陕西省韩城市利什曼原虫SSU rRNA基因系统发育研究

目的了解陕西省韩城市黑热病区利什曼原虫种类及分子遗传特征。方法对来自韩城市的利什曼原虫阳性标本,进行SSU rRNA基因序列扩增,扩增产物进行测序,与其它不同种类、不同地区利什曼原虫的SSU rRNA基因序列进行比对,分析突变位点规律,建立系统发育树。结果有3份标本SSU rRNA基因序列扩增测序成功,其基因序列与杜氏利什曼原虫、夏科氏利什曼原虫、婴儿利什曼原虫的SSU rRNA序列同源性较高,与婴儿利什曼原虫在UQ-II突变区有一个位点的变异,并与新疆荒漠虫株、甘肃省利什曼虫株聚为一类。结论结合流行病学与SSU rRNA序列分析结果,陕西省韩城市黑热病病原体应为婴儿利什曼原虫。

利用SSU rRNA分子探讨中国利什曼原虫分子系统发育学

目的利用SSU rRNA分子探讨中国利什曼原虫基因多态性及其分子系统发育学。方法采用PCR法获得中国不同地区利什曼原虫SSU rDNA,通过Clustal X软件比对序列碱基,构建贝叶斯进化树。结果中国不同地区流行利什曼原虫分属于不同的支序,在中国除了有杜氏利什曼原虫外,还有热带利什曼原虫和一支在国际上还没有定种的未定种存在。结论在中国有未定种利什曼原虫存在。

核糖体小亚基RNA和细胞色素氧化酶亚单位Ⅱ基因在中国利什曼原虫系统发育学分析中应用的比较

目的比较核糖体小亚基RNA（small subunit ribosomal RNA．SSUrRNA）和细胞色素氧化酶亚单位Ⅱ（cytochrome oxidaseⅡ，COXⅡ）这2种分子标志在中国利什曼原虫系统发育学分析中的不同。方法提取利什曼原虫各虫株核基因组和线粒体基因组．PCR方法扩增中国不同地区利什曼原虫SSUrRNA和COXⅡ基因．扩增产物送上海生工生物工程技术服务有限公司测序．序列碱基通过Clustal X软件比对，用DAMBE软件进行单倍型分析、Mega4软件计算遗传距离，Mrbayes3．1．2软件构建贝叶斯进化树。结果COXⅡ分析结果表明．流行于中国的利什曼原虫虫株未形成一个单系群：GS7和XJ771属于杜氏利什曼原虫复合体；10株利什曼原虫形成的6个单倍型（MHOM／CN/93/GS7,IPHL／CN／77／XJ771,MHOM／CN／84／JS1和MGER／CN／60／GS．GER20除外）形成1个单系群：而SSUrRNA分析结果表明：11株利什曼原虫（IPHL／CN／77／XJ771，MHOM/CN，93／GS7，MRH0／CN／88／KXG-2，MHOM／CN／84／JS1．MGER／CN／60／GS．GER20除外）形成一个独立枝；江苏株JS1和热带利什曼原虫聚在一起，不与杜氏利什曼原虫聚在一起。结论SSUrRNA和COXⅡ得出的结果较一致．但COXⅡ基因在分析利什曼原虫的系统发育关系时．可能是一个更可靠的遗传标志。