番鸭CRHBP基因多态性及生物信息学分析

为研究促肾上腺皮质激素释放激素结合蛋白(corticotropin-releasing hormone binding protein,CRHBP)作为番鸭异常行为研究候选基因的可能性。实验以半番鸭为实验材料,设计9对引物对CRHBP基因内含子和外显子序列进行扩增,其PCR产物经测序后,利用生物信息学软件分析SNPs位点突变前后CRHBP基因及其蛋白结构的变化。结果表明,在扩增的CRHBP基因中筛选出12个SNPs:Exon3-G^(5805)A、Exon3-C^(5906)T、Exon7-A^(10747)G、Intron3-A^(5984)G、Intron3-T^(6019)G、Intron3-C^(6021)T、Intron3-G^(6035)A、Intron3-G^(6036)A、Intron7-C^(10506)T、Intron7-A^(10613)G、Intron8-G^(12097)A和Intron8-G^(12118)A,其中Exon3-G^(5805)A和Exon7-A^(10747)G为同义突变;Exon3-C^(5906)T是错义突变,导致编码的缬氨酸(Val)突变为异亮氨酸(Ile);Intron3-A^(5984)G、Intron3-T^(6019)G、Intron3-C^(6021)T、Intron3-G^(6035)A、Intron3-G^(6036)A、Intron7-C^(10506)T、Intron7-A^(10613)G、Intron8-G^(12097)A和Intron8-G^(12118)A处于内含子区域,不参与氨基酸编码。