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基于基因组和转录组的丹参酮生物合成相关基因SmCYP71AU66的筛选 被引量:3
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作者 于浩滢 高冉冉 +1 位作者 徐志超 闵伟红 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2019年第5期859-866,共8页
目的:以丹参基因组及全长转录组数据库为基础,对丹参酮生物合成关键酶基因进行预测,进一步推进丹参酮生物合成途径的解析。方法:结合丹参中CYP450s的系统发育鉴定丹参CYP71clan成员,采用生物信息技术分析其差异表达、基因结构和保守基序... 目的:以丹参基因组及全长转录组数据库为基础,对丹参酮生物合成关键酶基因进行预测,进一步推进丹参酮生物合成途径的解析。方法:结合丹参中CYP450s的系统发育鉴定丹参CYP71clan成员,采用生物信息技术分析其差异表达、基因结构和保守基序等;克隆候选基因并进行理化特性和蛋白结构等分析。结果:从丹参基因组注释到161个CYP71clan成员,分为16个家族,其中CYP71家族成员有64个,数量最多且结构域保守。转录组表达分析显示CYP71clan中36%的基因高表达(FPKM> 10)。克隆到基因SmCYP71AU66全长1503bp,编码500个氨基酸,在丹参根的周皮部位显著高表达,符合丹参酮在丹参体内的分布规律,预测该基因是丹参酮生物合成途径中的关键酶基因。结论:本研究为丹参酮合成相关基因的挖掘以及生物合成途径的解析提供参考。 展开更多
关键词 丹参酮 生物合成 cyp71clan Smcyp71AU66
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过量表达cyp71av1和cpr基因提高青蒿中青蒿素的含量 被引量:13
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作者 景福远 张凌 +1 位作者 李美芽 唐克轩 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2008年第3期64-70,共7页
青蒿素是从青蒿植株地上部分提取的一种含有过氧桥结构的倍半萜内酯,是目前最有效的治疗疟疾的药物。为了提高青蒿中青蒿素的含量,根据GenBank中青蒿紫穗槐二烯氧化酶(CYP71AV1)和细胞色素P450还原酶(CPR)的基因序列设计特异引物,从青蒿... 青蒿素是从青蒿植株地上部分提取的一种含有过氧桥结构的倍半萜内酯,是目前最有效的治疗疟疾的药物。为了提高青蒿中青蒿素的含量,根据GenBank中青蒿紫穗槐二烯氧化酶(CYP71AV1)和细胞色素P450还原酶(CPR)的基因序列设计特异引物,从青蒿cDNA中扩增出了cyp71av1和cpr基因片段,分别连上CaMV35S启动子和NOS终止子,然后将cyp71av1和cpr基因的表达盒依次插入到植物表达载体pCAM-BIA2300中,获得含有cyp71av1和cpr基因的植物表达载体p2300-GYR。通过农杆菌介导法转化青蒿,获得了20株转基因植株,PCR检测以及Southern杂交分析证实外源基因已被成功地导入青蒿基因组中。采用HPLC-ELSD测定转基因青蒿中青蒿素的含量,结果表明,大部分转基因青蒿中青蒿素的含量高于对照植株,其中,转基因青蒿中青蒿素含量最高约为对照的2.4倍。该研究证明过量表达cyp71av1和cpr基因是提高青蒿中青蒿素含量的有效方法。 展开更多
关键词 青蒿 青蒿素 cyp71av1基因 cpr基因
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烟草CYP71D亚家族的生物信息学分析 被引量:3
3
作者 王蕾 赵泽玉 +1 位作者 陈明丽 龚达平 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2020年第2期79-85,92,共8页
细胞色素P450(CYP450)是一类超基因家族编码的多功能氧化酶,在生物合成、代谢解毒及植物防御方面具有重要作用。其中CYP71D属于CYP450的一个亚家族,主要在次生代谢物合成和病虫害防御方面起作用。为了更好地了解烟草CYP71D亚家族基因特... 细胞色素P450(CYP450)是一类超基因家族编码的多功能氧化酶,在生物合成、代谢解毒及植物防御方面具有重要作用。其中CYP71D属于CYP450的一个亚家族,主要在次生代谢物合成和病虫害防御方面起作用。为了更好地了解烟草CYP71D亚家族基因特征和功能,本研究利用生物信息学分析手段及烟草转录组数据,对CYP71D亚家族基因的结构和表达等进行了分析。结果发现,在烟草中共有42个CYP71D亚家族成员,各成员在染色体上并非均匀分布,其氨基酸长度和等电点差异较大,但基因结构、保守结构域数目和分布高度一致;二级结构分析表明,烟草CYP71D亚家族成员具备P450蛋白特征结构域;基因表达模式分析显示,多数CYP71D基因在根、叶、花中特异表达,大部分基因参与了IAA激素、黑胫病、温度等逆境胁迫反应。这为烟草CYP71D亚家族基因功能的深入研究及烟草抗逆品种的培育奠定了基础。 展开更多
关键词 烟草 cyp71D亚家族 生物信息学分析
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CYP71AV1和CPR基因在转基因青蒿后代中的遗传分析 被引量:1
4
作者 王涛 沈乾 +2 位作者 陆续 江伟民 唐克轩 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2012年第4期8-14,30,共8页
为研究CYP71AV1和CPR基因在转基因青蒿后代中的遗传及表达特性,在获得共转CYP71AV1和CPR基因青蒿(GYR)T0代的基础上,对其T2代用普通PCR和Southern Blot分别检测了目标基因分离比及部分植株中目标基因拷贝数;利用实时定量PCR分析了部分... 为研究CYP71AV1和CPR基因在转基因青蒿后代中的遗传及表达特性,在获得共转CYP71AV1和CPR基因青蒿(GYR)T0代的基础上,对其T2代用普通PCR和Southern Blot分别检测了目标基因分离比及部分植株中目标基因拷贝数;利用实时定量PCR分析了部分植株中目标基因的转录水平;利用HPLC-ELSD测定了其青蒿素含量;对其关键农艺性状也进行了测定。结果表明虽然目标基因在世代间可以顺利遗传,但其拷贝数则有一些不规则的变化,转基因位点的纯合较难实现;目标基因的表达也受到基因组的修饰限制系统影响。T2代青蒿素含量最高的一组平均含量比对照提高46.9%,植株鲜重和叶片干重则没有显著差异。本研究为进一步获得遗传稳定的转基因青蒿株系打下了基础。 展开更多
关键词 青蒿素 cyp71AV1基因 CPR基因 转基因后代
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白粉菌诱导月季对甜菜夜蛾产生抗性的关键候选基因筛选及CYP71的生物信息学分析 被引量:1
5
作者 刘思琪 杨琦 +2 位作者 王科建 李云仙 杨发忠 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1601-1611,共11页
【目的】通过检测白粉菌侵染月季后转录组基因的表达量变化,筛选白粉菌诱导月季产生对甜菜夜蛾抗性的关键候选基因,为月季抗虫基因的功能研究及抗虫品种的培育提供参考。【方法】以月季品种艳粉(Rosa chinensis Jacq.)为研究材料,利用... 【目的】通过检测白粉菌侵染月季后转录组基因的表达量变化,筛选白粉菌诱导月季产生对甜菜夜蛾抗性的关键候选基因,为月季抗虫基因的功能研究及抗虫品种的培育提供参考。【方法】以月季品种艳粉(Rosa chinensis Jacq.)为研究材料,利用二代测序技术对白粉菌侵染月季前后基因的表达量进行转录组测序。利用RSEM对基因的表达水平进行定量分析,DESeq2软件进行表达差异分析,利用KOBAS将得到的差异表达基因进行KEGG富集分析。对筛选出的可能参与三萜类物质生物合成的CYP71D差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)进行生物信息学分析,并分析了CYP71D蛋白与抗虫性的关系。【结果】转录组测序共检测到差异表达基因1 646个,共643个差异表达基因被富集到81条KEGG通路中,其中31个差异表达基因与萜类合成相关。生物信息学分析结果表明了CYP71D亚家族的物种特异性。在植物中CYP71A主要参与类单萜的生物合成,CYP71D主要参与单萜类、倍半萜类、二萜类、三萜类等与抗病、虫有关的次生代谢物的生物合成。【结论】月季细胞色素P450超家族蛋白酶中CYP71簇的CYP71A、 CYP71D亚家族可能与三萜化合物Dehydro(11,12)ursolicacid lactone(DUA)的生物合成有关,表明CYP71D家族蛋白参与修饰三萜化合物的底物识别位点,本研究为探索寄主植物介导的间接的病虫互作机理的研究提供了一定的思路。 展开更多
关键词 月季 白粉菌 三萜类化合物 甜菜夜蛾 cyp71 生物信息学
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烟草CYP71基因的克隆与原核优化表达 被引量:1
6
作者 佟硕秋 高洁 +2 位作者 钟杰 贡献 吴拥军 《山地农业生物学报》 2018年第1期12-16,共5页
本文从烟草中克隆出CYP71基因,进行生物信息学分析,并在原核细胞中表达出目的蛋白。应用RTPCR,从野生型烟草(Nicotiana tabacum)叶片中克隆出一种CYP450 c DNA序列(CYP71)。序列分析表明,烟草CYP71基因ORF长为1545 bp,编码514个氨基酸,... 本文从烟草中克隆出CYP71基因,进行生物信息学分析,并在原核细胞中表达出目的蛋白。应用RTPCR,从野生型烟草(Nicotiana tabacum)叶片中克隆出一种CYP450 c DNA序列(CYP71)。序列分析表明,烟草CYP71基因ORF长为1545 bp,编码514个氨基酸,基因登录号为KC480444.1。将去除跨膜信号肽及密码子优化后的基因合成后,构建至p ET-30a表达载体,转化到大肠杆菌Rosetta(DE3)中,经IPTG诱导和SDS-PAGE电泳、Western-blot检测,获得与预期一致的49 KDa蛋白质,为进一步研究CYP71基因的抗虫功能奠定了基础。 展开更多
关键词 烟草 cyp71 基因克隆 生物信息学分析 原核表达
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番茄CYP71基因的克隆及其功能的初步分析
7
作者 郝彦伟 李正国 +2 位作者 杨迎伍 邓伟 苏丽艳 《热带作物学报》 CSCD 2009年第12期1813-1817,共5页
分析番茄的EST数据库,获得一条在番茄果实中表达的EST序列CYP71,通过RT-PCR分析表明,该基因在番茄的叶、花、果实中均有表达,其中幼果中表达最强,并受到乙烯的负调控,推测可能与果实的发育成熟相关。进而通过RACE(rapid amplification o... 分析番茄的EST数据库,获得一条在番茄果实中表达的EST序列CYP71,通过RT-PCR分析表明,该基因在番茄的叶、花、果实中均有表达,其中幼果中表达最强,并受到乙烯的负调控,推测可能与果实的发育成熟相关。进而通过RACE(rapid amplification of cDNA ends)的方法获得了全长为1637bp的番茄CYP71基因(GenBank accession No.GQ370622)。该片段包括一个完整的开放阅读框(1488bp),编码495个氨基酸。通过系统进化树分析,属于CYP71家族。将番茄的CYP71基因定向克隆到植物表达载体pBI121中,获得CYP71基因的正、反义植物表达载体pBI121-CYP71s和pBI121-CYP71as,为深入研究该基因的功能奠定基础。 展开更多
关键词 番茄 cyp71基因 RACE技术 植物表达载体
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蒜头果中CYP71基因克隆与果实不同发育时期的表达分析 被引量:1
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作者 原晓龙 陈中华 +1 位作者 李云琴 王毅 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期501-508,共8页
由氨基酸衍生的氰苷是由植物细胞色素P450单加氧酶(CYP)催化氨基酸生成的次生代谢产物,与植物的防御和抗逆境胁迫相关。该研究通过分析蒜头果转录组数据,从中分离并克隆得到1条细胞色素P450基因(命名为MoCYP71,GenBank登录号为MK172858)... 由氨基酸衍生的氰苷是由植物细胞色素P450单加氧酶(CYP)催化氨基酸生成的次生代谢产物,与植物的防御和抗逆境胁迫相关。该研究通过分析蒜头果转录组数据,从中分离并克隆得到1条细胞色素P450基因(命名为MoCYP71,GenBank登录号为MK172858),对其进行生物信息学分析并检测该基因在果实不同发育时期的表达情况。结果表明:MoCYP71基因含1572 bp,编码523个氨基酸,该基因的cDNA序列与咖啡(Coffea eugenioides,XM027319282)、小果咖啡(Coffea arabica,XM027213456)中的CYP71基因的mRNA序列均有88%的一致性;MoCYP71蛋白的相对分子质量为58976.54,理论等电点pI为8.10,分子式为C2675H4184N704O744S27,不稳定系数(Ⅱ)为40.84,是一种不稳定蛋白;该蛋白不存在信号肽,存在于分泌途径,含有两个跨膜结构,分别位于20~37和311~333位的氨基酸为跨膜疏水螺旋,锚定于细胞器上;该蛋白含有CYP家族的保守结构域,包括脯氨酸富集区(PPSPPRLP)、K螺旋(KETFR)、I螺旋(GGIDTS)、PERF域(PERF)和识别结构域血红素结合域(FGAGRRICPG),与可可、榴莲、高粱等的CYP71E家族的蛋白(GenBank登录号分别为EOX92908.1、XP022773875.1和AAC39318.1)聚为一支;在花谢后,MoCYP71基因表达量逐渐降低,花谢后1个月>2个月>3个月,但在花谢后4个月的表达量急剧增加。以上结果对研究蒜头果的对虫害的防御、组织成熟及蒜头果中有效次生代谢产物的发掘具有重要意义。 展开更多
关键词 蒜头果 cyp71基因 氰苷 生物信息学分析 基因表达
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金丝楸CbuCYP71D15基因克隆及表达分析
9
作者 徐艳红 于晓池 +3 位作者 易飞 王军辉 梁宏伟 麻文俊 《中南林业科技大学学报》 CAS 2024年第8期150-158,168,共10页
【目的】通过对金丝楸CbuCYP71D15基因的分子特征和表达模式进行研究分析,为揭示CbuCYP71D15基因在金丝楸心材颜色形成过程中的作用提供参考依据。【方法】基于金丝楸木材样本的转录组数据,采用常规PCR扩增技术克隆获得CbuCYP71D15基因... 【目的】通过对金丝楸CbuCYP71D15基因的分子特征和表达模式进行研究分析,为揭示CbuCYP71D15基因在金丝楸心材颜色形成过程中的作用提供参考依据。【方法】基于金丝楸木材样本的转录组数据,采用常规PCR扩增技术克隆获得CbuCYP71D15基因的编码区序列(CDS)全长,利用ProtParam,Protscale,PSORT Prediction等在线工具对CbuCYP71D15基因进行基础生物信息学分析。根据转录组数据,探究CbuCYP71D15基因在边材中的表达水平。同时,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的方法分析该基因在金丝楸不同组织部位中的表达模式。【结果】成功克隆得到长为1497 bp的CbuCYP71D15基因序列,生物信息学分析显示该基因编码498个氨基酸,相对分子量为56.5 kD,理论等电点为9.16,是稳定的亲水蛋白,其二级结构主要由α螺旋(46.18%)和无规则卷曲(34.34%)组成,存在跨膜区段。通过序列比对及系统进化分析发现,CbuCYP71D15基因所编码的氨基酸序列与芝麻的同源序列相似度最高,同源蛋白遗传关系最近,且CYP71Ds在进化过程中是保守的,CbuCYP71D15蛋白具有细胞色素P450超家族特征的保守结构域及血红素结合位点,属于CYP71家族。转录组数据分析显示CbuCYP71D15基因在边材中的表达水平与1,4-萘醌类化合物在边材中的表达趋势一致。qRT-PCR分析表明,CbuCYP71D15基因在金丝楸各组织部位均有表达,在边材中表达水平最高,根中表达水平最低。【结论】CbuCYP71D15基因可能在金丝楸心材呈色物质的合成代谢过程中起到羟化作用,可为进一步解析CbuCYP71D15基因在金丝楸中的生物学功能提供依据。 展开更多
关键词 金丝楸 cyp71D15 基因克隆 表达分析
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二倍体紫苏CYP71基因家族的鉴定和生物信息学分析 被引量:1
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作者 刘鸣茹 朱永平 陈莎 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期160-170,共11页
目的:CYP71是细胞色素P450中CYP71簇(CYP71clan)中的其中一个家族,在次生代谢产物尤其是萜类化合物的生物合成中起到至关重要的作用。为了更好地了解二倍体紫苏CYP71基因家族的特征并预测其功能,该研究利用生物信息学方法对二倍体紫苏CY... 目的:CYP71是细胞色素P450中CYP71簇(CYP71clan)中的其中一个家族,在次生代谢产物尤其是萜类化合物的生物合成中起到至关重要的作用。为了更好地了解二倍体紫苏CYP71基因家族的特征并预测其功能,该研究利用生物信息学方法对二倍体紫苏CYP71基因家族进行鉴定和系统性分析。方法:在二倍体紫苏PC99全基因组的基础上,根据CYP71基因家族共有的保守结构域进行筛选,利用美国国家生物技术信息中心(NCBI)、TBtools、MEME、MEGA、Cytoscape等工具对二倍体紫苏CYP71基因家族的序列特征、基因结构、染色体定位、系统发育、顺式作用元件等进行分析。结果:在二倍体紫苏中共鉴定出68个CYP71基因,不均匀的分布在34条染色体上,属于2个亚家族,编码的氨基酸数目介于481~530,等电点在5.70~9.03,相对分子质量为54 217.07~60 031.79 Da,含有10个保守基序,富集分析和功能注释结果显示共富集到11个通路和114个类别,功能注释主要集中在生物过程中,在CYP71基因的启动子区存在多种顺式作用元件,主要为光响应和茉莉酸甲酯响应元件,蛋白质-蛋白质相互作用分析表明CYP71蛋白具有多种功能比如具有萜烯环化酶活性。结论:该研究为CYP71基因家族的功能研究奠定基础,并为紫苏单萜类化合物的生物合成和定向培育优良品种提供参考。 展开更多
关键词 紫苏 二倍体 cyp71 基因家族 生物信息学 功能分析
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黄花蒿cyp71av1启动子的分离及表达特性分析 被引量:4
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作者 杨瑞仪 杨雪芹 +1 位作者 冯丽玲 曾庆平 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期765-769,共5页
目的从黄花蒿中分离鉴定青蒿素生物合成途径关键酶——细胞色素P450单加氧酶编码基因(cyp71av1)的启动子序列并研究其表达特性,探索提高该基因表达量并进一步促进青蒿素合成的途径。方法采用热不对称嵌套PCR法从黄花蒿DNA中分离cyp71av... 目的从黄花蒿中分离鉴定青蒿素生物合成途径关键酶——细胞色素P450单加氧酶编码基因(cyp71av1)的启动子序列并研究其表达特性,探索提高该基因表达量并进一步促进青蒿素合成的途径。方法采用热不对称嵌套PCR法从黄花蒿DNA中分离cyp71av1 5’端非翻译区序列,构建与β-葡萄糖苷酸酶(GUS)报告基因融合的植物表达载体,通过农杆菌介导转化烟草。采用GUS组织化学染色法和分光光度法分别定性和定量检测cyp71av1 5’端非翻译区序列调控GUS基因在正常条件和胁迫条件下的表达。结果从黄花蒿中分离出长短2个cyp71av1 5’端非翻译区序列,分别获得与GUS基因融合表达的转基因烟草,均能检测到GUS活性且两者无明显差异。GUS活性定量检测结果还显示,在脱水、4℃和紫外辐射条件下,转化烟草GUS活性提高1.4~2.7倍。结论从黄花蒿分离出的2个cyp71av1 5’端非翻译区序列都具有启动子功能,并且具有环境诱导表达特性。 展开更多
关键词 黄花蒿 cyp71av1 启动子 青蒿素 β-葡萄糖甘酸酶(GUS)
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高粱抗虫基因CYP71E1表达载体的Gateway技术构建 被引量:2
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作者 霍岩 李金红 付莉 《农药》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期661-664,共4页
[目的】探讨高梁HCN途径关键酶CYP71EI基因对玉米幼苗抗螟虫的影响,为培育抗玉米螟新品种奠定基础。[方法】以高梁自交系BTx623幼苗总RNA为模板,反转录成cDNA,利用聚合酶链式反应(PCR)扩增出1854bp的CYP71E1基因全长。利用基于位... [目的】探讨高梁HCN途径关键酶CYP71EI基因对玉米幼苗抗螟虫的影响,为培育抗玉米螟新品种奠定基础。[方法】以高梁自交系BTx623幼苗总RNA为模板,反转录成cDNA,利用聚合酶链式反应(PCR)扩增出1854bp的CYP71E1基因全长。利用基于位点特异性重组的Gateway技术,通过TOPO克隆将该基因克隆到入门克隆(vCRw8/GW/TOP00),在LR克隆酶作用下将入门克隆重组到表达载体(pMDC141)中。【结果】成功构建pMDC141-CYP71E1表达载体并将构建好的表达载体导人农杆菌EHA105,PCR和测序表明所构建的载体及获得的工程菌与预期的完全一致。【结论】Gateway克隆技术与传统的克隆方法相比具有阳性克隆率高、快速、灵活等优点。 展开更多
关键词 高粱 表达载体 GATEWAY cyp71E1
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青蒿素生物合成关键酶CYP71AV1的表达纯化和晶体培养
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作者 史超 邓洁 常振战 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第15期3064-3069,共6页
疟疾是一种严重危害人类健康的世界性流行疾病,在青蒿素广泛应用之前,全世界每年约4亿人次感染疟疾,至少有100万人的死亡病例。因此疟疾被世界卫生组织列为世界三大死亡疾病之一。青蒿素的发现,开创了疟疾治疗新方法,全球数亿人因这种... 疟疾是一种严重危害人类健康的世界性流行疾病,在青蒿素广泛应用之前,全世界每年约4亿人次感染疟疾,至少有100万人的死亡病例。因此疟疾被世界卫生组织列为世界三大死亡疾病之一。青蒿素的发现,开创了疟疾治疗新方法,全球数亿人因这种"中国神药"而受益。紫穗槐-4,11-二烯氧化酶是一种植物细胞色素P450蛋白(CYP71AV1),参与催化紫穗槐-4,11-二烯生成青蒿酸的三步氧化反应,是青蒿素生物合成途径上的关键酶。作者拟通过p CW Ori(+)-CYP71AV1重组质粒在原核表达系统中的可溶性表达及蛋白纯化,采用一氧化碳差式光谱分析和基于血红素辅基的生物活性测定,验证CYP71AV1蛋白的活性,培养该蛋白的晶体。结果表明,构建的重组基因p CW Ori(+)-CYP71AV1在大肠杆菌中得以功能性表达,经过亲和层析和凝胶过滤层析纯化得到了毫克级、有活性的目的蛋白,筛选出了重组CYP71AV1蛋白的晶体生长条件。这些研究为解析青蒿素生物合成关键酶CYP71AV1的晶体结构,以及通过合成生物学方法批量生产青蒿素奠定了基础,同时为其他植物来源的P450蛋白的表达纯化与结晶提供参考。 展开更多
关键词 青蒿素 cyp71AV1 植物P450蛋白 生物合成 结晶
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Effect of Chlorella Intake on the Development of Atherosclerosis and Spontaneous Thrombolytic Activity
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作者 Kanae Hyodo Nana Kurisu +4 位作者 Natumi Yoshihama Kentaro Shimatani Naotaka Ohta Hiromitu Ishii Tsutomu Yamashita 《Health》 2023年第12期1390-1401,共12页
Background and Purpose: Thrombotic disease is a leading cause of death in industrialized countries. The development of atherosclerosis is a major underlying pathogenesis. Atherosclerotic lesions are largely related to... Background and Purpose: Thrombotic disease is a leading cause of death in industrialized countries. The development of atherosclerosis is a major underlying pathogenesis. Atherosclerotic lesions are largely related to abnormalities in lipid metabolism, and improvement of dietary habits is of great significance. Chlorella is a unicellular organism belonging to the green algae family, and is consumed worldwide as a functional food for the purpose of health promotion due to its excellent nutritional balance including high quality protein. In this study, we investigated the effects of long-term consumption of Chlorella as a food on the development of atherosclerosis and its ability to dissolve thrombi caused by the disruption of the atherosclerotic layer as a functional study of Chlorella. Methods: ApoE<sup>−/−</sup> and Ldlr<sup>−/−</sup> double-knockout mice were fed a chlorella-supplemented experimental diet for 14 weeks. The Entire aorta method was used to measure atherosclerosis development, and the area of sclerotic vessels was evaluated as a percentage of the total area of vessels. In addition, mRNA levels of lipid metabolism-related proteins in the liver and blood vessels were analyzed, as well as blood lipoprotein analysis. Spontaneous thrombolytic activity was measured by measuring the change in volume over time of thrombus formed in microvessel running over the cremaster muscle of the mice using the He-Ne laser-induced thrombus model. Results: There was no significant difference between the two groups in atherosclerosis development compared to the placebo group. However, a significant decrease in SREBP-1 mRNA level and a significant increase in mRNA levels of LXR and CPY71a were observed in the chlorella group. Cholesterol and TG levels in each lipoprotein fraction did not differ between the two groups. On the other hand, thrombolysis in vivo was not significantly different between the two groups in terms of thrombus volume at 60 minutes after thrombus formation. However, a trend toward decreased PAI-1 and TAFI mRNA expression levels was observed in the chlorella group. Conclusion: Intake of chlorella as a food suggested an effect on cholesterol catabolism, increased bile acid synthesis, improved lipid metabolism, and inhibited the development of atherosclerosis. Furthermore, it was suggested that chlorella may suppress the expression of fibrinolytic inhibitory factor and enhance thrombolytic activity. 展开更多
关键词 CHLORELLA ATHEROSCLEROSIS Thrombolysis SREBP-1 LXR cyp71a PAI-1 TAFI
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青蒿P450 cDNA基因的克隆及生物信息学分析 被引量:8
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作者 孔建强 王伟 +2 位作者 郑晓东 朱平 程克棣 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第21期2227-2231,共5页
目的:对青蒿P450 cDNA基因进行克隆和生物信息学分析。方法:通过RT-PCR,从青蒿cDNA中克隆了1个P450基因;通过生物信息学方法,对其结构特点进行分析。结果:该P450 cDNA基因ORF为1 464 bp,编码488个氨基酸,该序列在GenBank上的登录号为DQ6... 目的:对青蒿P450 cDNA基因进行克隆和生物信息学分析。方法:通过RT-PCR,从青蒿cDNA中克隆了1个P450基因;通过生物信息学方法,对其结构特点进行分析。结果:该P450 cDNA基因ORF为1 464 bp,编码488个氨基酸,该序列在GenBank上的登录号为DQ667171。编码蛋白是一个中等大小的A型P450,相对分子质量54.992 kDa;等电点8.83,定位于线粒体,和CYP71AV1具有很高的同源性。结论:该青蒿P450和CYP71AV1在进化和性质上很接近,可能在青蒿中执行类似功能。 展开更多
关键词 青蒿 P450 生物信息学分析 cyp71AV1
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Biosynthesis of artemisinic acid in engineered Saccharomyces cerevisiae and its attractiveness to the mirid bug Apolygus lucorum 被引量:1
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作者 TENG Dong LIU Dan-feng +4 位作者 Khashaveh ADEL SUN Pei-yao GENG Ting ZHANG Da-wei ZHANG Yong-jun 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第10期2984-2994,共11页
Artemisia annua is an important preferred host of the mirid bug Apolygus lucorum in autumn.Volatiles emitted from A.annua attract A.Iucorum.Volatile artemisinic acid of A.annua is a precursor of artemisinin that has b... Artemisia annua is an important preferred host of the mirid bug Apolygus lucorum in autumn.Volatiles emitted from A.annua attract A.Iucorum.Volatile artemisinic acid of A.annua is a precursor of artemisinin that has been widely investigated in the Chinese herbal medicine field.However,little is known at this point about the biological roles of artemisinic acid in regulating the behavioral trends of A.lucorum.In this study,we collected volatiles from A.annua at the seedling stage by using headspace solid phase microextraction(HS-SPME).Gas chromatography-mass spectrometry(GC-MS) analysis showed that approximately 11.03±6.00 and 238.25±121.67 ng hartemisinic acid were detected in volatile samples and milled samples,respectively.Subsequently,a key gene for artemisinic acid synthesis,the cytochrome P450 gene cyp71 av1,was expressed in engineered Saccharomyces cerevisiae to catalyze the production of artemisinic acid.After the addition of exogenous artemisinic alcohol or artemisinic aldehyde,artemisinic acid was identified as the product of the expressed gene.In electroantennogram(EAG) recordings,3-day-old adult A.lucorum showed significant electrophysiological responses to artemisinic alcohol,artemisinic aldehyde and artemisinic acid.Furthermore,3-day-old female bugs were significantly attracted by artemisinic acid and artemisinic alcohol at a concentration of 10 mmol L,whereas 3-day-old male bugs were attracted significantly by 10 mmol Lartemisinic acid and artemisinic aldehyde.We propose that artemisinic acid and its precursors could be used as potential attractant components for the design of novel integrated pest management strategies to control A.lucorum. 展开更多
关键词 artemisinic acid cyp71AV1 BIOSYNTHESIS Apolygus lucorum electrophysiological responses behavioral trends
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The Jasmonate-Responsive AP2/ERF Transcription Factors AaERF1 and AaERF2 Positively Regulate Artemisinin Biosynthesis in Artemisia annua L. 被引量:82
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作者 Zong-Xia Yu Jian-Xu Li +3 位作者 Chang-Qing Yang Wen-Li Hu Ling-Jian Wang Xiao-Ya Chen 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2012年第2期353-365,共13页
Plants of Artemisia annua produce artemisinin, a sesquiterpene lactone widely used in malaria treatment. Amorpha-4,11-diene synthase (ADS), a sesquiterpene synthase, and CYP71AV1, a P450 monooxygenase, are two key e... Plants of Artemisia annua produce artemisinin, a sesquiterpene lactone widely used in malaria treatment. Amorpha-4,11-diene synthase (ADS), a sesquiterpene synthase, and CYP71AV1, a P450 monooxygenase, are two key enzymes of the artemisinin biosynthesis pathway. Accumulation of artemisinin can be induced by the phytohormone jasmonate (JA). Here, we report the characterization of two JA-responsive AP2 family transcription factors-AaERF1 and AaERF2-from A. annua L. Both genes were highly expressed in inflorescences and strongly induced by JA. Yeast one- hybrid and electrophoretic mobility shift assay (EMSA) showed that they were able to bind to the CRTDREHVCBF2 (CBF2) and RAVlAAT (RAA) motifs present in both ADS and CYP71AV1 promoters. Transient expression of either AaERF1 or AaERF2 in tobacco induced the promoter activities of ADS or CYP71AV1, and the transgenic A. annua plants overexpressing either transcription factor showed elevated transcript levels of both ADS and CYP71AV1, resulting in increased accumulation of artemisinin and artemisinic acid. By contrast, the contents of these two metabolites were reduced in the RNAi transgenic lines in which expression of AaERF1 or AaERF2 was suppressed. These results demonstrate that AaERF1 and AaERF2 are two positive regulators of artemisinin biosynthesis and are of great value in genetic engineering of arte- misinin production. 展开更多
关键词 ARTEMISININ Artemisiaannua SESQUITERPENE amorpha-4 11-dienesynthase cyp71Av1 JASMONATE AP2/ERF transcription factor.
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A 5′tRNA-Ala-derived small RNA regulates anti-fungal defense in plants 被引量:2
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作者 Hanqing Gu Bi Lian +4 位作者 Yuxiang Yuan Ci Kong Yan Li Chang Liu Yijun Qi 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2022年第1期1-15,共15页
Apart from their primordial role in protein synthesis,t RNAs can be cleaved to produce t RNA-derived small RNAs(ts RNAs).The biological functions of ts RNAs in plants remain largely unknown.In this study,we developed ... Apart from their primordial role in protein synthesis,t RNAs can be cleaved to produce t RNA-derived small RNAs(ts RNAs).The biological functions of ts RNAs in plants remain largely unknown.In this study,we developed Rtc B ligation-based small RNA(s RNA)sequencing,a method that captures and distinguishes between 3′-2′,3′-cyclic-phosphate(c P)/phosphate(P)-terminated s RNAs and 3′-OH-terminated s RNAs,and profiled 5′ts RNAs and 5′t RNA halves in Arabidopsis thaliana.We found that Arabidopsis 5′ts RNAs and 5′t RNA halves predominantly contain a c P at the 3′end and require S-like RNase 1(RNS1)and RNS3 for their production.One of the most abundant 5′ts RNAs,5′ts R-Ala,by associating with AGO1,negatively regulates Cytochrome P45071 A13(CYP71 A13)expression and camalexin biosynthesis to repress anti-fungal defense.Interestingly,5′ts R-Ala is downregulated upon fungal infection.Our study provides a global view of 5′ts RNAs and 5′t RNA halves in Arabidopsis and unravels an important role of a 5′ts RNA in regulating anti-fungal defense. 展开更多
关键词 tRNA-derived small RNAs small RNA sequencing RNase T2 cyp71A13 disease resistance
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A novel cytochrome P450 gene from Catharanthus roseus cell line C_(20)hi:cloning and characterization of expression
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作者 Lihong He Shujuan Zhao Zhibi Hu 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS 2012年第3期250-255,共6页
An expressed sequence tag(EST)obtained from a subtractive-suppression hybridization cDNA library constructed using Catharanthus roseus cell line C_(20)hi and its parental cell line C_(20)D was used to clone a ful-leng... An expressed sequence tag(EST)obtained from a subtractive-suppression hybridization cDNA library constructed using Catharanthus roseus cell line C_(20)hi and its parental cell line C_(20)D was used to clone a ful-length cytochrome P450 cDNA of cyp71d1.The encoded polypeptide contained 507 amino acids with 39-56% identity to other CYP7ID subfamily members at the.amino acid level.Expression characteristics of cyp71d1 were determined using semi-quantitative RT-PCR.The cyp71d1 transcript was expressed in all three cell lines with the highest level in the cell line C_(20)hi.In the mature C.roseus plant,the cyp71d1 cDNA was highly expressed in petals,roots and stems,but very weakly expressed in young leaves.Its transcription level increased with the development of flowers.2,4-D could down-regulate the transcription of cyp71d1,as did KT,but only to a minor degree.Neither light nor yeast elicitor could induce the transcription of cyp71d1. 展开更多
关键词 Cytochrome P450 cyp71d1 TRANSCRIPTION Tissue specific expression Full habituated cell line
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