基因的表达调节机制,本文采用PCR的方法从棉铃虫中肠DNA序列中扩增了CYP6B6基因转录起始位点上游不同片段长度的5段序列,构建由其驱动的萤火虫荧光素酶基因报告质粒pGL3-CYP6B6-promoter,与内参载体pRL-TK同在脂质体的介导下转染昆虫Sf9细胞,体外分析该基因启动子的转录活性及与调控相关的因素.结果显示,5个报告质粒的荧光素酶相对活性分别是基本载体pGL3-Basic载体的0.95、1.95、1.21、1.17和1.01倍,其中p-791片段序列具有启动子活性,这段序列位于翻译起始位点上游400bp之间,生物信息学分析显示,该区间具有TATA box、CAAT box、CBFα、C/EBP等基本元件和AhR等异源物质响应的重要元件结合序列,暗示该序列可能具有与转录调控相关的元件,这为研究CYP6B6的调控机制奠定了基础. 展开更多
关键词 棉铃虫 细胞色素P450 cyp6b6基因启动子 活性分析
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棉铃虫细胞色素P450 CYP6B6基因启动子活性检测条件的优化
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作者 李芬 刘小宁 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期167-172,共6页
旨在用阳离子脂质体介导携带有pGL3-Basic报告基因的棉铃虫细胞色素P450 CYP6B6启动子pGL-CYP6B6-promoter重组质粒转染Sf9细胞,对启动子活性的检测条件进行优化。将长度为999 bp的棉铃虫CYP6B6基因启动子亚克隆至荧光素酶报告载体pGL3-... 旨在用阳离子脂质体介导携带有pGL3-Basic报告基因的棉铃虫细胞色素P450 CYP6B6启动子pGL-CYP6B6-promoter重组质粒转染Sf9细胞,对启动子活性的检测条件进行优化。将长度为999 bp的棉铃虫CYP6B6基因启动子亚克隆至荧光素酶报告载体pGL3-Basic上,提取无细胞内毒素的质粒,转染处于对数生长期的昆虫细胞Sf9,通过检测荧光素酶的表达量验证启动子的活性。对转染后的检测时间、加入转染质粒的量,转染质粒与内对照质粒pRL-TK的比例分别进行了优化,进而确定检测的最优条件。结果表明,转染后的最适检测时间为24 h,转染质粒的最适用量为3.2μg,报告质粒与内对照质粒用量的比例为10 1时转染效率最高。 展开更多
关键词 细胞色素P450 cyp6b6基因启动子 SF9细胞 脂质体 转染 活性检测
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甘薯U6启动子克隆及其转录活性分析
3
作者 唐维 后猛 +6 位作者 宋炜涵 闫会 王欣 李臣 高闰飞 张允刚 李强 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期969-974,共6页
在CRISPR/Cas9基因编辑系统中,U6启动子可以通过驱动sgRNA的表达来编辑目的基因,因而其转录活性会影响基因编辑效率。尽管人们已经在拟南芥、玉米、大豆、棉花等植物中开展了U6启动子的克隆与应用研究,然而目前在甘薯中U6启动子的相关... 在CRISPR/Cas9基因编辑系统中,U6启动子可以通过驱动sgRNA的表达来编辑目的基因,因而其转录活性会影响基因编辑效率。尽管人们已经在拟南芥、玉米、大豆、棉花等植物中开展了U6启动子的克隆与应用研究,然而目前在甘薯中U6启动子的相关研究还未见报道。本研究利用拟南芥的AtU6 SnRNA的保守序列在三浅裂野牵牛(Ipomoea trifida)基因组数据库中搜索候选U6 RNA,然后在其上游搜索到2个不同的候选U6启动子,长度分别为526 bp(IbU6p-1)和532 bp(IbU6p-2);序列比对分析结果显示,甘薯的U6启动子具有上游序列元件(USE)以及TATA-box,其序列也与拟南芥高度相似。然后,利用获得的U6启动子核酸序列构建了能够驱动萤火虫荧光素酶基因(LUC)表达的重组框U6::LUC。最后,将含有上述重组载体的根癌农杆菌瞬时转化到本氏烟草叶片和甘薯愈伤组织中,并通过荧光成像技术分析荧光素酶活性。结果发现,在烟草及甘薯愈伤组织中2个甘薯U6启动子均能驱动LUC基因表达,具有转录活性。同时,IbU6p-2的转录活性无论是在烟草叶片中还是在甘薯愈伤组织中都显著高于拟南芥U6启动子。本研究结果为进一步发展甘薯基因编辑技术提供了参考。 展开更多
关键词 甘薯 U6启动子 克隆 基因编辑 转录活性
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月季‘月月粉’与野蔷薇U6启动子的克隆及活性分析
4
作者 覃语祺 苏健馨 +3 位作者 曹雪敏 朱婉 程文翰 张蔚 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第13期2651-2661,共11页
【背景】U6启动子是CRISPR/Cas9基因编辑系统中驱动sgRNA转录的重要元件,而不同物种的U6启动子转录活性可能存在差异,且物种内源U6启动子相比物种外源U6启动子可能具有更高效的启动效率。迄今对蔷薇属(Rosa)植物的U6启动子少有报道,且... 【背景】U6启动子是CRISPR/Cas9基因编辑系统中驱动sgRNA转录的重要元件,而不同物种的U6启动子转录活性可能存在差异,且物种内源U6启动子相比物种外源U6启动子可能具有更高效的启动效率。迄今对蔷薇属(Rosa)植物的U6启动子少有报道,且尚未获得转录活性强于拟南芥U6的启动子。【目的】筛选转录活性更高的蔷薇属植物U6启动子,为后续月季和野蔷薇等蔷薇属植物CRISPR/Cas9基因编辑系统的优化和分子育种奠定基础。【方法】利用拟南芥保守的102 bp U6 snRNA序列,从中国古老月季‘月月粉’(Rosa chinensis Old Blush,OB)基因组中克隆相似性最高的6个OBU6启动子,从野蔷薇(R.multiflora)基因组中克隆相似性最高的7个RmU6启动子,并构建OBU6启动子和RmU6启动子分别驱动LUC和GUS报告基因的融合表达载体,利用农杆菌介导的瞬时转化法转染本氏烟草(Nicotiana benthamiana)叶片和月季‘萨曼莎’(R.Samantha)组培苗,通过双荧光素酶活性检测和GUS组织化学染色对月季和野蔷薇的启动子转录活性分别进行比较。【结果】‘月月粉’6个OBU6启动子和野蔷薇7个RmU6启动子均具有影响U6启动子转录活性的两个必要元件USE和TATA box。双荧光素酶活性检测和GUS组织化学染色结果显示,月季‘月月粉’OBU6启动子和野蔷薇RmU6启动子均具有转录活性,但OBU6启动子的转录活性均弱于拟南芥AtU6-1启动子。考虑到过长的U6启动子可能会削弱其转录活性,于是选取其中转录活性相对较高的OBU6-4进行5′端截短(1507、1076、574和187 bp),但截短后的启动子未能提高转录活性;而在野蔷薇中,成功筛选到一个长度为630 bp的RmU6-2启动子,其转录活性显著高于拟南芥AtU6-1启动子。【结论】从月季‘月月粉’中克隆得到6条U6启动子,从野蔷薇中克隆得到7条U6启动子,并筛选出一条转录活性显著高于拟南芥AtU6-1启动子的野蔷薇U6启动子RmU6-2,为构建蔷薇属植物CRISPR/Cas9基因组编辑系统提供了极具应用潜力的启动子。 展开更多
关键词 U6启动子 月季 蔷薇属 报告基因 瞬时表达
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The role of polymorphic cytochrome P450 gene(CYP2B6)in B-chronic lymphocytic leukemia(B-CLL)incidence and outcome among Egyptian patients
5
作者 MENNA AL-ADL MAGDY MYOUSSEF +2 位作者 AHMED EL-SEBAIE SHERIF REFAAT AFAF EL-SAID 《Oncology Research》 SCIE 2024年第4期785-797,共13页
Cytochromes P450(CYPs)play a prominent role in catalyzing phase I xenobiotic biotransformation and account for about 75%of the total metabolism of commercially available drugs,including chemotherapeutics.The gene expr... Cytochromes P450(CYPs)play a prominent role in catalyzing phase I xenobiotic biotransformation and account for about 75%of the total metabolism of commercially available drugs,including chemotherapeutics.The gene expression and enzyme activity of CYPs are variable between individuals,which subsequently leads to different patterns of susceptibility to carcinogenesis by genotoxic xenobiotics,as well as differences in the efficacy and toxicity of clinically used drugs.This research aimed to examine the presence of the CYP2B6*9 polymorphism and its possible association with the incidence of B-CLL in Egyptian patients,as well as the clinical outcome after receiving cyclophosphamide chemotherapy.DNA was isolated from whole blood samples of 100 de novo B-CLL cases and also from 100 sex-and age-matched healthy individuals.The presence of the CYP2B6*9(G516T)polymorphism was examined by PCR-based allele specific amplification(ASA).Patients were further indicated for receiving chemotherapy,and then they were followed up.The CYP2B6*9 variant indicated a statistically significant higher risk of B-CLL under different genetic models,comprising allelic(T-allele vs.G-allele,OR=4.8,p<0.001)and dominant(GT+TT vs.GG,OR=5.4,p<0.001)models.Following cyclophosphamide chemotherapy,we found that the patients with variant genotypes(GT+TT)were less likely to achieve remission compared to those with the wild-type genotype(GG),with a response percentage of(37.5%vs.83%,respectively).In conclusion,our findings showed that the CYP2B6*9(G516T)polymorphism is associated with B-CLL susceptibility among Egyptian patients.This variant greatly affected the clinical outcome and can serve as a good therapeutic marker in predicting response to cyclophosphamide treatment. 展开更多
关键词 b-CLL Xenobiotics Cytochromes P450 cyp2b6
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白纹伊蚊CYP6N3基因启动子序列的分子克隆与功能分析 被引量:2
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作者 周国理 黄炯烈 +1 位作者 吴瑜 王玲 《寄生虫与医学昆虫学报》 CAS 2002年第1期12-20,共9页
根据本室已获得的白纹伊蚊CYP6N亚家族新成员CYP6N3全长cDNA的 5′ 末端核苷酸序列 ,设计 2个反向特异引物 (GSP1和GSP2 ) ,利用 4种限制性内切酶DraⅠ、EcoRⅤ、PvuⅡ和StuⅠ分别消化白纹伊蚊溴氰菊酯抗性株高分子量基因组DNA ,消化产... 根据本室已获得的白纹伊蚊CYP6N亚家族新成员CYP6N3全长cDNA的 5′ 末端核苷酸序列 ,设计 2个反向特异引物 (GSP1和GSP2 ) ,利用 4种限制性内切酶DraⅠ、EcoRⅤ、PvuⅡ和StuⅠ分别消化白纹伊蚊溴氰菊酯抗性株高分子量基因组DNA ,消化产物与适配子连接产生 4种消化的DNA库 ,并分别以此为模板 ,进行基因步移。用特异引物GSP1与适配子引物AP1进行第 1步PCR扩增 ,然后再以第 1步PCR产物为模板、用内部特异引物GSP2与内部适配子引物AP2进行第 2次PCR扩增。将扩增产物进行T A克隆及测序。结果显示 :分别以DraⅠ、EcoRⅤ、PvuⅡ和StuⅠ消化的DNA库为模板而获得 4个长短不一的DNA序列 :80 6bp、 2 190bp、 3 0 76bp和 2 2 0 6bp ,它们均包括有CYP6N3全长cDNA5′ 非翻译区序列及氨基端开头 10个氨基酸的编码序列 ;在其ATG上游序列中均存在有若干个典型的TATA盒、Barbie盒和 或CCAAT盒、抗氧化剂反应元件或外源化合物反应元件。表明本实验已成功地获得了白纹伊蚊溴氰菊酯抗性株CYP6N3基因 4个上游启动子区序列 ,并分析、讨论了它们在蚊虫中细胞色素P45 展开更多
关键词 基因步移 白纹伊蚊 细胞色素P450 cyp6N3 启动子 分子克隆 功能
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中国部分汉族人群中IL-6基因启动子-572G/C多态性与HBV感染易感性的关系 被引量:2
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作者 戴悦 刘晓琳 +3 位作者 柴庆波 盖郁慧 李岩 刘宝国 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2009年第15期1522-1526,共5页
目的:探讨中国人群中IL-6基因启动子中单核苷酸多态性与HBV感染的遗传易感性关联.方法:提取160例HBV感染者及212例健康献血者外周血基因组DNA,用PCR-RFLP方法检测两组人群中G-174C、G-572C和G-597A三个多态性位点的基因型.性别、吸烟、... 目的:探讨中国人群中IL-6基因启动子中单核苷酸多态性与HBV感染的遗传易感性关联.方法:提取160例HBV感染者及212例健康献血者外周血基因组DNA,用PCR-RFLP方法检测两组人群中G-174C、G-572C和G-597A三个多态性位点的基因型.性别、吸烟、饮酒以及Hardy-Weinberg等采用Chi-square Test检测,多态性与HBV感染者风险关联及亚组关联的统计学分析采用非条件Logistic回归并同时校正混杂因素.结果:PCR-RFLP检测结果显示:IL-6基因启动子中G-174C和G-597A两个位点在中国人群中不存在多态性,而G-572C处的多态性在人群中普遍存在,其多态性位点等位基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律.统计分析表明该位点的多态性在两组人群中有明显的差异(G/C vs G/G,OR=2.65,P<0.05;C/C vs G/G,OR=3.31,P<0.05);亚组分析中表明<30岁的年龄组中差异显著(G/G vs G/C或C/C,OR=16.92,P<0.05).结论:在中国汉族人群中,IL-6基因启动子中-572处的多态性对于乙型肝炎的发生有着显著的易患关系,同时年龄对于这种易感关联有着协同作用. 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 IL-6基因 启动子 多态性 易感
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过表达E2F6基因抑制BRD7基因启动子活性 被引量:1
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作者 刘华英 罗晓敏 +10 位作者 李夏雨 牛朝霞 张荔茗 周鸣 彭聪 向波 李征 彭淑平 李丹 李小玲 李桂源 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期886-893,共8页
BRD7基因是采用cDNA代表性差异分析法克隆的一个新bromodomain基因(GenBank登录号AF152604).它在鼻咽癌细胞和组织中表达明显下调,过表达BRD7基因可抑制鼻咽癌细胞的生长和细胞周期的进程.前期工作已克隆了BRD7基因启动子区,并将其启动... BRD7基因是采用cDNA代表性差异分析法克隆的一个新bromodomain基因(GenBank登录号AF152604).它在鼻咽癌细胞和组织中表达明显下调,过表达BRD7基因可抑制鼻咽癌细胞的生长和细胞周期的进程.前期工作已克隆了BRD7基因启动子区,并将其启动子定位于450bp(-404~+46bp)的区域.为了进一步揭示BRD7基因在鼻咽癌细胞和组织中表达下调的分子机制,生物信息学分析表明,BRD7基因启动子-229至-243bp为一个E2F6转录因子结合位点共有序列,电泳迁移率实验结果表明转录因子E2F6特异性地结合于BRD7启动子区.荧光素酶检测和绿色荧光蛋白表达检测都证实,过表达E2F6基因能抑制BRD7基因启动子活性. 展开更多
关键词 bRD7基因 E2F6转录因子 启动子活性 荧光素酶检测技术 绿色荧光蛋白
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广西壮族与汉族白细胞介素-6基因启动子MbiⅠ多态性的分布特点
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作者 韦叶生 蓝艳 +1 位作者 徐群清 李壮 《解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期381-382,442,共3页
目的:了解白细胞介素-6基因启动子MbiⅠ多态性在中国广西不同民族中的分布。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测壮族和汉族人的白细胞介素-6基因启动子Mbi Ⅰ多态性,比较2组白细胞介素-6基因型和等位基因的分布频率。... 目的:了解白细胞介素-6基因启动子MbiⅠ多态性在中国广西不同民族中的分布。方法:应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测壮族和汉族人的白细胞介素-6基因启动子Mbi Ⅰ多态性,比较2组白细胞介素-6基因型和等位基因的分布频率。结果:在壮族人中CC基因型占56.22%、CG基因型占41.08%、GG基因型占2.70%;在汉族人中CC基因型占66.67%、CG基因型占32.32%、GG基因型占1.01%。两组白细胞介素-6基因型的分布频率差异有显著性。结论:壮族与汉族白细胞介素-6基因Mbi Ⅰ多态性分布频率差异有显著性。 展开更多
关键词 广西 壮族 汉族 白细胞介素-6 基因启动子 MbiⅠ 基因多态性 基因频率
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POU6F2-AS2靶向miR-125b调控口腔鳞状细胞癌增殖、侵袭和转移的机制
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作者 李婧 张发奎 邓智元 《中国老年学杂志》 北大核心 2024年第2期480-485,共6页
目的探讨长链非编码基因(LncRNA)-POU6F2-AS2对微小RNA(miR)-125b的调控作用及对口腔鳞状细胞癌(OSCC)增殖、侵袭和转移的影响。方法取正常口腔上皮细胞HOK和OSCC细胞系(CAL-27、TSCCa、Tca8113),采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT)-PC... 目的探讨长链非编码基因(LncRNA)-POU6F2-AS2对微小RNA(miR)-125b的调控作用及对口腔鳞状细胞癌(OSCC)增殖、侵袭和转移的影响。方法取正常口腔上皮细胞HOK和OSCC细胞系(CAL-27、TSCCa、Tca8113),采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT)-PCR检测各组细胞LncRNA-POU6F2-AS2、miR-125b表达水平。取CAL-27细胞,分为空白对照组、LncRNA-POU6F2-AS2干扰载体(Si-POU6F2-AS2)组、LncRNA干扰阴性对照(Si-NC)组、miR-125b激动剂(miR-125b-mimic)组、miR-125b激动剂阴性对照(miR-125b-NC)组。CCK-8法检测各组细胞增殖活性;Transwell小室法检测细胞迁移侵袭能力;RT-qPCR检测各组细胞LncRNA-POU6F2-AS2、miR-125b表达水平;Western印迹检测各组细增殖标记蛋白(Ki67)、侵袭迁移相关蛋白E-钙黏蛋白(cadherin)及Yes相关蛋白(YAP)、miR-125b下游调控因子-抗氧化蛋白质(PRXL2)、类胡萝卜素2相关因子(NRF)2、钙信号转导因子(TACSTD)2蛋白相对表达水平。共转染Si-POU6F2-AS2与miR-125b抑制剂(miR-125b-inhibitor)及其阴性对照试剂,并分为Si-NC+miR-125b-NC组、Si-NC+miR-125b-inhibitor组、Si-POU6F2-AS2+miR-125b-NC组、Si-POU6F2-AS2+miR-125b-inhibitor组及未转染(空白对照)组,检测各组细胞Ki67、E-cadherin、YAP蛋白相对表达水平。结果与HOK细胞系相比,OSCC细胞CAL-27、TSCCa、Tca8113中LncRNA-POU6F2-AS2表达明显升高,miR-125b表达明显降低(P<0.05)。与空白对照组比较,Si-POU6F2-AS2组及miR-125b-mimic组细胞增殖活性、侵袭迁移能力、LncRNA-POU6F2-AS2表达、Ki67、YAP、PRXL2、NRF2、TACSTD2蛋白表达明显降低,miR-125b表达、E-cadherin表达明显升高(P<0.05)。与空白对照组比较,Si-NC+miR-125b-inhibitor组细胞Ki67、YAP蛋白表达明显升高,E-cadherin表达明显降低(P<0.05);Si-POU6F2-AS2+miR-125b-NC组细胞Ki67、YAP蛋白表达明显降低,E-cadherin表达明显升高(P<0.05)。与Si-POU6F2-AS2+miR-125b-NC组相比,Si-POU6F2-AS2+miR-125b-inhibitor组细胞Ki67、YAP蛋白表达明显升高,E-cadherin表达明显降低(P<0.05)。结论敲低Lnc RNA-POU6F2-AS2可能通过上调miR-125b表达抑制OSCC细胞的恶性生物学行为。 展开更多
关键词 长链非编码基因POU6F2-AS2 微小RNA-125b 口腔鳞状细胞癌 增殖 侵袭 迁移
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FISH信号类型和染色体核型分析在ETV6/RUNX1阳性B-ALL患儿中的诊疗价值评估
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作者 高雨晴 徐鸥 胡绍燕 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第1期40-43,共4页
目的探讨FISH信号类型和染色体核型分析对ETV6/RUNX1阳性B系急性淋巴细胞白血病(B-acute lymphoblastic leukemia,B-ALL)的诊疗价值。方法收集164例ETV6-RUNX1融合阳性B-ALL患者的临床病理资料,对其染色体核型和FISH的结果进行回顾性分... 目的探讨FISH信号类型和染色体核型分析对ETV6/RUNX1阳性B系急性淋巴细胞白血病(B-acute lymphoblastic leukemia,B-ALL)的诊疗价值。方法收集164例ETV6-RUNX1融合阳性B-ALL患者的临床病理资料,对其染色体核型和FISH的结果进行回顾性分析。结果164例患者中FISH检出163例阳性,其中61例为经典阳性信号2F1R1G;102例为非经典信号,其中2F1G和1F1R2G信号类型最多,提示ETV6缺失;164例患者中有8例患儿未做染色体核型分析,31例患儿因无核分裂象未能进行染色体核型分析,可以进行核型分析的125例患儿中,正常核型106例,异常核型19例,且均未检出t(12;21)易位。结论FISH技术检测ETV6/RUNX1融合基因敏感度高,且多表现为包括ETV6缺失在内的非经典信号类型;染色体核型分析有助于发现复杂核型和超倍体,但不利于t(12;21)融合的检出。因此FISH信号类型和染色体核型分析在ETV6/RUNX1阳性B-ALL中具有不可或缺的作用。 展开更多
关键词 儿童b淋巴细胞白血病 染色体核型分析 荧光原位杂交 ETV6/RUNX1融合基因
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PXR、MDR1、CYP3A5和CYP2B6在高级别浆液性卵巢癌组织中的表达及其意义
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作者 张萍 马岚 陈桦 《精准医学杂志》 2023年第2期135-139,144,共6页
目的探讨孕烷X受体(PXR)、多药耐药蛋白1(MDR1)、细胞色素P4503A5(CYP3A5)和细胞色素P4502B6(CYP2B6)在高级别浆液性卵巢癌(high grade serous ovarian cancer,HGSOC)组织中的表达及其意义。方法选取2019年9月-2021年12月青岛市市立医... 目的探讨孕烷X受体(PXR)、多药耐药蛋白1(MDR1)、细胞色素P4503A5(CYP3A5)和细胞色素P4502B6(CYP2B6)在高级别浆液性卵巢癌(high grade serous ovarian cancer,HGSOC)组织中的表达及其意义。方法选取2019年9月-2021年12月青岛市市立医院妇科收治的56例HGSOC患者作为试验组,据其对铂类药物的耐药情况分为耐药组(24例)和敏感组(32例),另外选取妇科同期收治的16例子宫肌瘤患者作为对照组。采用免疫组织化学、实时定量荧光PCR及蛋白印迹法对试验组患者HGSOC组织和对照组患者正常输卵管组织中PXR、MDR1、CYP3A5和CYP2B6的表达情况进行检测。结果与对照组相比较,试验组患者PXR、MDR1、CYP3A5、CYP2B6阳性表达率显著升高(χ^(2)=12.879~17.174,P<0.05),mRNA相对表达量显著升高(t=9.746~17.640,P<0.05),蛋白表达量显著升高(t=13.312~60.448,P<0.05);与敏感组相比,耐药组患者PXR、MDR1、CYP3A5、CYP2B6阳性表达率显著升高(χ^(2)=4.371~8.549,P<0.05),mRNA相对表达量显著升高(t=6.859~19.000,P<0.05),蛋白表达量显著升高(t=8.693~27.670,P<0.05)。HGSOC患者PXR与CYP3A5、CYP2B6的表达呈正相关(r=0.332、0.308,P<0.05),与MDR1的表达无明显相关性(P>0.05)。结论PXR、MDR1、CYP3A5、CYP2B6在HGSOC患者的肿瘤组织中呈高表达,其可能参与HGSOC的发生发展过程。PXR、MDR1、CYP3A5和CYP2B6的表达检测可用于判断HGSOC对化疗的敏感性,有助于为术后化疗提供指导意见。 展开更多
关键词 高级别浆液性卵巢癌 PXR MDR1 cyp3A5 cyp2b6 多药耐药 化疗耐药
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精神分裂症患者CYP2D6*10基因多态性与血清利培酮浓度的量化关系研究 被引量:3
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作者 陈洁 宋明芬 +5 位作者 闫盼 王姝琪 王晟东 王泽民 王玉文 施剑飞 《浙江医学》 CAS 2023年第1期48-51,57,共5页
目的探讨精神分裂症患者细胞色素P450(CYP)2D6*10基因多态性对血清利培酮浓度的影响及其量化关系。方法选取2019年5月至2022年5月杭州市第七人民医院收治住院的接受利培酮单一治疗的精神分裂症患者197例为研究对象,采用随机数字表法分... 目的探讨精神分裂症患者细胞色素P450(CYP)2D6*10基因多态性对血清利培酮浓度的影响及其量化关系。方法选取2019年5月至2022年5月杭州市第七人民医院收治住院的接受利培酮单一治疗的精神分裂症患者197例为研究对象,采用随机数字表法分为血清利培酮浓度预测模型的预测组99例和验证组98例。采用荧光PCR法检测CYP2D6*10基因多态性,采用超高效液相色谱-串联质谱法检测治疗4周时血清利培酮浓度,运用曲线估计对CYP2D6*10基因多态性与血清利培酮浓度进行量化关系分析。结果药物剂量、CYP2D6*10代谢酶基因型与血清利培酮浓度均显著相关(均P<0.01)。不同CYP2D6*10基因型的血清利培酮浓度与药物剂量之间存在幂函数曲线拟合(r=0.84,P<0.01)。模型验证中,预测利培酮浓度和实际利培酮浓度之间高度相关(r=0.81,P<0.01)。结论不同CYP2D6*10基因型的血清利培酮浓度与药物剂量之间存在幂函数的量化关系。 展开更多
关键词 cyp2D6*10基因多态性 血清利培酮浓度 精神分裂症
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尼罗罗非鱼跨膜Bax抑制剂母体6基因Tmbim 6的克隆、表达及功能鉴定 被引量:1
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作者 巫祎琴 陈福暖 +3 位作者 张志强 江栢坚 简纪常 黄瑜 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期275-283,共9页
为了解跨膜Bax抑制剂母体6(transmembrane Bax inhibitor motif containing 6,TMBIM 6)在尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)病原体感染中的作用,利用聚合酶链式反应(PCR)对Tmbim 6基因进行克隆与鉴定,并采用实时荧光定量PCR(qPCR)分析T... 为了解跨膜Bax抑制剂母体6(transmembrane Bax inhibitor motif containing 6,TMBIM 6)在尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)病原体感染中的作用,利用聚合酶链式反应(PCR)对Tmbim 6基因进行克隆与鉴定,并采用实时荧光定量PCR(qPCR)分析Tmbim 6在健康尼罗罗非鱼(体质量为80~100 g)的组织分布模式及无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)、Poly I:C模拟病毒刺激后的表达变化。结果表明:尼罗罗非鱼Tmbim 6开放阅读框为714 bp,可编码237个氨基酸,包含6个跨膜结构域和1个C-末端基序;亚细胞定位显示,尼罗罗非鱼TMBIM 6定位于细胞质,双荧光素酶报告基因系统检测发现,Tmbim 6在HEK-293T细胞中过表达后极显著抑制NF-κB通路(P<0.01);qPCR分析显示,Tmbim 6基因在所检测的组织中广泛分布,在肝脏和肌肉中的表达量最高;经无乳链球菌感染和Poly I:C刺激后,Tmbim 6在肝脏、脾脏、头肾、脑和肠道中的表达水平均显著上调(P<0.05)。研究表明,尼罗罗非鱼TMBIM 6参与了无乳链球菌感染和Poly I:C刺激后的细胞应激过程及免疫反应。 展开更多
关键词 尼罗罗非鱼 Tmbim 6 亚细胞定位 NF-Κb 基因表达
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番茄U6启动子的克隆及CRISPR/Cas9基因编辑体系的建立 被引量:17
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作者 蒲艳 刘超 +3 位作者 李继洋 阿尔祖古丽.塔什 胡燕 刘晓东 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期315-326,共12页
【目的】从番茄中克隆高效转录的SlU6启动子,构建CRISPR/Cas9基因编辑载体,并在番茄中建立CRISPR/Cas9系统,为番茄功能基因组学和分子育种研究提供技术基础。【方法】采用PCR方法从‘中蔬四号’番茄品种中克隆4种SlU6启动子,利用Transfe... 【目的】从番茄中克隆高效转录的SlU6启动子,构建CRISPR/Cas9基因编辑载体,并在番茄中建立CRISPR/Cas9系统,为番茄功能基因组学和分子育种研究提供技术基础。【方法】采用PCR方法从‘中蔬四号’番茄品种中克隆4种SlU6启动子,利用Transfer PCR方法分别对4个启动子进行两种不同长度的截短,分别构建8个截短的SlU6启动子驱动GUS的植物融合表达载体。利用农杆菌瞬时转化法分别转染番茄叶片,通过GUS染色筛选出在番茄叶片中转录活性较高的SlU6-2启动子。采用DNA重组技术构建以SlU6-2为启动子驱动sg RNA,以番茄白粉病相关基因MLO1和EDR1为靶序列的CRISPR/Cas9基因组编辑载体。载体构建成功后,采用PEG法转化番茄原生质体,提取基因组DNA,采用酶切/PCR法分析内源基因突变情况;采用测序法分析内源基因突变的类型。利用突变位点频率分布图来验证番茄内源启动子在番茄CRISPR/Cas9系统中的有效性。【结果】经过两轮PCR,共获得4种8个不同长度的番茄U6启动子,其长度分别是452、202、448、206、433、190、448和218 bp,启动子序列比对分析发现番茄U6启动子与拟南芥U6启动子一样,也含有比较保守的两个元件,USE和TATA框。成功构建了8个SlU6启动子分别驱动GUS的植物融合表达载体。番茄叶片染色结果显示转化后的番茄叶片均被染成蓝色,表明克隆的番茄8个SlU6启动子均具有转录活性。选择SlU6-2P4为启动子驱动sg RNA,成功构建番茄白粉病相关基因MLO1和EDR1为靶序列的CRISPR/Cas9基因组编辑载体,验证结果表明番茄内源启动子SlU6-2P4能有效地驱动sg RNA的转录,并成功实现对番茄内源基因的编辑。内源基因突变的类型都为碱基替换,突变热点仅存在于内源基因靶序列区。【结论】成功克隆了4种在番茄叶片中高效转录的SlU6启动子;基于SlU6-2启动子的CRISPR/Cas9基因组编辑载体,在番茄中成功实现对内源基因的编辑。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 SlU6启动子 克隆 番茄 基因编辑
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内质网应激对ATF6调控XBP1启动子转录的影响 被引量:11
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作者 赵文君 朱慧芳 +3 位作者 周菁华 李祥柱 刘艳娜 郭风劲 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期317-321,共5页
目的确定XBP1启动子的转录核心区域,探讨激活转录因子6(ATF6)在内质网应激(ERS)与非ERS状态下对XBP1启动子转录活性的调控作用。方法采用基因重组技术构建ATF6基因及两个缺失体ATF6s1p、ATF6s2p的真核表达载体pcDNA3.1(-)-ATF6、pcDNA3.... 目的确定XBP1启动子的转录核心区域,探讨激活转录因子6(ATF6)在内质网应激(ERS)与非ERS状态下对XBP1启动子转录活性的调控作用。方法采用基因重组技术构建ATF6基因及两个缺失体ATF6s1p、ATF6s2p的真核表达载体pcDNA3.1(-)-ATF6、pcDNA3.1(-)-s1p、pcDNA3.1(-)-s2p,以及XBP1启动子报告基因载体pGL3-XBP1。针对XBP1启动子的各个组成元件设计和构建XBP1一系列截短体的报告基因载体。采用双荧光素酶报告基因法检测并确定XBP1启动子的核心启动子区,Western blotting检测ATF6及缺失体s2p、s1p在ERS与非ERS状态下对XBP1核心启动子区转录的调控作用。结果 XBP1启动子的-407bp-+133bp区域是转录活性调控的核心区域,-2000bp--407bp区域不具有转录活性,该区域可能含有抑制转录活性的组成元件。非ERS状态时,ATF6及两个缺失体s2p、s1p可明显上调XBP1启动子的转录活性及XBP1蛋白表达;而在ERS状态时,ATF6及两个缺失体s2p、s1p下调了XBP1启动子的转录活性和XBP1蛋白表达。结论 ATF6对XBP1的转录调控作用在ERS状态和非ERS状态下存在差异。非ERS状态时,ATF6上调XBP1的转录和表达,而ERS状态时,ATF6下调XBP1的转录和表达。 展开更多
关键词 激活转录因子6 基因表达调控 转录启动子
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中国苗族CYP2D6*10B基因多态性研究 被引量:6
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作者 雷霆雯 许庆忠 +2 位作者 吴宁 李红 吴青青 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期439-440,共2页
关键词 中国 苗族 cyp2D6*10b基因 基因多态性 羟化反应
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IL-6和IL-18基因启动子多态性与广东汉族人群类风湿性关节炎相关性研究 被引量:8
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作者 黄宪章 庄俊华 +2 位作者 任燕歌 周罗晶 周强 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1661-1664,共4页
目的了解我国广东地区汉族人群白细胞介素-6(IL-6)和白细胞介素-18(IL-18)基因启动子单核苷酸多态性及与类风湿性关节炎(RA)的相关性。方法应用序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)技术检测168名健康体检者和120例RA患者的IL-6基因启... 目的了解我国广东地区汉族人群白细胞介素-6(IL-6)和白细胞介素-18(IL-18)基因启动子单核苷酸多态性及与类风湿性关节炎(RA)的相关性。方法应用序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)技术检测168名健康体检者和120例RA患者的IL-6基因启动子-572和-174及IL-18基因启动子-607C/A和-137G/C单核苷酸多态性。结果对照组和患者组IL-6基因启动子-572位点、-174位点和IL-18基因启动子-607C/A位点、-137G/C位点均存在单核苷酸多态性。IL-6-572位点、-174位点和IL-18-607位点基因型和等位基因频率分布在RA组和对照组间差异均有显著性(P<0.001)。IL-18-137位点基因型频率在两组间无统计学意义(P=0.141),但等位基因分布频率在两组间差异有显著性(P=0.024)。经Logistic回归分析,年龄、性别、IL-6-572位点、-174位点和IL-18-137位点与RA有相关性(P<0.05)。结论广东汉族人群IL-6基因启动子-572和-174单核苷酸多态性与RA可能相关,IL-18基因启动子-607C/A和-137G/C单核苷酸多态性与RA是否相关需进一步研究。 展开更多
关键词 类风湿性关节炎 白细胞介素-6 白细胞介素-18 基因多态性 启动子
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木薯低温诱导基因MeLTI6A的启动子的克隆与序列分析 被引量:5
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作者 黎娟华 孙海彦 +3 位作者 阮孟斌 赵平娟 曾长英 彭明 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2013年第11期2164-2171,共8页
MeLTI6A(Manihot esculenta low temperature inducible 6A)是木薯低温干旱诱导基因,本研究从MeLTI6A的序列出发,利用电子克隆设计引物进行PCR扩增的方法获得该基因的启动子,其序列共1 304 bp。生物信息学分析发现该启动子中具有真核生... MeLTI6A(Manihot esculenta low temperature inducible 6A)是木薯低温干旱诱导基因,本研究从MeLTI6A的序列出发,利用电子克隆设计引物进行PCR扩增的方法获得该基因的启动子,其序列共1 304 bp。生物信息学分析发现该启动子中具有真核生物典型的核心启动子区(TATA-box和CAAT-box),并利用α-互补,蓝白斑筛选原理验证了该启动子核心序列具有活性;该启动子具有与干旱胁迫相关的激素类(如脱落酸、乙烯)的响应元件和逆境胁迫(如低温、干旱胁迫)的响应元件;还具有与木薯组织特异表达相关的调控元件和其它光响应元件;并通过Real time PCR检测了低温胁迫(4℃)下的木薯组培苗中MeLTI6A的表达变化,说明了该启动子区的低温胁迫顺式作用响应元件可能调节MeLIT6A在低温胁迫下的表达。这些说明木薯的MeLIT6A基因可能是通过对干旱胁迫激素信号响应以及逆境胁迫响应起作用,使木薯获得一定的抗胁迫的能力,同时还可能参与了木薯相关组织发育过程的调控。本研究有利于对MeLTI6A基因抗逆境胁迫功能的理解,为探索木薯高效抗逆的分子机制作初步研究。 展开更多
关键词 木薯 启动子 木薯低温诱导基因MeLTI6A 启动子序列分析
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IL-6基因启动子区-634C/G多态性与糖尿病肾病的相关性 被引量:5
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作者 安新焕 宋滇平 +3 位作者 刘华 王玉明 段勇 冯霞 《中国糖尿病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期289-291,共3页
目的探讨白细胞介素6(IL-6)基因启动子区-634C/G多态性与糖尿病肾病(DN)的关系。方法在昆明地区汉族人中,应用PCR-RFLP方法和等位特异PCR(ASPCR)方法,对246例2型糖尿病(T2DM)患者(正常白蛋白尿组88例,微量白蛋白尿组93例,大量白蛋白尿... 目的探讨白细胞介素6(IL-6)基因启动子区-634C/G多态性与糖尿病肾病(DN)的关系。方法在昆明地区汉族人中,应用PCR-RFLP方法和等位特异PCR(ASPCR)方法,对246例2型糖尿病(T2DM)患者(正常白蛋白尿组88例,微量白蛋白尿组93例,大量白蛋白尿组65例)和101例健康对照者(NC组)的IL-6基因启动子区-634C/G多态性进行检测。结果(1)微量白蛋白尿组、大量白蛋白尿组、微量、大量白蛋白尿组的G/G基因型频率均高于正常白蛋白尿组(P=0.001),大量白蛋白尿组亦高于微量白蛋白尿组(P=0.045)。(2)大量白蛋白尿组和大量、微量白蛋白尿组的G等位基因频率均高于正常白蛋白尿组(P=0.031),大量白蛋白尿组亦高于微量白蛋白尿组(P=0.005)。(3)T2DM组中,GG基因型组UAER明显高于CG、CC基因型组(P<0.01)。(4)Logistic回归分析表明:IL-6基因启动子区-634G/G基因型、病程是DN发生的危险因素。结论在昆明地区汉族人中,IL-6基因启动子区-634G/G基因型可能是DN发生的危险因素,此基因型携带者UAER明显增高;G等位基因可能是DN发展的危险因素之一。 展开更多
关键词 白细胞介素6 基因 启动子 多态性 糖尿病肾病
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