基于转录组学探讨蚕梅方抗结直肠癌的作用机制

目的利用二代测序技术探讨蚕梅方在转录组学层面上抗结直肠癌活性的作用机制。方法将来源于《本草纲目》中治疗肠风的核心药物乌梅及僵蚕组方为蚕梅方,对RKO细胞(肠癌细胞)进行干扰,采用二代高通量测序平台(Illumina HiSeq)测序技术分别对对照组(RKO-control)和实验组(RKO-treatment)进行高通量转录组测序,并应用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行生物功能富集分析,通过分子对接方法验证活性成分与关键靶点的结合作用。结果差异基因数为2 516个,其中上调基因1 279个,下调基因1 237个,筛选得到叉头框蛋白D1(FOXD1)、腓骨蛋白2(FBLN2)、低密度脂蛋白受体A类结构域2(LDLRAD2)三个与结直肠癌相关的核心差异基因。GO分析发现,差异基因主要涉及单体代谢过程、细胞周期过程以及对有机物质的调控等过程;KEGG分析发现,差异表达基因主要涉及代谢途径、细胞周期和RNA转运等信号通路,分子对接验证了蚕梅方主要活性化合物与核心靶点有较高的结合活性。结论蚕梅方可能通过多靶点、多途径的作用方式,从基因的转录表达、细胞代谢和凋亡等方面发挥抗结直肠癌作用。

蚕梅方干预炎癌转化模式小鼠肠组织蛋白质组学差异表达研究

目的:应用非标记定量(label-free)蛋白质组学技术,探究蚕梅方对炎癌转化模式小鼠肠组织蛋白质差异表达的影响。方法:从对照组、结直肠腺瘤模型组(模型组)、蚕梅方水煎醇沉给药组(CMF-A组)小鼠肠组织中提取蛋白,进行label-free蛋白质组学研究及分子对接分析。结果:蛋白质组学研究共鉴定出3 456个蛋白质,与模型组比较,CMF-A组差异蛋白有515个,与对照组比较,模型组差异蛋白有15个,其中上调蛋白6个,下调蛋白9个。模型组与对照组比较有差异而蚕梅方可使差异趋势逆转的蛋白有1个,即线粒体输入受体亚基TOM20同源物(TOMM20)。GO分析发现差异表达蛋白主要参与ATP代谢等生物过程,KEGG分析提示差异蛋白共涉及产热作用通路等37条信号通路,分子对接显示麦角胺等活性成分与TOMM20具有良好相互作用。结论:蚕梅方可能通过下调TOMM20的表达,通过ATP代谢等多个生物过程,作用于多条信号通路,达到对炎癌转化的防治作用。