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中华按蚊CYP6P5基因的生物信息学鉴定及特征分析
被引量:
6
1
作者
车燕飞
张玉娟
+2 位作者
唐尧
洪瑞
陈斌
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2014年第3期205-210,共6页
目的鉴定中华按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征,为研究中华按蚊CYP6P5基因杀虫剂抗性机制提供理论依据。方法以催命按蚊基因CYP6P5为询问基因,基于中华按蚊转录组测序数据,采用双向Blast方法搜寻中华按蚊CYP6P5cDNA序列。利用生物信...
目的鉴定中华按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征,为研究中华按蚊CYP6P5基因杀虫剂抗性机制提供理论依据。方法以催命按蚊基因CYP6P5为询问基因,基于中华按蚊转录组测序数据,采用双向Blast方法搜寻中华按蚊CYP6P5cDNA序列。利用生物信息学相关软件对该基因编码蛋白序列的一级结构、疏水区、跨膜区、结构域、3D结构等进行预测分析,并采用最大似然法(maximumlikelihood,ML)建立代表性蚊种的系统发育关系。结果搜索获得1条中华按蚊CYP6P5全长cDNA序列。该cDNA序列具备P450超家族和CYP6家族特征性的保守序列,命名为CYP6P5(GenBank登录号:KF358704)。该cDNA全长为1583bp,开放阅读框为1527bp,编码508个氨基酸,推测其相对分子质量为58.32×10-3,等电点为7.17。分析表明该基因编码的蛋白序列第5~21位氨基酸是疏水区,第5~22位氨基酸是跨膜区,第36~505位氨基酸是P450保守结构域,并具有多个酶活性位点。系统发育关系和相似性分析表明,中华按蚊CYP6P5与催命按蚊CYP6P5和冈比亚按蚊CYP6P5亲缘关系最近,形成一个单系,相似率分别为89.4%和89.0%。结论为进一步研究中华按蚊CYP6P5基因溴氰菊酯抗性的分子机制奠定了基础。
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关键词
细胞色素P450
中华按蚊
cyp6p5
鉴定
生物信息学分析
原文传递
题名
中华按蚊CYP6P5基因的生物信息学鉴定及特征分析
被引量:
6
1
作者
车燕飞
张玉娟
唐尧
洪瑞
陈斌
机构
重庆师范大学生命科学学院
出处
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2014年第3期205-210,共6页
基金
美国国立卫生研究院NIH项目(R01AI095184)
国家自然科学基金(31071968
+2 种基金
31372265)
重庆市科技攻关重点项目(CSTC2012GG.YYJSB80002)
"两江学者"计划专项经费~~
文摘
目的鉴定中华按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征,为研究中华按蚊CYP6P5基因杀虫剂抗性机制提供理论依据。方法以催命按蚊基因CYP6P5为询问基因,基于中华按蚊转录组测序数据,采用双向Blast方法搜寻中华按蚊CYP6P5cDNA序列。利用生物信息学相关软件对该基因编码蛋白序列的一级结构、疏水区、跨膜区、结构域、3D结构等进行预测分析,并采用最大似然法(maximumlikelihood,ML)建立代表性蚊种的系统发育关系。结果搜索获得1条中华按蚊CYP6P5全长cDNA序列。该cDNA序列具备P450超家族和CYP6家族特征性的保守序列,命名为CYP6P5(GenBank登录号:KF358704)。该cDNA全长为1583bp,开放阅读框为1527bp,编码508个氨基酸,推测其相对分子质量为58.32×10-3,等电点为7.17。分析表明该基因编码的蛋白序列第5~21位氨基酸是疏水区,第5~22位氨基酸是跨膜区,第36~505位氨基酸是P450保守结构域,并具有多个酶活性位点。系统发育关系和相似性分析表明,中华按蚊CYP6P5与催命按蚊CYP6P5和冈比亚按蚊CYP6P5亲缘关系最近,形成一个单系,相似率分别为89.4%和89.0%。结论为进一步研究中华按蚊CYP6P5基因溴氰菊酯抗性的分子机制奠定了基础。
关键词
细胞色素P450
中华按蚊
cyp6p5
鉴定
生物信息学分析
Keywords
Cytochrome P450
Anopheles sinensis
CYP6PS
Identification
Bioinformatic analysis
分类号
R384.1 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中华按蚊CYP6P5基因的生物信息学鉴定及特征分析
车燕飞
张玉娟
唐尧
洪瑞
陈斌
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2014
6
原文传递
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参考文献
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