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浙江省啮齿动物携带心病毒的遗传特征研究
被引量:
2
1
作者
郭文平
林献丹
+7 位作者
王文
李明慧
王淼若
邢建光
郑剑
孙肖瑜
倪庆翔
张永振
《疾病监测》
CAS
2016年第6期452-458,共7页
目的了解我国浙江省的啮齿动物携带心病毒情况,并分析其遗传特征。方法用反转录-聚合酶链反应选啮齿动物粪便标本中的心病毒,扩增其全基因组;利用Lasergene软件分别对多聚蛋白、P1蛋白、2C+3CD蛋白序列与Gen Bank下载的序列进行同源性...
目的了解我国浙江省的啮齿动物携带心病毒情况,并分析其遗传特征。方法用反转录-聚合酶链反应选啮齿动物粪便标本中的心病毒,扩增其全基因组;利用Lasergene软件分别对多聚蛋白、P1蛋白、2C+3CD蛋白序列与Gen Bank下载的序列进行同源性分析;分析其基因组与多聚蛋白的特征;利用Phy ML软件构建系统发生树。结果浙江省啮齿动物携带心病毒。毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3的多聚蛋白、P1以及2C+3CD蛋白与心病毒B的同源性分别为71.9%~85.4%、65.2%~89.8%与78.3%~95.4%,属于心病毒B;毒株Wencheng-Rn416的多聚蛋白、P1以及2C+3CD蛋白与Boone心病毒的同源性分别为92.5%、85.3%与96.9%,属于心病毒C。系统发生分析也表明毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3与心病毒B的亲缘关系最近,Wencheng-Rn416与Boone心病毒的亲缘关系最近。系统发育分析发现啮齿动物在心病毒的起源与进化过程中起着重要的作用,并且可能发生跨种间传播而感染人。结论我国浙江省啮齿动物携带心病毒,并可能跨种间传播到人。
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关键词
心病毒
序列分析
系统发生分析
原文传递
题名
浙江省啮齿动物携带心病毒的遗传特征研究
被引量:
2
1
作者
郭文平
林献丹
王文
李明慧
王淼若
邢建光
郑剑
孙肖瑜
倪庆翔
张永振
机构
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所人兽共患病室传染病预防控制国家重点实验室
温州市疾病预防控制中心
龙泉市疾病预防控制中心
文成县疾病预防控制中心
瑞安市疾病预防控制中心
出处
《疾病监测》
CAS
2016年第6期452-458,共7页
基金
国家自然科学基金(No.81273014
81290343)~~
文摘
目的了解我国浙江省的啮齿动物携带心病毒情况,并分析其遗传特征。方法用反转录-聚合酶链反应选啮齿动物粪便标本中的心病毒,扩增其全基因组;利用Lasergene软件分别对多聚蛋白、P1蛋白、2C+3CD蛋白序列与Gen Bank下载的序列进行同源性分析;分析其基因组与多聚蛋白的特征;利用Phy ML软件构建系统发生树。结果浙江省啮齿动物携带心病毒。毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3的多聚蛋白、P1以及2C+3CD蛋白与心病毒B的同源性分别为71.9%~85.4%、65.2%~89.8%与78.3%~95.4%,属于心病毒B;毒株Wencheng-Rn416的多聚蛋白、P1以及2C+3CD蛋白与Boone心病毒的同源性分别为92.5%、85.3%与96.9%,属于心病毒C。系统发生分析也表明毒株Ruian-Rn93-1、Longquan-Aa3-1、Ruian-Rn93-3与心病毒B的亲缘关系最近,Wencheng-Rn416与Boone心病毒的亲缘关系最近。系统发育分析发现啮齿动物在心病毒的起源与进化过程中起着重要的作用,并且可能发生跨种间传播而感染人。结论我国浙江省啮齿动物携带心病毒,并可能跨种间传播到人。
关键词
心病毒
序列分析
系统发生分析
Keywords
cardiovirus
es
Sequence analysis
Phylogenetic analysis
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
浙江省啮齿动物携带心病毒的遗传特征研究
郭文平
林献丹
王文
李明慧
王淼若
邢建光
郑剑
孙肖瑜
倪庆翔
张永振
《疾病监测》
CAS
2016
2
原文传递
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参考文献
引证文献
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