Identification RAPD Markers Linked to Texture Quality of Chinese Cabbage

[ Objectives] This study was conducted to identify the random amplification of polymorphic DNA （RAPD） markers linked to chewy texture-controlling gene of Chinese cabbage. [ Methods] The RAPD markers associated with chewy texture of Chinese cabbage were identified via bulked segregant analysis （BSA） in an F2 population derived from the cross between Hua 273 （female parent） and 114 Fushan （male parent）. [ Results] OPA06-1400 was identified to he linked to the chewy texture-controlling gene of Chinese cabbage. The genetic distance between the target gene and the RAPD marker was 24.8 cM. [ Conclusions] The resuits provide experimental evidence for breeding of Chinese cabbage.

白菜及其相邻类群基因组DNA的RAPD分析

运用ＡＰＰＣＲ技术对白菜及其相邻类群的基因组ＤＮＡ进行ＲＡＰＤ分析。结果表明，用α－３２ＰｄＣＴＰ标记的单一引物扩增的带型在所试材料中显示了比成对引物用溴化乙锭染色的带型更为丰富的多态性。ＰⅡ—３、１３、３２和３４是所试１８种蔬菜材料的基本片段，ＰⅡ—２、１８、２０、２１、２３、２５、３３是鸡心甘蓝的特征片段，而ＰⅡ—１、１０、１５、１９、２２、２４、３０是白菜、芜菁和日本的壬生菜等１７种蔬菜材料（２ｎ＝２０）共有的特征片段。

西伯利亚蝗基因组DNA提取及RAPD分析条件的优化

以西伯利亚蝗Gomphocerus sibiricus(L.)为研究材料,利用改良的SDS法提取高质量的DNA,分别测试了dNTP浓度、镁离子浓度、TaqDNA聚合酶用量、模板DNA的量等因素对反应结果的影响。通过各因子的组合比较,建立了西伯利亚蝗RAPD优化体系:25μLPCR反应体系,10×buffer2·5μL;dNTP0·24mmol/L;MgCl22·0mmol/L;Taq DNA聚合酶1U;DNA模板45ng;引物30ng。扩增程序为:94℃预变性1min45s、94℃变性30s、35℃退火1min30s、72℃延伸2min,45个循环、72℃延伸10min。结果表明,利用优化的反应条件进行西伯利亚蝗基因组DNA分析,实验有着良好的重复性和稳定性。

辣椒细胞质雄性不育系与其保持系基因组DNA的RAPD分析

利用RAPD技术对细胞质雄性不育系21A与其相应保持系21B的基因组DNA进行了比较分析,共使用了380个随机引物,其中有213个引物在两系之间都得到了扩增产物,不育系21A与相应保持系21B基因组DNA用213个引物扩增后有6条主差异带,主要表现为条带数目、条带位置和条带强弱的差异。找到了辣椒细胞质雄性不育系21A基因组DNA特异的RAPD片段CMS Y15500、CMS BE5850和CMS BG1900,并对这些特异片段的来源及其在细胞质雄性不育中的作用进行了讨论。

直接从人工老化的菜心干种子中提取基因组DNA用于RAPD分析

利用 4 0℃、1 0 0 %RH对菜心种子进行人工加速老化处理获得了不同活力的种子批 ,利用平衡酚_氯仿法直接从人工老化的菜心干种子中提取基因组DNA ,并对提取的基因组DNA进行了RAPD扩增。结果表明 ,所提取的基因组DNA量多 ,而且比较整齐一致。引物S2 0 8扩增所获得的基因组DNA指纹图谱上的DNA带清晰、明亮 ,从而表明利用本方法从人工老化菜心干种子中直接提取的基因组DNA完全可以用于RAPD分析。

用RAPD标记检测棘阿米巴基因组DNA多态性

本文用ＲＡＰＤ技术就我国首次分离到的棘阿米巴角膜炎病原体Ｗ株（ＥＣＮＵ－９２Ｗ１），同其它４个虫株（Ａｃａｎｔｈａｍｏｅｂａｐｏｌｙｐｈａｇａ，Ａ．ｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ，Ａ．ｑｕｉｎａ，Ａ．ｐａｌｅｓｔｉｎｅｎｓｉｓ）进行了分子分类的比较研究，并对各虫株的系统发生进行了初步探讨。虫株间的共享度各有差异，其中Ａ．ｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ和Ａ．ｑｕｉｎａ最大，为０．６４５；Ｗ和Ａ．ｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ，Ａ．ｑｕｉｎａ分别为０．６３６，０．６００；Ａ．ｐｏｌｙｐｈａｇａ和Ａ．ｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ，Ａ．ｑｕｉｎａ及Ｗ分别为０．５７６，０．４７６，０．４７８；Ａ．ｐａｌｅｓｔｉｎｅｎｓｉｓ和Ａ．ｐｏｌｙｐｈａｇａ，Ａ．ｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ，Ａ．ｑｕｉｎａ及Ｗ分别为０．２２５，０．２００，０．２７０，０．３０８。结合以往对形态学，同工酶和ｍｔＤＮＡ限制性内切酶分析的结果，进一步为Ａ．ｌｕｇｄｕｎｅｎｓｉｓ－Ａ．ｑｕｉｎａｃｏｍｐｌｅｘ提供了分子证据。

适合RAPD分析的三种玉米基因组DNA提取方法比较

本文通过对3种玉米基因组DNA提取方法的比较得出,DNA提取时采用一次氯仿/异戊醇抽提方法,得到的DNA质和量都较为理想,并且能够达到RAPD实验的要求。

枸杞基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化

[目的]研究枸杞基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化。[方法]采用了进一步优化的CTAB法提取枸杞基因组DNA,检测所提取的DNA的浓度范围,并对RAPD反应体系进行了科学、合理的优化。[结果]结果表明,浓度范围在3.5～5.5μg/μl,完全能够满足RAPD-PCR的要求。[结论]该方法具有步骤少、费用低、效率高等特点,比较适用于枸杞基因组DNA的提取。

我国旋毛虫地理株基因组DNA多态性的RAPD分析

以旋毛虫(Trichinella spiralis,T1)、乡土旋毛虫(T.nativa,T2)、布氏旋毛虫(T.britovi,T3)、伪旋毛虫(T.pseudospiralis,T4)、纳氏旋毛虫(T.nelsoni,T7)的国际参考株作为对照,应用随机扩增多态性DNA技术对我国7个旋毛虫地理株(河南、湖北、云南、陕西西安、天津、黑龙江同江及哈尔滨株)基因组DNA进行了PCR扩增,根据扩增产物的电泳条带进行MEGA分析,计算遗传距离并构建进化树。结果显示,T1与我国7个旋毛虫地理株之间的遗传距离均小于0.365 9,其中哈尔滨株与云南株、河南株与西安株的遗传距离小于0.166 7,其遗传相似性分别为83.33%与86.35%;天津株与哈尔滨株及云南株的遗传距离小于0.250 0;同江株与其他6个地理株的遗传距离均大于0.284 1,与T1的遗传距离小于0.263 3;湖北株与其他6个地理株及T1的遗传距离大于0.301 3。T2、T3、T4、T7与我国7个地理株之间的遗传距离均大于0.589 8。我国7个旋毛虫地理株均为T1,其中哈尔滨株、云南株及天津株归为一类,河南株与西安株归为一类,同江株与湖北株各单独归为一类。

乌头基因组DNA提取与RAPD反应体系优化

采用改进方法提取乌头基因组DNA,建立乌头RAPD分析的PCR反应体系,成功地进行了RAPD扩增,筛选出乌头RAPD的最佳方案为:25μl反应体系中包括dNTPs 0.06 mmol·L-1,引物0.2μmol.μL-1,模板DNA40 ng,Taq酶1U,Mg2+ 4 mmol·L-1,10×buffer缓冲液2.5μl,其余部分为无菌超纯水。PCR扩增循环为95℃3 min,38 ℃1 min,72 ℃2min 1次循环;94 ℃=1 min,38℃1 min,72 ℃2 min,45次循环,最后72℃延伸10 min。

适于RAPD分析的三种基因组DNA提取方法比较

通过对 3种基因组DNA提取方法的实验比较 ,找到了一种既能够满足RAPD实验要求 ,又简便快捷、经济的基因组DNA提取方法 ,经RAPD试验检测与电泳结果分析表明

杂交一代(尼罗罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂)及其亲本基因组DNA的比较

采用RAPD技术 ,用 2 0个随机引物对尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼及其杂交一代的精巢DNA进行扩增反应 ,发现引物OPZ - 14和OPZ - 18在尼罗罗非鱼和奥利亚罗非鱼之间扩增出有差异的DNA片段 ,作为鉴定两种鱼的分子标记有较高可信度。对这两种鱼的杂交一代基因组DNA的RAPD扩增能获得足够的多态性 ,2 0个引物中有 8个引物扩增出差异性产物 ,表明杂交一代基因杂合性增强 ,这是杂种优势得以形成的重要遗传物质基础之一。

野生与笼养绿孔雀种群的随机扩增多态DNA研究

利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对野生 14只和笼养 18只绿孔雀 (Pavomuticus)个体进行了种群遗传多样性分析。用 2 3个随机引物 ,野生与笼养绿孔雀分别获得 16 1和 16 6个扩增片段 ,计算发现野生与笼养绿孔雀的种群内平均相对遗传距离分别是 0 .0 5 5 5和 0 .135 5 ,两种群间的为 0 .16 35 ;两种群的Shannon多样性指数平均分别是 0 .434 8和 1.0 16 3,有显著性差异。以上分析都显示野生绿孔雀的遗传多样性很低。用UPGMA法聚类显示两个种群都是分别来源于两个家系 ,可据此进行繁育管理。

七种媒介硬蜱基因组随机扩增多态性DNA分析

目的 研究 7种硬蜱的基因组随机扩增多态性DNA (RAPD)以及种间的遗传距离。 方法 用 5条不同的多聚核苷酸单链引物对草原革蜱、森林革蜱、青海血蜱、台湾血蜱、刻点血蜱、龟形花蜱、卵形硬蜱 7种硬蜱基因组DNA进行随机扩增 ,分析DNA图谱并计算 7种硬蜱间的遗传距离。 结果 7种硬蜱基因组随机扩增产物均有各自独特的DNA条带 ,种间的平均遗传距离为 0 71。 结论 RAPD技术可以区分这 7种硬蜱。

大白菜基因组DNA快速提取方法的研究

快速高效的DNA提取是作物大规模分子育种的关键一步。旨为构建一种快速提取大白菜基因组DNA的方法,以大白菜叶片为试验材料,比较了CTAB法、二步CTAB法以及4种碱裂解法提取DNA的质量,分析了不同方法提取的DNA为模板的PCR扩增效果,还对不同方法提取的基因组DNA的保存时间和保存条件进行了比较,选择最优的方法在抗根肿病基因分子标记辅助选择中进行了应用。结果表明,CTAB法和3种碱裂解法提取的基因组DNA作为模板的PCR扩增产物,都可以通过8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测到清晰的条带。其中碱裂解法Ⅲ,不仅提取质量好,而且提取过程简单、快速,能够满足大白菜高通量DNA提取的需要,提取的DNA在4℃和-20℃的条件下保存,将保存至30 d的基因组DNA作为模板进行PCR扩增,产物仍然可以通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测到清晰的条带,说明这种方法保存时间较长,经验证,该方法在抗根肿病基因分子标记辅助选择中的应用效果也较好。碱裂解法Ⅲ显著提高了大白菜分子标记辅助筛选的效率,可广泛应用于大白菜分子标记辅助选择育种。

笼养蓝孔雀两个种群的随机扩增多态DNA分析

利用随机扩增多态DNA技术对英吉利孔雀场和广州动物园两个蓝孔雀Pavocristatus种群进行了分析。用 2 3个随机引物 ,共获得 173和 15 7个扩增片段 ,多态率分别为 47 40 %和 9 5 5 %

中国豹猫6个群体的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术 ,对豹猫 (Prionailurusbengalensis)的 6个群体进行了遗传多样性和系统发育分析。在 4 0个随机引物中筛选出 35个有效引物 ,对 6份群体样品扩增 ,共获得 2 88条DNA谱带 ,其中 2 31条具有多态性 ,占 80 .2 1%。单个引物获得的标记数在 2～ 16之间 ,平均每个引物获得 8.2 3条DNA谱带。基于遗传距离 ,用UPGMA法构建了系统聚类图。聚类分析显示 ,所研究豹猫的 6个群体可分 4支 ,黑龙江—山西群体为一支 ,对应于北方亚种 (P .b.euptilura) ;贵州—广西群体聚在一起为另一支 ,对应于指名亚种 (P .b .bengalensis) ;云南群体为第三支 ,对应于川西亚种 (P .b.scripta) ;福建群体为第四支 ,对应于华东亚种 (P .b .chinensis)。该结果支持目前基于形态和地理分布的亚种划分。

PEG 渗调引发处理对菜薹老化种子DNA损伤的修复作用

利用RAPD技术对菜薹人工老化种子DNA的损伤及PEG渗调引发处理的修复作用进行了研究。在 61种引物中 ,有 6种在菜薹人工老化的种子上获得了基因组DNA指纹图谱 ,平均每种引物扩增的总DNA带数为 2 .16,多态性DNA带数为 1.17;有 11种引物在PEG渗调引发的菜薹老化种子上获得了基因组DNA指纹图谱 ,平均每种引物扩增的总DNA带数为3.91,多态性DNA带数也是 3.91。人工老化对菜薹种子基因组DNA的损伤作用表现为随老化程度的加深DNA带逐渐减弱直至完全消失。而PEG渗调引发处理对老化程度较轻的菜薹种子中的损伤DNA具有修复作用 ,表现为新的DNA带产生 ,原有DNA带增强。

板栗基因组DNA几种提取方法比较研究

通过对板栗基因组 DNA几种提取方法获得的 DNA质量分析 ,表明改良 SDS法是最为理想的提取方法 ,能满足

南、北五味子的RAPD鉴别研究

目的 为准确区分南五味子和北五味子寻找一种新的鉴别手段。方法 采用随机扩增引物DNA (RAPD)法 ,筛选适于鉴别南、北五味子的随机引物。结果 总共筛选了 80条随机引物 ,只得到一条引物S4 2 9能准确区分南、北五味子 ,并且其重复性非常高。结论 可利用随机引物S4 2 9通过RAPD准确区分南。