用Chelex100法及有机溶剂提取法联合提取DNA扩增STR基因座的比较研究

为了比较不同方法提取DNA扩增STR基因座的成功率 ,本文用Chelex10 0法及Chelex10 0法联合有机溶剂提取法分别提取性犯罪案件 6份血斑及 6份混合斑中精子DNA ,并用PE公司ProfilerPlus系统复合扩增 ,ABI 310型基因分型仪检测。结果表明 ,常规采用Chelex10 0法提取血斑及精斑等生物检材DNA作STR基因座检验失败或所检测的位点较少时 ,应对Chelex10 0法提取的DNA上清液再用有机溶剂提取法提取 ,可极大提高DNA检验成功率。采用本文建立的Chelex10 0法联合有机溶剂提取法 ,提高了PCR扩增阳性率 ,对实际检案很有帮助 ;在PCR扩增前应常规进行DNA定量检验 ,否则对于重要检材应进行梯度扩增。

Chelex100法和有机法联合应用检验微量精斑DNA

某日一女学生(16岁)在放学回家途中被犯罪分子强奸.现场提取卫生纸1份,在其边缘部位留有少许擦拭状斑迹,据受害人回忆,这是案发时犯罪分子曾用过并弃下的.

Chelex100法从贮存食管拉网脱落细胞涂片中提取DNA并作PCR分析的应用和意义

目的 探讨从贮存 2 0年的食管拉网脱落细胞涂片的微量细胞中抽提DNA的方法和可行性 ;比较p5 3基因在正常食管上皮和重度不典型增生上皮中的突变差异。方法 利用螯合型离子交换树脂Chelex10 0作为介质 ,一步法从食管拉网脱落细胞中提取用作PCR分析的DNA ,共提取食管正常上皮与重度不典型增生上皮细胞涂片各 2 4例 ,采用PCR SSCP分析法进行p5 3基因第 7外显子的突变检测。结果 所有 48例标本中微量细胞的DNA抽提均获成功 ;正常食管组p5 3基因第 7外显子均未发生突变 ,重度不典型增生组 5例发生突变 ,其中 3例在 10年、12年、14年后转变为食管癌。结论 Chelex10 0法简便、高效 ,能从微量细胞中抽提DNA ,使对 2 0年前食管拉网细胞涂片进行分子水平的检测成为可能 ;p5 3基因第 7外显子的突变使食管上皮重度不典型增生细胞具有了癌变趋势。

微量DNA提取工作站与Chelex-100法提取指纹脱落细胞DNA效果比较

比较Chelex-100法或自动化工作站提取法对脱落细胞提取DNA的效果。方法 选取3名志愿者制作脱落细胞,用两步擦拭法分别提取脱落细胞检材,使用博坤24道全自动DNA提取工作站和Chelex-100方法分别提取模板DNA,用VeriFilerTM Plus试剂盒进行PCR扩增,扩增产物应用3500型全自动荧光分析仪进行检测、分析,并对分析结果进行比较。结果 两种方法提取的DNA模板经过分型分析,均出现了不同程度的丢峰现象,Chelex-100法的STR基因座检出数平均数为15.3,博坤24道全自动DNA提取工作站检出的STR基因座平均数为19.5。结论 本实验中博坤24道全自动DNA提取工作站提取的脱落细胞DNA检出率高于Chelex-100法。

一种基于新型发光法的中枢神经特异性蛋白S100β检测试剂盒的性能评估

目的:对基于新型发光法的Pylon中枢神经特异性蛋白S100β检测试剂的性能进行评估。方法:依据美国临床和实验室标准委员会相关文件方案对S100β检测试剂盒的分析性能,包括精密度、线性范围、抗干扰能力、正常人群参考区间等性能进行评估,并与电化学发光法ElecsysS100β检测进行方法学比对。比较不同疾病与健康人群的S100β水平,以评估该方法的临床应用价值。结果:PylonS100β检测在低浓度(平均值0.250μg/L)重复性精密度和实验室内总不精密度均为6.30%,在高浓度(平均值2.96μg/L)重复性精密度和实验室内总不精密度分别为6.48%、6.53%。该方法在0.05~36.9μg/L之间呈线性。干扰物质(甘油三酯≤15mg/mL、血红蛋白≤10mg/mL、生物素≤50ng/mL、胆红素≤0.4mg/mL)对PylonS100β检测结果无影响。PylonS100β检测厂家说明书申明的参考区间(<0.105μg/L)适合本实验室检测人群。40例样本同时进行PylonS100β检测与罗氏电化学发光法检测,结果表明两种检测方法结果一致性良好。在体外循环心脏手术后、ICU昏迷、脑卒中、轻度和重度创伤性脑损伤患者的S100β显著升高(P<0.001)。结论:PylonS100β检测具有良好的精密度、线性范围、抗干扰能力,其与罗氏电化学发光法S100检测结果一致性好,符合于临床分析的要求,并且S100β在多种脑损伤相关疾病中显示出潜在的临床应用价值。

调神解郁针法结合康复训练治疗卒中后抑郁的疗效及对S100β、5-HT的影响

探究调神解郁针法结合康复训练治疗脑卒中后抑郁(PSD)的疗效及对S100钙结合蛋白β(S100β)、5-羟色胺(5-HT)的影响。方法 随机将海南省中医院2021年11月-2023年3月接收的PSD患者60例分为两组,各30例。将实施基础治疗的患者纳入对照组,将实施基础治疗+调神解郁针法+康复训练的患者纳入观察组。比较两组治疗效果。结果 治疗4周,观察组总有效率较对照组高(P<0.05)。两组治疗4周汉密尔顿抑郁量表24项(HAMD-24)评分、血清S100β降低,观察组较低,改良Barthel指数(ADL)评分、5-HT升高,观察组较高(P<0.05)。结论 调神解郁针法结合康复训练治疗PSD效果显著,可改善其血清S100β及5-HT水平,减轻其抑郁症状,提高日常生活能力。

纳米金刚石膜/{100}晶面多晶金刚石膜台阶法快速生长研究

通过高功率微波等离子体化学气相沉积(MPCVD)以及台阶式基底排列方法,可以在一次沉积过程中同时沉积纳米晶粒及<100>取向的{100}面多晶金刚石薄膜。详细比较在同一次沉积中同时制备的多种不同类别的金刚石产物的生长速率。采用台阶法并添加少量空气,微波功率从2.0k W增加至3.2 kW,在下面大硅片上生长的纳米金刚石膜的平均生长速率可从0.3μm/h增大到3.0μm/h;而在上面小硅片上生长的纳米金刚石膜的平均生长速率从3.8μm/h也增加到11.2μm/h,同时产物也转变为{100}晶面的多晶膜。另外,在上面小硅片上生长的金刚石膜的边角效应明显,在边界生长的金刚石产物的生长速率更高,从17.0μm/h增大到27.1μm/h。该结果表明少量氮气和氧气同时添加对金刚石生长的形貌多样性调节作用和对生长速率的提升作用强烈依赖于生长条件。

改良Chelex-100法和CTAB法用于转基因抗草甘膦大豆检测效果的比较

以转基因抗草甘膦大豆为研究材料,分别采用改良Chelex-100法和常规CTAB法提取基因组DNA,以提取DNA的浓度和纯度,同时以PCR扩增大豆的内源基因(lectin)及外源特异性序列(CaMV35S,nos,Cp4-epsps)的效果对两种方法进行比较和评价。结果表明:虽然改良Chelex-100法DNA提取纯度不高,但是提取效率与常规CTAB法相当,而且改良Chelex-100法能够快速在1 h之内从大豆中提取DNA,所提取的DNA可以直接用于PCR扩增反应,PCR扩增产物电泳条带清晰。因此,改良Chelex-100法可以替代CTAB法提取DNA用于转基因检测,该方法具有经济、简便、快速的特点。

Chelex-100法提取滤纸血痕DNA影响因素的比较

目的改进滤纸血痕DNA提取方法,建立更简便、廉价,适合当前DNA建库需要的提取方法。方法将752份滤纸血痕分成四组,分别按照四种不同的Chelex-100法进行DNA提取并进行比较研究;63份新鲜血痕分别按照两种方法提取并进行对比研究。结果对于陈旧滤纸血痕,四种提取方法的检测成功率无显著差异(P>0.05);对于新鲜血痕,两种提取方法的检测成功率有显著差异(P<0.05)。结论对于建库陈旧滤纸血痕样本的DNA提取可采用不加纯水处理,直接加入Chelex-100的方法进行。

改良Chelex-100法快速提取转基因农产品DNA

旨在建立一种从转基因农产品中快速提取DNA的方法。分别采用改良Chelex-100法和常规CTAB法提取转基因大豆GTS40-3-2基因组DNA,测其浓度和纯度,PCR扩增其内源基因(Lectin)、启动子(CaMV35S)和品系特异性序列,对两种方法进行比较和评价,并研究两种方法提取的DNA在-20℃下保存一个月内的检测效果,以及改良Chelex-100法在玉米、小麦和水稻等其他转基因农产品的应用效果。结果表明,改良Chelex-100法能够快速在1.5 h之内从样品中提取DNA,所提取的DNA直接用于PCR扩增反应,产物电泳条带清晰明亮。两种方法提取的DNA在-20℃下保存一个月内的检测效果未见明显差别。该方法在玉米、小麦和水稻等转基因农产品的应用效果稳定。因此,改良Chelex-100法提取的DNA可以作为PCR扩增模板用于转基因农产品检测。该方法具有经济、简便、快速、安全的特点,适合转基因农产品大规模筛选和鉴别。

Chelex-100法从颊粘膜拭子提取DNA进行基因型分析的研究

目的 :探讨采用Chelex 10 0法从颊粘膜拭子提取DNA这一方法的有效性和可靠性。 方法 :用棉签刮取 130例个体口腔颊粘膜脱落细胞 ,采用Chelex 10 0法从颊粘膜拭子中提取DNA ,采用SSP PCR及PCR PFLP法对其进行检测 ,观察结果的有效性和可靠性。 结果 :所有样本中都获得成功。电泳结果显示 ,PCR扩增及酶切的靶带清晰 ,无非特异性杂带 ,扩增结果重复性好。 结论 :采用Chelex 10 0法从颊粘膜拭子提取DNA ,方法稳定可靠 ,可以用于基因型检测。

Chelex-100快速提取动物源饲料DNA方法的建立

为防止疯牛病疫区反刍动物源性饲料传入我国,非常有必要对贸易往来中的肉骨粉品种来源进行鉴定。本文建立了一种利用Chelex-100快速提取动物源性饲料DNA的方法,用于反刍动物源性饲料的PCR扩增分析。结果显示该方法与GuSCN法、SDS法同样理想,从而实现了对进境饲料的快速检定的要求。该方法检测灵敏度达到牛成分含量为0.1%的水平,具有简单、快捷、灵敏度高的优点。

Chelex-100法提取甘薯小象甲DNA及云南地区甘薯小象甲的分子鉴定

甘薯小象甲是国内外重要的检疫性害虫,除本身为害薯块外,引起的伤口还会诱致病菌侵入,使受害薯块发生恶臭和苦味无法食用。准确鉴定云南地区的甘薯小象甲,特别是研究其遗传变异可为检疫提供依据。本研究采集了云南元谋县甘薯小象甲,采用Chelex-100法快速提取甘薯小象甲基因组DNA,分别对雌雄成虫rDNA ITS-1序列进行系统发育分析,首次发现云南元谋县的甘薯小象甲属于东亚分支的东南亚亚支,与我国之前报道的甘薯小象甲属于东亚分支的东北亚亚支不同,说明云南元谋县的甘薯小象甲种群来源与中国广东、福建、浙江和重庆的种群来源不同。

一种改进的Chelex-100法提取单头螨DNA

提供了一种改进的Chelex-100法从单头螨中提取DNA,通过充分研磨以及反复冻融从单头螨得到的DNA可直接用于PCR。实验结果表明:与酚-氯仿法相比,此方法提取单头螨的DNA效果理想,操作简单,稳定性好;以3种不同类群螨为验证样,表明Chelex-100法可广泛用于各种螨的单头螨DNA提取;对于70%的酒精和奥氏螨保存液分别保存的个体,以及永久玻片标本,运用此方法均可提取出DNA,其中酒精保存标本提取效果最好;所提取的DNA在-20℃条件下可做长期保存。实验证明,改进的Chelex-100法是一种获取螨类等微小动物基因的较好方法。

饱和苯酚-氯仿抽提法与Chelex-100树脂法提取DNA在研究犬STR基因座多态性中的应用比较

在研究犬STR基因座多态性中,比较使用了饱和苯酚-氯仿抽提法和Chelex-100树脂法,两种方法提取的DNA在扩增后的检测结果均能准确地反映实验结果。尽管从平均峰面积和平均峰高值等指标上,利用Chelex-100树脂法提取的DNA质量和扩增后的检测效果较饱和苯酚-氯仿抽提法差,但Chelex-100树脂提取法更为简单快捷,适合在建立警犬STR基因座等位基因数据库中和犬亲缘关系鉴定中广泛使用。

PCR-RFLP中Chelex-100制备DNA模板的方法建立及其条件优化

目的:建立一种快速、可靠、经济的DNA纯化技术用于分子流行病学调查及群体遗传学的研究.方法:根据MMP3基因外显子2中rs679620的SNP区域(-Lys45Glu-)设计引物,采用Chelex-100法从微量全血中提取人基因组DNA,利用PCR-RFLP对其进行检测,观察基因分型结果.结果表明:取10μL全血,加入200μL 5%Chelex-100溶液,56℃水浴保温30 min后,100℃水浴8 min,离心取上清为最佳用于PCR的DNA模板提取条件.经PCR扩增及酶切验证,其DNA条带特异、清晰,适用于基因分型.结论:提取人基因组DNA的Chelex-100法所需血样微量、操作简单、快速、可靠、经济,特别适合于大量样本的DNA提取,可用于人群分子流行病学调查及群体遗传学的研究.

Chelex-100法提取脱落细胞检材DNA的实时定量研究

目的研究脱落细胞检材DNA检验的简便有效的提取方法。方法对76份包括帽子、眼镜、牙刷、剃须刀、梳子、口香糖、羊水在内的7种脱落细胞检材采用Chelex-100法提取DNA,在ABI7500型荧光定量PCR仪上进行定量,同时用Identifiler复合扩增系统扩增,在ABI3130遗传分析仪上进行STR分型。结果从帽子(头套)中获得的脱落细胞DNA平均含量为8.31ng,眼镜擦拭物上获得的脱落细胞DNA平均含量为6.20ng,牙刷上获得的脱落细胞DNA平均含量为49.40ng,剃须刀擦拭物上获得的脱落细胞DNA平均含量为6.92ng、梳子擦拭物上获得的的脱落细胞DNA平均含量为10.68ng,口香糖的脱落细胞DNA平均含量为16.30ng,羊水的脱落细胞DNA平均含量为320ng。以上76份检材性别及10个以上STR位点分型成功率为75.8%。结论从帽子、眼镜、牙刷、剃须刀、梳子、口香糖、羊水等检材提取的脱落细胞可用Chelex-100法提取DNA作STR分型。

MPure-12全自动核酸纯化仪与Chelex-100法的比较

目的通过对DNA含量不同的血痕和多种类型生物学检材进行DNA提取和STR分型检测,探讨MPure-12全自动核酸纯化仪(MPure-12法)在DNA提取中的法医学应用价值。方法收集血痕、精斑、唾液等9种类型的生物学检材,应用MPure-12法和传统Chelex-100法提取DNA,经过PCR扩增和电泳,获取STR分型图谱。结果 MPure-12法对发根、口香糖、烟蒂、肌肉组织、唾液斑、血痕、精斑这些检材能够成功分型,唾液出现了个别等位基因丢失现象,接触拭子分型较差。Chelex-100法对血量为20μL、15μL、10μL、5μL、1μL制成的血痕均有完整分型结果,MPure-12法在血量为1μL时出现等位基因丢失现象。结论 MPure-12法适用于一定浓度血样的检验,而对于微量血样,Chelex-100法提取DNA的效果可能更优。仪器应用于DNA提取具有操作简单、快速、提取效率高,分型成功率高,减少人为污染等优势。

Chelex-100法和碱性裂解法提取细菌DNA的比较

目的:通过对两种DNA提取方法的比较,寻找一种灵敏、快速、经济实用的提取方法。方法:采用Chelex-100法和碱性裂解法分别提取不同浓度大肠杆菌ATCC25922和金黄色葡萄球菌ATCC25923的DNA,利用通用引物扩增16SrDNA片段检测两种方法的灵敏度。结果:碱性裂解法提取的不同浓度的两种细菌DNA,经PCR扩增均未显出目的条带;Chelex-100法提取不同浓度的两种细菌DNA均扩增出目的条带,PCR检测大肠埃希菌和金黄色葡萄球菌的灵敏度均为1.2×101cfu/ml,电泳结果提示相同浓度的大肠杆菌被提取到的DNA含量比金黄色葡萄球菌的含量高。结论:Chelex-100法操作简便,可用于细菌DNA的快速提取。