目的:探讨从微量福尔马林固定石蜡包埋组织(formalinfixation and paraffin embeddedtissues,FFPET)中提取DNA的简单而高效的方法。方法:采用Chelex-100提取法、酚氯仿抽提法、单纯消化法、水煮法4种方法提取组织DNA;应用聚合酶链...目的:探讨从微量福尔马林固定石蜡包埋组织(formalinfixation and paraffin embeddedtissues,FFPET)中提取DNA的简单而高效的方法。方法:采用Chelex-100提取法、酚氯仿抽提法、单纯消化法、水煮法4种方法提取组织DNA;应用聚合酶链反应扩增100500bp长度DNA片段,然后进行电泳分析,1年后重复PCR电泳分析。结果:小于200bp长度DNA片段扩增,Chelex-100提取法、单纯消化法阳性率分别为88.8%、78.8%,明显优于酚氯仿抽提法(15.0%)(P〈0.01)及水煮法(21.3%)(P〈0.01)。随着扩增长度的增加,PCR扩增效率逐渐降低,Chelex-100提取法PCR反应总阳性率为82.5%,单纯消化法为66.5%,水煮法为13.4%,酚氯仿抽提法为13.4%。1年后重复PCR总阳性率分别为80.1%、31.7%、2.5%、9.2%。结论:Chelex-100提取法方便简单,适用于微量石蜡组织DNA扩增分析;单纯消化法及水煮法在一定条件下适用于微量石蜡组织短片段DNA的扩增。展开更多
[目的]建立一套快捷、安全、有效的丝核菌菌株DNA提取方法。[方法]采用Chelex-100法提取丝核菌菌株DNA,作为5.8S r DNA-ITS序列的PCR扩增模板,评价提取的DNA质量。[结果]采用Chelex-100法提取丝核菌DNA能够在15 min之内完成,提取的DNA...[目的]建立一套快捷、安全、有效的丝核菌菌株DNA提取方法。[方法]采用Chelex-100法提取丝核菌菌株DNA,作为5.8S r DNA-ITS序列的PCR扩增模板,评价提取的DNA质量。[结果]采用Chelex-100法提取丝核菌DNA能够在15 min之内完成,提取的DNA可以直接作为PCR扩增模板,PCR产物经电泳检测,条带整齐、清晰、明亮,产量大,符合常规测序要求,测序结果准确。[结论]该方法具有快速简便、省时省力、经济高效的特点,是一种较为理想的丝核菌基因组DNA提取方法,适用于丝核菌菌株的分类鉴定。展开更多
文摘目的:探讨从微量福尔马林固定石蜡包埋组织(formalinfixation and paraffin embeddedtissues,FFPET)中提取DNA的简单而高效的方法。方法:采用Chelex-100提取法、酚氯仿抽提法、单纯消化法、水煮法4种方法提取组织DNA;应用聚合酶链反应扩增100500bp长度DNA片段,然后进行电泳分析,1年后重复PCR电泳分析。结果:小于200bp长度DNA片段扩增,Chelex-100提取法、单纯消化法阳性率分别为88.8%、78.8%,明显优于酚氯仿抽提法(15.0%)(P〈0.01)及水煮法(21.3%)(P〈0.01)。随着扩增长度的增加,PCR扩增效率逐渐降低,Chelex-100提取法PCR反应总阳性率为82.5%,单纯消化法为66.5%,水煮法为13.4%,酚氯仿抽提法为13.4%。1年后重复PCR总阳性率分别为80.1%、31.7%、2.5%、9.2%。结论:Chelex-100提取法方便简单,适用于微量石蜡组织DNA扩增分析;单纯消化法及水煮法在一定条件下适用于微量石蜡组织短片段DNA的扩增。
文摘[目的]建立一套快捷、安全、有效的丝核菌菌株DNA提取方法。[方法]采用Chelex-100法提取丝核菌菌株DNA,作为5.8S r DNA-ITS序列的PCR扩增模板,评价提取的DNA质量。[结果]采用Chelex-100法提取丝核菌DNA能够在15 min之内完成,提取的DNA可以直接作为PCR扩增模板,PCR产物经电泳检测,条带整齐、清晰、明亮,产量大,符合常规测序要求,测序结果准确。[结论]该方法具有快速简便、省时省力、经济高效的特点,是一种较为理想的丝核菌基因组DNA提取方法,适用于丝核菌菌株的分类鉴定。