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辣椒生长素抑制蛋白基因CaARP1的克隆及其对青枯菌侵染的响应
1
作者
刘艳艳
丁颖
+1 位作者
刘兴华
郑佳秋
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第21期13-19,共7页
生长素响应基因编码生长素抑制蛋白(ARP),是非常重要的下调基因,能够抑制生长素(IAA)信号的转导,在植物的生长、发育、抗病、抗逆以及种子休眠等过程中发挥重要作用。为解析辣椒ARP1基因的序列特征和功能,以辣椒品种CM334为试材,克隆获...
生长素响应基因编码生长素抑制蛋白(ARP),是非常重要的下调基因,能够抑制生长素(IAA)信号的转导,在植物的生长、发育、抗病、抗逆以及种子休眠等过程中发挥重要作用。为解析辣椒ARP1基因的序列特征和功能,以辣椒品种CM334为试材,克隆获得辣椒ARP1基因cDNA全长序列,命名为CaARP1,GenBank登录号为AAR83888.1。序列分析结果表明,辣椒CaARP1基因的cDNA全长228 bp,没有非翻译区,包含1个228 bp的开放阅读框架,编码75个氨基酸。CaARP1基因含有2个外显子和1个内含子,全长385 bp。CaARP1蛋白的分子量为8.298 ku,理论等电点为9.99,没有跨膜结构,不存在信号肽,为亲水性不稳定蛋白,二元结构元件多为无规则卷曲。CaARP1蛋白与同属茄科植物的马铃薯、番茄、黄果茄、烟草生长素抑制蛋白的同源性较高,序列一致性分别为95.00%、96.67%、93.24%、91.89%。实时荧光定量PCR分析结果表明,CaARP1基因在青枯菌侵染1~7 d期间均呈现极显著下调的趋势,推测该基因可能在辣椒应答青枯病侵染中发挥重要作用。
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关键词
辣椒
caarp1基因
基因
克隆
序列分析
表达分析
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题名
辣椒生长素抑制蛋白基因CaARP1的克隆及其对青枯菌侵染的响应
1
作者
刘艳艳
丁颖
刘兴华
郑佳秋
机构
江苏沿海地区农业科学研究所
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2023年第21期13-19,共7页
基金
江苏省农业科技自主创新资金[编号:CX(21)3031]
江苏省农业重大新品种创制专项(编号:PZCZ201715)。
文摘
生长素响应基因编码生长素抑制蛋白(ARP),是非常重要的下调基因,能够抑制生长素(IAA)信号的转导,在植物的生长、发育、抗病、抗逆以及种子休眠等过程中发挥重要作用。为解析辣椒ARP1基因的序列特征和功能,以辣椒品种CM334为试材,克隆获得辣椒ARP1基因cDNA全长序列,命名为CaARP1,GenBank登录号为AAR83888.1。序列分析结果表明,辣椒CaARP1基因的cDNA全长228 bp,没有非翻译区,包含1个228 bp的开放阅读框架,编码75个氨基酸。CaARP1基因含有2个外显子和1个内含子,全长385 bp。CaARP1蛋白的分子量为8.298 ku,理论等电点为9.99,没有跨膜结构,不存在信号肽,为亲水性不稳定蛋白,二元结构元件多为无规则卷曲。CaARP1蛋白与同属茄科植物的马铃薯、番茄、黄果茄、烟草生长素抑制蛋白的同源性较高,序列一致性分别为95.00%、96.67%、93.24%、91.89%。实时荧光定量PCR分析结果表明,CaARP1基因在青枯菌侵染1~7 d期间均呈现极显著下调的趋势,推测该基因可能在辣椒应答青枯病侵染中发挥重要作用。
关键词
辣椒
caarp1基因
基因
克隆
序列分析
表达分析
分类号
S641.301 [农业科学—蔬菜学]
S436.418.19 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
辣椒生长素抑制蛋白基因CaARP1的克隆及其对青枯菌侵染的响应
刘艳艳
丁颖
刘兴华
郑佳秋
《江苏农业科学》
北大核心
2023
0
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