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题名球毛壳菌组蛋白H3基因克隆与特性分析
被引量:1
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作者
刘志华
杨谦
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机构
哈尔滨工业大学生命科学与工程系
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出处
《生物信息学》
2005年第3期108-111,共4页
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基金
国家高新技术发展项目863资助(No.2003AA241140)
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文摘
构建了球毛壳菌菌丝的cDNA文库,并获得了1410条ESTs序列,用里氏木霉(Hypocrea jecorina,AAM76068)和粗糙脉胞菌(Neurospora crassa,CAA25761)的组蛋白H3基因(Histone H3)蛋白序列对球毛壳菌(Chaetomium globosum)ESTs序列本地数据库进行tBlastn检索,获得了球毛壳菌组蛋白H3cDNA序列。cDNA序列全长739bp,开放阅读框411bp,编码136个氨基酸组成的多肽,蛋白分子量为15.4kD。BlastP同源性分析表明该基因与里氏木霉同源性最高为100%;与地钱(Marchantia polymorpha)同源性最低为95%。三级结构预测表明,该蛋白C端为球状结构域,而N端结构对其发挥调控作用起重要作用。该基因的cDNA序列及推测的氨基酸序列在GenBank登录(登录号分别为AY669068,AAT74576)。
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关键词
球毛壳菌
组蛋白H3
基因克隆
特性分析
生物信息学
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Keywords
chaetorrdum globosum
Histone H3
gene cloning
characterization analysis
bioinformatics
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分类号
Q785
[生物学—分子生物学]
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